GRASP55 - GRASP55 - Wikipedia

GORASP2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3RLE, 4EDJ
Идентификаторы
Псевдонимы	GORASP2, GOLPH6, GRASP55, GRS2, p59, белок 2 повторной сборки Гольджи
Внешние идентификаторы	OMIM: 608693 MGI: 2135962 ГомолоГен: 9180 Генные карты: GORASP2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q31.1 Начинать 170,928,464 бп[1] Конец 170,967,130 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 C2 Начинать 70,661,576 бп[2] Конец 70,712,636 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • Мембрана Гольджи • мембрана • аппарат Гольджи • эндоплазматический ретикулум • мембрана эндоплазматического ретикулума Биологический процесс • организация органелл • Организация Гольджи • сборка органелл • сперматогенез • дифференциация клеток • реакция на стресс эндоплазматического ретикулума • установление локализации белка на плазматической мембране Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	26003	70231
Ансамбль	ENSG00000115806	ENSMUSG00000014959
UniProt	Q9H8Y8	Q99JX3
RefSeq (мРНК)	NM_001201428 NM_015530	NM_027352
RefSeq (белок)	NP_001188357 NP_056345	NP_081628
Расположение (UCSC)	Chr 2: 170.93 - 170.97 Мб	Chr 2: 70.66 - 70.71 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Повторная сборка-укладка белка Гольджи 55 kДа (GRASP55) также известный как повторная сборка-укладка белка Гольджи 2 (GORASP2) это белок что у людей кодируется GORASP2 ген.^[5][6] Он был идентифицирован по его гомологии с GRASP65 и аминокислотная последовательность белка был определен анализом молекулярный клон своего комплементарная ДНК.^[5] Первый (N-конец ) 212 аминокислотные остатки из GRASP55 очень гомологичны таковым из GRASP65, но остальные из 454 аминокислотных остатков сильно отличаются от GRASP65.^[5] Консервативный регион известен как домен GRASP, и он является консервативным среди GRASP широкого разнообразия эукариоты, но нет растения.^[6][7] В C-конец часть молекулы называется SPR домен (серин, пролин -богатые).^[7] GRASP55 более близок к гомологам у других видов, что позволяет предположить, что GRASP55 является предком GRASP65.^[7] GRASP55 ассоциирован с медиальная и трансцистерна из аппарат Гольджи.^[7]

Функция

Выравнивание домена GRASP GRASP55 и гомолог GRASP Криптококк neoformans

GRASP55 участвует в установлении структуры аппарата Гольджи.^[7][6] Это белок периферической мембраны расположен на Гольджи цистерна, и он может связываться с другим GRASP55, расположенным на соседней цистерне, через домен GRASP, таким образом связывая цистерны вместе через несколько белок-белковые взаимодействия.^[7][8]

GRASP55 прикрепляется к мембране двумя способами; это миристилированный, который прикрепляет его непосредственно к липидный бислой; он также косвенно связан с голгин-45, который связывается с Rab белок, что само по себе липидированный и, таким образом, прикреплен к мембране.^[7]

Структура Гольджи нарушается во время митоз, и фосфорилирование SPR-доменов GRASP55 и GRASP65 регулируют это нарушение,^[9][8]GRASP55 также может участвовать в формировании лент Гольджи, но доказательства неоднозначны.^[7][9]

Другие взаимодействия

GRASP55 был показан взаимодействовать с TGF альфа,^[10] TMED2^[10] и ГОЛГА2.^[5][10][11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115806 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000014959 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Короче Дж., Уотсон Р., Джаннаку М.Э., Кларк М., Уоррен Г., Барр Ф.А. (сентябрь 1999 г.). «GRASP55, второй белок GRASP млекопитающих, участвующий в укладке цистерн Гольджи в бесклеточную систему». Журнал EMBO. 18 (18): 4949–60. Дои:10.1093 / emboj / 18.18.4949. ЧВК  1171566. PMID  10487747.
6. "Ген Entrez: GORASP2 повторная сборка белка 2 гольджи, 55 кДа".
7. Чжан X, Ван Y (2015). «GRASP в структуре и функциях Гольджи». Границы клеточной биологии и биологии развития. 3: 84. Дои:10.3389 / fcell.2015.00084. ЧВК  4701983. PMID  26779480.
8. Чжан, Сяоянь; Ван, Янчжуан (6 января 2016 г.). «GRASP в структуре и функциях Гольджи». Границы клеточной биологии и биологии развития. 3: 84. Дои:10.3389 / fcell.2015.00084. ЧВК  4701983. PMID  26779480.
9. Сян И, Ван И (январь 2010 г.). «GRASP55 и GRASP65 играют взаимодополняющие и важные роли в цистернальном накоплении Гольджи». Журнал клеточной биологии. 188 (2): 237–51. Дои:10.1083 / jcb.200907132. ЧВК  2812519. PMID  20083603.
10. Барр Ф.А., Прайзингер С., Копайтих Р., Кёрнер Р. (декабрь 2001 г.). «Белки матрикса Гольджи взаимодействуют с рецепторами груза p24 и способствуют их эффективному удержанию в аппарате Гольджи». Журнал клеточной биологии. 155 (6): 885–91. Дои:10.1083 / jcb.200108102. ЧВК  2150891. PMID  11739402.
11. Short B, Preisinger C, Körner R, Kopajtich R, Byron O, Barr FA (декабрь 2001 г.). «Эффекторный комплекс GRASP55-rab2, связывающий структуру Гольджи с мембранным движением». Журнал клеточной биологии. 155 (6): 877–83. Дои:10.1083 / jcb.200108079. ЧВК  2150909. PMID  11739401.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Куо А., Чжун С., Лейн В.С., Деринк Р. (декабрь 2000 г.). «Трансмембранный трансформирующий фактор роста-альфа связывает PDZ-домен, ассоциированный с мембраной белок Гольджи p59 / GRASP55». Журнал EMBO. 19 (23): 6427–39. Дои:10.1093 / emboj / 19.23.6427. ЧВК  305863. PMID  11101516.
• Йеш С.А., Льюис Т.С., Ан Н.Г., Линстедт А.Д. (июнь 2001 г.). «Митотическое фосфорилирование белка 55 повторной сборки Гольджи с помощью митоген-активируемой протеинкиназы ERK2». Молекулярная биология клетки. 12 (6): 1811–7. Дои:10.1091 / mbc.12.6.1811. ЧВК  37343. PMID  11408587.
• Short B, Preisinger C, Körner R, Kopajtich R, Byron O, Barr FA (декабрь 2001 г.). «Эффекторный комплекс GRASP55-rab2, связывающий структуру Гольджи с мембранным движением». Журнал клеточной биологии. 155 (6): 877–83. Дои:10.1083 / jcb.200108079. ЧВК  2150909. PMID  11739401.
• Барр Ф.А., Прайзингер С., Копайтих Р., Кёрнер Р. (декабрь 2001 г.). «Белки матрикса Гольджи взаимодействуют с рецепторами груза p24 и способствуют их эффективному удержанию в аппарате Гольджи». Журнал клеточной биологии. 155 (6): 885–91. Дои:10.1083 / jcb.200108102. ЧВК  2150891. PMID  11739402.
• Лейн Дж. Д., Люкок Дж., Прайд Дж., Барр Ф. А., Вудман П. Г., Аллан В. Дж., Лоу М. (февраль 2002 г.). «Опосредованное каспазой расщепление укладывающегося белка GRASP65 необходимо для фрагментации по Гольджи во время апоптоза». Журнал клеточной биологии. 156 (3): 495–509. Дои:10.1083 / jcb.200110007. ЧВК  2173349. PMID  11815631.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (октябрь 2006 г.). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Природа Биотехнологии. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.