WWTR1 - WWTR1

WWTR1
Идентификаторы
Псевдонимы	WWTR1, TAZ, WW домен, содержащий регулятор транскрипции 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 607392 MGI: 1917649 ГомолоГен: 9159 Генные карты: WWTR1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q25.1 Начинать 149,517,235 бп[1] Конец 149,736,714 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 Д Начинать 57,455,649 бп[2] Конец 57,575,910 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность гомодимеризации белков • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • комплекс регуляторов транскрипции • нуклеоплазма • ядро клетки • цитозоль • ядерное тело Биологический процесс • отрицательная регуляция фосфорилирования белков • морфогенез ресничек • регуляция дифференцировки эпителиальных клеток метанефрических канальцев нефрона • отрицательная регуляция дифференцировки жировых клеток • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция активности протеинкиназы • рост многоклеточного организма • регуляция канонического пути передачи сигналов Wnt • развитие клубочков • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • Сигнальный путь бегемота • положительная регуляция перехода эпителия в мезенхиму • регуляция импорта белка SMAD в ядро • SCF-зависимый протеасомный убиквитин-зависимый катаболический процесс белка • дифференцировка мезенхимальных клеток • деление стволовых клеток • убиквитинирование белков • дифференцировка остеобластов • морфогенез почек • положительное регулирование пролиферации клеток • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция канонического сигнального пути Wnt • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • тканевый гомеостаз • сердечный процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	25937	97064
Ансамбль	ENSG00000018408	ENSMUSG00000027803
UniProt	Q9GZV5	Q9EPK5
RefSeq (мРНК)	NM_001168278 NM_001168280 NM_015472 NM_001348362	NM_001168281 NM_133784
RefSeq (белок)	NP_001161750 NP_001161752 NP_056287 NP_001335291	NP_001161753 NP_598545
Расположение (UCSC)	Chr 3: 149,52 - 149,74 Мб	Chr 3: 57,46 - 57,58 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

WW-домен, содержащий белок регулятора транскрипции 1 это белок что у людей кодируется WWTR1 ген.^[5][6][7]

Структура

WWTR1 содержит WW домен, спиральная катушка регион и PDZ домен переплетный мотив.

Функция

WWTR1 Это транскрипционный коактиватор который действует как регулирующая цель нижестоящего в Сигнальный путь бегемота который играет ключевую роль в контроле размера органов и подавление опухоли ограничивая распространение и продвигая апоптоз. Ядро этого пути состоит из каскада киназ, в котором STK3 (MST2) /STK4 (MST1) в комплексе со своим регуляторным белком SAV1, фосфорилирует и активирует LATS1 /LATS2 в комплексе со своим регуляторным белком MOB1, который, в свою очередь, фосфорилирует и инактивирует YAP1 онкопротеин и WWTR1 / TAZ. WWTR1 улучшает PAX8 и NKX2-1 (TTF1) -зависимая активация гена. Регулирует ядерное накопление SMAD и играет ключевую роль в соединении их с транскрипционным механизмом, таким как посреднический комплекс.

Используя человека SHSY5Y линия клеток как модель нейрональной дифференцировки человека FAT1 было показано, что он регулирует нуклеоцитоплазматическое перемещение WWTR1 / TAZ и увеличивает транскрипцию целевого гена Hippo. CTGF. То же исследование также показало, что FAT1 может регулировать TGF-бета сигнализация ^[8]

Номенклатура

Обратите внимание, что этот ген часто путают с тафаззин, который имеет официальный символ гена ТАЗ. TAZ (ген) не имеет отношения к пути бегемота. WWTR1 часто упоминается как TAZ в исследовательских публикациях из-за того, что первая публикация, описывающая этот ген, назвала его TAZ, хотя TAZ (тафаззин) уже был назван.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000018408 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027803 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Канаи Ф., Мариньяни П.А., Сарбасова Д., Яги Р., Холл Р.А., Доновиц М., Хисаминато А., Фудзивара Т., Ито Й., Кэнтли Л.С., Яффе МБ (декабрь 2000 г.). «TAZ: новый коактиватор транскрипции, регулируемый взаимодействиями с белками 14-3-3 и PDZ-домена». Журнал EMBO. 19 (24): 6778–91. Дои:10.1093 / emboj / 19.24.6778. ЧВК  305881. PMID  11118213.
6. Хауэлл М., Борчерс С., Милграм С.Л. (июнь 2004 г.). «Гетерогенный ядерный рибонуклеарный белок U связывается с YAP и регулирует его коактивацию транскрипции Bax». Журнал биологической химии. 279 (25): 26300–6. Дои:10.1074 / jbc.M401070200. PMID  15096513.
7. «Ген Entrez: WWTR1 WW домен, содержащий регулятор транскрипции 1».
8. Ахмед А.Ф., де Бок CE, Линц Л.Ф., Пундавела Дж., Зуикр И., Зонтаг Е., Хондермарк Х., Торн Р.Ф. (июнь 2015 г.). «Кадгерин FAT1 действует выше передачи сигналов Hippo через TAZ, регулируя дифференцировку нейронов». Клеточные и молекулярные науки о жизни. 72 (23): 4653–69. Дои:10.1007 / s00018-015-1955-6. PMID  26104008. S2CID  15861327.

дальнейшее чтение

• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Hong JH, Hwang ES, McManus MT, Amsterdam A, Tian Y, Kalmukova R, Mueller E, Benjamin T., Spiegelman BM, Sharp PA, Hopkins N, Yaffe MB (август 2005 г.). «ТАЗ, транскрипционный модулятор дифференцировки мезенхимальных стволовых клеток». Наука. 309 (5737): 1074–8. Дои:10.1126 / наука.1110955. PMID  16099986. S2CID  1958224.
• Park KS, Whitsett JA, Di Palma T, Hong JH, Yaffe MB, Zannini M (апрель 2004 г.). «TAZ взаимодействует с TTF-1 и регулирует экспрессию сурфактантного протеина-C». Журнал биологической химии. 279 (17): 17384–90. Дои:10.1074 / jbc.M312569200. PMID  14970209.