Семейство гликозид гидролаз 39 - Glycoside hydrolase family 39
| Семейство гликозилгидролаз 39 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура бета-d-ксилозидазы из thermoanaerobacterium saccharolyticum, гликозидгидролазы семейства 39 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_39 | ||||||||
| Pfam | PF01229 | ||||||||
| Pfam клан | CL0058 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000514 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00787 | ||||||||
| SCOP2 | 1uhv / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| CAZy | GH39 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии семейство гликозид гидролаз 39 это семья из гликозидгидролазы.
Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать то гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]
Семейство гликозид гидролаз 39 КАЗИ GH_39 содержит ферменты с несколькими известными активностями; альфа-L-идуронидаза (ЕС 3.2.1.76 ); бета-ксилозидаза (EC 3.2.1.37 ).
Наиболее консервативные области этих ферментов расположены в их N-концевых участках. Они содержат глютаминовая кислота остаток, который на основании сходства с другими семействами гликозилгидролаз,[1] вероятно действует как донор протонов в их каталитическом механизме.
Рекомендации
- ^ а б Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК 41477. PMID 7624375.
- ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Структуры и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Проблема с базой данных): D490-5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК 3965031. PMID 24270786.
- ^ «Семейство гликозид гидролаз 39». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. PMID 29040563.
