SERPINB6 - SERPINB6

SERPINB6
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1М37
Идентификаторы
Псевдонимы	SERPINB6, CAP, DFNB91, MSTP057, PI-6, PI6, PTI, SPI3, член B семейства серпинов 6
Внешние идентификаторы	OMIM: 173321 MGI: 103123 ГомолоГен: 20956 Генные карты: SERPINB6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п25.2 Начните 2,948,159 бп[1] Конец 2,972,165 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 A3.3 | 13 14,0 см Начните 33,917,918 бп[2] Конец 34,002,794 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность ингибитора пептидазы • связывание протеазы • активность ингибитора эндопептидазы серинового типа Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • внеклеточная экзосома • ядро клетки • внеклеточный • клеточная мембрана • секреторная мембрана гранул • мембрана третичных гранул • мембрана гранул, богатая фиколином-1 • внеклеточная область • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс • комплекс ингибиторов сериновых протеаз Биологический процесс • отрицательная регуляция активности пептидазы • чувственное восприятие звука • клеточный ответ на осмотический стресс • отрицательная регуляция активности эндопептидазы • дегрануляция нейтрофилов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	5269	20719
Ансамбль	ENSG00000124570	ENSMUSG00000060147
UniProt	P35237	Q60854
RefSeq (мРНК)	NM_001195291 NM_001271822 NM_001271823 NM_001271824 NM_001271825 NM_001297699 NM_001297700 NM_004568 NM_001374515 NM_001374516 NM_001374517	NM_001164117 NM_001164118 NM_001243192 NM_009254
RefSeq (белок)	NP_001182220 NP_001258751 NP_001258752 NP_001258753 NP_001258754 NP_001284628 NP_001284629 NP_004559 NP_001361444 NP_001361445 NP_001361446	NP_001157589 NP_001157590 NP_001230121 NP_033280
Расположение (UCSC)	Chr 6: 2.95 - 2.97 Мб	Chr 13: 33.92 - 34 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Серпин В6 это белок что у людей кодируется SERPINB6 ген.^[5][6][7]

Смотрите также

• Серпин

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000124570 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060147 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Кафлин П., Сан Дж., Черрути Л., Салем Х. Х., Берд П. (ноябрь 1993 г.). «Клонирование и молекулярная характеристика ингибитора внутриклеточной сериновой протеиназы человека». Proc Natl Acad Sci U S A. 90 (20): 9417–21. Дои:10.1073 / пнас.90.20.9417. ЧВК  47579. PMID  8415716.
6. Сан Дж., Стивенс Р., Мирза Дж., Канаи Х., Рагусси Дж., Берд П.И. (февраль 1999 г.). «Кластер серпиновых генов на хромосоме 6p25 человека содержит PI6, PI9 и ELANH2, которые имеют общую структуру, почти идентичную серпиновым генам овальбумина 18q21». Cytogenet Cell Genet. 82 (3–4): 273–7. Дои:10.1159/000015118. PMID  9858835. S2CID  23659776.
7. «Ген Entrez: ингибитор серпин-пептидазы SERPINB6, клад B (овальбумин), член 6».

дальнейшее чтение

• Сан Дж., Кафлин П., Салем Х. Х., Берд П. (1995). «Производство и характеристика рекомбинантного ингибитора протеиназы человека 6, экспрессированного в Pichia pastoris». Биохим. Биофиз. Acta. 1252 (1): 28–34. Дои:10.1016/0167-4838(95)00108-7. PMID  7548163.
• Кафлин П., Николл Дж., Сан Дж. И др. (1995). «Хромосомное картирование гена ингибитора протеиназы 6 (PI6) человека на 6p25 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Геномика. 26 (2): 431–3. Дои:10.1016 / 0888-7543 (95) 80240-М. PMID  7601482.
• Моргенштерн К.А., Спречер С., Холт Л. и др. (1994). «Комплементарное клонирование ДНК и кинетическая характеристика нового внутриклеточного ингибитора сериновой протеиназы: механизм действия с трипсином и фактором Ха в качестве модельных протеиназ». Биохимия. 33 (11): 3432–41. Дои:10.1021 / bi00177a037. PMID  8136380.
• Моргенштерн К.А., Хензель В.Дж., Бейкер Дж.Б. и др. (1993). «Выделение и характеристика внутриклеточного ингибитора сериновой протеиназы из линии эпителиальных клеток почки обезьяны». J. Biol. Chem. 268 (29): 21560–8. PMID  8408007.
• Coughlin PB, Tetaz T, Salem HH (1993). «Идентификация и очистка нового ингибитора сериновой протеиназы». J. Biol. Chem. 268 (13): 9541–7. PMID  8486644.
• Ревальд М., Моргенштерн К.А., Шлиф Р.Р. (1996). «Идентификация и характеристика цитоплазматической антипротеиназы (CAP) в тромбоцитах человека. Доказательства взаимодействия CAP с эндогенными белками тромбоцитов». J. Biol. Chem. 271 (12): 7160–7. Дои:10.1074 / jbc.271.12.7160. PMID  8636153.
• Ревальд М., Шлиф Р.Р. (1996). «Цитоплазматическая антипротеиназа человека быстро и эффективно нейтрализует химотрипсин и трипсиноподобные протеазы с использованием различных остатков реактивного сайта». J. Biol. Chem. 271 (24): 14526–32. Дои:10.1074 / jbc.271.24.14526. PMID  8662739.
• Скотт Ф.Л., Паддл-Лединек Дж. Э., Черрути Л. и др. (1999). «Экспрессия ингибитора протеиназы 6 (PI-6) в коже человека: индукция PI-6 и комплекса PI-6 / протеиназа во время дифференцировки кератиноцитов». Exp. Cell Res. 245 (2): 263–71. Дои:10.1006 / excr.1998.4241. PMID  9851866.
• Миколайчик С.Д., Миллар Л.С., Маркер К.М. и др. (1999). «Идентификация нового комплекса между человеческим калликреином 2 и ингибитором протеазы-6 в ткани рака простаты». Рак Res. 59 (16): 3927–30. PMID  10463585.
• Саеди М.С., Чжу З., Маркер К. и др. (2002). «Калликреин 2 человека (hK2), но не простатоспецифический антиген (PSA), быстро соединяется с ингибитором протеазы 6 (PI-6), высвобождаемым из клеток карциномы простаты». Int. J. Рак. 94 (4): 558–63. Дои:10.1002 / ijc.1501. PMID  11745444. S2CID  2826757.
• Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK и др. (2002). «Анализ экспрессируемых последовательностей хрусталика взрослого человека для проекта NEIBank: более 2000 неизбыточных транскриптов, новые гены и варианты сплайсинга». Мол. Vis. 8: 171–84. PMID  12107413.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Стрик М.С., Вольбинк А., Воутерс Д. и др. (2004). «Внутриклеточный серпин SERPINB6 (PI6) обильно экспрессируется тучными клетками человека и образует комплексы с мономерами бета-триптазы». Кровь. 103 (7): 2710–7. Дои:10.1182 / кровь-2003-08-2981. PMID  14670919.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Чаррон Ю., Мадани Р., Неф С. и др. (2006). «Экспрессия серпинов serpinb6 в зародышевых и соматических клетках гонад мыши». Мол. Репродукция. Dev. 73 (1): 9–19. Дои:10.1002 / мрд.20385. PMID  16175637. S2CID  42438203.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.

внешние ссылки

• В МЕРОПЫ онлайн-база данных пептидаз и их ингибиторов: I04.011
• SERPINB6 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)