S100A12 - S100A12

S100A12
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1E8A, 1GQM, 1ODB, 2М9Г, 2WC8, 2WCB, 2WCE, 2WCF
Идентификаторы
Псевдонимы	S100A12, CAAF1, CAGC, CGRP, ENRAGE, MRP-6, MRP6, p6, кальций-связывающий белок A12 S100, EN-RAGE
Внешние идентификаторы	OMIM: 603112 ГомолоГен: 48361 Генные карты: S100A12
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q21.3 Начните 153,373,711 бп[1] Конец 153,375,621 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание рецептора RAGE • связывание ионов меди Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • мембрана • клеточная мембрана • внеклеточная область • цитоскелет • ядро клетки • просвет секреторной гранулы Биологический процесс • активация тучных клеток • положительная регуляция воспалительного ответа • положительная регуляция активности киназы MAP • хемотаксис моноцитов • иммунная система • секреция цитокинов • защитная реакция на грибок • хемотаксис нейтрофилов • защитный ответ на бактерию • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • ксенобиотический метаболический процесс • врожденная иммунная система • воспалительная реакция • дегрануляция нейтрофилов • антимикробный гуморальный иммунный ответ, опосредованный антимикробным пептидом • убийство клеток другого организма Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	6283	н / д
Ансамбль	ENSG00000163221	н / д
UniProt	P80511	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_005621	н / д
RefSeq (белок)	NP_005612	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 1: 153.37 - 153.38 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

S100 кальций-связывающий белок A12 (S100A12) это белок что у людей кодируется S100A12 ген.^[3][4] S100A12 человека, также известный как кальгранулин C, впервые был описан в 1995 году.^[5]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков S100, содержащих 2 EF-рука кальций-связывающие мотивы.

Функция

Как правило, S100A12 обладает значительными противоинфекционными и антибактериальный роль, связанная с его способностью поглощать ионы. Например, сдерживает распространение и вирулентность из Хеликобактер пилори.^[6][7]

Распределение тканей

Нейтрофилов и моноциты / макрофаги являются важным источником S100A12 в клетке^[8] хотя некоторые эпителиальный клетки и дендритные клетки способны к его секреции.^[9] Некоторые ткани богаты этими клетками, как и этим белком. К ним относятся селезенка или легкие. Он происходит внутриклеточно, но также продуцируется во внеклеточной среде, где играет важную роль. Это происходит во внеклеточной среде как гомодимер или гексамер.^[10]

Клиническое значение

Его наличие связано с сердечно-сосудистый и болезни почек.^[10] Как и другие белки S100, S100A12 передает сигналы через Рецептор RAGE и TLR. В общем, эта сигнализация приводит к цитокин производство хемотаксис и увеличился окислительный стресс. В эндотелиальных клетках эта передача сигналов приводит к активации NFκB, под которым производство молекулы адгезии такие как ICAM, VCAM или селектины увеличена.^[10] Предполагается, что этот белок участвует в определенных кальций-зависимых преобразование сигнала пути и его регулирующее влияние на цитоскелет компоненты могут модулировать различные активности нейтрофилов.^[4]

Каскады, которые запускаются взаимодействием S100A12 с RAGE, могут играть важную роль в почечная недостаточность в гемодиализ пациенты. Связь между S100A12 и почечным диализом уровень смертности сообщалось неоднократно. S100A12 может играть роль в мониторинге SLE пациентов как маркер поражения почек в гломерулонефрит.^[11][12] Это также связано с желудочно-кишечный болезни. В воспалительные заболевания кишечника, он значительно коррелирует с активностью заболевания и вместе с другими белками семейства 100S может предсказывать рецидив заболевания.^[13][14]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163221 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Вики Р., Маренхольц И., Мишке Д., Шефер Б. В., Хейцманн С. В. (декабрь 1996 г.). «Характеристика человеческого гена S100A12 (кальгранулин C, p6, CAAF1, CGRP), нового члена кластера генов S100 на хромосоме 1q21». Клеточный кальций. 20 (6): 459–64. Дои:10.1016 / S0143-4160 (96) 90087-1. PMID  8985590.
4. «Ген Entrez: S100A12 S100 кальций-связывающий белок A12».
5. Вики Р., Маренхольц И., Мишке Д., Шефер Б. В., Хейцманн С. В. (декабрь 1996 г.). «Характеристика человеческого гена S100A12 (кальгранулин C, p6, CAAF1, CGRP), нового члена кластера генов S100 на хромосоме 1q21». Клеточный кальций. 20 (6): 459–64. Дои:10.1016 / S0143-4160 (96) 90087-1. PMID  8985590.
6. Ян З., Ян В. X., Цай Х., Тедла Н., Армишоу К., Ди Джироламо Н. и др. (Январь 2007 г.). «S100A12 провоцирует активацию тучных клеток: потенциальный путь амплификации при астме и врожденном иммунитете». Журнал аллергии и клинической иммунологии. 119 (1): 106–14. Дои:10.1016 / j.jaci.2006.08.021. PMID  17208591.
7. Ли Д., Цзэн З., Ю Т, Цинь Дж, Ву Дж, Сон Дж. К. и др. (Май 2016). «Экспрессия и клиническое значение S100A12 в карциноме желудка». Биология опухоли. 37 (5): 6551–9. Дои:10.1007 / s13277-015-4460-5. PMID  26638166.
8. Хоррамделазад Х., Багери В., Хасаншахи Г., Карами Х., Мугоуэй М., Зейнали М., Абединзаде М. (2015-04-14). «Экспрессия S100A12 и RAGE в переходно-клеточной карциноме мочевого пузыря человека: роль оси лиганд / RAGE в прогрессии опухоли?». Азиатско-Тихоокеанский журнал профилактики рака. 16 (7): 2725–9. Дои:10.7314 / APJCP.2015.16.7.2725. PMID  25854354.
9. Багери В., Хасаншахи Г., Зейнали М., Абединзаде М., Хоррамделазад Х. (март 2016 г.). «Повышенный уровень S100A12 в семенной плазме бесплодных мужчин с варикоцеле». Международная урология и нефрология. 48 (3): 343–7. Дои:10.1007 / s11255-015-1188-5. PMID  26725070.
10. Назари А., Хоррамделазад Х., Хассаншахи Г., Дэй А.С., Сардоо А.М., Фард Е.Т. и др. (Декабрь 2017 г.). «S100A12 при почечных и сердечно-сосудистых заболеваниях». Науки о жизни. 191: 253–258. Дои:10.1016 / j.lfs.2017.10.036. PMID  29080693.
11. Шиоцу Й, Мори Й, Нисимура М., Хатта Т., Имада Н., Маки Н. и др. (Январь 2013). «Прогностическая полезность уровней S100A12 в плазме для создания новой системы баллов для прогнозирования смертности у пациентов, находящихся на поддерживающем гемодиализе: двухлетнее проспективное обсервационное исследование в Японии». BMC Нефрология. 14 (1): 16. Дои:10.1186/1471-2369-14-16. ЧВК  3552940. PMID  23324110.
12. Тайден Х., Луд С., Гуллстранд Б., Йонсен А., Иварс Ф., Лендерсон Т., Бенгтссон А.А. (февраль 2017 г.). «Провоспалительные белки S100 связаны с гломерулонефритом и антителами против дцДНК при системной красной волчанке». Волчанка. 26 (2): 139–149. Дои:10.1177/0961203316655208. PMID  27407135.
13. Фоелл Д., Кухарзик Т., Крафт М., Фогл Т., Сорг С., Домшке В., Рот Дж. (Июнь 2003 г.). «Полученный из нейтрофилов человеческий S100A12 (EN-RAGE) сильно экспрессируется во время хронического активного воспалительного заболевания кишечника». Кишечник. 52 (6): 847–53. Дои:10.1136 / гут.52.6.847. ЧВК  1773692. PMID  12740341.
14. Райт Е.К., Де Круз П., Гирри Р., Дэй А.С., Камм Массачусетс (сентябрь 2014 г.). «Фекальные биомаркеры в диагностике и мониторинге болезни Крона». Воспалительные заболевания кишечника. 20 (9): 1668–77. Дои:10.1097 / MIB.0000000000000087. PMID  24918319.

дальнейшее чтение

• Рот Дж, Фогл Т., Сорг С., Сандеркёттер С. (апрель 2003 г.). «Фагоцит-специфические белки S100: новая группа провоспалительных молекул». Тенденции в иммунологии. 24 (4): 155–8. Дои:10.1016 / S1471-4906 (03) 00062-0. PMID  12697438.
• Guignard F, Mauel J, Markert M (июль 1995 г.). «Идентификация и характеристика нового человеческого нейтрофильного белка, относящегося к семейству S100». Биохимический журнал. 309 (Pt 2) (2): 395–401. Дои:10.1042 / bj3090395. ЧВК  1135745. PMID  7626002.
• Шефер Б.В., Вики Р., Энгелькамп Д., Маттей М.Г., Хейцманн С.В. (февраль 1995 г.). «Выделение клона YAC, покрывающего кластер из девяти генов S100 на хромосоме 1q21 человека: обоснование новой номенклатуры семейства кальций-связывающих белков S100». Геномика. 25 (3): 638–43. Дои:10.1016/0888-7543(95)80005-7. PMID  7759097.
• Ямамура Т., Хитоми Дж., Нагасаки К., Сузуки М., Такахаши Э., Сайто С. и др. (Апрель 1996 г.). «Ген CAAF1 человека - молекулярное клонирование, структура гена и картирование хромосом». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 221 (2): 356–60. Дои:10.1006 / bbrc.1996.0600. PMID  8619860.
• Марти Т., Эрттманн К.Д., Галлин М.Ю. (апрель 1996 г.). «Взаимодействие хозяин-паразит при онхоцеркозе человека: идентификация и анализ последовательности нового кальгранулина человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 221 (2): 454–8. Дои:10.1006 / bbrc.1996.0616. PMID  8619876.
• Ilg EC, Troxler H, Bürgisser DM, Kuster T., Markert M, Guignard F, et al. (Август 1996 г.). «Определение аминокислотной последовательности человеческого S100A12 (P6, кальгранулин C, CGRP, CAAF1) тандемной масс-спектрометрией». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 225 (1): 146–50. Дои:10.1006 / bbrc.1996.1144. PMID  8769108.
• Хофманн М.А., Друри С., Фу К., Ку В., Тагучи А., Лу И и др. (Июнь 1999 г.). «RAGE опосредует новую провоспалительную ось: рецептор центральной поверхности клетки для полипептидов S100 / кальгранулина». Ячейка. 97 (7): 889–901. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80801-6. PMID  10399917.
• Мороз О.В., Антсон А.А., Додсон Г.Г., Уилсон К.С., Скибшой И., Луканидин Е.М., Бронштейн И.Б. (февраль 2000 г.). «Кристаллизация и предварительный рентгеноструктурный анализ человеческого кальцийсвязывающего белка S100A12». Acta Crystallographica. Раздел D, Биологическая кристаллография. 56 (Pt 2): 189–91. Дои:10.1107 / S0907444999014936. PMID  10666601.
• Мороз О.В., Антсон А.А., Муршудов Г.Н., Мейтленд Н.Дж., Додсон Г.Г., Уилсон К.С. и др. (Январь 2001 г.). «Трехмерная структура человека S100A12». Acta Crystallographica. Раздел D, Биологическая кристаллография. 57 (Чт 1): 20–9. Дои:10.1107 / S090744490001458X. PMID  11134923.
• Коул AM, Ким YH, Tahk S, Hong T, Weis P, Waring AJ, Ganz T. (август 2001 г.). «Кальцитермин, новый антимикробный пептид, выделенный из секрета дыхательных путей человека». Письма FEBS. 504 (1–2): 5–10. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 02731-4. PMID  11522286.
• Мороз О.В., Антсон А.А., Додсон Э.Дж., Баррелл Х.Дж., Грист С.Дж., Ллойд Р.М. и др. (Март 2002 г.). «Структура S100A12 в гексамерной форме и его предполагаемая роль в передаче сигналов рецептора». Acta Crystallographica. Раздел D, Биологическая кристаллография. 58 (Pt 3): 407–13. Дои:10.1107 / S0907444901021278. PMID  11856825.
• Штраус Г.И., Эдвинссон Л., Ларсен Ф.С., Мёллер К., Кнудсен Г.М. (2002). «Уровни циркуляции нейропептидов (CGRP, VIP, NPY) у пациентов с фульминантной печеночной недостаточностью». Нейропептиды. 35 (3–4): 174–80. Дои:10.1054 / npep.2001.0861. PMID  11884208.
• Мааян C, Беккер Y, Gesundheit B, Girgis SI (2002). «Пептид, родственный гену кальцитонина, при семейной дизавтономии». Нейропептиды. 35 (3–4): 189–95. Дои:10.1054 / npep.2001.0863. PMID  11884210.
• Филипек А., Ястшебска Б., Новотны М., Кузницкий Ю. (август 2002 г.). «CacyBP / SIP, кальциклин и белок, взаимодействующий с Siah-1, связывает белки EF-hand семейства S100». Журнал биологической химии. 277 (32): 28848–52. Дои:10.1074 / jbc.M203602200. PMID  12042313.
• Рикман К., Робишо Г.А., Рой Дж., Кантин Р., Тремблей М.Дж., Тессье, Пенсильвания (сентябрь 2002 г.). «Транскрипция ВИЧ-1 и производство вируса усиливаются провоспалительными миелоидными белками в CD4 + Т-лимфоцитах человека». Журнал иммунологии. 169 (6): 3307–13. Дои:10.4049 / jimmunol.169.6.3307. PMID  12218151.
• Фоелл Д., Ичида Ф., Фогл Т., Ю Х, Чен Р., Мияваки Т. и др. (Апрель 2003 г.). «S100A12 (EN-RAGE) в мониторинге болезни Кавасаки». Ланцет. 361 (9365): 1270–2. Дои:10.1016 / S0140-6736 (03) 12986-8. PMID  12699958.
• Фоелл Д., Кухарзик Т., Крафт М., Фогл Т., Сорг С., Домшке В., Рот Дж. (Июнь 2003 г.). «Полученный из нейтрофилов человеческий S100A12 (EN-RAGE) сильно экспрессируется во время хронического активного воспалительного заболевания кишечника». Кишечник. 52 (6): 847–53. Дои:10.1136 / гут.52.6.847. ЧВК  1773692. PMID  12740341.