Иммуноглобулин тяжелая константа альфа 1 - Immunoglobulin heavy constant alpha 1

IGHA1
Идентификаторы
ПсевдонимыIGHA1, IgA1, Иммуноглобулин тяжелая константа альфа 1
Внешние идентификаторыOMIM: 146900 Генные карты: IGHA1
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

н / д

н / д

RefSeq (белок)

н / д

н / д

Расположение (UCSC)н / дн / д
PubMed поиск[1]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Иммуноглобулин тяжелая константа альфа 1 представляет собой ген иммуноглобулина с символом IGHA1.[2] Он кодирует постоянный (C) сегмент Иммуноглобулин А тяжелая цепь. Иммуноглобулин А - это антитело который играет решающую роль в иммунной функции в слизистые оболочки. IgA демонстрирует ту же типичную структуру, что и другие классы антител, с двумя тяжелыми цепями и двумя легкими цепями и четырьмя отдельными доменами: одной вариабельной областью и тремя вариабельными областями. Как основной класс иммуноглобулин в секреции организма IgA играет роль в защите от инфекция, а также предотвращение доступа иностранных антигены к иммунологической системе.

Открытие

IGHA1 был впервые подробно описан в 1975 году, когда первичная структура (аминокислотная последовательность) IgA была выяснена путем секвенирования триптических и химотриптических пептидов.[3] Точно так же первичная последовательность была определена независимо для альфа-2 цепи белка в 1979 году.[4] Завершить нуклеотидные последовательности для константной области тяжелой цепи альфа-1 и аллельный области тяжелой цепи альфа-2 были опубликованы в 1984 году и показали, что гены содержатся в трех экзоны, каждая из которых кодирует одну область белкового домена.[5]

Расположение гена

Гены, кодирующие IGHA1, находятся на хромосома человека 14.[6] Последовательность, кодирующая IGHA1, имеет длину 1497 нуклеотидов и находится между локусами 105,707,168 и 105,708,664.[7] Аннотированное расположение хромосомы также указано как 14q32.33.[8]

Структура белка

С-область цепи альфа-1 Ig содержится в первой из константных областей IgA и состоит из аминокислота последовательность длиной 353 остатка.[9] В вторичная структура содержащиеся в этом регионе преобладают бета-нити, которые определяют четыре антипараллельных бета-листы. Эти антипараллельные бета-листы затем складываются, образуя два бета-сэндвича, типичный третичная структура класса сверток иммуноглобулинов.[10] Два бета-листа, составляющие каждый бета-сэндвич, соединены альфа-спираль на одной стороне. Эти альфа-спирали определяют сайт привязки для этого белка с сайтом связывания, включающим одну антипараллельную бета-цепь с каждой стороны спирали.[9] В дополнение к сайтам связывания противоположная сторона бета-сэндвича связана серией петель, которые определяют гипервариабельную петлевую систему, которая может играть роль в определении специфичности взаимодействия между IgA и антигеном.[11]

Патологическая информация

IGHA1 был замешан в хромосомная аномалия идентифицировано в множественная миелома линий.[12] Аномалия была идентифицирована как перемещение событие, где перемещение между IGHA1 (находится на хромосоме 14), и FCRL4 (последовательность гена, кодирующая ингибирующий рецептор, обнаруженный на хромосоме 1) приводит к образованию гибридный белок.[13]

использованная литература

  1. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  2. ^ «Ген Entrez: тяжелая константа альфа-1 иммуноглобулина IGHA1».
  3. ^ Kratzin, H .; Altevogt, P .; Ruban, E .; Kortt, A .; Старощик, К .; Хильшманн, Н. (1975-08-01). «[Первичная структура моноклонального IgA-иммуноглобулина (IgA Tro.), II. Аминокислотная последовательность H-цепи, альфа-тип, подгруппа III; структура полной IgA-молекулы (авторский перевод)]». Hoppe-Seyler's Zeitschrift für Physiologische Chemie. 356 (8): 1337–1342. ISSN  0018-4888. PMID  809331.
  4. ^ Putnam, F.W .; Liu, Y. S .; Лоу, Т. Л. (1979-04-25). «Первичная структура иммуноглобулина IgA1 человека. IV. Протеаза IgA1 стрептококка, расщепление, фрагменты Fab и Fc, и полная аминокислотная последовательность тяжелой цепи альфа 1». Журнал биологической химии. 254 (8): 2865–2874. ISSN  0021-9258. PMID  107164.
  5. ^ Flanagan, J.G .; Lefranc, M.P .; Кроликов, Т. Х. (1984-03-01). «Механизмы дивергенции и конвергенции последовательностей генов константной области альфа-1 и альфа-2 иммуноглобулина человека». Ячейка. 36 (3): 681–688. Дои:10.1016/0092-8674(84)90348-9. ISSN  0092-8674. PMID  6421489. S2CID  54312675.
  6. ^ «Средство просмотра геномных данных». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2016-10-16.
  7. ^ «Тяжелая константа альфа-1 иммуноглобулина IGHA1 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2016-10-16.
  8. ^ "Отчет по символам IGHA1 | Комитет по номенклатуре генов HUGO". www.genenames.org. Получено 2016-10-16.
  9. ^ а б Европа, Банк данных по белкам в. «С-область цепи альфа-1 Ig в записи PDB 1ow0‹ PDBe ‹EMBL-EBI». www.ebi.ac.uk. Получено 2016-10-16.
  10. ^ Берг, Джереми М .; Тимочко, Джон Л .; Страйер, Люберт (01.01.2002). «Иммуноглобулиновая складка состоит из бета-сэндвич-структуры с гипервариабельными петлями». Цитировать журнал требует | журнал = (Помогите)
  11. ^ Села-Куланг, Инбал; Куник, Веред; Офран, Янай (2013-10-08). «Структурные основы распознавания антител и антигенов». Границы иммунологии. 4: 302. Дои:10.3389 / fimmu.2013.00302. ISSN  1664-3224. ЧВК  3792396. PMID  24115948.
  12. ^ «IGHA1 - C-область цепи альфа-1 Ig - Homo sapiens (человек) - ген и белок IGHA1». www.uniprot.org. Получено 2016-10-16.
  13. ^ «Результаты для белка: P01876». bioinf.umbc.edu. Получено 2016-10-16.

дальнейшее чтение