SCRIB - SCRIB

SCRIB
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1UJU, 1WHA, 1X5Q, 2W4F, 4WYU, 4WYT
Идентификаторы
Псевдонимы	SCRIB, CRIB1, SCRB1, SCRIB1, Vartul, набросанный белок плоской клеточной полярности, набросанный белком плоской клеточной полярности
Внешние идентификаторы	OMIM: 607733 MGI: 2145950 ГомолоГен: 44228 Генные карты: SCRIB
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q24.3 Начните 143,790,920 бп[1] Конец 143,815,773 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 D3 | 15 35,29 см Начните 76,047,158 бп[2] Конец 76,069,784 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • активность гуанилаткиназы • связывание ионотропных рецепторов глутамата • связывание кадгерина Сотовый компонент • постсинаптическая мембрана • проекция клетки • мембрана • межклеточное соединение • стык • клеточная мембрана • нуклеоплазма • миелиновая оболочка абаксональной области • соединение клеток • передний край ячейки • пресинапс • внеклеточная экзосома • пресинаптическая мембрана • ламеллиподиум • Комплекс Scrib-APC-бета-катенин • цитоплазма • зона контакта ячейка • ионотропный рецепторный комплекс глутамата • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • базолатеральная плазматическая мембрана • синапс • глутаматергический синапс • внешний компонент постсинаптической плотной мембраны Биологический процесс • дифференциация клеток • установление полярности апикальных / базальных клеток • нацеливание на синаптические пузырьки • GO: 0032861, GO: 0032862, GO: 0032856 активация активности GTPase • миграция клеток астроцитов • апоптотический процесс, вовлеченный в морфогенез • лечение раны • морфогенез слуховых рецепторных клеток • морфогенез протока молочной железы • организация стереоцилий слуховых рецепторных клеток • развитие многоклеточного организма • закрытие нервной трубки • эндоцитоз синаптических пузырьков • локализация белка на стыке сращений • положительная регуляция апоптотического процесса • положительный хемотаксис • морфогенез эмбрионального эпителия • клеточная пролиферация • GO: 0022415 вирусный процесс • миграция клеток • развитие кохлеарного ядра • отрицательная регуляция митотического клеточного цикла • положительное регулирование рециклинга рецепторов • химическая синаптическая передача • кластеризация рецепторов • установление или поддержание апикальной / базальной полярности эпителиальных клеток • GMP метаболический процесс • Метаболический процесс GDP • локализация рецептора в синапсе • Транспорт рецептора нейромедиатора, эндосома к постсинаптической мембране • Постсинаптическая мембрана транспортирует рецептор нейромедиатора к эндосоме • уклонение или толерантность вируса иммунного ответа хозяина • подавление вирусом опосредованного интерфероном сигнального пути хозяина I типа • подавление вирусом врожденного иммунного ответа хозяина • подавление вирусом активности хозяина STAT1 • подавление вирусом активности хозяина STAT2 • межклеточная адгезия • локализация белка • везикулярный транспорт в синапсе • регуляция интернализации постсинаптических рецепторов нейромедиаторов • постанальный морфогенез хвоста • Организация стереоцилий рецепторов внутреннего уха Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	23513	105782
Ансамбль	ENSG00000274287 ENSG00000180900	ENSMUSG00000022568
UniProt	Q14160	Q80U72
RefSeq (мРНК)	NM_182706 NM_015356	NM_134089 NM_001310542 NM_001310543
RefSeq (белок)	NP_056171 NP_874365	NP_001297471 NP_001297472 NP_598850
Расположение (UCSC)	Chr 8: 143,79 - 143,82 Мб	Chr 15: 76.05 - 76.07 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

SCRIB, также известен как Каракули, SCRIBL, или Нарисованный гомолог (Drosophila), это эшафот белок который у человека кодируется SCRIB ген.^[5][6] Первоначально он был изолирован в Drosophila melanogaster в дорожке (также известной как комплекс Scribble) с DLGAP5 (Диски большие) и LLGL1 (Летальные гигантские личинки) как супрессор опухолей.^[7] У человека SCRIB обнаруживается как мембранный белок и участвует в миграция клеток, полярность ячейки, и распространение клеток в эпителиальные клетки.^[7][8] Есть также убедительные доказательства того, что SCRIB может играть роль в прогрессировании рака из-за его сильного гомология к белку дрозофилы.^[7]

Функция

В Drosophila melanogaster, SCRIB участвует в синаптической функции, дифференцировке нейробластов и поляризации эпителия. Механически человек гомолог белок каркаса, связанный с клеточная дифференциация сосредоточены на регуляции эпителиального, а также нейронального морфогенеза. Дефицит SCRIB ухудшает многие аспекты полярность ячейки и движение клеток. SCRIB также, вероятно, участвует в установлении апикально-базальной полярности, а также в развитии от Фаза G1 к Фаза S в клеточный цикл в результате его отношений с распространение клеток и экзоцитоз.^[8]

Транскрибируемые белковые продукты гена SCRIB вместе с DLGAP5 (Диски большие) и LLGL1 (Летальные гигантские личинки) являются компонентами комплекса Scribble, локализованного в базолатеральной мембране. Комплекс Scribble играет роль в определении полярность ячейки и распространение клеток в эпителиальные клетки.^[9] Точный механизм, посредством которого эти белки функционируют вместе, в настоящее время неизвестен, но они участвуют в нескольких сигнальных путях, переносе везикул и в миозин II-актиновый цитоскелет.^[7] Было показано, что комплекс Scribble способствует идентичности базолатеральной мембраны за счет противодействия как комплексу Par, так и комплексу Crumbs, которые способствуют идентичности апикальной мембраны.^[9] Эти гены также были идентифицированы как супрессоры опухолей в Drosophila melanogaster. Поскольку эти гены в высокой степени консервативны у людей, есть доказательства того, что они играют роль в прогрессировании рака.^[7]

Структура

Гомолог человека - белок LAP, он содержит 16 лейцин -богатые повторы и четыре PDZ домены.^[10] SCRIB принадлежит к белковому комплексу, содержащему betaPIX, фактор обмена для Rac / Cdc42, и GIT1, белок, активирующий ГТФазу для ARF6 участвует в рециклинге рецепторов и экзоцитозе.^[11]

Субклеточное и тканевое распределение

SCRIB чаще всего обнаруживается в клеточной мембране в виде белок периферической мембраны. Комплекс Scribble локализован на базолатеральной мембране.^[9] SCRIB также встречается в клеточных соединениях, таких как прилипает к стыкам и узкие стыки.^[12] В частности, он находится в почка, скелетные мышцы, печень, легкое, грудь, кишечник, плацента и эпителиальный клетки.^[13]

Клиническое значение

В PDZ домен SCRIB связывается непосредственно с вирус папилломы человека Белок Е6.^[14] SCRIB предназначен для убиквитинирование комплексом E6 и UBE3A и E6 вызывает деградацию SCRIB.^[14]

Роль супрессора опухолей

Как упоминалось выше, SCRIB был идентифицирован как опухолевый супрессор наряду с DLGAP5 (Диски большие) и LLGL1 (Смертельные гигантские личинки).^[7] В частности, было показано, что мутанты с дефицитом SCRIB способствуют активности многих онкогены.^[9] Например, известно, что SCRIB ингибирует образование рака груди, а истощение SCRIB способствует неопластический рост за счет нарушения морфогенез и подавление смерть клетки через ассоциацию с Мой с.^[9][15] В клетках человека, экспрессирующих онкогенный Рас или Раф, было обнаружено, что потеря SCRIB привела к вторжению в внеклеточный матрикс различными типами клеток. Считается, что это прямой результат регулирования MAP киназа путь по SCRIB.^[16]

Роль в эпителиальном мезенхимальном переходе (ЭМП)

Благодаря своей роли в полярность ячейки и подвижность клеток, SCRIB также был замешан в эпителиальный мезенхимальный переход (EMT), который связан с опухолью метастаз и распространение во многих раки. EMT участвует в прогрессировании рака, позволяя статическим эпителиальный клетки становятся мигрирующими и позволяют этим клеткам адаптироваться, а также колонизировать новую среду. В злокачественных эпителиальных тканях SCRIB обнаруживается в основном в цитозоле, а не в обычном месте в мембране, таким образом, дополнительно участвуя в опухолевой прогрессии и EMT для SCRIB.^[17]

Нокдаун-мутанты привели к потере адгезии между эпителиальными клетками почек собак Madin-Darby. Эта потеря адгезии коррелировала с приобретенным мезенхимальный появление, увеличение моторики и потеря направленности. Эти эффекты были прямым результатом прерывания E-кадгерин -опосредованная клеточная адгезия.^[18] Уменьшение миграции клеток и общее снижение маркеров клеточной подвижности, а также эпителиальный мезенхимальный переход Медиаторы также наблюдались в небольших клетках аденокарциномы легких, которые были истощены по SCRIB.^[17]

использованная литература

1. ENSG00000180900 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000274287, ENSG00000180900 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000022568 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: гомолог SCRIB (Drosophila)».
6. Нагасе Т., Секи Н., Танака А., Исикава К., Номура Н. (август 1995 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IV. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0121-KIAA0160), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 2 (4): 167–74, 199–210. Дои:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID  8590280.
7. Патрик Гумберт; Сара Рассел; Хелена Ричардсон (июнь 2003 г.). «Dlg, Scribble и Lgl в полярности клеток, пролиферации клеток и раке». BioEssays. 25 (6): 542–53. Дои:10.1002 / bies.10286. PMID  12766944.
8. L E Dow; Дж. С. Кауфман; Джей Кэдди; А. С. Петерсон; С. М. Джейн; С. М. Рассел и П. О. Гумберт (апрель 2007 г.). «Супрессор опухолей Scribble определяет полярность клеток во время направленной миграции эпителия: регуляция рекрутирования Rho GTPase на передний край». Онкоген. 26 (16): 2272–82. Дои:10.1038 / sj.onc.1210016. PMID  17043654.
9. Ройер К., Лу Х (сентябрь 2011 г.). "Полярность эпителиальных клеток: главный привратник против рака?". Разница в гибели клеток. 18 (9): 1470–7. Дои:10.1038 / cdd.2011.60. ЧВК  3178423. PMID  21617693.
10. Дженнифер Н. Мердок; Дебора Дж. Хендерсон; Кит Дудни; Карлес Гастон-Массуэ; Хелен М. Филлипс; Кэролайн Патернотт; Рут Аркелл; Филип Станье и Эндрю Дж. Копп (ноябрь 2002 г.). «Нарушение каракулей (Scrb1) вызывает серьезные дефекты нервной трубки у мышей с круглым хвостом». Гм. Мол. Genet. 12 (2): 87–98. Дои:10,1093 / чмг / 12.2.87. PMID  12499390.
11. Nola S, Sebbagh M, Marchetto S, Osmani N, Nourry C, Audebert S, Navarro C, Rachel R, Montcouquiol M, Sans N, Etienne-Manneville S, Borg JP, Santoni MJ (ноябрь 2008 г.). «Scrib регулирует активность PAK в процессе миграции клеток». Гм. Мол. Genet. 17 (22): 3552–65. Дои:10.1093 / hmg / ddn248. PMID  18716323.
12. Пети М.М., Меулеманс С.М., Ален П., Аюби Т.А., Янсен Э., Ван де Вен В.Дж. (январь 2005 г.). «Супрессор опухолей Scrib взаимодействует с зиксин-родственным белком LPP, который перемещается между сайтами клеточной адгезии и ядром». BMC Cell Biol. 6 (1): 1. Дои:10.1186/1471-2121-6-1. ЧВК  546208. PMID  15649318.
13. Наварро С., Нола С., Одеберт С., Сантони М.Дж., Арсанто Дж. П., Гинестье С., Маркетто С., Жакемье Дж., Иснардон Д., Ле Бивик А., Бирнбаум Д., Борг Дж. П. (июнь 2005 г.). «Вербовка узлов Scribble у млекопитающих зависит от вовлечения E-кадгерина». Онкоген. 24 (27): 4330–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1208632. PMID  15806148.
14. Nakagawa S, Huibregtse JM (ноябрь 2000 г.). «Человеческие каракули (Вартул) нацелены на опосредованную убиквитином деградацию белками E6 папилломавируса высокого риска и убиквитин-протеинлигазой E6AP». Мол. Cell. Биол. 20 (21): 8244–53. Дои:10.1128 / MCB.20.21.8244-8253.2000. ЧВК  86433. PMID  11027293.
15. Чжан Л., Розенберг А., Бергами К.С., Ю М., Сюань З., Джаффе А.Б., Оллред К., Мутхусвами С.К. (ноябрь 2008 г.). «Нарушение регуляции каракулей способствует онкогенезу молочной железы и показывает роль полярности клеток в карциноме». Ячейка. 135 (5): 865–78. Дои:10.1016 / j.cell.2008.09.045. ЧВК  3015046. PMID  19041750.
16. L E Dow; Я Эльсум; C L King; К. М. Кинросс; Е. Ричардсон и П. О. Гумберт (июль 2008 г.). «Потеря человеческого Scribble взаимодействует с H-Ras, чтобы способствовать клеточной инвазии посредством дерегуляции передачи сигналов MAPK». Онкоген. 27 (46): 5988–6001. Дои:10.1038 / onc.2008.219. PMID  18641685.
17. Валентина Вайра; Алиса Фаверсани; Такехико Дохи; Марко Маджони; Марио Нозотти; Дельфина Този; Дарио К. Альтьери; Сильвано Босари (июнь 2011 г.). «Аберрантная сверхэкспрессия каракулей модуля клеточной полярности при раке человека». Американский журнал патологии. 178 (6): 2478–83. Дои:10.1016 / j.ajpath.2011.02.028. ЧВК  3124121. PMID  21549346.
18. И Цинь; Кристофер Капальдо; Барри М. Гамбинер и Ян Г. Макара (декабрь 2005 г.). «Белок полярности SCRIB млекопитающих регулирует адгезию и миграцию эпителиальных клеток через E-кадгерин». Журнал клеточной биологии. 171 (6): 1061–71. Дои:10.1083 / jcb.200506094. ЧВК  2171311. PMID  16344308.

дальнейшее чтение

• Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Н. и др. (2003). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Res. 9 (3): 99–106. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID  12168954.
• Нагасе Т., Секи Н., Танака А. и др. (1996). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IV. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0121-KIAA0160), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 2 (4): 167–74, 199–210. Дои:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID  8590280.
• Накагава С., Хьюибрегтсе Дж. М. (2000). «Человеческие каракули (Вартул) нацелены на опосредованную убиквитином деградацию белками E6 папилломавируса высокого риска и убиквитин-протеинлигазой E6AP». Мол. Cell. Биол. 20 (21): 8244–53. Дои:10.1128 / MCB.20.21.8244-8253.2000. ЧВК  86433. PMID  11027293.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Доу Л. Е., Брамби А. М., Мураторе Р. и др. (2004). «hScrib является функциональным гомологом супрессора опухолей Drosophila Scribble». Онкоген. 22 (58): 9225–30. Дои:10.1038 / sj.onc.1207154. PMID  14681682.
• Накагава С., Яно Т., Накагава К. и др. (2004). «Анализ экспрессии и локализации белка LAP, человеческого каракуля, в нормальном и неопластическом эпителии шейки матки». Br. J. Рак. 90 (1): 194–9. Дои:10.1038 / sj.bjc.6601465. ЧВК  2395302. PMID  14710229.
• Бауместер Т., Баух А., Раффнер Х. и др. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. Дои:10.1038 / ncb1086. PMID  14743216. S2CID  11683986.
• Брилл Л.М., Саломон А.Р., Фикарро С.Б. и др. (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т-клеток человека с использованием аффинной хроматографии с иммобилизованным металлом и тандемной масс-спектрометрии». Анальный. Chem. 76 (10): 2763–72. Дои:10.1021 / ac035352d. PMID  15144186.
• Ленер Б, Сандерсон CM (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Res. 14 (7): 1315–23. Дои:10.1101 / gr.2122004. ЧВК  442147. PMID  15231747.
• Борг JP (2004). «[hScrib: потенциальный новый опухолевый супрессор]». Патол. Биол. 52 (6): 328–31. Дои:10.1016 / j.patbio.2003.09.015. PMID  15261375.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А. и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши». Мол. Cell. Протеомика. 3 (11): 1093–101. Дои:10.1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID  15345747.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Пети М.М., Меулеманс С.М., Ален П. и др. (2006). «Супрессор опухолей Scrib взаимодействует с зиксин-родственным белком LPP, который перемещается между сайтами клеточной адгезии и ядром». BMC Cell Biol. 6 (1): 1. Дои:10.1186/1471-2121-6-1. ЧВК  546208. PMID  15649318.
• Барриос-Родилес М., Браун К.Р., Оздамар Б. и др. (2005). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука. 307 (5715): 1621–5. Дои:10.1126 / science.1105776. PMID  15761153. S2CID  39457788.
• Лахуна О., Куэллари М., Ахард С. и др. (2005). «Транспортировка рецепторов тиротропина зависит от пути hScrib-betaPIX-GIT1-ARF6». EMBO J. 24 (7): 1364–74. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600616. ЧВК  1142541. PMID  15775968.
• Наварро С., Нола С., Одеберт С. и др. (2005). «Вербовка узлов Scribble у млекопитающих зависит от вовлечения E-кадгерина». Онкоген. 24 (27): 4330–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1208632. PMID  15806148.
• Métais JY, Navarro C, Santoni MJ и др. (2005). «hScrib взаимодействует с ZO-2 в межклеточных соединениях эпителиальных клеток». FEBS Lett. 579 (17): 3725–30. Дои:10.1016 / j.febslet.2005.05.062. PMID  15975580. S2CID  4893407.
• Томас М., Массими П., Наварро С. и др. (2005). «Апико-базальный контрольный комплекс hScrib / Dlg по-разному нацелен на белки E6 HPV-16 и HPV-18». Онкоген. 24 (41): 6222–30. Дои:10.1038 / sj.onc.1208757. PMID  16103886.