Даблкортин - Doublecortin

DCX
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4ATU, 1MJD, 2BQQ, 2XRP, 5IN7, 5IOI, 5IKC, 5IP4, 5IO9
Идентификаторы
Псевдонимы	DCX, DBCN, DC, LISX, SCLH, XLIS, даблкортин
Внешние идентификаторы	OMIM: 300121 MGI: 1277171 ГомолоГен: 7683 Генные карты: DCX
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq23 Начните 111,293,779 бп[1] Конец 111,412,429 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X | X F2 Начните 143,855,842 бп[2] Конец 143,933,311 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание протеинкиназы • связывание микротрубочек Сотовый компонент • проекция клетки • комплекс, связанный с микротрубочками • микротрубочки • цитоскелет • цитозоль • проекция нейрона • цитоплазма • GO: 0035085 аксонема Биологический процесс • дифференциация клеток • развитие нервной системы • развитие многоклеточного организма • развитие центральной нервной системы • миграция нейронов • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • сборка аксонемы • развитие фоторецепторных клеток • развитие сетчатки глаза камерного типа Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	1641	13193
Ансамбль	ENSG00000077279	ENSMUSG00000031285
UniProt	O43602	O88809
RefSeq (мРНК)	NM_000555 NM_001195553 NM_178151 NM_178152 NM_178153 NM_001369370 NM_001369371 NM_001369372 NM_001369373 NM_001369374	NM_001110222 NM_001110223 NM_001110224 NM_010025
RefSeq (белок)	NP_000546 NP_001182482 NP_835364 NP_835365 NP_835366 NP_001356299 NP_001356300 NP_001356301 NP_001356302 NP_001356303	NP_001103692 NP_001103693 NP_001103694 NP_034155
Расположение (UCSC)	Chr X: 111.29 - 111.41 Мб	Chr X: 143,86 - 143,93 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок миграции нейронов даблкортин, также известен как дублин или лиссэнцефалин-X это белок что у людей кодируется DCX ген.^[5]

Функция

Экспрессия даблкортина у крыс зубчатые извилины, 21 послеродовой день. Oomen et al., 2009.^[6]

Даблкортин (DCX) - это микротрубочка -ассоциированный белок, экспрессируемый нейрональными клетками-предшественниками и незрелыми нейроны в корковых структурах эмбриона и взрослых. Клетки-предшественники нейронов начинают экспрессировать DCX при активном делении, а их дочерние нейрональные клетки продолжают экспрессировать DCX в течение 2–3 недель по мере того, как клетки созревают в нейроны. Подавление DCX начинается через 2 недели и происходит в то же время, когда эти клетки начинают экспрессировать NeuN, маркер зрелых нейронов.^[7]

Из-за почти исключительной экспрессии DCX в развивающихся нейронах это белок все чаще используется как маркер для нейрогенез. Действительно, уровни экспрессии DCX повышаются в ответ на упражнения,^[8] и это увеличение происходит параллельно с увеличением Брду маркировка, которая в настоящее время является «золотым стандартом» в измерении нейрогенеза.

Было обнаружено, что даблкортин связывать к микротрубочка цитоскелет. В естественных условиях и in vitro Анализы показывают, что Doublecortin стабилизирует микротрубочки и вызывает образование пучков.^[9] Даблкортин - это основной белок с изоэлектрическая точка из 10 типичных для связывания микротрубочек белки.

Выбить мышь

Двухслойный гиппокамп у мышей с нокаутом Doublecortin (правые панели) по сравнению с нормальным гиппокампом у мышей дикого типа (левые панели). Рисунок извлечен из работы лаборатории г. Фиона Фрэнсис

У мышей, у которых был обнаружен ген Doublecortin выбит, корковые слои по-прежнему правильно сформированы. Однако гиппокамп у этих мышей обнаруживается дезорганизация в области CA3. Обычно один слой пирамидные клетки у мутантов рассматривается как двойной слой. Эти мыши также ведут себя иначе, чем их однопометники дикого типа, и страдают эпилепсией.^[10]

Структура

Даблкортин
структура раствора N-концевого домена dcx двойной кортин-подобной киназы человека
Идентификаторы
Символ	DCX
Pfam	PF03607
ИнтерПро	IPR003533
SCOP2	1mfw / Объем / СУПФАМ
CDD	cd01617
Доступные белковые структуры: Pfam   структуры / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum резюме структуры

Подробный последовательность анализ Doublecortin и Doublecortin-подобных белков позволил идентифицировать тандемный повтор эволюционно сохраненный Даблкортин (ДК) домены. Эти домены находятся в N конечная белков и состоит из тандемно повторяющихся копий примерно 80 аминокислоты область, край. Было высказано предположение, что первый DC-домен Doublecortin связывает тубулин и усиливает полимеризацию микротрубочек.^[11]

Было показано, что даблкортин влияет на структуру микротрубочек. Зарождение микротрубочек in vitro в присутствии Doublecortin имеют почти исключительно 13 протофиламентов, тогда как ядро ​​микротрубочек без Doublecortin присутствует в диапазоне различных размеров.

Взаимодействия

Даблкортин показал взаимодействовать с участием PAFAH1B1.^[12]

Клиническое значение

Даблкортин мутирует в Х-сцепленный лиссэнцефалия и синдром двойной коры головного мозга, и клинические проявления связаны с полом. У мужчин Х-сцепленная лизэнцефалия приводит к гладкому мозгу из-за отсутствия миграции незрелых нейронов, которые обычно способствуют складчатости поверхности мозга. Синдром двойной коры характеризуется аномальной миграцией нервной ткани во время развития, что приводит к появлению двух полос неуместных нейронов в подкорковом белке, образующих две кортикальные слои, что и дает название синдрому; это открытие обычно происходит у женщин.^[13] Мутация была обнаружена Джозеф Глисон и Кристофер А. Уолш в Бостоне.^[14][15]

Смотрите также

• Лиссэнцефалия

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000077279 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031285 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. EntrezGene 1641
6. Oomen CA, Girardi CE, Cahyadi R, Verbeek EC, Krugers H, Joëls M, Lucassen PJ (2009). «Противоположные эффекты ранней материнской депривации на нейрогенез у самцов и самок крыс». PLOS ONE. 4 (1): e3675. Bibcode:2009PLoSO ... 4.3675O. Дои:10.1371 / journal.pone.0003675. ЧВК  2629844. PMID  19180242.
7. Brown JP, Couillard-Després S, Cooper-Kuhn CM, Winkler J, Aigner L, Kuhn HG (декабрь 2003 г.). «Временная экспрессия даблкортина во время нейрогенеза у взрослых». J. Comp. Neurol. 467 (1): 1–10. Дои:10.1002 / cne.10874. PMID  14574675. S2CID  25315374.
8. Couillard-Despres S, Winner B, Schaubeck S, Aigner R, Vroemen M, Weidner N, Bogdahn U, Winkler J, Kuhn HG, Aigner L (январь 2005 г.). «Уровни экспрессии даблкортина в мозге взрослого человека отражают нейрогенез». Евро. J. Neurosci. 21 (1): 1–14. Дои:10.1111 / j.1460-9568.2004.03813.x. PMID  15654838.
9. Хореш Д., Сапир Т., Фрэнсис Ф., Вольф С. Г., Каспи М., Эльбаум М., Челли Дж., Райнер О. (сентябрь 1999 г.). «Даблкортин, стабилизатор микротрубочек». Гм. Мол. Genet. 8 (9): 1599–610. Дои:10.1093 / hmg / 8.9.1599. PMID  10441322.
10. Ностен-Бертран М., Каппелер С., Динокур С., Дени С., Жермен Дж., Фан Динь Туй Ф, Верстратен С., Альварес С., Метин С., Челли Дж., Гирос Б., Майлз Р., Деполис А., Фрэнсис Фрэнсис (2008-06- 25). «Эпилепсия у мышей с нокаутом Dcx, связанная с дискретными дефектами ламинирования и повышенной возбудимостью в гиппокампе». PLOS ONE. 3 (6): e2473. Bibcode:2008PLoSO ... 3.2473N. Дои:10.1371 / journal.pone.0002473. ЧВК  2429962. PMID  18575605.
11. Сапир Т., Хореш Д., Каспи М., Атлас Р., Берджесс Х.А., Вольф С.Г., Фрэнсис Ф., Челли Дж., Эльбаум М., Пьетроковски С., Райнер О. (март 2000 г.). «Кластер мутаций даблкортина в эволюционно консервативных функциональных доменах». Гм. Мол. Genet. 9 (5): 703–12. Дои:10,1093 / hmg / 9,5,703. PMID  10749977.
12. Каспи М., Атлас Р., Кантор А., Сапир Т., Райнер О. (сентябрь 2000 г.). «Взаимодействие между LIS1 и даблкортином, двумя продуктами гена лиссэнцефалии». Гм. Мол. Genet. 9 (15): 2205–13. Дои:10.1093 / oxfordjournals.hmg.a018911. PMID  11001923.
13. Онлайн-менделевское наследование в человеке (OMIM): Даблкортин - 300121
14. Глисон Дж. Г., Аллен К. М., Фокс Дж. В., Ламперти Э. Д., Беркович С., Шеффер И., Купер Э. К., Добинс В. Б., Миннерат С. Р., Росс М. Е., Уолш, Калифорния (январь 1998 г.). «Даблкортин, специфический для мозга ген, мутировавший при Х-сцепленной лизэнцефалии человека и синдроме двойной коры головного мозга, кодирует предполагаемый сигнальный белок». Ячейка. 92 (1): 63–72. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80899-5. PMID  9489700.
15. Левенштейн DH (2011). «Судороги и эпилепсия». В Loscalzo J, Longo DL, Fauci AS, Kasper DL, Hauser SL (ред.). Принципы внутренней медицины Харрисона (18-е изд.). McGraw-Hill Professional. С. 3251–3269. ISBN  978-0-07-174889-6.

дальнейшее чтение

• des Portes V, Pinard JM, Smadja D и др. (1997). «Доминантная X-связанная подкорковая ламинарная гетеротопия и синдром лиссэнцефалии (XSCLH / LIS): доказательства возникновения мутации у мужчин и картирование потенциального локуса в Xq22». J. Med. Genet. 34 (3): 177–83. Дои:10.1136 / jmg.34.3.177. ЧВК  1050888. PMID  9132485.
• des Portes V, Pinard JM, Billuart P и др. (1998). «Новый ген ЦНС, необходимый для миграции нейронов и участвующий в X-сцепленной подкорковой ламинарной гетеротопии и синдроме лиссэнцефалии». Ячейка. 92 (1): 51–61. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80898-3. PMID  9489699.
• Глисон Дж. Г., Аллен К. М., Фокс Дж. В. и др. (1998). «Даблкортин, специфический для мозга ген, мутировавший при Х-сцепленной лизэнцефалии человека и синдроме двойной коры головного мозга, кодирует предполагаемый сигнальный белок». Ячейка. 92 (1): 63–72. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80899-5. PMID  9489700.
• des Portes V, Francis F, Pinard JM и др. (1999). «даблкортин является основным геном, вызывающим Х-сцепленную субкортикальную ламинарную гетеротопию (SCLH)». Гм. Мол. Genet. 7 (7): 1063–70. Дои:10.1093 / hmg / 7.7.1063. PMID  9618162.
• Сосси-Алауи К., Хартунг А.Дж., Геррини Р. и др. (1998). «Даблкортин человека (DCX) и гомологичный ген у мыши кодируют предполагаемый Са2 + -зависимый сигнальный белок, который мутирован в дефектах миграции нейронов, связанных с Х-хромосомой человека». Гм. Мол. Genet. 7 (8): 1327–32. Дои:10.1093 / hmg / 7.8.1327. PMID  9668176.
• Пилз Д.Т., Мацумото Н., Миннерат С. и др. (1999). «Мутации LIS1 и XLIS (DCX) вызывают большинство классических лиссэнцефалий, но разные паттерны развития». Гм. Мол. Genet. 7 (13): 2029–37. Дои:10.1093 / hmg / 7.13.2029. PMID  9817918.
• Глисон Дж. Г., Миннерат С. Р., Фокс Дж. В. и др. (1999). «Характеристика мутаций в гене doublecortin у пациентов с синдромом двойной коры головного мозга». Анна. Neurol. 45 (2): 146–53. Дои:10.1002 / 1531-8249 (199902) 45: 2 <146 :: AID-ANA3> 3.0.CO; 2-N. PMID  9989615.
• Като М., Кимура Т., Лин С. и др. (1999). «Новая мутация гена даблкортина у японских пациентов с Х-сцепленной лизэнцефалией и подкорковой полосовой гетеротопией». Гм. Genet. 104 (4): 341–4. Дои:10.1007 / s004390050963. PMID  10369164. S2CID  875280.
• Глисон Дж. Г., Лин П. Т., Фланаган Л. А., Уолш Калифорния (1999). «Даблкортин - это белок, связанный с микротрубочками, который широко экспрессируется мигрирующими нейронами». Нейрон. 23 (2): 257–71. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80778-3. PMID  10399933.
• Пилз Д.Т., Кук Дж., Мацумото Н. и др. (2000). «Гетеротопия подкорковых полос у редко пораженных мужчин может быть вызвана миссенс-мутациями в DCX (XLIS) или LIS1». Гм. Мол. Genet. 8 (9): 1757–60. Дои:10,1093 / hmg / 8.9.1757. PMID  10441340.
• Сакамото М., Оно Дж., Окада С. и др. (2000). «Генетическое изменение гена DCX у японских пациентов с субкортикальной ламинарной гетеротопией или изолированной последовательностью лиссэнцефалии». J. Hum. Genet. 45 (3): 167–70. Дои:10.1007 / с100380050204. PMID  10807542.
• Каспи М., Атлас Р., Кантор А. и др. (2001). «Взаимодействие между LIS1 и даблкортином, двумя продуктами гена лиссэнцефалии». Гм. Мол. Genet. 9 (15): 2205–13. Дои:10.1093 / oxfordjournals.hmg.a018911. PMID  11001923.
• Мацумото Н., Левентер Р. Дж., Кук Дж. А. и др. (2001). «Мутационный анализ гена DCX и корреляция генотип / фенотип в подкорковой полосовой гетеротопии». Евро. J. Hum. Genet. 9 (1): 5–12. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5200548. PMID  11175293.
• Демелас Л., Серра Дж., Конти М. и др. (2001). «Неполная пенетрантность при нормальной МРТ у женщины с мутацией в зародышевой линии гена DCX». Неврология. 57 (2): 327–30. Дои:10.1212 / wnl.57.2.327. PMID  11468322. S2CID  6735445.
• Friocourt G, Chafey P, Billuart P, et al. (2001). «Даблкортин взаимодействует с мю-субъединицами адаптерных комплексов клатрина в развивающейся нервной системе». Мол. Cell. Неврологи. 18 (3): 307–19. Дои:10.1006 / mcne.2001.1022. PMID  11591131. S2CID  54264008.
• Като М., Канаи М., Сома О. и др. (2001). «Мутация гена doublecortin у пациентов мужского пола с синдромом двойной коры: соматический мозаицизм, обнаруженный с помощью анализа корня волос». Анна. Neurol. 50 (4): 547–51. Дои:10.1002 / ana.1231. PMID  11601509. S2CID  18259219.
• des Portes V, Abaoub L, Joannard A и др. (2002). «Так называемые« криптогенные »парциальные припадки, возникающие в результате тонкой корковой дисгенезии из-за мутации гена даблкортина». Захват: Журнал Британской ассоциации эпилепсии. 11 (4): 273–7. Дои:10.1053 / seiz.2001.0607. PMID  12027577.
• Кижатил К., Ву YX, Сен А., Беннет В. (2002). «Новая активность даблкортина в распознавании тирозина фосфо-FIGQY в цитоплазматическом домене нейрофасцина». J. Neurosci. 22 (18): 7948–58. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.22-18-07948.2002. ЧВК  6758080. PMID  12223548.
• Д'Агостино, доктор медицины, Бернаскони А., Дас С. и др. (2002). "Гетеротопия подкорковых полос (SBH) у мужчин: клинические, визуальные и генетические данные по сравнению с женщинами". Мозг. 125 (Pt 11): 2507–22. Дои:10.1093 / мозг / awf248. PMID  12390976.
• Мейер Дж., Перес-Гарсия К. Г., Глисон Дж. Г. (2003). «Избирательная экспрессия даблкортина и LIS1 в развивающейся коре головного мозга человека предполагает уникальные режимы движения нейронов». Цереб. Кора. 12 (12): 1225–36. Дои:10.1093 / cercor / 12.12.1225. PMID  12427674.

внешние ссылки

• СМИ, связанные с даблкортин в Wikimedia Commons
• GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о заболеваниях, связанных с DCX
• Записи OMIM о заболеваниях, связанных с DCX
• даблкортин + белок в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: O43602 (Белок миграции нейронов даблкортин) на PDBe-KB.

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR003533