FKBP2 - FKBP2

FKBP2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2PBC, 4NNR
Идентификаторы
Псевдонимы	FKBP2, FKBP-13, PPIase, FK506 связывающий белок 2, FKBP пролилизомераза 2, FKBP13
Внешние идентификаторы	OMIM: 186946 MGI: 95542 ГомолоГен: 40604 Генные карты: FKBP2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q13.1 Начните 64,241,003 бп[1] Конец 64,244,134 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 А Начните 6,977,741 бп[2] Конец 6,980,501 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Обвязка FK506 • GO: 0001948 связывание с белками • изомеразная активность • активность пептидил-пролил цис-транс-изомеразы Сотовый компонент • мембрана • эндоплазматический ретикулум • мембрана эндоплазматического ретикулума Биологический процесс • шаперон-опосредованный сворачивание белка • изомеризация пептидил-пролила белков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2286	14227
Ансамбль	ENSG00000173486	ENSMUSG00000056629
UniProt	P26885	P45878
RefSeq (мРНК)	NM_001135208 NM_004470 NM_057092	NM_001166368 NM_008020 NM_001360286 NM_001360288
RefSeq (белок)	NP_001128680 NP_004461 NP_476433	NP_001159840 NP_032046 NP_001347215 NP_001347217
Расположение (UCSC)	Chr 11: 64.24 - 64.24 Мб	Chr 19: 6.98 - 6.98 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

FK506-связывающий белок 2 это белок что у людей кодируется FKBP2 ген.^[5][6]

Функция

В белок кодируемый этим геном, является членом иммунофилин семейство белков, которые играют роль в иммунорегуляции и основных клеточных процессах, включая сворачивание и транспортировку белков. Этот кодируемый белок представляет собой цис-транс пролил изомераза связывающий иммунодепрессанты FK506 и рапамицин. Считается, что он функционирует как ER шаперон и может также действовать как компонент мембранных цитоскелетных каркасов. Этот ген имеет два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, которые кодируют одну и ту же изоформу. Несколько полиаденилирование сайты были описаны для этого гена, но природа полной длины этого гена не была определена.^[6]

Взаимодействия

FKBP2 был показан взаимодействовать с ARFGEF1^[7] и EPB41L2.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000173486 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000056629 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Джин Ю.Дж., Альберс М.В., Лейн В.С., Бирер Б.Э., Шрайбер С.Л., Буракофф С.Дж. (сентябрь 1991 г.). «Молекулярное клонирование ассоциированного с мембраной человеческого FK506 и рапамицин-связывающего белка, FKBP-13». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 88 (15): 6677–81. Дои:10.1073 / pnas.88.15.6677. ЧВК  52151. PMID  1713687.
6. «Ген Entrez: FKBP2 FK506 связывающий белок 2, 13 кДа».
7. Падилья П.И., Чанг М.Дж., Пачеко-Родригес Дж., Адамик Р., Мосс Дж., Воган М. (март 2003 г.). «Взаимодействие FK506-связывающего белка 13 с брефельдином А-ингибированным белком 1 обмена гуаниновых нуклеотидов (BIG1): эффекты FK506». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (5): 2322–7. Дои:10.1073 / pnas.2628047100. ЧВК  151339. PMID  12606707.
8. Валенский Л.Д., Гаскард П., Филдс М.Э., Блэкшоу С., Конбой Дж. Г., Мохандас Н., Снайдер С.Х. (апрель 1998 г.). «Связывающий белок FK506 массой 13 кДа, FKBP13, взаимодействует с новым гомологом цитоскелетного белка мембраны эритроцитов 4.1».. J. Cell Biol. 141 (1): 143–53. Дои:10.1083 / jcb.141.1.143. ЧВК  2132710. PMID  9531554.

дальнейшее чтение

• Дилелла А.Г., Хокинс А., Крейг Р.Дж., Шрайбер С.Л., Гриффин, Калифорния (1992). «Присвоение хромосомных полос генов, кодирующих человеческие FKBP12 и FKBP13». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 189 (2): 819–23. Дои:10.1016 / 0006-291X (92) 92276-4. PMID  1281998.
• Хендриксон Б.А., Чжан В., Крейг Р.Дж., Цзинь Ю.Дж., Бирер Б.Е., Буракофф С., Дилелла А.Г. (1993). «Структурная организация генов, кодирующих человеческий и мышиный FK506-связывающий белок (FKBP) 13, и сравнение с FKBP1». Ген. 134 (2): 271–5. Дои:10.1016 / 0378-1119 (93) 90106-Д. PMID  7505249.
• Буш К.Т., Хендриксон Б.А., Нигам С.К. (1994). «Индукция FK506-связывающего белка, FKBP13, в условиях неправильной укладки белков в эндоплазматическом ретикулуме». Biochem. J. 303 (Pt 3): 705–8. Дои:10.1042 / bj3030705. ЧВК  1137603. PMID  7526846.
• Нигам С.К., Джин Ю.Дж., Джин М.Дж., Буш К.Т., Бирер Б.Е., Бураков С.Дж. (1993). «Локализация FK506-связывающего белка, FKBP 13, в просвете эндоплазматического ретикулума». Biochem. J. 294 (Pt 2): 511–5. Дои:10.1042 / bj2940511. ЧВК  1134484. PMID  8373365.
• Валенский Л.Д., Гаскард П., Филдс М.Э., Блэкшоу С., Конбой Дж. Г., Мохандас Н., Снайдер С.Х. (1998). «Связывающий белок FK506 массой 13 кДа, FKBP13, взаимодействует с новым гомологом цитоскелетного белка мембраны эритроцитов 4.1».. J. Cell Biol. 141 (1): 143–53. Дои:10.1083 / jcb.141.1.143. ЧВК  2132710. PMID  9531554.
• Падилья П.И., Чанг М.Дж., Пачеко-Родригес Дж., Адамик Р., Мосс Дж., Воган М. (2003). «Взаимодействие FK506-связывающего белка 13 с брефельдином А-ингибированным белком 1 обмена гуаниновых нуклеотидов (BIG1): эффекты FK506». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (5): 2322–7. Дои:10.1073 / pnas.2628047100. ЧВК  151339. PMID  12606707.
• Уиллингем С., Отейро Т.Ф., Девит М.Дж., Линдквист С.Л., Муховски П.Дж. (2003). «Гены дрожжей, повышающие токсичность мутантного фрагмента хантинтина или альфа-синуклеина». Наука. 302 (5651): 1769–72. Дои:10.1126 / science.1090389. PMID  14657499. S2CID  43221047.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу К., Патель А.Дж., Сабо Дж., Руал Дж. Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Э., Барабаши А.Л., Видал М., Зогби HY (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Клетка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.