Семейство гликозид гидролаз 33 - Glycoside hydrolase family 33
| Сиалидаза, N-концевой домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Сиалидаза | ||||||||
| Pfam | PF02973 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR004124 | ||||||||
| SCOP2 | 1sli / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| CAZy | GH33 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии семейство гликозид гидролаз 33 это семья из гликозидгидролазы.
Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать то гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]
Эта семья содержит сиалидазы (КАЗИ GH_33 ), которые гидролизуют альфа- (2-> 3) -, альфа- (2-> 6) -, альфа- (2-> 8) -гликозидные связи концевых сиаловых остатков в олигосахариды, гликопротеины, гликолипиды, коломиновая кислота и синтетические субстраты. Сиалидазы могут действовать как патогенный факторы в микробный инфекции.[8] 1.8 А структура транс-сиалидазы из пиявка (Macrobdella decora, Q27701) в комплексе с 2-дезокси-2,3-дидегидро-NeuAc. Уточненная модель, содержащая остатки 81-769, имеет каталитический бета-пропеллер домен, N-конец лектин -подобный домен и нерегулярный бета-цепочечный домен, вставленный в каталитический домен.[9]
Рекомендации
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК 41477. PMID 7624375.
- ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Проблема с базой данных): D490-5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК 3965031. PMID 24270786.
- ^ «Семейство гликозид гидролаз 33». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. PMID 29040563.
- ^ Роте Б., Роггентин П., Шауэр Р. (апрель 1991 г.). «Ген сиалидазы из Clostridium septicum: клонирование, секвенирование, экспрессия в Escherichia coli и идентификация консервативных последовательностей в сиалидазах и других белках». Молекулярная и общая генетика. 226 (1–2): 190–7. Дои:10.1007 / BF00273603. PMID 2034213. S2CID 21308462.
- ^ Ло Ю., Ли С. К., Чжоу М. Ю., Ли Ю. Т., Ло М. (апрель 1998 г.). «Кристаллическая структура внутримолекулярной транс-сиалидазы со специфичностью NeuAc alpha2 -> 3Gal». Структура. 6 (4): 521–30. Дои:10.1016 / S0969-2126 (98) 00053-7. PMID 9562562.
