SERPINB1 - SERPINB1

SERPINB1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4GA7
Идентификаторы
Псевдонимы	SERPINB1, EI, ELANH2, HEL57, LEI, M / NEI, MNEI, PI-2, PI2, HEL-S-27, член B семейства серпинов 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 130135 MGI: 1913472 ГомолоГен: 133768 Генные карты: SERPINB1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п25.2 Начните 2,832,332 бп[1] Конец 2,841,959 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 A3.2 | 13 13,75 см Начните 32,842,092 бп[2] Конец 32,851,185 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность ингибитора пептидазы • активность ингибитора эндопептидазы серинового типа • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • внеклеточная экзосома • мембрана • внеклеточный • просвет секреторной гранулы • внеклеточный матрикс • внеклеточная область • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • отрицательная регуляция активности пептидазы • отрицательная регуляция активности эндопептидазы • дегрануляция нейтрофилов • пролиферация клеток поджелудочной железы типа B Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	1992	66222
Ансамбль	ENSG00000021355	ENSMUSG00000044734
UniProt	P30740	Q9D154
RefSeq (мРНК)	NM_030666	NM_025429
RefSeq (белок)	NP_109591	NP_079705
Расположение (UCSC)	Chr 6: 2,83 - 2,84 Мб	Chr 13: 32,84 - 32,85 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ингибитор лейкоцитарной эластазы (LEI), также известный как серпин В1 это белок что у людей кодируется SERPINB1 ген. Он является членом серпинов клады B или ов-серпинов (серпинов, связанных с овальбумином), основанных на овальбумине.^[5][6][7]

MNEI (ингибитор эластазы моноцитов / нейтрофилов) является мышиным ортологом SerpinB1 человека.^[7]

Функция

SerpinB1 - ингибитор цитоплазматической сериновой протеазы полиморфноядерные нейтрофилы. Среди других сериновых протеаз он специфически ингибирует нейтрофильная эластаза, PR3 и катепсин G все они обнаруживаются в гранулах нейтрофилов за счет механизма суицидального ингибирования. Было обнаружено, что SerpinB1 снижает повреждение тканей, вызванное упомянутыми протеазами во время воспаления, и играет роль в гомеостазе нейтрофилов у мышей. В различных моделях инфекции (например, пневмонии) была показана корреляция отсутствия SerpinB1 и отсутствия микробного клиренса. Различные штаммы с нокаутом служат моделью для исследования роли SerpinB1 in vivo.^[8][9][10]

Смотрите также

• Серпин

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000021355 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000044734 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ремольд-О'Доннелл Э, Чин Дж, Альбертс М. (июль 1992 г.). «Последовательность и молекулярная характеристика ингибитора эластазы моноцитов / нейтрофилов человека». Proc Natl Acad Sci U S A. 89 (12): 5635–9. Bibcode:1992PNAS ... 89.5635R. Дои:10.1073 / пнас.89.12.5635. ЧВК  49347. PMID  1376927.
6. «Ген Entrez: ингибитор серпин-пептидазы SERPINB1, клад B (овальбумин), член 1».
7. Бенарафа К., Ремольд-О'Доннелл Э. (август 2005 г.). «Пересмотр серпинов овальбумина: взгляд на куриный геном эволюции серпинов клады B у позвоночных». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 102 (32): 11367–72. Bibcode:2005ПНАС..10211367Б. Дои:10.1073 / pnas.0502934102. ЧВК  1183561. PMID  16055559.
8. Гонг Д., Фарли К., Уайт М., Хартсхорн К.Л., Бенарафа К., Ремольд-О'Доннелл Э. (август 2011 г.). «Критическая роль serpinB1 в регуляции воспалительных реакций при инфекции легочного гриппа». J. Infect. Дис. 204 (4): 592–600. Дои:10.1093 / infdis / jir352. ЧВК  3144176. PMID  21791661.
9. Бенарафа К., ЛеКуйер Т.Э., Бауманн М., Столли Дж. М., Кремона Т. П., Ремольд-О'Доннелл Э. (июль 2011 г.). «SerpinB1 защищает резерв зрелых нейтрофилов в костном мозге». J. Leukoc. Биол. 90 (1): 21–9. Дои:10.1189 / jlb.0810461. ЧВК  3114599. PMID  21248149.
10. Бенарафа К., Прибе Г. П., Ремольд-О'Доннелл Э. (август 2007 г.). «Ингибитор сериновой протеазы нейтрофилов serpinb1 сохраняет защитные функции легких при инфекции Pseudomonas aeruginosa». J. Exp. Med. 204 (8): 1901–9. Дои:10.1084 / jem.20070494. ЧВК  2118684. PMID  17664292.

дальнейшее чтение

• Расмуссен Х. Х., Ван Дамм Дж., Пуйпе М. и др. (1993). «Микропоследовательности 145 белков, записанные в базе данных двумерных гелевых белков нормальных эпидермальных кератиноцитов человека». Электрофорез. 13 (12): 960–9. Дои:10.1002 / elps.11501301199. PMID  1286667. S2CID  41855774.
• Packard BZ, Lee SS, Remold-O'Donnell E, Komoriya A (1995). «Серпин из опухолевых клеток человека с прямой лимфоидной иммуномодулирующей активностью: митогенная стимуляция инфильтрирующих опухоль лимфоцитов человека». Биохим. Биофиз. Acta. 1269 (1): 41–50. Дои:10.1016/0167-4889(95)00113-7. PMID  7578269.
• Сугимори Т., Кули Дж., Хойдал-младший, Ремольд-О'Доннелл Э. (1995). «Ингибирующие свойства рекомбинантного ингибитора эластазы моноцитов / нейтрофилов человека». Am. J. Respir. Cell Mol. Биол. 13 (3): 314–22. Дои:10.1165 / ajrcmb.13.3.7654387. PMID  7654387.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Эванс Э, Кули Дж, Ремольд-О'Доннелл Э (1996). «Характеристика и хромосомная локализация ELANH2, гена, кодирующего человеческий ингибитор эластазы моноцитов / нейтрофилов». Геномика. 28 (2): 235–40. Дои:10.1006 / geno.1995.1136. PMID  8530031.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Цзэн В., Сильверман Г.А., Ремольд-О'Доннелл Э. (1998). «Структура и последовательность человеческого M / NEI (ингибитор эластазы моноцитов / нейтрофилов), гена семейства Ov-серпинов». Ген. 213 (1–2): 179–87. Дои:10.1016 / S0378-1119 (98) 00189-9. PMID  9630619.
• Сан Дж., Стивенс Р., Мирза Дж. И др. (1999). «Кластер серпиновых генов на хромосоме 6p25 человека содержит PI6, PI9 и ELANH2, которые имеют общую структуру, почти идентичную серпиновым генам овальбумина 18q21». Cytogenet. Cell Genet. 82 (3–4): 273–7. Дои:10.1159/000015118. PMID  9858835. S2CID  23659776.
• Перани П., Зеггаи С., Торрилья А, Куртуа Y (2000). «Мутации в шарнирной области ингибитора лейкоцитарной эластазы определяют утрату ингибиторной функции». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 274 (3): 841–4. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3191. PMID  10924364.
• Кули Дж., Такаяма Т.К., Шапиро С.Д. и др. (2002). «Серпиновый MNEI ингибирует эластазоподобные и химотрипсиноподобные сериновые протеазы посредством эффективных реакций в двух активных центрах». Биохимия. 40 (51): 15762–70. Дои:10.1021 / bi0113925. PMID  11747453.
• Коркмаз Б, Аттуччи С., Хазуард Э. и др. (2002). «Различение активности эластазы нейтрофилов человека и протеиназы 3 с использованием флуорогенных субстратов серпинового происхождения». J. Biol. Chem. 277 (42): 39074–81. Дои:10.1074 / jbc.M202918200. PMID  12114510.
• Бенарафа С., Кули Дж., Зенг В. и др. (2003). «Характеристика четырех мышиных гомологов человеческого ингибитора эластазы нейтрофилов ов-серпина MNEI (SERPINB1) человека». J. Biol. Chem. 277 (44): 42028–33. Дои:10.1074 / jbc.M207080200. PMID  12189154.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Геваерт К., Геталс М., Мартенс Л. и др. (2004). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Биотехнология. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ахмед М., Форсберг Дж., Бергстен П. (2005). «Профилирование белков островков поджелудочной железы человека с помощью двумерного гель-электрофореза и масс-спектрометрии». J. Proteome Res. 4 (3): 931–40. Дои:10.1021 / pr050024a. PMID  15952740.

внешние ссылки

• В МЕРОПЫ онлайн-база данных пептидаз и их ингибиторов: I04.006
• SERPINB1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.