HLA-DRB1 - HLA-DRB1

HLA-DRB1
1AQD.png
Доступные конструкции
PDBHuman UniProt search: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыHLA-DRB1, DRB1, DRw10, HLA-DR1B, HLA-DRB, SS1, главный комплекс гистосовместимости, класс II, DR beta 1
Внешние идентификаторыOMIM: 142857 ГомолоГен: 136635 Генные карты: HLA-DRB1
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человек)[1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение HLA-DRB1
Геномное расположение HLA-DRB1
Группа6п21.32Начните32,578,769 бп[1]
Конец32,589,848 бп[1]
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001243965
NM_002124
NM_001359193
NM_001359194

н / д

RefSeq (белок)

NP_001230894
NP_002115
NP_001346122
NP_001346123
NP_002115.2

н / д

Расположение (UCSC)Chr 6: 32,58 - 32,59 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Антиген гистосовместимости HLA класса II, бета-цепь DRB1 это белок что у людей кодируется HLA-DRB1 ген.[3] DRB1 кодирует наиболее распространенную бета-субъединицу HLA-DR. Несколько аллелей DRB1 (общие аллели эпитопа)[4] связаны с увеличением числа случаев ревматоидный артрит.

Функция

В белок кодируемый этим геном принадлежит к HLA класса II бета-цепочка паралоги. Молекула класса II представляет собой гетеродимер, состоящий из альфа (DRA) и бета-цепи (DRB), которые закреплены в мембране. Он играет центральную роль в иммунная система путем представления пептидов, полученных из внеклеточных белков, в Т-хелперные клетки. Молекулы класса II конститутивно экспрессируются в профессиональных антигенпрезентирующие клетки (APC: B-лимфоциты, дендритные клетки, макрофаги),[3] и могли быть вызваны в непрофессиональных БТР.

Структура гена и полиморфизмы

Бета-цепь составляет приблизительно 26-28 кДа. Он кодируется 6 экзоны, экзон один кодирует лидерный пептид, экзоны 2 и 3 кодируют два внеклеточных домены, экзон 4 кодирует трансмембранный домен и экзон 5 кодирует цитоплазматический хвостик. Внутри молекулы DR бета-цепь содержит все полиморфизмы определение специфичности связывания пептида. Сотни DRB1 аллели были описаны, и типирование этих полиморфизмов обычно проводится при трансплантации костного мозга и почек.[3]

Экспрессия гена

DRB1 экспрессируется на уровне в пять раз выше, чем его паралоги. DRB3, DRB4 и DRB5. DRB1 присутствует у всех людей. Аллельные варианты DRB1 не связаны ни с одним из генов DRB3, DRB4 и DRB5, либо с одним из них. Есть 4 связанных псевдогена: DRB2, DRB6, DRB7, DRB8 и DRB9.[3]

Распространенность аллеля HLA-DRB1 * 10: 01 была значительно увеличена у людей с болезнь anti-IgLON5.[5]

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ а б c ENSG00000206240, ENSG00000229074, ENSG00000196126, ENSG00000206306, ENSG00000228080 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000236884, ENSG00000206240, ENSG00000229074, ENSG0000019612206, ENSG00000196126 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ а б c d «Ген Entrez: главный комплекс гистосовместимости HLA-DRB1, класс II, DR beta 1».
  4. ^ Грегерсен П.К., Сильвер Дж., Винчестер Р.Дж. (ноябрь 1987 г.). «Гипотеза общего эпитопа. Подход к пониманию молекулярной генетики предрасположенности к ревматоидному артриту». Артрит и ревматизм. 30 (11): 1205–13. Дои:10.1002 / арт.1780301102. PMID  2446635.
  5. ^ Gaig C, Graus F, Compta Y, Högl B, Bataller L, Brüggemann N, Giordana C, Heidbreder A, Kotschet K, Lewerenz J, Macher S, Martí MJ, Montojo T, Pérez-Pérez J, Puertas I, Seitz C, Симабукуро М., Телез Н., Вандингер К.П., Иранзо А., Эрсилла Дж., Сабатер Л., Сантамария Дж., Далмау Дж. (Май 2017 г.). «Клинические проявления болезни anti-IgLON5». Неврология. 88 (18): 1736–1743. Дои:10.1212 / WNL.0000000000003887. ЧВК  5409845. PMID  28381508.

дальнейшее чтение