TMEM123 - TMEM123

TMEM123
Идентификаторы
Псевдонимы	TMEM123, KCT3, PORIMIN, PORMIN, трансмембранный белок 123
Внешние идентификаторы	OMIM: 606356 MGI: 1919179 ГомолоГен: 14177 Генные карты: TMEM123
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q22.2 Начните 102,396,332 бп[1] Конец 102,470,384 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 A1 Начните 7,764,041 бп[2] Конец 7,794,333 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • сигнальная активность рецептора Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • внешняя сторона плазматической мембраны • цитоплазматический пузырек Биологический процесс • онкоз • преобразование сигнала Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	114908	71929
Ансамбль	ENSG00000152558	ENSMUSG00000050912
UniProt	Q8N131	Q91Z22
RefSeq (мРНК)	NM_052932	NM_133739
RefSeq (белок)	NP_443164	NP_598500
Расположение (UCSC)	Chr 11: 102,4 - 102,47 Мб	Chr 9: 7.76 - 7.79 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Поримин это белок что у людей кодируется TMEM123 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует очень гликозилированный трансмембранный белок с высоким содержанием треонин и серин остатки во внеклеточном домене, аналогичные широко определенной категории белков, называемой муцины.

Воздействие анти-ПОРИМИНА на некоторые типы клеток (проонкозный рецептор, вызывающий повреждение мембраны) антитело, сшивает этот белок на поверхности клетки и индуцирует тип гибели клеток, называемый онкоз.

Онкоз отличается от апоптоз и характеризуется потерей целостности клеточной мембраны без ДНК фрагментация. Предполагается, что этот генный продукт функционирует как рецептор клеточной поверхности что опосредует гибель клеток.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000152558 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000050912 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ма Ф, Чжан С., Прасад К.В., Фриман Г.Дж., Шлоссман С.Ф. (август 2001 г.). «Молекулярное клонирование поримина, нового рецептора клеточной поверхности, опосредующего гибель онкотических клеток». Proc Natl Acad Sci U S A. 98 (17): 9778–83. Дои:10.1073 / pnas.171322898. ЧВК  55529. PMID  11481458.
6. «Ген Entrez: трансмембранный белок TMEM123 123».

дальнейшее чтение

• Деккер Дж., Россен Дж. В., Бюллер Х.А., Эйнерханд А.В. (2002). «Семья MUC: некролог». Trends Biochem. Наука. 27 (3): 126–31. Дои:10.1016 / S0968-0004 (01) 02052-7. PMID  11893509.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Чжан С., Сюй Ю, Гу Дж, Шлоссман С.Ф. (1998). «Рецептор клеточной поверхности, определяемый mAb, опосредует уникальный тип гибели клеток, подобный онкозу». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (11): 6290–5. Дои:10.1073 / пнас.95.11.6290. ЧВК  27661. PMID  9600958.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Бонкобара М., Дас А., Такао Дж. И др. (2003). «Идентификация новых генов секретируемых и закрепленных за мембраной белков в кератиноцитах человека». Br. J. Dermatol. 148 (4): 654–64. Дои:10.1046 / j.1365-2133.2003.05244.x. PMID  12752121. S2CID  21635573.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретируемого белка (SPDI), широкомасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: биоинформатическая оценка». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Чжан З., Хензель В.Дж. (2005). «Прогнозирование сигнального пептида на основе анализа экспериментально подтвержденных сайтов расщепления». Белковая наука. 13 (10): 2819–24. Дои:10.1110 / пс. 04682504. ЧВК  2286551. PMID  15340161.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID  16303743.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.