Гаплогруппа C-V20 - Haplogroup C-V20

Гаплогруппа C-V20
Возможное место происхождения	Западная Азия ?
Предок	(Бабушка и дедушка) C1
Определение мутаций	V20
Самые высокие частоты	Очень низкая частота в Европа, Северная Африка, Западная Азия и Южная Азия

Гаплогруппа C-V20 (также известен как Гаплогруппа C1a2) это Y-хромосома гаплогруппа. Это одна из двух основных ветвей Гаплогруппа C1a, один из потомков Гаплогруппа C1 (Другой C1a1 в Япония со средней суммой 5%^[1]). Гаплогруппа C-V20 теперь распространяется в Европа, Северная Африка, Западная Азия, и Южная Азия с очень низкой частотой.

История и распространение

Миграция гаплогруппы C (Y-ДНК)

Карта распространения нынешних людей (кроманьонцы), Currat & Excoffier (2004).^[2] Это считается почти синонимом рождения гаплогруппы C1.

Гаплогруппа C1a2 (V20) была обнаружена в останках Палеолит люди в Чехия (30 000 лет назад), Бельгия (35000 лет назад),^[3] и Сунгирь археологические раскопки рядом Владимир, Россия.^[4] Что касается более поздней предыстории, гаплогруппа C-V20 была обнаружена в останках мужчины (умершего ок. 7000 лет назад), связанный с поздней группой Культура линейной керамики Альфельда в Kompolt-Kigyósér, Венгрия, чья мтДНК принадлежала гаплогруппа J1c1, останки мужчины (умер ок. 7000 лет назад), связанные с LBK Культура в Apc-Berekalja (I.), Венгрия, чья мтДНК принадлежала гаплогруппа K1a3a3, и останки мужчины (умер ок. 7000 лет назад), связанные с Мезолит культура в Ла-Брана-Аринтеро, Леон, Испания чья мтДНК принадлежала гаплогруппа U5b2c1.^[5] Также было обнаружено^[6] в древней ДНК из Анатолия, особенно в останках Анатолийские охотники-собиратели датируется 13.642-13.073 г. до н.э. и принадлежит к митохондриальной гаплогруппе K2b.

Y-ДНК гаплогруппы C-V20 также была обнаружена в небольшом количестве современных Европейцы,^[7] Алжирский Берберы,^[8] Армяне,^[9] и Непальцы.^[10] Он включает множество образцов Y-ДНК, связанных с самой старой известной в настоящее время популяцией анатомически современных людей в Европе (Кроманьонцы ), и считается носителем верхнего палеолита. Ориньяк культура, возникшая 40 000 лет назад.^{[нужна цитата ]}

использованная литература

^ 崎谷満『DNA ・考古・言語の学が示す新・日本列島』（勉誠出 2009） (на японском языке)
^ Currat, M .; Экскофье, Л. (2004). «Современные люди не смешивались с неандертальцами во время их экспансии в Европу». ПЛОС Биол. 2 (12): e421. Дои:10.1371 / journal.pbio.0020421. ЧВК 532389. PMID 15562317.
^ Фу, Цяомэй; и другие. (2016). «Генетическая история ледникового периода Европы». Природа. 534 (7606): 200–5. Bibcode:2016Натура.534..200F. Дои:10.1038 / природа17993. HDL:10211.3/198594. ЧВК 4943878. PMID 27135931.
^ Сикора, Мартин; Сегин-Орландо, Андайн; Sousa, Vitor C .; Альбрехтсен, Андерс; Корнелиуссен, Торфинн; и другие. (2017). «Древние геномы показывают социальное и репродуктивное поведение собирателей раннего верхнего палеолита». Наука. 358 (6363): 659–662. Bibcode:2017Научный ... 358..659S. Дои:10.1126 / science.aao1807. ISSN 0036-8075. PMID 28982795.
^ ISOGG, 2015 «Гаплогруппа C Y-ДНК и ее субклады - 2015» (15 сентября 2015 г.).
^ Краузе, Йоханнес; Чон, Чунгвон; Хаак, Вольфганг; Пост, Козимо; Stockhammer, Philipp W .; Мустафаоглу, Гекхан; Fairbairn, Эндрю; Bianco, Raffaela A .; Юлия Грески (19.03.2019). «Геном человека позднего плейстоцена предполагает местное происхождение первых фермеров из центральной Анатолии». Nature Communications. 10 (1): 1218. Bibcode:2019НатКо..10.1218F. Дои:10.1038 / s41467-019-09209-7. ISSN 2041-1723. ЧВК 6425003. PMID 30890703.
^ Scozzari, R; Massaia, A; Д'Атаназио, Э; Майрес, Нью-Мексико; Перего, UA; и другие. (2012). "Молекулярная диссекция базальных клад в филогенетическом дереве Y-хромосомы человека". PLOS ONE. 7 (11): e49170. Bibcode:2012PLoSO ... 749170S. Дои:10.1371 / journal.pone.0049170. ЧВК 3492319. PMID 23145109.
^ ISOGG Y-DNA Haplogroup C and its Subclades - 2017 (по состоянию на 26 августа 2017 г.)
^ YFull Haplogroup YTree v5.05 на 30 июля 2017 г.
^ Халласт, Пилле; Батини, Кьяра; Задик, Даниил; и другие. (2014). «Дерево Y-хромосомы превращается в лист: 13 000 высоконадежных SNP, покрывающих большинство известных клад». Молекулярная биология и эволюция. 32 (3): 661–673. Дои:10.1093 / molbev / msu327. ЧВК 4327154. PMID 25468874.

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы ^{[χ 1]}^{[χ 2]}

"Y-хромосомный Адам "

A0-T ^{[χ 3]}

A1 ^{[χ 4]}

F2

F3

GHIJK

я

J

LT ^{[χ 5]}

K2 ^{[χ 6]}

L

Т

K2a ^{[χ 7]}

K2b ^{[χ 8]}

K2c

K2d

K2e ^{[χ 9]}

K-M2313 ^{[χ 10]}

K2b1 ^{[χ 11]}

п ^{[χ 12]}

Нет

S ^{[χ 13]}

M ^{[χ 14]}

P1

P2

Сноски

^ Ван Овен М., Ван Гейстелен А., Кайзер М., Декорте Р., Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Человеческая мутация. 35 (2): 187–91. Дои:10.1002 / humu.22468. PMID 24166809.
^ Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015. (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.)
^ Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4).
^ Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4.
^ Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1.
^ Между 2002 и 2008 гг. Гаплогруппа T-M184 была известна как «Гаплогруппа К2». С тех пор это имя было изменено на K-M526, брат Haplogroup LT.
^ Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году (это последовало за публикацией: Позник GD, Xue Y, Mendez FL, et al. (2016). «Прерывистые всплески в демографии мужчин-мужчин, выведенные из 1244 всемирных последовательностей Y-хромосомы». Природа Генетика. 48 (6): 593–9. Дои:10,1038 / нг.3559. ЧВК 4884158. PMID 27111036. В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a».
^ Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы.
^ Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешней K2a).
^ K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Позник op. соч.; YFull YTree v5.08, 2017, «К-М2335», и; Филодерево, 2017, «Детали маркеров Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.)
^ Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру.
^ Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2.
^ Гаплогруппа S с 2017 года также известна как K2b1a. (Ранее имя Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.)
^ Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее имя Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

Эта статья по биоинформатике заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

Эта генетика статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[1] 崎谷満『DNA ・考古・言語の学が示す新・日本列島』（勉誠出 2009） (на японском языке)

[2] Currat, M .; Экскофье, Л. (2004). «Современные люди не смешивались с неандертальцами во время их экспансии в Европу». ПЛОС Биол. 2 (12): e421. Дои:10.1371 / journal.pbio.0020421. ЧВК 532389. PMID 15562317.

[3] Фу, Цяомэй; и другие. (2016). «Генетическая история ледникового периода Европы». Природа. 534 (7606): 200–5. Bibcode:2016Натура.534..200F. Дои:10.1038 / природа17993. HDL:10211.3/198594. ЧВК 4943878. PMID 27135931.

[SikoraSeguin-Orlando2017-4] Сикора, Мартин; Сегин-Орландо, Андайн; Sousa, Vitor C .; Альбрехтсен, Андерс; Корнелиуссен, Торфинн; и другие. (2017). «Древние геномы показывают социальное и репродуктивное поведение собирателей раннего верхнего палеолита». Наука. 358 (6363): 659–662. Bibcode:2017Научный ... 358..659S. Дои:10.1126 / science.aao1807. ISSN 0036-8075. PMID 28982795.

[5] ISOGG, 2015 «Гаплогруппа C Y-ДНК и ее субклады - 2015» (15 сентября 2015 г.).

[6] Краузе, Йоханнес; Чон, Чунгвон; Хаак, Вольфганг; Пост, Козимо; Stockhammer, Philipp W .; Мустафаоглу, Гекхан; Fairbairn, Эндрю; Bianco, Raffaela A .; Юлия Грески (19.03.2019). «Геном человека позднего плейстоцена предполагает местное происхождение первых фермеров из центральной Анатолии». Nature Communications. 10 (1): 1218. Bibcode:2019НатКо..10.1218F. Дои:10.1038 / s41467-019-09209-7. ISSN 2041-1723. ЧВК 6425003. PMID 30890703.

[7] Scozzari, R; Massaia, A; Д'Атаназио, Э; Майрес, Нью-Мексико; Перего, UA; и другие. (2012). "Молекулярная диссекция базальных клад в филогенетическом дереве Y-хромосомы человека". PLOS ONE. 7 (11): e49170. Bibcode:2012PLoSO ... 749170S. Дои:10.1371 / journal.pone.0049170. ЧВК 3492319. PMID 23145109.

[8] ISOGG Y-DNA Haplogroup C and its Subclades - 2017 (по состоянию на 26 августа 2017 г.)

[9] YFull Haplogroup YTree v5.05 на 30 июля 2017 г.

[10] Халласт, Пилле; Батини, Кьяра; Задик, Даниил; и другие. (2014). «Дерево Y-хромосомы превращается в лист: 13 000 высоконадежных SNP, покрывающих большинство известных клад». Молекулярная биология и эволюция. 32 (3): 661–673. Дои:10.1093 / molbev / msu327. ЧВК 4327154. PMID 25468874.

[vanOven2014-11] Ван Овен М., Ван Гейстелен А., Кайзер М., Декорте Р., Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Человеческая мутация. 35 (2): 187–91. Дои:10.1002 / humu.22468. PMID 24166809.

[ISOGG2015-12] Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015. (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.)

[A0-T-13] Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4).

[A1-14] Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4.

[LT-15] Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1.

[K2-16] Между 2002 и 2008 гг. Гаплогруппа T-M184 была известна как «Гаплогруппа К2». С тех пор это имя было изменено на K-M526, брат Haplogroup LT.

[K2a-17] Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году (это последовало за публикацией: Позник GD, Xue Y, Mendez FL, et al. (2016). «Прерывистые всплески в демографии мужчин-мужчин, выведенные из 1244 всемирных последовательностей Y-хромосомы». Природа Генетика. 48 (6): 593–9. Дои:10,1038 / нг.3559. ЧВК 4884158. PMID 27111036. В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a».

[K2b-18] Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы.

[K2e-19] Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешней K2a).

[K-M2313-20] K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Позник op. соч.; YFull YTree v5.08, 2017, «К-М2335», и; Филодерево, 2017, «Детали маркеров Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.)

[K2b1-21] Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру.

[P-22] Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2.

[S-23] Гаплогруппа S с 2017 года также известна как K2b1a. (Ранее имя Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.)

[M-24] Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее имя Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[χ 1]

[χ 2]

[χ 3]

[χ 4]

[χ 5]

[χ 6]

[χ 7]

[χ 8]

[χ 9]

[χ 10]

[χ 11]

[χ 12]

[χ 13]

[χ 14]