TCEAL1 - TCEAL1

TCEAL1
Идентификаторы
Псевдонимы	TCEAL1, SIIR, WEX9, p21, pp21, фактор элонгации транскрипции A как 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 300237 MGI: 2385317 ГомолоГен: 3510 Генные карты: TCEAL1
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq22.2 Начинать 103,628,704 бп[1] Конец 103,630,953 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа Х | Х F1 Начинать 136,707,982 бп[2] Конец 136,711,478 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание домена WW Сотовый компонент • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9338	237052
Ансамбль	ENSG00000172465	ENSMUSG00000049536
UniProt	Q15170	Q921P9
RefSeq (мРНК)	NM_004780 NM_001006639 NM_001006640	NM_146236 NM_001356367
RefSeq (белок)	NP_001006640 NP_001006641 NP_004771	NP_666348 NP_001343296
Расположение (UCSC)	Chr X: 103.63 - 103.63 Мб	Chr X: 136.71 - 136.71 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор элонгации транскрипции A, подобный белку 1 это белок что у людей кодируется TCEAL1 ген.^[5][6][7]

Этот ген кодирует член семейства генов фактора элонгации транскрипции А (SII) (TCEAL). Члены этого семейства могут функционировать как ядерные фосфопротеины которые модулируют транскрипцию в зависимости от контекста промотора. Кодируемый белок аналогичен фактору элонгации транскрипции A / фактору транскрипции SII и содержит цинковый палец -подобный мотив, а также последовательность, относящаяся к фактор транскрипции SII Pol II-связывающая область. Он может оказывать свое действие через белок-белковые взаимодействия с другими регуляторами транскрипции, а не через прямое связывание ДНК. Несколько членов семьи находятся на Х хромосома. Альтернативный сплайсинг приводит к нескольким вариантам транскрипции, кодирующим один изоформа.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000172465 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000049536 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Yeh CH, Shatkin AJ (июль 1994 г.). «Кодируемый клетками HeLa p21 гомологичен фактору элонгации транскрипции SII». Ген. 143 (2): 285–7. Дои:10.1016/0378-1119(94)90112-0. PMID  8206389.
6. Yeh CH, Shatkin AJ (декабрь 1994 г.). «Снижение регуляции активности промотора длинных концевых повторов вируса саркомы Рауса основным белком клетки HeLa». Proc Natl Acad Sci U S A. 91 (23): 11002–6. Дои:10.1073 / пнас.91.23.11002. ЧВК  45154. PMID  7971997.
7. «Ген Entrez: фактор элонгации транскрипции A (SII) -подобный 1 TCEAL1».

дальнейшее чтение

• Yeh CH, Zong WX, Shatkin AJ (1995). «Пара Ser36-Ser37 в ядерном белке HeLa p21 / SIIR опосредует фосфорилирование Ser / Thr и необходима для репрессии длинных терминальных повторов вируса саркомы Рауса». J. Biol. Chem. 270 (43): 25313–5. Дои:10.1074 / jbc.270.44.26558. PMID  7592688.
• Pillutla RC, Shimamoto A, Furuichi Y, Shatkin AJ (1999). «Геномная структура и хромосомная локализация TCEAL1, гена человека, кодирующего ядерный фосфопротеин p21 / SIIR». Геномика. 56 (2): 217–20. Дои:10.1006 / geno.1998.5705. PMID  10051408.
• ван дер Куип Х., Кариус Б., Хак С.Дж. и др. (1999). «ДНК-связывающая субъединица p140 фактора репликации C активируется в циклических клетках и связывается с белками, регулирующими клеточный цикл фазы G1». J. Mol. Med. 77 (4): 386–92. Дои:10.1007 / s001090050365. PMID  10353443.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Росс М.Т., Графхэм Д.В., Коффи А.Дж. и др. (2005). «Последовательность ДНК Х-хромосомы человека». Природа. 434 (7031): 325–37. Дои:10.1038 / природа03440. ЧВК  2665286. PMID  15772651.
• Макино Х., Тадзири Т., Мияшита М. и др. (2005). «Дифференциальная экспрессия TCEAL1 при раке пищевода с помощью пользовательского анализа микрочипов кДНК». Дис. Пищевод. 18 (1): 37–40. Дои:10.1111 / j.1442-2050.2005.00432.x. PMID  15773840.
• О Дж. Х., Ян Дж., Хан И и др. (2006). «Транскриптомный анализ рака желудка человека». Мамм. Геном. 16 (12): 942–54. Дои:10.1007 / s00335-005-0075-2. PMID  16341674.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.