(S) -манделатдегидрогеназа - (S)-mandelate dehydrogenase

(S) -манделатдегидрогеназа
Идентификаторы
Номер ЕС	1.1.99.31
Базы данных
IntEnz	Просмотр IntEnz
БРЕНДА	BRENDA запись
ExPASy	Просмотр NiceZyme
КЕГГ	Запись в KEGG
MetaCyc	метаболический путь
ПРИАМ	профиль
PDB структуры	RCSB PDB PDBe PDBsum
Поиск ЧВК статьи PubMed статьи NCBI белки

В энзимология, (S) -манделатдегидрогеназа (EC 1.1.99.31 ) (MDH), является фермент это катализирует в химическая реакция

${\displaystyle {\ce {+}}}$ ${\displaystyle {\ce {acceptor}}}$ (S) -Манделат

${\displaystyle {\ce {=}}}$

${\displaystyle {\ce {+}}}$ ${\displaystyle {\ce {reduced}}}$ ${\displaystyle {\ce {acceptor}}}$ 2-оксо-2-фенилацетат

(S) -2-гидрокси-2-фенилацетат + акцептор ${\displaystyle \rightleftharpoons }$ 2-оксо-2-фенилацетат + восстановленный акцептор

Таким образом, два субстраты этого фермента (S) -2-гидрокси-2-фенилацетат и акцептор, а его два продукты находятся 2-оксо-2-фенилацетат и восстановленный акцептор.

Этот фермент принадлежит к семейству оксидоредуктазы, особенно те, которые действуют на группу CH-OH донора с другими акцепторами. В систематическое название этого класса ферментов (S) -2-гидрокси-2-фенилацетат: акцептор 2-оксидоредуктазы.

Этот фермент переносит электронную пару от FMNH2 к компоненту электронная транспортная цепь, скорее всего убихинон [1,2]. Это часть метаболический путь в Псевдомонады что позволяет этим

организмы использовать миндальную кислоту, полученную из обычной почвы метаболит амигдалин, как единственный источник углерода и энергии. Фермент имеет большой активный сайт карман и предпочтительно связывает

субстраты с более длинными боковые цепи, например 2-гидроксиоктаноат, а не 2-гидроксибутират. Он также предпочитает субстраты, которые, как (S) -манделат, имеют бета-ненасыщенность, например (индол-3-ил) гликолят по сравнению с

(индол-3-ил) лактат. Сложные эфиры манделата, такого как метил (S) -манделат, также являются субстратами.^[1]

Синонимы

(S) -манделатдегидрогеназа также известна как L-манделатдегидрогеназа, L-MDH, MDH, SManDH и SMDH.^[1]

использованная литература

1. «Информация по EC 1.1.99.31 - (S) -манделатдегидрогеназа».

• Lehoux IE, Mitra B (1999). «(S) -Манделатдегидрогеназа из Pseudomonas putida: механистические исследования с альтернативными субстратами и эффектами pH и кинетических изотопов». Биохимия. 38 (18): 5836–48. Дои:10.1021 / bi990024m. PMID  10231535.
• Dewanti AR, Xu Y, Mitra B (2004). «Роль глицина 81 в (S) -манделатдегидрогеназе из Pseudomonas putida в субстратной специфичности и оксидазной активности». Биохимия. 43 (33): 10692–700. Дои:10.1021 / bi049005p. PMID  15311930.
• Dewanti AR, Xu Y, Mitra B (2004). «Сложные эфиры миндальной кислоты в качестве субстратов для (S) -манделатдегидрогеназы из Pseudomonas putida: последствия для механизма реакции». Биохимия. 43 (7): 1883–90. Дои:10.1021 / bi036021y. PMID  14967029.