Семейство гликозидгидролаз 48 - Glycoside hydrolase family 48 - Wikipedia

Glyco_hydro_48
PDB 1g9j EBI.jpg
X-Tal структура мутанта e44q целлюлазы cel48f в комплексе с тиоолигосахаридом
Идентификаторы
СимволGlyco_hydro_48
PfamPF02011
Pfam кланCL0059
ИнтерПроIPR000556
SCOP21fce / Объем / СУПФАМ
CAZyGH48

В молекулярной биологии семейство гликозид гидролаз 48 это семья из гликозидгидролазы.

Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать то гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]

Семейство гликозид гидролаз 48 CAZY GH_48 содержит ферменты с несколькими известными активностями; эндоглюканаза (EC 3.2.1.4 ); целлобиогидролаза (EC 3.2.1.91 ).

Примером фермента, содержащего домен, принадлежащий к этому семейству, является один из целлюлазы (celA) из генома термофильной анаэробной бактерии Caldocellum saccharolyticum. Продукт гена celA представляет собой полипептид из 1751 аминокислоты; он имеет многодоменную структуру, включающую два каталитических домена и два целлюлозосвязывающих домена, связанных областями, богатыми Pro-Thr. N-концевой домен кодирует активность эндоглюканазы на карбоксиметилцеллюлоза, что согласуется с его сходством с несколькими последовательностями эндо-1,4-бета-D-глюканазы, и является членом семейство гликозид гидролаз 9. С-концевой домен, принадлежащий к этому семейству, показывает сходство с целлюлазой из Clostridium thermocellum (CelS), который действует синергетически со вторым компонентом, гидролизуя кристаллическую целлюлозу.[8]

Рекомендации

  1. ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК  41477. PMID  7624375.
  2. ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID  8535779.
  3. ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2) (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК  1217404. PMID  8687420.
  4. ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
  5. ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Проблема с базой данных): D490-5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК  3965031. PMID  24270786.
  6. ^ «Семейство гликозид гидролаз 48». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
  7. ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. HDL:21.11116 / 0000-0003-B7EB-6. PMID  29040563.
  8. ^ Te'o VS, Saul DJ, Bergquist PL (1995). «celA, еще один ген, кодирующий мультидоменную целлюлазу из крайне термофильного Caldocellum saccharolyticum». Прикладная микробиология и биотехнология. 43 (2): 291–6. Дои:10.1007 / BF00172827. PMID  7612247. S2CID  22500191.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR000556