CARD9 - CARD9 - Wikipedia

CARD9
Идентификаторы
ПсевдонимыCARD9, CANDF2, член семейства hcaspase recruitment domain 9
Внешние идентификаторыOMIM: 607212 MGI: 2685628 ГомолоГен: 14150 Генные карты: CARD9
Расположение гена (человек)
Хромосома 9 (человек)
Chr.Хромосома 9 (человек)[1]
Хромосома 9 (человек)
Геномное расположение для CARD9
Геномное расположение для CARD9
Группа9q34.3Начинать136,361,903 бп[1]
Конец136,373,681 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_052814
NM_052813

NM_001037747

RefSeq (белок)

NP_434700
NP_434701

NP_001032836

Расположение (UCSC)Chr 9: 136.36 - 136.37 МбChr 2: 26.35 - 26.36 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок, содержащий домен рекрутирования каспазы 9 является адаптерный белок из Семейство белков CARD-CC, который у человека кодируется CARD9 ген.[5][6] Он передает сигналы от рецепторов распознавания образов для активации провоспалительных и противовоспалительных цитокинов, регулирующих воспаление и клетки. апоптоз. Гомозиготные мутации в CARD9 связаны с дефектным врожденным иммунитетом против дрожжей, таких как Candida и дерматофиты.

Функция

CARD9 является членом семейства белков CARD, которое определяется наличием характерного домена рекрутирования, связанного с каспазой (КАРТА ). CARD - это домен взаимодействия с белками, который, как известно, участвует в активации или подавлении CARD, содержащего членов каспаза семьи, и, таким образом, играет важную регулирующую роль в клеточном апоптоз. Этот белок был идентифицирован по его избирательной ассоциации с доменом CARD BCL10, положительный регулятор апоптоза и NF-κB активация.[7] Считается, что он функционирует как молекулярный каркас для сборки сигнального комплекса BCL10, который активирует NF-κB. Наблюдалось несколько альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, но их полноразмерная природа четко не определена.[6]

Клиническое значение

В 2006 году стало ясно, что Card9 играет важную роль в врожденном иммунном ответе против дрожжей. Card9 передает сигналы от так называемых рецепторов распознавания образов (Дектин-1 ) к нижестоящим сигнальным путям, таким как NF-κB и тем самым активирует провоспалительные цитокины (TNF, Ил-23, Ил-6, Ил-2 ) и противовоспалительный цитокин (Ил-10 ), а затем соответствующий врожденный и адаптивный иммунный ответ для устранения инфекции.[8]Аутосомно-рецессивная форма восприимчивости к хронической кожно-слизистой кандидоз в 2009 году было обнаружено, что он связан с гомозиготными мутациями в CARD9.[9]Глубокий дерматофитоз и дефицит Card9, зарегистрированные в иранской семье, привели к его обнаружению у 17 человек из тунисских, алжирских и марокканских семей с глубокий дерматофитоз.[10]

Мутации CARD9 были связаны с воспалительными заболеваниями, такими как анкилозирующий спондилоартрит и воспалительное заболевание кишечника (Болезнь Крона и язвенный колит).[11] Мануэль Ривас, Марк Дейли и его коллеги обнаружили, что генетический вариант c.IVS11 + 1G> C защищает от болезни Крона, язвенного колита и анкилозирующего спондилита.[12] CARD9 S12NΔ11, является редким вариантом сплайсинга, в котором экзон 11 CARD9 удален. Этот аллель, идентифицированный глубоким секвенированием локусов GWAS, приводит к белку с усечением на С-конце. В последующем функциональном исследовании с использованием повторно экспрессированных изоформ CARD9 человека на мышах Card9- / - дендритные клетки костного мозга (BMDC) оценивали на продукцию цитокинов. BMDC, экспрессирующие предрасполагающий вариант CARD9 S12N, показали повышенную продукцию TNFα и IL-6 по сравнению с BMDC, экспрессирующими CARD9 дикого типа. Напротив, CARD9 Δ11 и CARD9 S12NΔ11, а также усеченный на С-конце вариант CARD9 V6 показали значительное нарушение продукции TNFα и IL-6. Было обнаружено, что CARD9 Δ11 оказывает доминирующее отрицательное влияние на функцию CARD9 при совместной экспрессии с CARD9 дикого типа в дендритных клетках человека и мыши.[13]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции CARD9. Условный нокаутирующая мышь линия называется Card9tm1a (EUCOMM) Хмгу был создан на Wellcome Trust Sanger Institute.[14] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг[15] для определения последствий удаления.[16][17][18][19] Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование[20] - углубленное фенотипирование костей и хрящей[21]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000187796 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000026928 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Бертин Дж, Гуо Й, Ван Л., Сринивасула С.М., Джейкобсон, доктор медицины, Пойет Дж. Л., Мерриам С., Ду М.К., Дайер М.Дж., Робисон К.Э., ДиСтефано П.С., Алнемри Е.С. (январь 2001 г.). «CARD9 - это новый белок, содержащий домен рекрутирования каспаз, который взаимодействует с BCL10 / CLAP и активирует NF-каппа B». J. Biol. Chem. 275 (52): 41082–6. Дои:10.1074 / jbc.C000726200. PMID  11053425.
  6. ^ а б "Entrez Gene: семейство доменов рекрутирования каспаз CARD9, член 9".
  7. ^ Бертин Дж, Гуо Й, Ван Л., Сринивасула С.М., Джейкобсон, доктор медицины, Пойет Дж. Л., Мерриам С., Ду М.К., Дайер М.Дж., Робисон К.Э., ДиСтефано П.С., Алнемри Е.С. (декабрь 2000 г.). «CARD9 - это новый белок, содержащий домен рекрутирования каспаз, который взаимодействует с BCL10 / CLAP и активирует NF-каппа B». J. Biol. Chem. 275 (52): 41082–6. Дои:10.1074 / jbc.C000726200. PMID  11053425.
  8. ^ Гросс О., Гевис А., Фингер К., Шефер М., Спарвассер Т., Пешель С., Фёрстер И., Руланд Дж. (Август 2006 г.). «Card9 контролирует не-TLR сигнальный путь для врожденного противогрибкового иммунитета». Природа. 442 (7103): 651–6. Bibcode:2006Натура 442..651Г. Дои:10.1038 / природа04926. PMID  16862125. S2CID  4405404.
  9. ^ Glocker EO, ​​Hennigs A, Nabavi M, Schäffer AA, Woellner C, Salzer U, Pfeifer D, Veelken H, Warnatz K, Tahami F, Jamal S, Manguiat A, Rezaei N, Amirzargar AA, Plebani A, Hannesschläger N, Gross O , Руланд Дж., Гримбахер Б. (октябрь 2009 г.). «Гомозиготная мутация CARD9 в семье, подверженной грибковым инфекциям». N. Engl. J. Med. 361 (18): 1727–35. Дои:10.1056 / NEJMoa0810719. ЧВК  2793117. PMID  19864672.
  10. ^ Lanternier F, Pathan S, Vincent QB, Liu L, Cypowyj S, Prando C, Migaud M, Taibi L, Ammar-Khodja A, Boudghene Stambouli O, Guellil B, Jacobs F, Goffard JC, Schepers K, del Marmol V, Boussofara L, Денгезли M, Лариф M, Бачелез H, Мишель L, Лефранк G, Hay R, Jouvion G, Chretien F, Fraitag S, Bougnoux ME, Boudia M, Abel L, Lortholary O, Casanova JL, Picard C, Grimbacher B, Пуэль А. (2013). «Глубокий дерматофитоз и наследственная недостаточность CARD9». N Engl J Med. 369 (18): 1704–14. Дои:10.1056 / NEJMoa1208487. ЧВК  4084693. PMID  24131138.
  11. ^ Эванс Д.М., Спенсер С.К., Пойнтон Дж. Дж., Су З., Харви Д., Кочан Г. и др. (Август 2011 г.). «Взаимодействие между ERAP1 и HLA-B27 при анкилозирующем спондилите предполагает участие пептида в механизме HLA-B27 в восприимчивости к заболеванию». Nat. Genet. 43 (8): 761–7. Дои:10,1038 / нг.873. ЧВК  3640413. PMID  21743469.
  12. ^ Ривас М.А., Бодуан М., Гардет А., Стивенс С., Шарма Ю., Чжан С.К. и др. (Октябрь 2011 г.). «Глубокое ресеквенирование локусов GWAS позволяет выявить независимые редкие варианты, связанные с воспалительным заболеванием кишечника». Природа Генетика. 43 (11): 1066–73. Дои:10,1038 / нг.952. ЧВК  3378381. PMID  21983784.
  13. ^ Cao Z, Conway KL, Heath RJ, Rush JS, Leshchiner ES, Ramirez-Ortiz ZG и др. (Октябрь 2015 г.). «Убиквитинлигаза TRIM62 регулирует CARD9-опосредованный противогрибковый иммунитет и воспаление кишечника». Иммунитет. 43 (4): 715–26. Дои:10.1016 / j.immuni.2015.10.005. ЧВК  4672733. PMID  26488816.
  14. ^ Гердин А.К. (2010). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  15. ^ а б «Международный консорциум по фенотипированию мышей».
  16. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  17. ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  18. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  19. ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Sanger Institute Проект генетики мышей, Таннахилл Д., Логан Д.В., Макартур Д.Г., Флинт Дж., Махаджан В.Б., Цанг С.Х., Смит I, Ватт FM, Скарнес В.К., Дуган Джи, Адамс DJ, Рамирес-Солис Р., Брэдли А., Сталь КП (2013) . «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов». Клетка. 154 (2): 452–64. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. ЧВК  3717207. PMID  23870131.
  20. ^ а б «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)».
  21. ^ «Консорциум OBCD».

внешняя ссылка

дальнейшее чтение