Секвестосома 1 - Sequestosome 1

SQSTM1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1 квартал 2002 года, 2JY7, 2JY8, 2K0B, 2КНВ, 4MJS, 4UF8, 4UF9
Идентификаторы
Псевдонимы	SQSTM1, A170, OSIL, PDB3, ZIP3, p60, p62, p62B, FTDALS3, Секестосома 1, NADGP, DMRV
Внешние идентификаторы	OMIM: 601530 MGI: 107931 ГомолоГен: 31202 Генные карты: SQSTM1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q35.3 Начинать 179,806,398 бп[1] Конец 179,838,078 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 B1.3 Начинать 50,199,366 бп[2] Конец 50,210,827 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность гомодимеризации белков • связывание рецепторной тирозинкиназы • связывание ионов цинка • Привязка домена SH2 • связывание ионов металлов • активность протеин-серин / треонинкиназы • Связанное с K63 связывание с белком, зависимым от модификации полиубиквитина • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • связывание протеинкиназы • связывание протеинкиназы C • связывание убиквитина • связывание ферментов • связывание убиквитин-протеин-лигазы • связывание ионотропных рецепторов глутамата Сотовый компонент • цитоплазма • эндосома • Тело PML • поздняя эндосома • П-боди • преаутофагосомная структура • нуклеоплазма • агрессивный • аутофагосома • амфисома • эндоплазматический ретикулум • тело включения • лизосома • середина спермы • внеклеточная экзосома • цитоплазматический пузырек • ядро клетки • цитозоль • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • автолизосома • митохондрия • саркомер • Тело Леви Биологический процесс • апоптотический процесс • локализация белка • дифференциация клеток • положительная регуляция фосфорилирования белков • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • регуляция митохондриальной организации • гетероолигомеризация белков • иммунная система • реакция на стресс • регуляция передачи сигнала белка Ras • отрицательная регуляция апоптотического процесса • аутофагия • эндосомный транспорт • регуляция стабильности белкового комплекса • аутофагия митохондрии • положительная регуляция апоптотического процесса • регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • фосфорилирование белков • митофагия • ответ на митохондриальную деполяризацию • макроавтофагия • эндосомная организация • локализация белка в перинуклеарной области цитоплазмы • ответ на ишемию • митохондриальная организация • агрефагия • избирательная аутофагия • сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-1 • положительная регуляция долговременной синаптической потенциации • положительное регулирование локализации белка в плазматической мембране Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8878	18412
Ансамбль	ENSG00000161011 ENSG00000284099	ENSMUSG00000015837
UniProt	Q13501	Q64337
RefSeq (мРНК)	NM_001142298 NM_001142299 NM_003900	NM_001290769 NM_011018
RefSeq (белок)	NP_001135770 NP_001135771 NP_003891	NP_001277698 NP_035148
Расположение (UCSC)	Chr 5: 179,81 - 179,84 Мб	Chr 11: 50.2 - 50.21 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Секестосома-1 это белок что у людей кодируется SQSTM1 ген.^[5][6][7] Также известен как убиквитин-связывающий белок p62,^[8] это аутофагосома белок-груз, который нацелен на другие белки, которые связываются с ним для селективного аутофагия. Взаимодействуя с GATA4 и направляя его на деградацию, он может ингибировать связанный с GATA-4 старение и секреторный фенотип, связанный со старением.^[9]

Модельные организмы

Sqstm1 нокаутный фенотип мыши

Характеристика	Фенотип
Гомозигота жизнеспособность	Нормальный
Плодородие	Нормальный
Масса тела	Нормальный
Беспокойство	Нормальный
Неврологический осмотр	Нормальный
Сила захвата	Нормальный
Горячая тарелка	Нормальный
Дисморфология	Нормальный
Косвенная калориметрия	Нормальный
Тест толерантности к глюкозе	Нормальный
Слуховой ответ ствола мозга	Нормальный
DEXA	Нормальный
Рентгенография	Нормальный
Температура тела	Нормальный
Морфология глаза	Нормальный
Клиническая химия	Нормальный
Гематология	Аномальный[10]
Лимфоциты периферической крови	Нормальный
Микроядерный тест	Нормальный
Вес сердца	Нормальный
Сальмонелла инфекционное заболевание	Нормальный[11]
Citrobacter инфекционное заболевание	Нормальный[12]
Все тесты и анализы от[13][14]

Модельные организмы были использованы при изучении функции SQSTM1. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Sqstm1^{tm1a (КОМП) Wtsi[15][16]} был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.^[17][18][19]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.^[13][20] Было проведено двадцать два испытания на гомозиготный мутант мышей, и наблюдалась одна значительная аномалия: у самок были аномальные полный анализ крови параметры, в том числе повышенный эритроцит ширина распределения и увеличенное среднее тромбоцит объем.^[13]

Взаимодействия

Секвестосома 1 может взаимодействовать с:

• MAP1LC3A,^[21]
• PRKCI,^[22]
• RAD23A,^[23]
• РИПК1,^[24]
• TRAF6^[25]
• TrkA,^{[26][27][28][29]} и
• TrkB.^[27][28]
• Nrf2 ^[30]

Рекомендации

1. ENSG00000284099 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000161011, ENSG00000284099 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015837 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Джунг И., Строминджер Дж. Л., Шин Дж. (Июль 1996 г.). «Молекулярное клонирование фосфотирозин-независимого лиганда SH2 домена p56lck». Proc Natl Acad Sci U S A. 93 (12): 5991–5. Дои:10.1073 / pnas.93.12.5991. ЧВК  39176. PMID  8650207.
6. Devergne O, Hummel M, Koeppen H, Le Beau MM, Nathanson EC, Kieff E, Birkenbach M (февраль 1996). «Новый родственный интерлейкину-12 белок p40, индуцированный латентной инфекцией вируса Эпштейна-Барра в B-лимфоцитах». J Virol. 70 (2): 1143–53. Дои:10.1128 / JVI.70.2.1143-1153.1996. ЧВК  189923. PMID  8551575.
7. «Энтрез Ген: секвестосома 1 SQSTM1».
8. Онлайн-менделевское наследование в человеке (OMIM): 601530
9. Кэссиди Л.Д., Нарита М (2015). "GATA сдерживает старение" (PDF). Наука. 349 (6255): 1448–9. Дои:10.1126 / science.aad2501. PMID  26404812. S2CID  35805331.
10. «Гематологические данные для Sqstm1». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
11. "Сальмонелла данные о заражении для Sqstm1 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
12. "Citrobacter данные о заражении для Sqstm1 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
13. Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
14. Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
15. «Международный консорциум нокаут-мышей».
16. "Информатика генома мыши".
17. Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт АФ, Брэдли А (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
18. Долгин Э (2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
19. Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (2007). «Мышь на все случаи жизни». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
20. ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.
21. Швец Э., Фасс Э., Шерц-Шуваль Р., Элазар З. (август 2008 г.). «N-конец и остаток Phe52 LC3 рекрутируют p62 / SQSTM1 в аутофагосомы». J. Cell Sci. 121 (Пт 16): 2685–95. Дои:10.1242 / jcs.026005. PMID  18653543.
22. Санчес П., Де Карсер Дж., Сандовал И.В., Москат Дж., Диас-Меко М.Т. (май 1998 г.). «Локализация изоформ атипичной протеинкиназы C в эндосомах, нацеленных на лизосомы, посредством взаимодействия с p62». Мол. Клетка. Биол. 18 (5): 3069–80. Дои:10.1128 / mcb.18.5.3069. ЧВК  110686. PMID  9566925.
23. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
24. Санз Л., Санчес П., Лаллена М.Дж., Диас-Меко М.Т., Москат Дж. (1999). «Взаимодействие p62 с RIP связывает атипичные PKC с активацией NF-kappaB». EMBO J. 18 (11): 3044–53. Дои:10.1093 / emboj / 18.11.3044. ЧВК  1171386. PMID  10356400.
25. Sanz L, Diaz-Meco MT, Nakano H, Moscat J (апрель 2000 г.). «Атипичный PKC-взаимодействующий белок p62 каналы активации NF-kappaB с помощью пути IL-1-TRAF6». EMBO J. 19 (7): 1576–86. Дои:10.1093 / emboj / 19.7.1576. ЧВК  310227. PMID  10747026.
26. Wooten MW, Seibenhener ML, Mamidipudi V, Diaz-Meco MT, Barker PA, Moscat J (март 2001 г.). «Атипичный протеин-протеин p62, взаимодействующий с протеинкиназой C, представляет собой основу для активации NF-kappaB фактором роста нервов». J. Biol. Chem. 276 (11): 7709–12. Дои:10.1074 / jbc.C000869200. PMID  11244088.
27. Гита Т., Вутен М.В. (февраль 2003 г.). «Ассоциация атипичного белка p62 / ZIP, взаимодействующего с протеинкиназой C, с рецептором фактора роста нервов TrkA регулирует перенос рецепторов и передачу сигналов Erk5». J. Biol. Chem. 278 (7): 4730–9. Дои:10.1074 / jbc.M208468200. PMID  12471037.
28. Джадхав Т., Гита Т., Цзян Дж., Вутен М.В. (2008). «Идентификация консенсусного сайта полиубиквитинирования TRAF6 / p62». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 371 (3): 521–4. Дои:10.1016 / j.bbrc.2008.04.138. ЧВК  2474794. PMID  18457658.
29. Вутен М.В., Гита Т., Бабу Дж. Р., Зайбенхенер М.Л., Пенг Дж., Кокс Н., Диас-Меко М. Т., Москат Дж. (Март 2008 г.). «Важная роль секвестосомы 1 / p62 в регулировании накопления Lys63-убиквитинированных белков». J. Biol. Chem. 283 (11): 6783–9. Дои:10.1074 / jbc.M709496200. PMID  18174161.
30. Feng, Lifeng et al. «Тамоксифен активирует Nrf2-зависимую транскрипцию SQSTM1, способствуя гиперплазии эндометрия» Theranostics vol. 7,7 1890-1900 гг. 10 апреля 2017 г., DOI: 10.7150 / thno.19135

дальнейшее чтение

• Гита Т., Вутен М.В. (2002). «Структура и функциональные свойства убиквитин-связывающего белка р62». FEBS Lett. 512 (1–3): 19–24. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 02286-X. PMID  11852044. S2CID  22029085.
• Layfield R, Ciani B, Ralston SH, Hocking LJ, Sheppard PW, Searle MS, Cavey JR (2005). «Структурные и функциональные исследования мутаций, влияющих на домен UBA SQSTM1 (p62), которые вызывают болезнь Педжета костей». Biochem. Soc. Транс. 32 (Пт 5): 728–30. Дои:10.1042 / BST0320728. PMID  15493999.
• Michou L, Collet C, Laplanche JL, Orcel P, Cornélis F (2006). «Генетика костной болезни Педжета». Суставная кость позвоночника. 73 (3): 243–8. Дои:10.1016 / j.jbspin.2005.05.009. PMID  16574459.
• Пак И., Чанг Дж., Уолш К. Т., Юн И, Строминджер Дж. Л., Шин Дж. (1996). «Фосфотирозин-независимое связывание белка массой 62 кДа с доменом src homology 2 (SH2) p56lck и его регуляция путем фосфорилирования Ser-59 в уникальной N-концевой области lck». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (26): 12338–42. Дои:10.1073 / пнас.92.26.12338. ЧВК  40352. PMID  8618896.
• Айер Н., Рейган М.С., Ву К.Дж., Канагараджа Б., Фридберг ЕС (1996). «Взаимодействия с участием комплекса транскрипции / эксцизионной репарации РНК-полимеразы II человека TFIIH, белка эксцизионной репарации нуклеотидов XPG и белка группы B синдрома Кокейна (CSB)». Биохимия. 35 (7): 2157–67. Дои:10.1021 / bi9524124. PMID  8652557.
• Вадламуди Р.К., Джунг И., Строминджер Д.Л., Шин Дж. (1996). «p62, фосфотирозин-независимый лиганд SH2-домена p56lck, принадлежит к новому классу убиквитин-связывающих белков». J. Biol. Chem. 271 (34): 20235–7. Дои:10.1074 / jbc.271.34.20235. PMID  8702753.
• Маркус С.Л., Уинроу С.Дж., Капоне Дж.П., Рачубинский Р.А. (1996). «Лиганд p56 (lck) служит коактиватором рецептора орфанного ядерного гормона». J. Biol. Chem. 271 (44): 27197–200. Дои:10.1074 / jbc.271.44.27197. PMID  8910285.
• Джаллал Б., Мосси К., Василудис Г., Князев П., Захвейя Дж., Ясновидящий Ф., Шиллинг Дж., Ульрих А. (1997). «Рецептор-подобная протеин-тирозинфосфатаза DEP-1 конститутивно связана с серин / треонинкиназой протеина массой 64 кДа». J. Biol. Chem. 272 (18): 12158–63. Дои:10.1074 / jbc.272.18.12158. PMID  9115287.
• Санчес П., Де Карсер Дж., Сандовал И.В., Москат Дж., Диас-Меко МТ (1998). «Локализация изоформ атипичной протеинкиназы C в эндосомах, нацеленных на лизосомы, посредством взаимодействия с p62». Мол. Клетка. Биол. 18 (5): 3069–80. Дои:10.1128 / mcb.18.5.3069. ЧВК  110686. PMID  9566925.
• Вадламуди Р.К., Шин Дж. (1998). «Геномная структура и анализ промотора гена p62, кодирующего непротеасомный мультиубиквитиновый белок, связывающий цепь». FEBS Lett. 435 (2–3): 138–42. Дои:10.1016 / S0014-5793 (98) 01021-7. PMID  9762895. S2CID  3184369.
• Санз Л., Санчес П., Лаллена М.Дж., Диас-Меко М.Т., Москат Дж. (1999). «Взаимодействие p62 с RIP связывает атипичные PKC с активацией NF-kappaB». EMBO J. 18 (11): 3044–53. Дои:10.1093 / emboj / 18.11.3044. ЧВК  1171386. PMID  10356400.
• Штумптнер К., Хейд Х, Фуксбихлер А., Хаузер Х., Мишингер Х. Дж., Затлукал К., Денк Х (1999). «Анализ внутрицитоплазматических гиалиновых телец при гепатоцеллюлярной карциноме. Демонстрация p62 как основного компонента». Являюсь. Дж. Патол. 154 (6): 1701–10. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 65426-0. ЧВК  1866621. PMID  10362795.
• Судо Т., Маруяма М., Осада Х (2000). «p62 функционирует как регулятор киназы p38 MAP». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 269 (2): 521–5. Дои:10.1006 / bbrc.2000.2333. PMID  10708586.
• Санс Л., Диас-Меко М.Т., Накано Х., Москат Дж. (2000). «Атипичный PKC-взаимодействующий белок p62 каналы активации NF-kappaB с помощью пути IL-1-TRAF6». EMBO J. 19 (7): 1576–86. Дои:10.1093 / emboj / 19.7.1576. ЧВК  310227. PMID  10747026.
• Wooten MW, Seibenhener ML, Mamidipudi V, Diaz-Meco MT, Barker PA, Moscat J (2001). «Атипичный протеин-протеинкиназный C-взаимодействующий протеин p62 является основой для активации NF-kappaB фактором роста нервов». J. Biol. Chem. 276 (11): 7709–12. Дои:10.1074 / jbc.C000869200. PMID  11244088.
• Куусисто Э., Салминен А, Алафузов I (2001). «Убиквитин-связывающий белок p62 присутствует в нейрональных и глиальных включениях при таупатиях и синуклеинопатиях человека». NeuroReport. 12 (10): 2085–90. Дои:10.1097/00001756-200107200-00009. PMID  11447312. S2CID  21272705.
• Лорин Н., Браун Дж. П., Лемейн А., Дюшен А., Хуот Д., Лакурсьер И., Драпо Г., Верро Дж., Раймон В., Мориссет Дж. (2001). «Костная болезнь Педжета: картирование двух локусов в 5q35-qter и 5q31». Являюсь. J. Hum. Genet. 69 (3): 528–43. Дои:10.1086/322975. ЧВК  1235483. PMID  11473345.
• Чанг С., Ким Дж. Х., Шин Дж. (2002). «p62 образует тройной комплекс с PKCzeta и PAR-4 и противодействует PAR-4-индуцированному ингибированию PKCzeta». FEBS Lett. 510 (1–2): 57–61. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 03224-0. PMID  11755531. S2CID  85579338.
• Feng, Lifeng et al. «Тамоксифен активирует Nrf2-зависимую транскрипцию SQSTM1, способствуя гиперплазии эндометрия» Theranostics vol. 7,7 1890-1900 гг. 10 апреля 2017 г., DOI: 10.7150 / thno.19135