Гаплогруппа Q-M3 - Haplogroup Q-M3

Гаплогруппа Q-M3
Возможное время происхождения	10000-15000 лет назад
Возможное место происхождения	Берингия: Либо Восточная Азия или же Северная Америка
Предок	Q-L54
Потомки	Q-M19, Q-M194, Q-M199, Q-PAGES104, Q-PAGES131, Q-L663, Q-SA01, Q-L766, Q-L883 и Q-L888
Определение мутаций	М3 (RS3894)

Гаплогруппа Q-M3 (Y-ДНК) это Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы. Гаплогруппа Q-M3 является субклад из Гаплогруппа Q-L54. Гаплогруппа Q-M3 ранее была известна как гаплогруппа Q3; в настоящее время Q-M3 находится ниже Q1b1a1a Q1b-M346.^[1]

В 1996 г. исследовательская группа в г. Стэндфордский Университет во главе с доктором Питером Андерхиллом впервые обнаружил SNP, который впоследствии стал известен как M3. В то время это называлось DYS191. Более поздние исследования завершили генетический мост, определив, что Q-M3 был связан с популяциями, несущими Q-M242, которые путешествовали через Центральную Азию в Восточную Азию.^[2]

Происхождение и распространение

Гаплогруппа Q-M3 - одна из Y-хромосома гаплогруппы, связанные с коренными народами Америки (более 90% коренных жителей Мезо и Южной Америки). Сегодня к таким линиям относятся и другие ответвления Q-M242 (Q-M346, Q-L54, Q-P89.1, Q-NWT01, и Q-Z780 ), ветви гаплогруппы C-M130 (C-M217 и C-P39 ), и R-M207, которые почти исключительно встречаются в Северной Америке. Гаплогруппа Q-M3 определяется наличием (M3) однонуклеотидный полиморфизм (SNP). Q-M3 произошел от линии Q-L54 примерно 10-15 тысяч лет назад, когда происходила миграция в Америку. Есть некоторые споры о том, на какой стороне Берингова пролива произошла эта мутация, но она определенно произошла у предков коренных народов Америки.

Северная и Южная Америка

Популяции, несущие Q-M3, широко распространены по всей Америке. С момента открытия Q-M3 несколько субкладов популяций, несущих Q-M3, также были обнаружены в Америке. Примером может служить Южная Америка, где в некоторых популяциях высока распространенность SNP M19, который определяет субклад. Q-M19. M19 был обнаружен в 59% амазонских Тикуна мужчин и в 10% Wayuu люди.^[3] Субклады Q-M19 и Q-M199, по-видимому, уникальны для южноамериканского населения и предполагают, что изоляция населения и, возможно, даже создание племен начались вскоре после миграции в Америку.^[4]В Kennewick Man имеет Y-хромосому, которая принадлежит к наиболее распространенной подкладе Q1b1a1a-M3, в то время как Y-хромосома Анзика принадлежит второстепенной линии Q1b1a2-M971.^[5]

Азия

Q-M3 присутствует в некоторых Сибирский популяции в Азии. Неясно, являются ли они остатками основной линии или свидетельством обратных миграций из Берингии в Восточную Азию.^[6]

численность населения		Бумага	N	Процент	SNP протестирован
Эвены		Малярчук 2011^[6]	2/63	~3.2%	M3

Европа

Линия Q-M3 не была обнаружена в европейской популяции.

Распределение субкладов

Q-M19 M19 Это происхождение встречается среди Коренные южноамериканцы, такой как Тикуна и Wayuu.^[7] Происхождение: Южная Америка примерно 5000–10 000 лет назад.

Q-M194 Он был обнаружен только в популяциях Южной Америки.^[7]

Q-M199 Эта линия была обнаружена только в популяциях Южной Америки.

Q-PAGES104 Эта линия была обнаружена исследовательской группой в Институт Уайтхеда во главе с доктором Дэвид С. Пейдж. Известна лишь ограниченная демографическая информация.

Q-PAGES131 Эта линия была обнаружена исследовательской группой Института Уайтхеда, возглавляемой доктором Дэвидом С. Пейджем. Известна лишь ограниченная демографическая информация.

Q-L663 Эта линия была обнаружена гражданскими учеными. Он связан с коренным населением Западной Центральной Мексики.

Q-SA01 Эта линия была обнаружена исследовательской группой во главе с доктором Дж. Теодор Г. Шурр.^[8]

Q-L766 Эта линия была обнаружена гражданскими учеными. Это может быть связано с коренным населением юго-запада США и Мексики.

Q-L883 Эта линия была обнаружена гражданскими учеными.

Q-L888 Эта линия была обнаружена гражданскими учеными.

Связанные SNP

Q-M3 определяется SNP M3 и L341.2.

Q-M3 Филогения и подгруппы

Текущее состояние полигентного дерева для Q-M3 опубликовано pinotti et al. в статье Последовательности Y-хромосомы показывают кратковременный берингийский застой, быстрое расширение и раннюю популяционную структуру коренных американцев-основателей (2018). Откалиброванная филогения гаплогруппы Y для Q-M3 и ее связь с ветвями внутри Q-L54.^[9]

L54
- Q-L330
- Q-MPB001 (18,9 тыс. Лет назад)
  - Q-CTS1780
  - Q-M930 (15.0-17.0 тыс. Лет назад) Древние Берингийцы
    - Q-L804 (скандинавский)
    - Q-M3 (коренные американцы, 15,0 тыс. Лет назад)
      - Q-Y4308
      - Q-M848 (14,9 тыс. Лет назад)
        Q-B48
        Q-CTS11357
        Q-M825
        Q-MPB073
        Q-MPB015
        Q-MPB115
        Q-Z6658
        Q-Z5906
        Q-Z19357
        Q-MPB139
        Q-MPB138
        Q-M848 *

В 2013 году Томас Кран из Центра геномных исследований сделал следующий филогенетический Предлагаемое дерево для гаплогруппы Q-M3.

L54
- M3, L341.2
  - M19
  - M194
  - M199, P106, P292
  - СТРАНИЦЫ104, СТРАНИЦЫ126
  - СТРАНИЦЫ131
  - L663
  - SA01
  - L766, L767
  - L883, L884, L885, L886, L887
  - L888, L889, L890, L891

Смотрите также

Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека

Субклады Y-ДНК Q-M242

Основное дерево Y-ДНК

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы ^{[χ 1]}^{[χ 2]}

"Y-хромосомный Адам "

A0-T ^{[χ 3]}

A1 ^{[χ 4]}

F2

F3

GHIJK

я

J

LT ^{[χ 5]}

K2 ^{[χ 6]}

L

Т

K2a ^{[χ 7]}

K2b ^{[χ 8]}

K2c

K2d

K2e ^{[χ 9]}

K-M2313 ^{[χ 10]}

K2b1 ^{[χ 11]}

п ^{[χ 12]}

НЕТ

S ^{[χ 13]}

M ^{[χ 14]}

P1

P2

Сноски

^ Ван Овен М., Ван Гейстелен А., Кайзер М., Декорте Р., Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Человеческая мутация. 35 (2): 187–91. Дои:10.1002 / humu.22468. PMID 24166809.
^ Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015. (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.)
^ Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4).
^ Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4.
^ Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1.
^ С 2002 по 2008 гг. Гаплогруппа T-M184 была известна как «Гаплогруппа К2». С тех пор это имя было изменено на K-M526, брат Haplogroup LT.
^ Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году (это последовало за публикацией: Позник Г.Д., Сюэ У., Мендес Ф.Л. и др. (2016). «Прерывистые всплески в демографии мужчин-мужчин, выведенные из 1244 всемирных последовательностей Y-хромосомы». Природа Генетика. 48 (6): 593–9. Дои:10,1038 / нг.3559. ЧВК 4884158. PMID 27111036. В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a».
^ Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы.
^ Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешней K2a).
^ K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Позник op. соч.; YFull YTree v5.08, 2017, «К-М2335», и; Филодерево, 2017, «Детали маркеров Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.)
^ Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру.
^ Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2.
^ Гаплогруппа S с 2017 года также известна как K2b1a. (Ранее имя Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.)
^ Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее имя Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

внешняя ссылка

[vanOven2014-11] Ван Овен М., Ван Гейстелен А., Кайзер М., Декорте Р., Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Человеческая мутация. 35 (2): 187–91. Дои:10.1002 / humu.22468. PMID 24166809.

[ISOGG2015-12] Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015. (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.)

[A0-T-13] Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4).

[A1-14] Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4.

[LT-15] Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1.

[K2-16] С 2002 по 2008 гг. Гаплогруппа T-M184 была известна как «Гаплогруппа К2». С тех пор это имя было изменено на K-M526, брат Haplogroup LT.

[K2a-17] Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году (это последовало за публикацией: Позник Г.Д., Сюэ У., Мендес Ф.Л. и др. (2016). «Прерывистые всплески в демографии мужчин-мужчин, выведенные из 1244 всемирных последовательностей Y-хромосомы». Природа Генетика. 48 (6): 593–9. Дои:10,1038 / нг.3559. ЧВК 4884158. PMID 27111036. В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a».

[K2b-18] Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы.

[K2e-19] Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешней K2a).

[K-M2313-20] K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Позник op. соч.; YFull YTree v5.08, 2017, «К-М2335», и; Филодерево, 2017, «Детали маркеров Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.)

[K2b1-21] Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру.

[P-22] Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2.

[S-23] Гаплогруппа S с 2017 года также известна как K2b1a. (Ранее имя Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.)

[M-24] Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее имя Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

[1] Y-ДНК Гаплогруппа Q и ее субклады - 2018, ISOGG

[Wells2002-2] Уэллс, Спенсер (2004). Путешествие человека: генетическая одиссея. Нью-Йорк, Нью-Йорк: книги в мягкой обложке Random House Trade. ISBN 978-0-8129-7146-0.

[Ruiz-Linares1999-3] Руис-Линарес, А .; Ортис-Барриентос, Д .; Фигероа, М .; Mesa, N .; Munera, J. G .; Bedoya, G .; Velez, I.D .; Гарсия, Л. Ф .; Перес-Лезаун, А. (1999). «Микросателлиты свидетельствуют о разнообразии Y-хромосомы у основателей Нового Света». Труды Национальной академии наук. 96 (11): 6312–7. Bibcode:1999PNAS ... 96.6312R. Дои:10.1073 / пнас.96.11.6312. ЧВК 26878. PMID 10339584.

[Bortolini2003-4] Бортолини, М; Salzano, F; Thomas, M; Стюарт, S; Насанен, С; Bau, C; Hutz, M; Layrisse, Z; Петцлерлер, М (2003). «Свидетельства Y-хромосомы для различающихся древних демографических историй в Америке». Американский журнал генетики человека. 73 (3): 524–39. Дои:10.1086/377588. ЧВК 1180678. PMID 12900798.

[Kivisild2017-5] Кивисилд, Тоомас (2017-03-04). «Изучение вариации Y-хромосомы человека с помощью древней ДНК». Генетика человека. Springer Nature. 136 (5): 529–546. Дои:10.1007 / s00439-017-1773-z. ISSN 0340-6717. ЧВК 5418327. PMID 28260210.

[Malyarchuk2011-6] а ^б Малярчук, Борис; Деренко, Мирослава; Денисова, Галина; Максимов, Аркадий; Возняк, Марцин; Гжибовски, Томаш; Дамбуева Ирина; Захаров, Илья (2011). «Древние связи между сибиряками и коренными американцами выявлены путем выделения гаплогруппы Q1a Y-хромосомы». Журнал генетики человека. 56 (8): 583–8. Дои:10.1038 / jhg.2011.64. PMID 21677663.

[demographic-7] а ^б (2003) «Свидетельства Y-хромосомы для различающихся древних демографических историй в Америке», В архиве 2011-04-28 на Wayback Machine (pdf) Мария-Катира Бортолини, Франсиско М. Сальцано

[TSchurrWebsite-8] "Теодор Г. Шурр".

[Pinotti_Tyler-Smith_2018-9] Пинотти, Томаз; Бергстрём, Андерс; Гепперт, Мария; Баун, Мэтт; Охаси, Доминик; Ши, Вентао; Lacerda, Daniela R .; Солли, Арне; Норстедт, Якоб; Рид, Кейт; Доутри, Ким; Гонсалес-Андраде, Фабрицио; Пас-и-Миньо, Сезар; Револло, Сусана; Куэльяр, Синтия; Jota, Marilza S .; Сантос, Хосе Э .; Аюб, Касим; Кивисилд, Тоомас; Sandoval, José R .; Фуджита, Рикардо; Сюэ, Яли; Роуэр, Лутц; Santos, Fabrício R .; Тайлер-Смит, Крис (2018). «Последовательности Y-хромосомы показывают кратковременный берингийский застой, быстрое расширение и раннюю популяционную структуру коренных американцев-основателей». Текущая биология. Elsevier BV. 29 (1): 149–157.e3. Дои:10.1016 / j.cub.2018.11.029. ISSN 0960-9822. PMID 30581024.

[10] Заявлено на В поисках корней, PBS, 5 февраля 2015 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[χ 1]

[χ 2]

[χ 3]

[χ 4]

[χ 5]

[χ 6]

[χ 7]

[χ 8]

[χ 9]

[χ 10]

[χ 11]

[χ 12]

[χ 13]

[χ 14]