APLP2 - APLP2

APLP2
Идентификаторы
ПсевдонимыAPLP2, APLP-2, APPH, APPL2, CDEBP, предшественник бета-амилоида, такой как белок 2
Внешние идентификаторыOMIM: 104776 MGI: 88047 ГомолоГен: 20396 Генные карты: APLP2
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человек)[1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение APLP2
Геномное расположение APLP2
Группа11q24.3Начинать130,068,147 бп[1]
Конец130,144,811 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE APLP2 208702 x в формате .png

PBB GE APLP2 208703 s в формате fs.png

PBB GE APLP2 208248 x at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

334

11804

Ансамбль

ENSG00000084234

ENSMUSG00000031996

UniProt

Q06481

Q06335

RefSeq (мРНК)

NM_001102455
NM_001102456
NM_009691
NM_001357698

RefSeq (белок)

NP_001095925
NP_001095926
NP_033821
NP_001344627

Расположение (UCSC)Chr 11: 130.07 - 130.14 МбChr 9: 31.15 - 31.21 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Амилоидоподобный белок 2, также известен как APLP2, это белок что у людей кодируется APLP2 ген.[5][6] APLP2 вместе с APLP1 являются важными модуляторами глюкоза и инсулин гомеостаз.[7]

Расположение гена

Человек APLP2 ген расположен на длинном (q) плече хромосома 11 в районе 2 полоса 4, от базовая пара 130, 069, 821 к паре оснований 130, 144, 811 (GRCh38.p7).[5]

Белковая структура

APLP2 состоит из 763 аминокислоты, с 31 аминокислотой, составляющей сигнальный пептид и 732 аминокислоты, составляющие цепь белка.[8]

Внеклеточный домен

Внеклеточный домен (остатки 32-692) содержит домен E1, домен E2 и домен ингибитора BPTI / Kunitz.[8][9] Домен E1 содержит две независимые сворачивающиеся единицы: домен, подобный фактору роста (GFLD) и медь-связывающий домен (CuBD).[9] GFLD имеет сильно заряженную основную поверхность и очень гибкую область, состоящую из N-концевой петли, образованной дисульфидным мостиком.[9] CuBD состоит из альфа-спираль который плотно упакован на трехниточном бета-лист.[9]

Домен E2 является самым большим субдоменом APLP2 и состоит из шести альфа-спиралей.[9] В N-концевой структура двухцепочечной спиральной катушки первого мономера пакетов E2 против C-терминал трехцепочечная спиральная структура второго мономера.[9]

Домен ингибитора BPTI / Kunitz (остатки 306-364)[8] является «Cys-богатым» и способен ингибировать несколько протеазы.[10]

В эктодомен APLP2 является димерным и содержит множество сайтов связывания для ионов металлов и компонентов внеклеточного матрикса.[9] Эти места связывания могут связывать медь, цинк, коллаген и гепарансульфат.[9]

Трансмембранная область

Трансмембранная область APLP2 (остатки 693-716) представляет собой спиральный в структуре.[8]

Цитоплазматический домен

Цитоплазматический домен (находится 717-763)[8] содержит последовательность YENPTY, предполагающую дуэльную функцию домена.[9] Мотив NPxY может служить сигналом для эндоцитоз или последовательность может функционировать, опосредуя связывание различных интерактивных партнеров.[9]

Функция

APLP2 связывается с молекулами презентации антигена, такими как MHC класс I молекул и регулирует их поверхностную экспрессию, усиливая эндоцитоз.[11][12]

APLP1 и APLP2 двойной нокаутные мыши отображать гипогликемия и гиперинсулинемия что указывает на то, что эти два белка являются важными модуляторами гомеостаза глюкозы и инсулина.[7] Было также показано, что APLP2 регулирует развитие мозга путем регулирования миграции и дифференцировки нервных стволовых клеток.[13]

Двойные мышиные нокауты APLP2 и его гомологов, ПРИЛОЖЕНИЕ и APLP1 продемонстрировали убедительное указание на то, что APLP2 играет ключевую физиологическую роль среди членов семьи.[14] Мыши с двойным нокаутом APLP2 / APP и мыши с двойным нокаутом APLP2 / APLP1 демонстрируют летальный фенотип (постнатальный день 1), тогда как мыши с двойным нокаутом APLP1 / APP, по-видимому, нормальны, что демонстрирует важность белка APLP2.[14]

APLP2 играет роль в синаптическая пластичность, функционирует, чтобы способствовать росту нейритов, миграции нервных клеток и гомеостазу меди.[14] Анализ нейронов и сетей мышей с двойным нокаутом APP / APLP2 с использованием нейронов, полученных из стволовых клеток, и срезов, показывает недостаточность возбуждающего синаптическая передача в этом генотипе.[15] Более того, APLP2 вместе с APP продемонстрировали пресинаптические и постсинаптические функции в синаптогенез и поддержание синапсов.[16]

Было показано, что APLP2 действует как рецептор груза в аксональном транспорте интактных белков.[17]

Клиническое значение

APLP2 является частью семейства млекопитающих мембранные белки вместе с APLP1 и белок-предшественник амилоида (ПРИЛОЖЕНИЕ).[18] Поскольку APP играет ключевую роль в молекулярной патологии Болезнь Альцгеймера (AD), было высказано предположение, что APLP2 также играет роль в AD. патогенез.[19] Пептид β-амилоида (Aβ), присутствующий в APP, вызывает нейротоксичный эффекты, приводящие к AD.[20] Хотя последовательность Aβ не присутствует на APLP2, было высказано предположение, что APLP2 и APP имеют общий функциональная избыточность посредством чего оба белка взаимодействуют друг с другом, чтобы проявлять физиологические функции, связанные с образованием синапсов.[19]

Взаимодействия

APLP2 был показан взаимодействовать с APBB1.[21][22]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000084234 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031996 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: белок-предшественник бета-амилоида (A4) APLP2 2».
  6. ^ Лич Р., Ко М., Кравец С.А. (1999). «Отнесение гена белка 2, подобного предшественнику амилоида (APLP2), к 11q24 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Цитогенетика и клеточная генетика. 87 (3–4): 215–6. Дои:10.1159/000015472. PMID  10702673. S2CID  39798007.
  7. ^ а б Needham BE, Wlodek ME, Ciccotosto GD, Fam BC, Masters CL, Proietto J, Andrikopoulos S, Cappai R (июнь 2008 г.). «Идентификация белка-предшественника амилоида (APP) болезни Альцгеймера и его гомолога APLP2 в качестве основных модуляторов гомеостаза и роста глюкозы и инсулина». Журнал патологии. 215 (2): 155–63. Дои:10.1002 / путь.2343. PMID  18393365. S2CID  1064378.
  8. ^ а б c d е «APLP2 - предшественник амилоидоподобного белка 2 - Homo sapiens (человек) - ген и белок APLP2». www.uniprot.org. Получено 2016-10-03.
  9. ^ а б c d е ж грамм час я j Каден Д., Мюнтер Л. М., Рейф Б., Мультхауп Г. (апрель 2012 г.). «Белок-предшественник амилоида и его гомологи: структурные и функциональные аспекты нативной и патогенной олигомеризации». Европейский журнал клеточной биологии. 91 (4): 234–9. Дои:10.1016 / j.ejcb.2011.01.017. PMID  21459473.
  10. ^ Петерсен Л.С., Бьорн С.Е., Норрис Ф., Норрис К., Спречер С., Фостер, округ Колумбия (январь 1994 г.). «Экспрессия, очистка и характеристика домена ингибитора протеазы Kunitz-типа из гомолога белка-предшественника амилоида человека». Письма FEBS. 338 (1): 53–7. Дои:10.1016/0014-5793(94)80115-0. PMID  8307156. S2CID  31738626.
  11. ^ Тули А., Шарма М., Наславский Н., Каплан С., Сольхейм Дж. К. (июнь 2008 г.). «Специфичность взаимодействий белка-предшественника амилоида 2 с молекулами MHC класса I». Иммуногенетика. 60 (6): 303–13. Дои:10.1007 / s00251-008-0296-0. ЧВК  2683759. PMID  18452037.
  12. ^ Тули А., Шарма М., Макилхейни М.М., Талмадж Дж. Э., Наславский Н., Каплан С., Сольхейм Дж. С. (август 2008 г.). «Амилоидный предшественник протеина 2 увеличивает эндоцитоз, нестабильность и оборот молекулы H2-K (d) MHC класса I». Журнал иммунологии. 181 (3): 1978–87. Дои:10.4049 / jimmunol.181.3.1978. ЧВК  2607064. PMID  18641335.
  13. ^ Шариати С.А., Лау П., Хассан Б.А., Мюллер У., Дотти К.Г., Де Строопер Б., Гертнер А. (март 2013 г.). «APLP2 регулирует дифференцировку нейрональных стволовых клеток во время кортикального развития». Журнал клеточной науки. 126 (Pt 5): 1268–77. Дои:10.1242 / jcs.122440. PMID  23345401.
  14. ^ а б c Walsh DM, Minogue AM, Sala Frigerio C, Fadeeva JV, Wasco W, Selkoe DJ (апрель 2007 г.). «Семейство белков APP: сходства и различия». Сделки Биохимического Общества. 35 (Pt 2): 416–20. Дои:10.1042 / BST0350416. PMID  17371289.
  15. ^ Schrenk-Siemens K, Perez-Alcala S, Richter J, Lacroix E, Rahuel J, Korte M, Müller U, Barde YA, Bibel M (август 2008 г.). «Нейроны, полученные из эмбриональных стволовых клеток, как клеточная система для изучения функции генов: отсутствие белков-предшественников амилоида APP и APLP2 приводит к нарушению синаптической передачи». Стволовые клетки. 26 (8): 2153–63. Дои:10.1634 / стволовые клетки.2008-0010. PMID  18535156. S2CID  207240922.
  16. ^ Ван З., Ван Б., Ян Л., Го Ц., Аитмитти Н., Сонъян З., Чжэн Х (сентябрь 2009 г.). «Пресинаптическое и постсинаптическое взаимодействие белка-предшественника амилоида способствует периферическому и центральному синаптогенезу». Журнал неврологии. 29 (35): 10788–801. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.2132-09.2009. ЧВК  2757256. PMID  19726636.
  17. ^ Мюллер У., Кинс С (2002). «Приложение в движении». Тенденции в молекулярной медицине. 8 (4): 152–5. Дои:10.1016 / S1471-4914 (02) 02320-1. PMID  11927267.
  18. ^ Корте М., Херрманн Ю., Чжан Х, Драгун А. (апрель 2012 г.). «Роль APP и APLP для синаптической передачи, пластичности и сетевой функции: уроки генетических моделей мышей». Экспериментальное исследование мозга. 217 (3–4): 435–40. Дои:10.1007 / s00221-011-2894-6. PMID  22006270. S2CID  11886993.
  19. ^ а б Midthune B, Tyan SH, Walsh JJ, Sarsoza F, Eggert S, Hof PR, Dickstein DL, Koo EH (апрель 2012 г.). «Делеция белка 2, подобного предшественнику амилоида (APLP2), не влияет на морфологию или функцию нейронов гиппокампа». Молекулярная и клеточная нейронауки. 49 (4): 448–55. Дои:10.1016 / j.mcn.2012.02.001. ЧВК  3348437. PMID  22353605.
  20. ^ Харди Дж., Селкое DJ (июль 2002 г.). «Амилоидная гипотеза болезни Альцгеймера: прогресс и проблемы на пути к терапии». Наука. 297 (5580): 353–6. Дои:10.1126 / science.1072994. PMID  12130773. S2CID  15150253.
  21. ^ Генетт С.Ю., Чен Дж., Джондро П.Д., Танзи Р.Э. (октябрь 1996 г.). «Ассоциация нового человеческого FE65-подобного белка с цитоплазматическим доменом белка-предшественника бета-амилоида». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (20): 10832–7. Дои:10.1073 / pnas.93.20.10832. ЧВК  38241. PMID  8855266.
  22. ^ Танахаши Х., Табира Т. (февраль 1999 г.). «Молекулярное клонирование человеческого Fe65L2 и его взаимодействие с белком-предшественником бета-амилоида Альцгеймера». Письма о неврологии. 261 (3): 143–6. Дои:10.1016 / S0304-3940 (98) 00995-1. PMID  10081969. S2CID  54307954.

внешняя ссылка