Арабидопсис - Arabidopsis

Эта статья о роде. Для модельного организма см. Arabidopsis thaliana.

Арабидопсис
Arabidopsis thaliana sl12.jpg
Тале кресс (Arabidopsis thaliana)
Научная классификация е
Королевство:Plantae
Clade:Трахеофиты
Clade:Покрытосеменные
Clade:Eudicots
Clade:Росиды
Заказ:Brassicales
Семья:Brassicaceae
Род:Арабидопсис
Эйн. в Холле и Эйн.
Типовой вид
Arabis thaliana
Л.
Разновидность

См. Текст

Арабидопсис (рок-кресс) является родом в семье Brassicaceae. Они маленькие цветущие растения относится к капуста и горчица. Этот род представляет большой интерес, так как содержит тале кресс (Arabidopsis thaliana), один из модельные организмы используется для изучения биологии растений и первого растения, геном которого был расшифрован. Изменения в кресс-салате легко заметить, что делает его очень полезной моделью.

Положение дел

В настоящее время род Арабидопсис имеет девять видов и еще восемь признанных подвидов. Это разграничение произошло совсем недавно и основано на морфологической и молекулярной филогении О'Кейна и Аль-Шехбаза.[1][2] и другие.

Их находки подтверждают, что виды, ранее включенные в Арабидопсис сделай это полифилетический. Самая последняя реклассификация перемещает два вида, ранее помещенных в Кардаминопсис и Hylandra и три вида Арабис в Арабидопсис, но не включает 50, которые были перемещены в новые роды Берингия, Crucihimalaya, Ianhedgea, Олимарабидопсис, и Псевдоарабидопсис.

Все виды в Арабидопсис коренные жители Европа, а два вида имеют широкие ареалы, также простирающиеся в Северная Америка и Азия.

За последние два десятилетия Arabidopsis thaliana вызвал большой интерес со стороны научного сообщества как модельный организм за исследования по многочисленным аспектам биологии растений. Информационный ресурс по арабидопсису (ТАИР) - это тщательно подобранный онлайн-источник информации для Arabidopsis thaliana генетические и молекулярно-биологические исследования, а также Книга об арабидопсисе представляет собой онлайн-сборник приглашенных глав по Arabidopsis thaliana биология. В Европе ресурсный центр модельных организмов Arabidopsis thaliana гермоплазма, биоинформатика и молекулярная биология ресурсы (в том числе GeneChips ) это Ноттингемский фондовый центр арабидопсиса – NASC в то время как в Северной Америке гермоплазма услуги предоставляются Центр биологических ресурсов арабидопсиса, (ABRC) на базе Государственный университет Огайо. Система заказов для ABRC была включена в Информационный ресурс по арабидопсису (TAIR) в июне 2001 года, тогда как NASC всегда (с 1991 года) размещал свою собственную систему заказа и браузер генома.

В 1982 году экипаж Советский Салют 7 космическая станция вырастила арабидопсис, став первым растением, которое зацвело и произвело семена в космосе. У них была продолжительность жизни 40 дней.[3] Arabidopsis thaliana семена были доставлены на Луну на Посадочный модуль Chang'e 4 в 2019 году в рамках студенческого эксперимента.

Арабидопсис очень похож на Boechera род.

Список видов и подвидов

  • Arabidopsis arenicola (Ричардсон экс Хук.) Аль-Шехбаз, Эльф, Д.Ф. Мюррей и С.И. Уорвик
Распределение: Гренландия, Лабрадор, Нунавут, Квебек, Онтарио, Манитоба, Саскачеван
A. arenosa subsp. ареноса
Распределение: Европа: уроженец Австрии, Беларуси, Боснии и Герцеговины, Болгарии, Хорватии, Чехии, северо-восточной Франции, Германии, Венгрии, северной Италии, Латвии, Литвы, Македонии, Польши, Румынии, Словакии, Словении, Швейцарии и Украины; натурализовались в Бельгии, Дании, Эстонии, Финляндии, Нидерландах, Норвегии, России и Западной Сибири и Швеции; отсутствует в Албании, Греции, Италии и Турции.
A. arenosa subsp. борбасии
Распределение: E Бельгия, Чехия, северо-восточная Франция, Германия, Венгрия, Польша, Румыния, Словакия, Швейцария, Украина. Сомнительно происходящее в Дании.
Распределение: ЮВ Франции.
Распределение: Босния, Хорватия.
А. Халлери subsp. аллери
Распределение: Австрия, Хорватия, Чехия, Германия, Северная и Южная Италия, Польша, Румыния, Словакия, Словения, Швейцария и Южная Украина. Вероятно, завезен на севере Франции и вымер в Бельгии.
А. Халлери subsp. ovirensis (Вульфен)
Распределение: Албания, Австрия, северо-восток Италии, Румыния, Словакия, Словения, юго-запад Украины, Югославия.
А. Халлери subsp. геммифера (Мацумура)
Распределение: Дальний Восток России, Северо-Восточный Китай, Корея, Япония и Тайвань.
А. Лирата subsp. лирата
Распределение: Северо-восток европейской части России, Аляска, Канада (запад Онтарио в Британскую Колумбию), а также юго-восток и центральную часть Соединенных Штатов (Вермонт на юге в северную Джорджию и Миссисипи на север в Миссури и Миннесоту).
А. Лирата subsp. Петрея (Линней) О'Кейн и Аль-Шехбаз
Распределение: Австрия, Чехия, Англия, Германия, Венгрия, Исландия, Ирландия, Северная Италия, Норвегия, Россия (Северо-запад России, Сибирь и Дальний Восток), Шотландия, Швеция, Украина, северная северная часть Америки (Аляска и Юкон). Видимо вымерший в Польше.
А. Лирата subsp. Камчатка (Фишер, бывший округ Колумбия) О'Кейн и Аль-Шехбаз
Распределение: северная Аляска, Канада (Юкон, округ Маккензи, Британская Колумбия, северный Саскачеван), Алеутские острова, Восточная Сибирь, Дальний Восток России, Корея, северный Китай, Япония и Тайвань.
Распределение: Карпаты (Польша, Румыния, Словакия и прилегающая Украина).
Распределение: северо-запад Италии и, предположительно, вымерший, в соседней юго-западной Швейцарии.
Распределение: Фенноскандинавия и Балтийский регион.
Распределение: Родной ареал почти от всей Европы до Центральной Азии, теперь натурализованный во всем мире.

Цитогенетика

Цитогенетический анализ показал гаплоидный хромосома число (n) варьируется в зависимости от вида в роде:[4]

A. thaliana n = 5[5] секвенирование ДНК этого вида было завершено в 2001 году. А. Лирата имеет n = 8, но некоторые подвиды или популяции тетраплоидны.[6] Различные подвиды A. arenosa имеют n = 8, но могут быть 2n (диплоид) или 4n (тетраплоид).[7]A. suecica n = 13 (5 + 8) и является амфидиплоид виды произошли в результате гибридизации между A. thaliana и диплоид A. arenosa.[8]

A. neglecta n = 8, как и различные подвиды А. Халлери.[7]

По состоянию на 2005 г. А. cebennensis, A. croatica и A. pedemontana цитологически не исследованы.

Реклассифицированные виды

Следующие виды, ранее помещенные в Арабидопсис в настоящее время не считаются частью этого рода.

  • A. bactriana = Dielsiocharis bactriana
  • A. brevicaulis = Круцихималая гималайская
  • А. бурсифолия = Берингия бурсифолистная
  • A. campestris = Crucihimalaya wallichii
  • A. dentata = Murbeckiella pinnatifida
  • A. drassiana =
  • A. erysimoides = Erysimum hedgeanum
  • A. eseptata = Олимарабидопсис умброза
  • А. гамосепала = Неоторулярия гамосепала
  • А. глаука = Thellungiella salsuginea
  • A. griffithiana = Олимарабидопсис пумила
  • A. Himalaica = Круцихимальная гималайская
  • A. huetii = Murbeckiella huetii
  • А. кнукери = Crucihimalaya Kneuckeri
  • А. Коршинский = Олимарабидопсис кабулика
  • A. lasiocarpa = Crucihimalaya lasiocarpa
  • A. minutiflora = Ianhedgea minutiflora
  • А. моллис = Берингия бурсифолистная
  • A. mollissima = Crucihimalaya mollissima
  • A. monachorum = Crucihimalaya lasiocarpa
  • A. mongolica = Crucihimalaya mongolica
  • A. multicaulis = Arabis tibetica
  • A. novae-anglicae = Neotorularia humilis
  • A. nuda = Drabopsis nuda
  • А. овчинниковый = Crucihimalaya mollissima
  • A. parvula = Теллунгиелла парвула
  • A. pinnatifida = Murbeckiella pinnatifida
  • А. пумила = Олимарабидопсис пумила
  • A. qiranica = Sisymbriopsis mollipila
  • А. ричардсоний = Neotorularia humilis
  • A. russeliana = Crucihimalaya wallichii '
  • A. salsugineum = Eutrema salsugineum
  • A. sarbalica = Crucihimalaya wallichii
  • А. шимпери = Робеския шимпери
  • A. stenocarpa = Берингия бурсифолистная
  • A. stewartiana = Олимарабидопсис пумила
  • A. stricta = Crucihimalaya stricta
  • A. taraxacifolia = Crucihimalaya wallichii
  • A. tenuisiliqua = Arabis tenuisiliqua
  • A. tibetica = Круцихималая гималайская
  • A. tibetica = Arabis tibetica
  • A. toxophylla = Псевдоарабидопсис токсофилла
  • A. trichocarpa = Neotorularia humilis
  • A. trichopoda = Берингия бурсифолистная
  • A. tschuktschorum = Берингия бурсифолистная
  • A. tuemurnica = Neotorularia humilis
  • А. верна = Drabopsis nuda
  • A. virgata = Берингия бурсифолистная
  • А. валличий = Crucihimalaya wallichii
  • А. yadungensis =

Рекомендации

  1. ^ О'Кейн, Стив Л .; Аль-Шехбаз, Ихсан А. (1997). "Краткое изложение Арабидопсис (Brassicaceae) ". Новон. 7 (3): 323. Дои:10.2307/3391949. JSTOR  3391949.
  2. ^ О'Кейн, Стив Л .; Аль-Шехбаз, Ихсан А. (2003). «Филогенетическое положение и родовые пределы Арабидопсис (Brassicaceae) на основе последовательностей ядерной рибосомной ДНК ». Летопись ботанического сада Миссури. 90 (4): 603. Дои:10.2307/3298545. JSTOR  3298545. S2CID  85316468.
  3. ^ «Первый вид растений, зацвести в космосе». Книга Рекордов Гиннесса. Получено 2017-03-10.
  4. ^ Аль-Шехбаз, Ихсан А .; О'Кейн-младший, Стив Л. (2002). "Таксономия и филогения Арабидопсис (Brassicaceae) ". Книга арабидопсиса. Том 1. Книга об арабидопсисе. 1. Американское общество биологов растений. стр. e0001. Дои:10.1199 / таб.0001. ЧВК  3243115. PMID  22303187.
  5. ^ Лысак, М. А; Берр, А; Печинка, А; Schmidt, R; МакБрин, К; Шуберт, я (2006). «Механизмы уменьшения числа хромосом в Arabidopsis thaliana и родственные виды Brassicaceae ". Труды Национальной академии наук. 103 (13): 5224–5229. Bibcode:2006ПНАС..103.5224Л. Дои:10.1073 / pnas.0510791103. ЧВК  1458822. PMID  16549785.
  6. ^ Дарт, Сара; Крон, Пол; Мейбл, Барбара К (2004). "Характеристика полиплоидии в Арабидопсис лирата с использованием подсчета хромосом и проточной цитометрии ". Канадский журнал ботаники. 82 (2): 185. Дои:10.1139 / b03-134.
  7. ^ а б Джоли, Саймон; Шмикль, Росвита; Пол, Джурадж; Кляйн, Йоханнес; Мархольд, Кароль; Кох, Маркус А. (2012). "Эволюционная история Arabidopsis arenosa Комплекс: разнообразные тетраплоиды маскируют Западный Карпатский центр видового и генетического разнообразия ». PLOS ONE. 7 (8): e42691. Bibcode:2012PLoSO ... 742691S. Дои:10.1371 / journal.pone.0042691. ISSN  1932-6203. ЧВК  3411824. PMID  22880083.
  8. ^ Якобссон, Маттиас; Хагенблад, Дженни; Таваре, Симон; Сэлль, Торбьёрн; Холлден, Кристер; Линд-Халлден, Кристина; Нордборг, Магнус (2006). "Уникальное недавнее происхождение аллотетраплоидных видов Arabidopsis suecica: Данные ядерных маркеров ДНК ". Молекулярная биология и эволюция. 23 (6): 1217–31. Дои:10.1093 / molbev / msk006. PMID  16549398.

дальнейшее чтение

  • Аль-Шехбаз, И.А., О'Кейн, Стив Л. (2002). Таксономия и филогения Arabidopsis (Brassicaceae). Книга об арабидопсисе: 1-22. онлайн-версия.
  • Чеккато, Лука; Мазиеро, Симона; Синха Рой, Дола; Бенчивенга, Стефано; Ройг-Вилланова, Ирма; Дитенгу, Франк Анисет; Пальме, Клаус; Саймон, Рюдигер; Коломбо, Люсия (17.06.2013). Поганка, Маркус (ред.). "Для развития женского гаметофита у Arabidopsis необходим материнский контроль PIN1 ". PLoS ONE. 8 (6): e66148. Дои: 10.1371 / journal.pone.0066148. ISSN  1932-6203. ЧВК  3684594. PMID  23799075.
  • О'Кейн-младший, С. Л., и Аль-Шехбаз, И. А. (1997). Краткий обзор Arabidopsis (Brassicaceae): Новон 7: 323–327.
  • О'Кейн-младший, С. Л., и Аль-Шехбаз, И. А. (2003). Филогенетическое положение и родовые ограничения Arabidopsis (Brassicaceae) на основе последовательностей ядерной рибосомной ДНК: Летопись ботанического сада Миссури 90 (4): 603-612.