Коды номенклатуры - Nomenclature codes
Коды номенклатуры или коды номенклатуры различные своды правил, регулирующие биологические таксономический номенклатура, каждый в своей широкой области организмов. Для конечного пользователя, который имеет дело только с названиями видов, с некоторым пониманием того, что виды могут быть отнесены к семьи, может быть не заметно, что существует более одного кода, но за пределами этого базового уровня они сильно отличаются по способу работы.
Успешное введение двухчастных названий видов Линней было началом постоянно расширяющейся системы номенклатуры. Когда все натуралисты во всем мире приняли этот подход к придумыванию имен, возникло несколько школ мысли о деталях. Становилось все более очевидным, что необходим подробный свод правил, чтобы управлять научные названия. Начиная с середины 19 века и далее было несколько инициатив, направленных на выработку общепринятых сводов правил. В настоящее время номенклатурные коды регулируют наименования:
- Водоросли, Грибы и Растения – Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений (ICN), который в июле 2011 г. заменил Международный кодекс ботанической номенклатуры (ICBN) и более ранние Международные правила ботанической номенклатуры.
- Животные – Международный кодекс зоологической номенклатуры (ICZN)
- Бактерии и Археи – Международный кодекс номенклатуры прокариот (ICNP), который в 2008 году заменил Международный кодекс номенклатуры бактерий (ICNB)
- Культурные растения – Международный кодекс номенклатуры культурных растений (ICNCP)
- Растительные ассоциации – Международный кодекс фитосоциологической номенклатуры (ICPN)
- Вирусы – Международный кодекс классификации и номенклатуры вирусов (ICVCN); смотрите также классификация вирусов
Различия между кодами
Отправная точка
Отправная точка, то есть время, с которого эти коды вступают в силу (обычно задним числом), варьируется от группы к группе, а иногда и от ранга к рангу.[1] В ботаника и микология отправной точкой часто является 1 мая 1753 г. (Линней, Виды plantarum ), в зоология 1758[требуется разъяснение ] (Линней, Systema Naturae, 10-е издание ). С другой стороны, бактериология начал заново, проведя чистую проверку в 1980 г. (Скерман и др., «Утвержденные списки названий бактерий»), сохранив при этом первоначальных авторов и даты публикации.[2]
Исключения в ботанике:[3][4][5]
- Сперматофиты и Pteridophyta, надродовые имена: 4 августа 1789 г.Жасси, Род подошвенный);
- Musci (кроме Sphagnaceae): 1 января 1801 г. (Хедвиг, Виды muscorum);
- Sphagnaceae и Hepaticae (в том числе Anthocerotae ), надродовые имена: 4 августа 1789 г. (Jussieu, Род подошвенный);
- (Грибы:) Микроспоридии регулируются ICZN (рассматриваются как животные), и см. ниже ископаемое грибы;[6]
- (Водоросли:)
- Nostocaceae homocysteae: 1 января 1892 г. (Гомонт, «Monographie des Oscillariées”);
- Nostocaceae heterocysteae: 1 января 1886 г. (Борнет & Flahault, “Révision des Nostocacées hétérocystées”);
- Десмидиевые: 1 января 1848 г. (Ральфс, Британские Desmidieae);
- Oedogoniaceae: 1 января 1900 г. (Hirn, “Monographie und Iconographie der Oedogoniaceen”);
- Ископаемое растения, водоросли (диатомеи за исключением) и грибов: 31 декабря 1820 г. (Штернберг, Флора дер Форвельт).
Исключения в зоологии:[7]
- Пауки: 1757[требуется разъяснение ] (Клерк, Араней Свечичи ).
Работы
Существуют также различия в способах работы кодов. Например, ICN (кодекс водорослей, грибов и растений) запрещает тавтонимы, в то время ICZN, (животный код) позволяет им.
Терминология
Эти кодексы различаются по терминологии, и существует долгосрочный проект по «согласованию» этого. Например, ICN использует «действительный» в «действительной публикации имени» (= акт публикации официального имени), с «установлением имени» в качестве ICZN эквивалент. В ICZN использует "действительный" в "допустимом имени" (= "правильное имя"), с "правильным именем" в качестве ICN эквивалент. Гармонизация идет очень ограниченно.
Типы
Существуют различия в том, какие виды типы используются. Бактериологический код предпочитает живые типовые культуры, но допускает другие виды. Продолжаются дискуссии о том, какой тип более полезен в таких случаях, как цианобактерии.[8]
Прочие коды
Биокод
Более радикальный подход был применен в 1997 г., когда Международный комитет по биономенклатуре (ICB) IUBS / IUMS представил давно обсуждаемый Черновик биокода, предлагается заменить все существующие Коды с их гармонизацией.[9][10] Первоначально запланированной датой реализации проекта Биокода было 1 января 2000 г., но было достигнуто соглашение о замене существующего Коды не было достигнуто.
В 2011 году пересмотренный Биокод было предложено вместо замены существующего Коды, предоставит им единый контекст, обращаясь к ним при необходимости.[11][12][13] В предлагаемые направления постепенно вносятся изменения в существующие коды.[14][15]
Филокод
Некоторые авторы столкнулись с проблемами при использовании системы Линнея в филогенетической классификации.[16] Другая Код в разработке с 1998 г. Филокод, который будет регулировать то, что их создатели называли филогенетическая номенклатура вместо традиционного Номенклатура Линнея (то есть, он требует филогенетических определений как «тип», прикрепленный к каждому имени, и не содержит обязательных рангов). В Код и прилагаемый том (предназначенный для того, чтобы служить списком неисключаемых имен и новой отправной точкой, как в 1980-х гг. Утвержденные списки бактериальных названий[17] функции относительно Бактериологический код, так же, как Systema naturae функции относительно Зоологический кодекс), однако все еще находится в стадии черновика, и неизвестно, когда или даже будет ли код реализован в какой-либо форме.
Протисты амбирегнала
Немного протисты иногда называют амбирегнальные протисты, считались обоими простейшие и водоросли, или простейшие и грибы, и названия для них были опубликованы под одним или обоими ICZN и ICN.[18][19] В результате двоякий язык во всех схемах классификации протистов привел к путанице.[20][21][22]
Группы, на которые заявлены права протозоологи и психологи включают эвглениды, динофлагелляты, криптомонады, гаптофиты, глаукофиты, много гетероконты (например., хризофиты, рафидофиты, силикофлагеллаты, немного ксантофиты, протеромонады ), какой-то монадоид зеленые водоросли (Volvocaleans и празинофиты ), хоанофлагелляты, бикозоециды, эбрииды и хлорарахниофиты.
Формы для слизи, плазмодий формы и прочее "грибовидный "организмы, заявленные протозоологами и микологи включают микетозойные, плазмодиофориды, акрасиды, и лабиринтуломицетса. Грибы утверждают протозоологи и микологи включают хитриды, бластоклады, а кишечные грибки.
Другими проблемными группами являются Цианобактерии и Микроспоридии.
Нерегулируемые таксоны
В зоологический кодекс не регулирует названия таксонов ниже подвида или выше надсемейства. Есть много попыток внести некоторый порядок в номенклатуру этих таксонов,[23][24] в том числе Филокод, или также ограниченная номенклатура.[25][26]
В ботанический код применяется в первую очередь к членам семьи и ниже. Есть некоторые правила для имен выше ранга семьи, но принцип приоритета к ним не относится, и принцип типизации не является обязательным. Эти имена могут быть либо автоматически типизированные имена или быть описательные имена.[27][28] В некоторых случаях у таксона есть два возможных названия (например, Chrysophyceae Пашер, 1914 г., ном. описание.; Хибберд, 1976, ном. типификатум). Описательные названия проблематичны, поскольку если таксон разделен, не очевидно, какая новая группа получит существующее название. Между тем, с типизированными именами существующее имя принимается новой группой, которая по-прежнему носит тип этого имени. Однако типизированные названия представляют собой особые проблемы для микроорганизмов.[22]
Смотрите также
- Биноминальная номенклатура
- Ботаническая номенклатура
- Химическая номенклатура
- Распространенное имя
- Номенклатура генов
- Глоссарий научного нейминга
- Список таксонов, названных анаграммами
- Зоологическая номенклатура
использованная литература
- ^ Николсон Дэн (1991). «История ботанической номенклатуры». Летопись ботанического сада Миссури. 78 (1): 33 –56. Дои:10.2307/2399589. JSTOR 2399589.
- ^ Скерман В. Б., Макгоуэн В., Снит П. Х. А. (1980). «Утвержденные списки названий бактерий». Int. J. Syst. Бактериол. 30: 225–420. Дои:10.1099/00207713-30-1-225.CS1 maint: несколько имен: список авторов (ссылка на сайт)
- ^ Читвуд Б.Г. (1958). «Обозначение официальных названий высших таксонов беспозвоночных». Бык. Zool. Номенклатурный. 15: 860–895. Дои:10.5962 / bhl.part.19410.
- ^ Сильва П.С. (1958). «Более поздние отправные точки в водорослях» (PDF). Таксон. 7 (7): 181–184. Дои:10.2307/1216399. JSTOR 1216399.
- ^ (Turland et al. 2018 г., Статья 13)
- ^ (Turland и др. 2018 г., Статья F.1.1)
- ^ ICZN - Международная комиссия по зоологической номенклатуре (1999). Международный кодекс зоологической номенклатуры. Четвертый выпуск. Международный фонд зоологической номенклатуры, Лондон, Великобритания. 306 с., [1].
- ^ Ахорен Орен (2004). «Предложение о дальнейшей интеграции цианобактерий в соответствии с Бактериологическим кодексом». Int. J. Syst. Evol. Микробиол. 54 (Pt 5): 1895–1902. Дои:10.1099 / ijs.0.03008-0. PMID 15388760.
- ^ "Проект Биокод". 1997.
- ^ Джон Макнил (1996-11-04). «Глава 2. Биокод: интегрированная биологическая номенклатура 21 века?». Материалы мини-симпозиума по биологической номенклатуре в 21 веке.
- ^ «Проект биокода (2011)». Международный комитет по биономенклатуре (ICB).
- ^ Гройтер В., Гаррити Г., Хоксворт Д.Л., Ян Р., Кирк П.М., Кнапп С., Макнил Дж., Мишель Э., Паттерсон Д.Дж., Пайл Р., Тиндалл Б.Дж. (2011). «Проект Биокода (2011 г.): Принципы и правила, регулирующие наименование организмов». Таксон. 60: 201–212. Дои:10.1002 / налог.601019.CS1 maint: несколько имен: список авторов (ссылка на сайт)
- ^ Хоксворт Д.Л. (2011). «Представляем черновой вариант биокода (2011 г.)». Таксон. 60 (1): 199–200. Дои:10.1002 / налог.601018.
- ^ DL Hawksworth (2011) BioCode 2011. Введение. http://www.bionomenclature.net/biocode2011.html
- ^ Вернер Гройтер (2011) Биокод 2011. Пояснительный пролог. http://www.bionomenclature.net/biocode2011.html
- ^ de Queiroz, K .; Готье, Дж. (1990). Филогения как центральный принцип таксономии: филогенетические определения названий таксонов. Syst. Zool. (39): 307–322. DOI: 10.2307 / 2992353 http://vertebrates.si.edu/herps/herps_pdfs/deQueiroz_pdfs/1990deQ_GauSZ.pdf.
- ^ В.Б.Д. Скерман, Вики Макгоуэн и ПХА Снит, 1989 г. Утвержденные списки названий бактерий, исправленное издание. Вашингтон (округ Колумбия): ASM Press
- ^ Корлисс, Дж. О (1995). «Амбирегнальные протисты и коды номенклатуры: краткий обзор проблемы и предлагаемых решений». Вестник зоологической номенклатуры. 52: 11–17. Дои:10.5962 / bhl.part.6717.
- ^ (McNeill et al. 2012 г., Преамбула: 8)
- ^ Adl, S. M. et al. Разнообразие, номенклатура и таксономия простейших. Систематическая биология, п. 684-689, 2007 г., [2].
- ^ Elbrächter, M. et al. Составление программы исследований известковых динофлагеллят (Thoracosphaeraceae, Dinophyceae), включая номенклатурный синопсис родовых названий. Таксон 57, стр. 1289–1303, 2008 г., г. [3]
- ^ а б (Lahr et al. 2012 г. )
- ^ Дюбуа, А. (2006). Предлагаемые правила для включения имен зоологических таксонов более высокого ранга в Международный кодекс зоологической номенклатуры. 2. Предлагаемые Правила и их обоснование. Зоосистема, 28 (1): 165‒258, [4].
- ^ Frost, D. R. et al. (2006). Древо жизни земноводных. Бюллетень Американского музея естественной истории 297: 1–291, [5],
- ^ Клюге, Н. Дж. (2010). Обводные названия высших таксонов Hexapoda. Бёономина, 1, 15-55, [6].
- ^ Клюге, Н. Дж. (1999). «Система альтернативных номенклатур надвидовых таксонов. Линнеевские и постлиннеевские принципы систематики». Энтомологический обзор. 79 (2): 133–147.
- ^ (McNeill et al. 2012 г., Статья 16)
- ^ (Turland et al. 2018 г., Статья 16)
Список используемой литературы
- Лар, Дэниел Дж. Г., Энрике Лара и Эдвард А. Д. Митчелл (2012), «Время регулировать номенклатуру микробных эукариот», Биологический журнал Линнеевского общества, 107 (3): 469–476, Дои:10.1111 / j.1095-8312.2012.01962.xCS1 maint: использует параметр авторов (ссылка на сайт)
- McNeill, J .; Barrie, F.R .; Бак, W.R .; Демулин, В .; Greuter, W .; Hawksworth, D.L .; Herendeen, P.S .; Knapp, S .; Marhold, K .; Prado, J .; Prud'homme Van Reine, W.F .; Smith, G.F .; Wiersema, J.H .; Турланд, Нью-Джерси (2012). Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений (Мельбурнский кодекс), принятый Восемнадцатым Международным ботаническим конгрессом, Мельбурн, Австралия, июль 2011 г.. Regnum Vegetabile 154. A.R.G. Gantner Verlag KG. ISBN 978-3-87429-425-6.
- Турланд, штат Нью-Джерси; Wiersema, J.H .; Barry, F.R .; Greuter, W .; Hawksworth, D.L .; Herendeen, P.S .; Knapp, S .; Kusber, W.H .; Ли, Д.-З .; Marhold, K .; May, T.W .; McNeill, J .; Monro, A.M .; Prado, J .; Прайс, M.J .; Смит, Г.Ф. (2018). Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений (Шэньчжэньский кодекс), принятый девятнадцатым Международным ботаническим конгрессом Шэньчжэнь, Китай, июль 2017 г.. Regnum Vegetabile 159. Ботанические книги Кельца. ISBN 978-3-946583-16-5.
внешние ссылки
- Биокод в действии на портале Смитсоновского океана
- ICN: Кодекс Шэньчжэня (2018)
- ICZN: "зеленая книга" (1999)
- Список прокариотических имен с позиций в номенклатуре (1997), Дж. П. Эузеби
- Биокод введение (2011)
- Филокод