Лидер SpeF - SpeF leader

лидер спФ
RF00518.jpg
Идентификаторы
СимволSPEF
РфамRF00518
Прочие данные
РНК типЦис-рег; лидер
Домен (ы)Бактерии
ТАКSO: 0005836
PDB структурыPDBe

SpeF это предполагаемый СНГ-действующий элемент идентифицирован в нескольких грамм отрицательный альфа-протеобактерии. Предлагается участвовать в регуляции экспрессии гены участвует в полиамид биосинтез.

SpeF - один из пяти предполагаемых регуляторных элементов, идентифицированных с помощью компьютерного экрана Agrobacterium tumefaciens и другие альфа-протеобактериальные геномы для консервативных мотивов последовательностей в оперон лидеры.[1] У большинства проанализированных видов он расположен в лидере оперона, содержащего ген speF и орнитиндекарбоксилаза фермент, который катализирует один из первых шагов в биосинтезе полиаминов. Однако авторы не обнаружили связывания метаболитов, связанных с этим путем (L-орнитин, L-лизин, мезо-диаминопимелат, путресцин, кадаверин, или же спермидин ) лидеру SpeF.[1]

Другие некодирующие РНК, обнаруженные в том же анализе, включают: suhB, ybhL, metA и serC.[1]

Рекомендации

  1. ^ а б c Корбино К.А., Баррик Дж. Э., Лим Дж. И др. (2005). «Доказательства второго класса рибопереключателей S-аденозилметионина и других регуляторных мотивов РНК у альфа-протеобактерий». Геном Биол. 6 (8): R70. Дои:10.1186 / gb-2005-6-8-r70. ЧВК  1273637. PMID  16086852.

внешняя ссылка