2 СЕНТЯБРЯ - SEPT2

СЕНТЯБРЬ2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2QA5, 2QAG, 2QNR
Идентификаторы
Псевдонимы	СЕНТЯБРЬ2, DIFF6, NEDD-5, NEDD5, Pnutl3, hNedd5, септин 2, SEPT2
Внешние идентификаторы	OMIM: 601506 MGI: 97298 ГомолоГен: 3243 Генные карты: СЕНТЯБРЬ2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q37.3 Начните 241,315,100 бп[1] Конец 241,354,027 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 Д Начните 93,478,993 бп[2] Конец 93,509,733 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • Связывание GTP • GO: 0001948 связывание с белками • связывание кадгерина • идентичное связывание с белками • ГТФазная активность • GO: 0032947 активность молекулярного адаптера Сотовый компонент • цитоплазма • Кинетохора конденсированной хромосомы • проекция клетки • мембрана • клеточная мембрана • шпиндель • комплекс септина • хромосома • фоторецептор, соединяющий реснички • клеточная кора • экзоциста • середина тела • ядрышко • ресничная мембрана • актиновый цитоскелет • перинуклеарная область цитоплазмы • GO: 0035085 аксонема • борозда декольте • хромосома, центромерная область • цитоскелет • внеклеточная экзосома • ядро клетки • кинетохора • цитозоль • кольцо спермы • неподвижная ресничка • ресничка • септиновое кольцо • цитоскелет микротрубочек • подвижная ресничка Биологический процесс • деление клеток • клеточный цикл • развитие проекции нейрона • сперматогенез • дифференциация клеток • сглаженный сигнальный путь • морфогенез ресничек • цитоскелет-зависимый цитокинез Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	4735	18000
Ансамбль	ENSG00000168385	ENSMUSG00000116048
UniProt	Q15019	P42208
RefSeq (мРНК)	NM_001008491 NM_001008492 NM_001282972 NM_001282973 NM_004404 NM_006155 NM_001321029 NM_001321030 NM_001321031 NM_001321032 NM_001321033 NM_001321034 NM_001321035 NM_001349287 NM_001349288 NM_001349289 NM_001349290 NM_001349291 NM_001349302 NM_001349304 NM_001349305 NM_001349306 NM_001349307 NM_001349308 NM_001349309 NM_001349310 NM_001349311 NM_001349312 NM_001349313 NM_001349314 NM_001349315	NM_001159717 NM_001159718 NM_001159719 NM_010891
RefSeq (белок)	NP_001008491 NP_001008492 NP_001269901 NP_001269902 NP_001307958 NP_001307959 NP_001307960 NP_001307961 NP_001307962 NP_001307963 NP_001307964 NP_004395 NP_006146 NP_001336216 NP_001336217 NP_001336218 NP_001336219 NP_001336220 NP_001336231 NP_001336233 NP_001336234 NP_001336235 NP_001336236 NP_001336237 NP_001336238 NP_001336239 NP_001336240 NP_001336241 NP_001336242 NP_001336243 NP_001336244	NP_001153189 NP_001153190 NP_001153191 NP_035021
Расположение (UCSC)	Chr 2: 241,32 - 241,35 Мб	Chr 1: 93,48 - 93,51 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Септин 2, также известен как 2 СЕНТЯБРЯ, это белок который у человека кодируется 2 СЕНТЯБРЯ ген.^[5][6]

Функция

SEPT2 может гетероолигомеризоваться с 6 СЕНТЯБРЯ и 7 СЕНТЯБРЯ сформировать нити.^[7] SEPT2 взаимодействовал с SEPT6 через свой C-терминал спиральная катушка домен.^[7] Сбить SEPT2, SEPT6 и SEPT7 в причинах актин нервные волокна разрушаются, а клетки теряются полярность. Септины, SOCS7, и NCK1 являются частью сигнального пути, который связывает регуляцию реакции цитоскелета на повреждение ДНК.^[8]

Взаимодействия

SEPT2 был показан взаимодействовать с участием:

• 6 СЕНТЯБРЯ^[9][10]
• 7 СЕНТЯБРЯ,^[9][11] и
• 9 СЕНТЯБРЯ.^[9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000168385 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000116048 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Entrez Gene: SEPT2 септин 2".
6. Мори Т., Миура К., Фудзивара Т., Шин С., Инадзава Дж., Накамура И. (1996). «Выделение и картирование гена человека (DIFF6), гомологичного дрожжевому CDC3, CDC10, CDC11 и CDC12, и Diff6 мыши». Цитогенетика и клеточная генетика. 73 (3): 224–7. Дои:10.1159/000134343. PMID  8697812.
7. Низкий C, Macara IG (октябрь 2006 г.). «Структурный анализ комплексов септина 2, 6 и 7». Журнал биологической химии. 281 (41): 30697–706. Дои:10.1074 / jbc.M605179200. PMID  16914550.
8. Кремер Б.Э., Аданг Л.А., Макара И.Г. (сентябрь 2007 г.). «Септины регулируют организацию актина и остановку клеточного цикла за счет накопления NCK в ядре, опосредованного SOCS7». Ячейка. 130 (5): 837–50. Дои:10.1016 / j.cell.2007.06.053. ЧВК  2085444. PMID  17803907.
9. Сурка М.С., Цанг С.В., Trimble WS (октябрь 2002 г.). «Септин млекопитающих MSF находится в микротрубочках и необходим для завершения цитокинеза». Молекулярная биология клетки. 13 (10): 3532–45. Дои:10.1091 / mbc.E02-01-0042. ЧВК  129964. PMID  12388755.
10. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
11. Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3: 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.

дальнейшее чтение

• Нагасе Т., Секи Н., Танака А., Исикава К., Номура Н. (август 1995 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IV. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0121-KIAA0160), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК исследования. 2 (4): 167–74, 199–210. Дои:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID  8590280.
• Мори Т., Миура К., Фудзивара Т., Шин С., Инадзава Дж., Накамура И. (1996). «Выделение и картирование гена человека (DIFF6), гомологичного дрожжевому CDC3, CDC10, CDC11 и CDC12, и Diff6 мыши». Цитогенетика и клеточная генетика. 73 (3): 224–7. Дои:10.1159/000134343. PMID  8697812.
• Киношита М., Кумар С., Мидзогути А., Иде С., Киношита А., Харагути Т., Хираока Ю., Нода М. (июнь 1997 г.). «Nedd5, септин млекопитающих, представляет собой новый компонент цитоскелета, взаимодействующий со структурами на основе актина». Гены и развитие. 11 (12): 1535–47. Дои:10.1101 / gad.11.12.1535. PMID  9203580.
• Hsu SC, Hazuka CD, Roth R, Foletti DL, Heuser J, Scheller RH (июнь 1998 г.). «Субъединичный состав, белковые взаимодействия и структуры комплекса sec6 / 8 мозга млекопитающих и филаментов септина». Нейрон. 20 (6): 1111–22. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80493-6. PMID  9655500. S2CID  10915358.
• Киношита А., Киношита М., Акияма Х., Томимото Х., Акигучи И., Кумар С., Нода М., Кимура Дж. (Ноябрь 1998 г.). «Идентификация септинов в нейрофибриллярных клубках при болезни Альцгеймера». Американский журнал патологии. 153 (5): 1551–60. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 65743-4. ЧВК  1853406. PMID  9811347.
• Центр Сангера, The; Центр секвенирования генома Вашингтонского университета, The (ноябрь 1998 г.). «К полной последовательности человеческого генома». Геномные исследования. 8 (11): 1097–108. Дои:10.1101 / гр. 8.11.1097. PMID  9847074.
• Бейтес С.Л., Се Х., Баузер Р., Trimble WS (май 1999 г.). «Септин CDCrel-1 связывает синтаксин и подавляет экзоцитоз». Природа Неврология. 2 (5): 434–9. Дои:10.1038/8100. PMID  10321247. S2CID  5863477.
• Ходжа М.Р., Валестедт С., Хёгк С. (август 2000 г.). «Стратегия визуальной внутриклеточной классификации не охарактеризованных белков человека». Экспериментальные исследования клеток. 259 (1): 239–46. Дои:10.1006 / excr.2000.4948. PMID  10942595.
• Сакаи К., Куримото М., Цугу А., Хаббард С.Л., Trimble WS, Рутка Д.Т. (май 2002 г.). «Экспрессия Nedd5, септина млекопитающих, в опухолях мозга человека». Журнал нейроонкологии. 57 (3): 169–77. Дои:10.1023 / А: 1015721801075. PMID  12125979. S2CID  20554212.
• Сурка М.С., Цанг С.В., Trimble WS (октябрь 2002 г.). «Септин млекопитающих MSF находится в микротрубочках и необходим для завершения цитокинеза». Молекулярная биология клетки. 13 (10): 3532–45. Дои:10.1091 / mbc.E02-01-0042. ЧВК  129964. PMID  12388755.
• Шеффилд П.Дж., Оливер С.Дж., Кремер Б.Е., Шенг С., Шао З., Макара И.Г. (январь 2003 г.). «Взаимодействие борг / септин и сборка гетеродимеров, тримеров и филаментов септина млекопитающих». Журнал биологической химии. 278 (5): 3483–8. Дои:10.1074 / jbc.M209701200. PMID  12446710.
• Vega IE, Hsu SC (январь 2003 г.). «Белок септина Nedd5 связывается как с комплексом экзоцисты, так и с микротрубочками, и нарушение его активности GTPase способствует аберрантному отрастанию нейритов в клетках PC12». NeuroReport. 14 (1): 31–7. Дои:10.1097/00001756-200301200-00006. PMID  12544826. S2CID  22757290.
• Кошелев Ю.А., Киселев С.Л., Георгиев Г.П. (2004). «Взаимодействие белка S100A4 (Mts1) с септинами Sept2, Sept6 и Sept7 in vitro». Доклады Биохимия и биофизика. 391: 195–7. Дои:10.1023 / А: 1025149005902. PMID  14531065. S2CID  26291196.
• Она Ю.М., Хуанг Ю.В., Чжан Л., Trimble WS (2004). «Фосфорилирование септина 2: теоретические и масс-спектрометрические доказательства существования единственного сайта фосфорилирования in vivo». Быстрые коммуникации в масс-спектрометрии. 18 (10): 1123–30. Дои:10.1002 / RCM.1453. PMID  15150837.
• Нагата К., Асано Т., Нозава Ю., Инагаки М. (декабрь 2004 г.). «Биохимические и клеточно-биологические анализы комплекса септина млекопитающих, 7 сентября / 9b / 11». Журнал биологической химии. 279 (53): 55895–904. Дои:10.1074 / jbc.M406153200. PMID  15485874.
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Д., Чжан Х., Чжа Х.М., Полакевич Р.Д., Гребень М.Дж. (январь 2005 г.). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Природа Биотехнологии. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Леунг А.К., Онг С.Е., Лион CE, Ламонд А.И., Манн М. (январь 2005 г.). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Спилиотис Е.Т., Киношита М., Нельсон В.Дж. (март 2005 г.). «Каркас митотического септина, необходимый для конгресса и сегрегации хромосом млекопитающих». Наука. 307 (5716): 1781–5. Дои:10.1126 / science.1106823. ЧВК  3368603. PMID  15774761.