Кельч мотив - Kelch motif - Wikipedia

Кельч мотив
PDB 1gof EBI.jpg
Структура галактозооксидазы, содержащей кельч-повторы.[1]
Идентификаторы
СимволКельч_1
PfamPF01344
ИнтерПроIPR006652
УМНАЯКельч
SCOP21гоф / Объем / СУПФАМ
OPM суперсемейство319
Белок OPM3ii7
Кельч мотив
Идентификаторы
СимволКельч_2
PfamPF07646
Pfam кланCL0186
ИнтерПроIPR011498
SCOP21гоф / Объем / СУПФАМ
Галактозооксидаза, центральный домен
Идентификаторы
СимволКельч_3
PfamPF13415
Pfam кланCL0186
Галактозооксидаза, центральный домен
Идентификаторы
СимволКельч_4
PfamPF13418
Pfam кланCL0186
Кельч мотив
Идентификаторы
СимволКельч_5
PfamPF13854
Pfam кланCL0186
Кельч мотив
Идентификаторы
СимволКельч_6
PfamPF13964
Pfam кланCL0186

В Кельч мотив это регион белковая последовательность широко встречается в белках из бактерии и эукариоты.[2] Этот мотив последовательности состоит примерно из 50 аминокислота остатки, образующие структуру четырехниточного бета-листового «лезвия». Этот мотив последовательности находится между пятью и восемью тандемные копии на белок, который складывать вместе, чтобы сформировать больший круг соленоид структура называется бета-винт домен.

Белки, содержащие мотивы Кельха

Мотив Кельча широко встречается у эукариотических и бактериальных видов. Примечательно, что геном человека содержит около 100 белков, содержащих мотив Кельча. В отдельных белках мотив встречается несколько раз. Например, мотив появляется 6 раз в Дрозофила регуляторный белок яичной камеры. Мотив также содержится в белке мыши. МИПП[3] и в ряде поксвирусы. Кроме того, кельч повторяет были обнаружены в альфа- и бета-скруинах,[4][5] в галактозооксидазе гриба Dactylium dendroides[6][7] и в кишечная палочка Белок NanM, то есть мутаротаза сиаловой кислоты.[8]

Структура

Структура галактозооксидазы показывает, что повторяющийся мотив последовательности Келча соответствует 4-нитевому антипараллельному мотиву бета-листа, который формирует повторяющуюся единицу в структурной складке супербарабана, обычно известной как бета-пропеллер.[9]

Функция

Известные функции белков, содержащих кельч, разнообразны:

  • скряга представляет собой сшивающий актин белок;
  • галактозооксидаза катализирует окисление гидроксильной группы в положении C6 в D-галактозе;
  • нейраминидаза гидролизует остатки сиаловой кислоты из гликопротеинов;
  • NanM представляет собой мутаротазу сиаловой кислоты, участвующую в эффективном использовании сиаловой кислоты бактериями;
  • кельч может выполнять функцию цитоскелета, поскольку он расположен в богатых актином кольцевых каналах, которые соединяют 15 клеток-медсестер с развивающимися ооцит у дрозофилы.[4]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Ито Н., Филлипс С.Е., Стивенс С. и др. (Март 1991 г.). «Новая тиоэфирная связь, обнаруженная кристаллической структурой 1,7А галактозооксидазы». Природа. 350 (6313): 87–90. Дои:10.1038 / 350087a0. PMID  2002850. S2CID  4345713.
  2. ^ Адамс Дж., Келсо Р., Кули Л. (январь 2000 г.). «Суперсемейство белков кельча-повторов: движители клеточной функции». Тенденции Cell Biol. 10 (1): 17–24. Дои:10.1016 / S0962-8924 (99) 01673-6. PMID  10603472.
  3. ^ Сюэ Ф, Кули Л. (1993). «Кельч кодирует компонент межклеточных мостиков в яйцевых камерах дрозофилы». Клетка. 72 (5): 681–693. Дои:10.1016/0092-8674(93)90397-9. PMID  8453663.
  4. ^ а б Путь М., Сандерс М., Мацудаира П., Чафель М., Рыцарь А., Ту Й.Х. (1995). «Бета-скруин, гомолог скруина сшивающего актин белка, локализован в акросомном пузырьке сперматозоидов Limulus». J. Cell Sci. 108: 3155–3162. PMID  7593276.
  5. ^ Путь М., Сакаи Дж., Сандерс М., Гарсия К., Мацудаира П. (1995). «Последовательность и доменная организация скруина, белка, перекрестно связывающего актин, в акросомном отростке сперматозоидов Limulus». J. Cell Biol. 128 (1): 51–60. Дои:10.1083 / jcb.128.1.51. ЧВК  2120335. PMID  7822422.
  6. ^ Дулитл РФ, Борк П. (1994). «Мотив Drosophila kelch происходит из общей ферментативной складки». J. Mol. Биол. 236 (5): 1277–1282. Дои:10.1016/0022-2836(94)90056-6. PMID  8126718.
  7. ^ Кин Дж. Н., Ито Н., Филлипс С. Е., Стивенс С., Огель З. Б., Макферсон М. Дж., Ядав К. Д., Ноулз П. Ф. (1991). «Новая тиоэфирная связь, обнаруженная кристаллической структурой 1,7А галактозооксидазы». Природа. 350 (6313): 87–90. Дои:10.1038 / 350087a0. PMID  2002850. S2CID  4345713.
  8. ^ Севери Э., Мюллер А., Поттс Дж. Р., Пиявка А., Уильямсон Д., Уилсон К. С., Томас Г. Х. (2008). "Мутаротация сиаловой кислоты катализируется кишечная палочка бета-пропеллерный белок YjhT ". J. Biol. Chem. 283 (8): 4841–4849. Дои:10.1074 / jbc.m707822200. PMID  18063573.
  9. ^ Ито Н, Филлипс С.Е., Ядав К.Д., Ноулз П.Ф. (1994). «Кристаллическая структура свободнорадикального фермента галактозооксидазы». J. Mol. Биол. 238 (5): 794–814. Дои:10.1006 / jmbi.1994.1335. PMID  8182749.

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR006652
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR011498