Атаксин-2 - Ataxin-2

ATXN2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3КТР
Идентификаторы
Псевдонимы	ATXN2, ASL13, ATX2, SCA2, TNRC13, атаксин 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 601517 MGI: 1277223 ГомолоГен: 2234 Генные карты: ATXN2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q24.12 Начинать 111,443,485 бп[1] Конец 111,599,676 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 F Начинать 121,711,337 бп[2] Конец 121,816,493 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание рецептора эпидермального фактора роста • связывание с С-концом белка • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • перинуклеарная область цитоплазмы • полисом • сеть транс-Гольджи • аппарат Гольджи • Гранула стресса • мембрана • цитозоль • рибонуклеопротеин Биологический процесс • регуляция сборки тела цитоплазматической мРНК • сборка гранул напряжения • Метаболический процесс РНК • регулирование перевода • сборка тела цитоплазматической мРНК • Транспорт РНК • отрицательная регуляция интернализации рецепторов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6311	20239
Ансамбль	ENSG00000204842	ENSMUSG00000042605
UniProt	Q99700	O70305
RefSeq (мРНК)	NM_001310121 NM_001310123 NM_002973 NM_001372574	NM_009125 NM_001359153
RefSeq (белок)	NP_001297050 NP_001297052 NP_002964 NP_001359503	NP_033151 NP_001346082
Расположение (UCSC)	Chr 12: 111.44 - 111.6 Мб	Chr 5: 121,71 - 121,82 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Атаксин-2 это белок что у людей кодируется ATXN2 ген.^[5][6] Мутации в ATXN2 вызывают спиноцеребеллярная атаксия тип 2 (SCA2).

Белковая структура

Атаксин-2 содержит следующие белковые домены:^[7]

• Два LSm домены, которые, вероятно, позволяют связывать РНК
• Мотив PAM2, предположительно связанный с поли (A) -связывающий белок
• А полиглутаминовый тракт у некоторых видов (расположен рядом с аминоконцом у приматов и между доменами LSm у насекомых)^[8]

Описан потенциальный вариант транскрипта, у которого отсутствует внутренний кодирующий экзон; однако его полнометражный характер неизвестен.^[9]

Виды, ткани и субклеточное распределение

ATXN2 сохраняется через эукариоты. У большинства позвоночных есть два ортологи гена (называемого ATXN2 и ATXN2L у людей), за исключением птиц, у которых есть только один. Видов растений бывает от двух до шести. ATXN2 ортологи.^[8]

ATXN2 повсеместно экспрессируется в разных тканях. Внутри отдельных ячеек он локализуется в аппарат Гольджи и стрессовые гранулы.^[10]

Функция

Атаксин-2 участвует в регуляции трансляции мРНК посредством взаимодействия с поли (A)-связывающим белком. Он также участвует в формировании стрессовые гранулы и П-тела, которые также играют роль в регуляции РНК.^[10]

Клиническое значение

Спиноцеребеллярная атаксия 2 типа (SCA2)

Полиглутаминовый тракт атаксина-2 человека нестабилен и может расширяться при передаче из поколения в поколение. Нормальные аллели обычно имеют 22 или 23 повтора, но могут содержать до 31 повтора. Более длинные расширения могут вызвать спиноцеребеллярная атаксия тип 2 (SCA2), фатальное прогрессирующее генетическое заболевание, при котором нейроны выродиться в мозжечок, низшая оливковая, мосты, и другие области. Симптомы SCA2 включают: атаксия (потеря согласованности движений), паркинсонизм, и в некоторых случаях деменция.^[11] Аллель болезни обычно содержит 34-52 повтора CAG, но может содержать всего 32 или более 100 и может увеличиваться в размере при передаче последующим поколениям. Как расширение полиглутамина в атаксине-2 приводит к этим симптомам, неизвестно.

Боковой амиотрофический склероз (БАС)

В 2010 году работы Аарона Гитлера и Нэнси Бонини на Пенсильванский университет обнаружили, что разрастания CAG-повторов среднего размера значительно связаны с риском развития боковой амиотрофический склероз (Болезнь Лу Герига).^[12]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000204842 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042605 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Гисперт С., Твеллс Р., Ороско Дж., Брайс А., Вебер Дж., Хередеро Л., Шойфлер К., Райли Б., Аллотей Р., Нотерс С. (июль 1993 г.). «Хромосомное отнесение второго локуса аутосомно-доминантной мозжечковой атаксии (SCA2) к хромосоме 12q23-24.1». Природа Генетика. 4 (3): 295–9. Дои:10.1038 / ng0793-295. PMID  8358438. S2CID  7387082.
6. Марголис Р.Л., Абрахам М.Р., Гатчелл С.Б., Ли С.Х., Кидвай А.С., Брешель Т.С., Стайн О.К., Каллахан К., Макиннис М.Г., Росс Калифорния (июль 1997 г.). «кДНК с длинными тринуклеотидными повторами CAG из человеческого мозга». Генетика человека. 100 (1): 114–22. Дои:10.1007 / s004390050476. PMID  9225980. S2CID  25999127.
7. Альбрехт М., Голатта М., Вюлльнер У., Ленгауэр Т. (август 2004 г.). «Структурно-функциональный анализ атаксина-2 и атаксина-3». Европейский журнал биохимии. 271 (15): 3155–70. Дои:10.1111 / j.1432-1033.2004.04245.x. PMID  15265035.
8. Хименес-Лопес Д., Гусман П. (июль 2014 г.). «Понимание эволюции и доменной структуры белков атаксина-2 у эукариот». BMC Research Notes. 7: 453. Дои:10.1186/1756-0500-7-453. ЧВК  4105795. PMID  25027299.
9. "Entrez Gene: ATXN2 атаксин 2".
10. Orr HT (апрель 2012 г.). «Клеточная биология спиноцеребеллярной атаксии». Журнал клеточной биологии. 197 (2): 167–77. Дои:10.1083 / jcb.201105092. ЧВК  3328388. PMID  22508507.
11. Справка, Дом генетики. «SCA2». Домашний справочник по генетике. Получено 2018-01-11.
12. Элден А.С., Ким Х.Дж., Харт М.П., ​​Чен-Плоткин А.С., Джонсон Б.С., Фанг X, Армакола М., Гесер Ф., Грин Р., Лу М.М., Падманабхан А., Клей-Фальконе Д., МакКласки Л., Эльман Л., Джур Д., Грубер П.Дж., Руб Ю., Обургер Дж., Трояновски Дж. К., Ли В.М., Ван Дирлин В.М., Бонини Н.М., Гитлер А.Д. (август 2010 г.). «Полиглутаминовые экспансии атаксина-2 средней длины связаны с повышенным риском БАС». Природа. 466 (7310): 1069–75. Дои:10.1038 / природа09320. ЧВК  2965417. PMID  20740007.

дальнейшее чтение

• Стеванин Г., Дюрр А., Брайс А. (январь 2000 г.). «Клинические и молекулярные достижения в аутосомно-доминантной мозжечковой атаксии: от генотипа к фенотипу и физиопатологии». Европейский журнал генетики человека. 8 (1): 4–18. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5200403. PMID  10713882.
• Пульст С.М., Нечипорук А., Нечипорук Т., Гисперт С., Чен XN, Лопес-Сендес I, Перлман С., Старкман С., Ороско-Диас Дж., Лункес А, ДеДжонг П, Роуло Г.А., Обургер Дж., Коренберг-младший, Фигероа С., Сахба S (ноябрь 1996 г.). «Умеренная экспансия обычно двуаллельного тринуклеотидного повтора при спиноцеребеллярной атаксии 2 типа». Природа Генетика. 14 (3): 269–76. Дои:10.1038 / ng1196-269. PMID  8896555. S2CID  12365475.
• Санпей К., Такано Х, Игараси С., Сато Т, Ояке М, Сасаки Х, Вакисака А, Таширо К., Исида Й, Икеучи Т, Коиде Р, Сайто М, Сато А, Танака Т, Ханю С., Такияма Й, Нисидзава М. , Симидзу Н., Номура И., Сегава М., Ивабучи К., Эгути И., Танака Х., Такахаши Х., Цудзи С. (ноябрь 1996 г.). «Идентификация гена спиноцеребеллярной атаксии типа 2 с использованием прямой идентификации повторной экспансии и техники клонирования, DIRECT». Природа Генетика. 14 (3): 277–84. Дои:10.1038 / ng1196-277. PMID  8896556. S2CID  24971010.
• Имберт Дж., Сауду Ф., Иверт Дж., Девис Д., Тротье Й., Гарнье Дж. М., Вебер К., Мандель Дж. Л., Кансанс Дж., Аббас Н., Дюрр А., Дидьерджан О., Стеванин Дж., Агид Й, Брайс А. (ноябрь 1996 г.) «Клонирование гена спиноцеребеллярной атаксии 2 обнаруживает локус с высокой чувствительностью к увеличенным CAG / глютаминовым повторам». Природа Генетика. 14 (3): 285–91. Дои:10.1038 / ng1196-285. PMID  8896557. S2CID  9304975.
• Сахба С., Нечипорук А., Фигероа К.П., Нечипорук Т., Пульст С.М. (февраль 1998 г.). «Геномная структура человеческого гена спиноцеребеллярной атаксии типа 2 (SCA2) на хромосоме 12q24.1». Геномика. 47 (3): 359–64. Дои:10.1006 / geno.1997.5131. PMID  9480749.
• Huynh DP, Del Bigio MR, Ho DH, Pulst SM (февраль 1999 г.). «Экспрессия атаксина-2 в головном мозге здоровых людей и пациентов с болезнью Альцгеймера и спиноцеребеллярной атаксией 2». Анналы неврологии. 45 (2): 232–41. Дои:10.1002 / 1531-8249 (199902) 45: 2 <232 :: AID-ANA14> 3.0.CO; 2-7. PMID  9989626.
• Хьюнь Д.П., Фигероа К., Хоанг Н., Пульст С.М. (сентябрь 2000 г.). «Ядерная локализация или образование телец включения атаксина-2 не являются необходимыми для патогенеза SCA2 у мыши или человека». Природа Генетика. 26 (1): 44–50. Дои:10.1038/79162. PMID  10973246. S2CID  14489237.
• Аффаитати А., де Кристофаро Т., Фелисиелло А., Варроне С. (апрель 2001 г.). «Идентификация альтернативного сплайсинга гена спиноцеребеллярной атаксии 2 типа». Ген. 267 (1): 89–93. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00402-4. PMID  11311558.
• Киль Т.Р., Шибата Х., Во Т, Хьюнь Д.П., Пульст С.М. (август 2001 г.). «Идентификация и экспрессия мышиного ортолога A2BP1». Геном млекопитающих. 12 (8): 595–601. Дои:10.1007 / s00335-001-2056-4. PMID  11471052. S2CID  7340712.
• Чоудри С., Мукерджи М., Шривастава А.К., Джайн С., Брахмачари С.К. (октябрь 2001 г.). «Нестабильность повтора CAG в локусе SCA2: закрепление прерываний CAA и связанных однонуклеотидных полиморфизмов». Молекулярная генетика человека. 10 (21): 2437–46. Дои:10.1093 / hmg / 10.21.2437. PMID  11689490.
• Панг Дж. Т., Джунти П., Чемберлен С., Ан С.Ф., Виталиани Р., Скаравилли Т., Мартиниан Л., Вуд Н. В., Скаравилли Ф., Ансорге О. (март 2002 г.). «Нейрональные внутриядерные включения в SCA2: генетическое, морфологическое и иммуногистохимическое исследование двух случаев». Мозг. 125 (Pt 3): 656–63. Дои:10.1093 / мозг / awf060. PMID  11872620.
• Саттерфилд Т.Ф., Джексон С.М., Палланк Л.Дж. (декабрь 2002 г.). «Гомолог гена полиглутаминовой болезни SCA2 у дрозофилы является чувствительным к дозе регулятором образования актиновых филаментов». Генетика. 162 (4): 1687–702. ЧВК  1462369. PMID  12524342.
• Wiedemeyer R, Westermann F, Wittke I, Nowock J, Schwab M (январь 2003 г.). «Атаксин-2 способствует апоптозу клеток нейробластомы человека». Онкоген. 22 (3): 401–11. Дои:10.1038 / sj.onc.1206150. PMID  12545161.
• Паями Х., Натт Дж., Ганчер С., Птица Т., МакНил М.Г., Зельцер В.К., Хасси Дж., Локхарт П., Гвинн-Харди К., Синглтон А.А., Синглтон А.Б., Харди Дж., Фаррер М. (апрель 2003 г.). «SCA2 может проявляться как леводопа-зависимый паркинсонизм». Двигательные расстройства. 18 (4): 425–9. Дои:10.1002 / mds.10375. PMID  12671950. S2CID  35401117.
• Светел М., Джармати А., Драгасевич Н., Савич Д., Кулькович Б., Ромац С., Костич В.С. (сентябрь 2003 г.). «Мутации SCA2 и SCA3 при паркинсонизме, вызванном допа-реакцией в молодом возрасте». Европейский журнал неврологии. 10 (5): 597. Дои:10.1046 / j.1468-1331.2003.00671.x. PMID  12940846. S2CID  30076827.
• Бреннейс С., Бёш С.М., Шокке М., Веннинг Г.К., Поу В. (октябрь 2003 г.). «Паттерн атрофии в SCA2 определяется морфометрией на основе вокселей». NeuroReport. 14 (14): 1799–802. Дои:10.1097/00001756-200310060-00008. PMID  14534423. S2CID  26149005.

внешняя ссылка

• GeneReviews / NIH / NCBI / UW запись о спиноцеребеллярной атаксии 2 типа
• Человек ATXN2 расположение генома и ATXN2 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.