ARHGAP25 - ARHGAP25

ARHGAP25
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыARHGAP25, HEL-S-308, KAIA0053, белок, активирующий ГТФазу Rho 25
Внешние идентификаторыOMIM: 610587 MGI: 2443687 ГомолоГен: 45507 Генные карты: ARHGAP25
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение ARHGAP25
Геномное расположение ARHGAP25
Группа2п13.3Начинать68,679,601 бп[1]
Конец68,826,833 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001037727
NM_001286610
NM_175476

RefSeq (белок)

NP_001032816
NP_001273539
NP_780685

Расположение (UCSC)Chr 2: 68,68 - 68,83 МбChr 6: 87,46 - 87,53 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок, активирующий ГТФазу Rho 25 это белок что у людей кодируется ARHGAP25 ген.[5] Ген также известен как KAIA0053.[5] ARHGAP25 принадлежит к семейству Rho GTPase -модулирующие белки, которые участвуют в актин ремоделирование, полярность ячейки, и миграция клеток.[6]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции ARHGAP25. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Архгап25tm1a (КОМП) Wtsi[13][14] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.[15][16][17]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[11][18] Был проведен 21 тест на гомозиготный -мутант у мышей и наблюдалась одна значительная аномалия: аномальная морфология и пигментация сетчатки.[11]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163219 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030047 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Белок, активирующий Rho GTPase 25». Получено 2011-12-05.
  6. ^ Като М., Като М. (август 2004 г.). «Идентификация и характеристика генов ARHGAP24 и ARHGAP25 in silico». Международный журнал молекулярной медицины. 14 (2): 333–8. Дои:10.3892 / ijmm.14.2.333. PMID  15254788.
  7. ^ «Данные морфологии глаза для Arhgap25». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  8. ^ «Данные клинической химии для Arhgap25». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  9. ^ "Сальмонелла данные о заражении для Arhgap25 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  10. ^ "Citrobacter данные о заражении для Arhgap25 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  11. ^ а б c Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  12. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  13. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
  14. ^ "Информатика генома мыши".
  15. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт А.Ф., Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  16. ^ Долгин Е. (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  17. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  18. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (июнь 2011 г.). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геномная биология. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.

дальнейшее чтение