PRAME - PRAME

PRAME
Идентификаторы
Псевдонимы	PRAME, CT130, MAPE, OIP-4, OIP4, предпочтительно экспрессируемый антиген при меланоме, регулятор транскрипции ядерного рецептора PRAME
Внешние идентификаторы	OMIM: 606021 ГомолоГен: 48404 Генные карты: PRAME
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q11.22 Начните 22,547,701 бп[1] Конец 22,559,361 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание рецептора ретиноевой кислоты Сотовый компонент • клеточная мембрана • ядро клетки • мембрана • цитоплазма Биологический процесс • отрицательная регуляция дифференцировки клеток • регулирование роста • дифференциация клеток • отрицательная регуляция апоптотического процесса • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • положительное регулирование пролиферации клеток • апоптотический процесс • отрицательная регуляция сигнального пути рецептора ретиноевой кислоты Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	23532	н / д
Ансамбль	ENSG00000185686 ENSG00000275013	н / д
UniProt	P78395	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001291715 NM_001291716 NM_001291717 NM_001291719 NM_006115 NM_206953 NM_206954 NM_206955 NM_206956 NM_001318126 NM_001318127	н / д
RefSeq (белок)	NP_001278644 NP_001278645 NP_001278646 NP_001278648 NP_001305055 NP_001305056 NP_006106 NP_996836 NP_996837 NP_996838 NP_996839	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 22: 22.55 - 22.56 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Антиген меланомы преимущественно экспрессируется в опухолях это белок что у людей кодируется PRAME ген.^[3][4][5] Для этого гена наблюдали пять альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, кодирующих один и тот же белок.^[5]

Функция

Этот ген кодирует антиген, который преимущественно экспрессируется у человека. меланомы и это распознается цитолитическим Т-лимфоциты. Не экспрессируется в нормальных тканях, кроме семенников. Этот образец экспрессии подобен таковому других антигенов CT, таких как МАГ, BAGE и Гейдж. Однако, в отличие от этих других антигенов CT, этот ген также экспрессируется при острой лейкемии. Сверхэкспрессия PRAME в опухолевых тканях и относительно низкие уровни в нормальных соматических тканях делают его привлекательной мишенью для лечения рака. В последние годы иммунотерапия возглавила новую эру терапии рака, что привело к развитию множества новых подходов к антиген-специфической иммунотерапии. Исследования PRAME-специфической иммунотерапии в первую очередь включают вакцины и клеточную иммунотерапию.^[6]

PRAME может подавлять ретиноевая кислота передача сигналов и опосредованная ретиноевой кислотой дифференциация и апоптоз.^[7] Было также обнаружено, что сверхэкспрессия PRAME при тройном негативном раке молочной железы способствует подвижности раковых клеток за счет индукции перехода от эпителия к мезенхиме. ^[8].

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции PRAME. Условный нокаутирующая мышь линия называется Prame^{tm1a (КОМП) Wtsi} был создан на Wellcome Trust Sanger Institute.^[9] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг^[10] для определения последствий удаления.^{[11][12][13][14]} Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование^[15]

Prame нокаутный фенотип мыши

Характеристика	Фенотип
Все данные доступны на сайте.[10][15]
Инсулин	Нормальный
Гомозиготная жизнеспособность на P14	Нормальный
Гомозиготная фертильность	Нормальный
Масса тела	Нормальный
Неврологический осмотр	Нормальный
Сила захвата	Нормальный
Дисморфология	Нормальный
Косвенная калориметрия	Нормальный
Тест толерантности к глюкозе	Нормальный
Слуховой ответ ствола мозга	Нормальный
DEXA	Нормальный
Рентгенография	Нормальный
Морфология глаза	Нормальный
Клиническая химия	Нормальный
Гематология 16 недель	Нормальный
Лейкоциты периферической крови 16 недель	Нормальный
Сальмонелла инфекция	Нормальный
Иммунофенотипирование селезенки	Нормальный
Иммунофенотипирование мезентериальных лимфатических узлов	Нормальный
Состав эпидермального иммунитета	Аномальный

использованная литература

1. ENSG00000275013 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000185686, ENSG00000275013 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Икеда Х., Лете Б., Леманн Ф., ван Барен Н., Борайн Дж. Ф., де Смет С., Чамбост Х., Витале М., Моретта А., Бун Т., Кули П. Г. (февраль 1997 г.). «Характеристика антигена, который распознается на меланоме, демонстрирующий частичную потерю HLA за счет CTL, экспрессирующих рецептор, ингибирующий NK». Иммунитет. 6 (2): 199–208. Дои:10.1016 / S1074-7613 (00) 80426-4. PMID  9047241.
4. Данхэм И., Шимидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж. Э., Брускевич Р., Биэр Д.М., Зажим М., Сминк Л.Дж., Эйнскау Р., Алмейда Дж. П., Бэббидж А., Баггулей С., Бейли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бисли О., Берд С. П., Блейки С., Бриджман А. М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В. Д., О'Брайен КП (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Bibcode:1999Натура.402..489D. Дои:10.1038/990031. PMID  10591208.
5. «Ген Entrez: PRAME, преимущественно экспрессируемый антиген при меланоме».
6. Аль-Хадаири Дж., Декок Дж. (Июль 2019 г.). «Антигены рака яичек и иммунотерапия: где мы находимся в борьбе с PRAME?». Рак. 11 (7): 984. Дои:10.3390 / раки11070984. ЧВК  6678383. PMID  31311081.
7. Эппинг М.Т., Ван Л., Эдель М.Дж., Карле Л., Эрнандес М., Бернардс Р. (сентябрь 2005 г.). «Человеческий опухолевый антиген PRAME является доминантным репрессором передачи сигналов рецептора ретиноевой кислоты». Ячейка. 122 (6): 835–47. Дои:10.1016 / j.cell.2005.07.003. HDL:1874/17819. PMID  16179254. S2CID  18144920.
8. Аль-Хадаири Г., Наик А., Томас Р., Аль-Сулайти Б., Ризли С., Декок Дж. (Январь 2019 г.). «PRAME способствует переходу от эпителия к мезенхиме при тройном отрицательном раке молочной железы». Журнал трансляционной медицины. 17 (1): 9. Дои:10.1186 / s12967-018-1757-3. ЧВК  6317205. PMID  30602372.
9. Гердин А.К. (2010). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
10. «Международный консорциум по фенотипированию мышей».
11. Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
12. Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
13. Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Ячейка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
14. Уайт Дж. К., Гердин А. К., Карп Н. А., Райдер Э., Бульян М., Басселл Дж. Н., Солсбери Дж., Клэр С., Ингем Нью-Джерси, Подрини С., Хоутон Р., Эстабель Дж., Боттомли Дж. Р., Мелвин Д. Дж., Сантер Д., Адамс, Северная Каролина, Таннахилл Д. , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (июль 2013 г.). «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов». Ячейка. 154 (2): 452–64. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. ЧВК  3717207. PMID  23870131.
15. «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)».

дальнейшее чтение

• Аль-Хадаири Дж., Декок Дж. (Июль 2019 г.). «Антигены рака яичек и иммунотерапия: где мы находимся в борьбе с PRAME?». Рак. 11 (7): 984. Дои:10.3390 / раки11070984. ЧВК  6678383. PMID  31311081.
• Аль-Хадаири Г., Наик А., Томас Р., Аль-Сулайти Б., Ризли С., Декок Дж. (Январь 2019 г.). «PRAME способствует переходу эпителия в мезенхиму при тройном отрицательном раке молочной железы». Журнал трансляционной медицины. 17 (1): 9. Дои:10.1186 / s12967-018-1757-3. ЧВК  6317205. PMID  30602372.
• Киркин А.Ф., Джанджугазян К, Зойтен Дж. (1998). «Иммуногенные свойства антигенов, ассоциированных с меланомой, распознаются цитотоксическими Т-лимфоцитами». Экспериментальная и клиническая иммуногенетика. 15 (1): 19–32. Дои:10.1159/000019050. PMID  9619397. S2CID  25993773.
• Matsushita M, Yamazaki R, Ikeda H, Kawakami Y (март 2003 г.). «Преимущественно экспрессируемый антиген меланомы (PRAME) при разработке методов диагностики и лечения гематологических злокачественных новообразований». Лейкемия и лимфома. 44 (3): 439–44. Дои:10.1080/1042819021000035725. PMID  12688312. S2CID  29064098.
• Боналду М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Уильямс Дж. М., Чен Г. К., Чжу Л., Rest RF (январь 1998 г.). «Использование дрожжевой двугибридной системы для идентификации белков эпителиальных клеток человека, которые связывают гонококковые белки Opa: внутриклеточные гонококки связывают пируваткиназу через свои белки Opa и требуют пирувата хозяина для роста». Молекулярная микробиология. 27 (1): 171–86. Дои:10.1046 / j.1365-2958.1998.00670.x. PMID  9466265.
• Нойман Э., Энгельсберг А., Деккер Дж., Штёркель С., Йегер Э., Хубер С., Селигер Б. (сентябрь 1998 г.). «Неоднородная экспрессия связанных с опухолью антигенов RAGE-1, PRAME и гликопротеина 75 в почечно-клеточной карциноме человека: кандидаты для иммунотерапии на основе Т-клеток?». Исследования рака. 58 (18): 4090–5. PMID  9751617.
• ван Барен Н., Чамбост Н., Феррант А., Мишо Л., Икеда Н., Миллард И., Олив Д., Бун Т., Кули П. Г. (сентябрь 1998 г.). «PRAME, ген, кодирующий антиген, распознаваемый на меланоме человека цитолитическими Т-клетками, экспрессируется в клетках острого лейкоза». Британский журнал гематологии. 102 (5): 1376–9. Дои:10.1046 / j.1365-2141.1998.00982.x. PMID  9753074. S2CID  2896384.
• Ватари К., Тодзё А., Нагамура-Иноуэ Т., Нагамура Ф., Такешита А., Фукусима Т., Мотодзи Т., Тани К., Асано С. (январь 2000 г.). «Идентификация антигена меланомы, PRAME, как BCR / ABL-индуцибельного гена». Письма FEBS. 466 (2–3): 367–71. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 01112-1. PMID  10682862. S2CID  26778464.
• Пелла-Десенинк С., Меллерин М.П., ​​Лабаррьер Н., Жего Дж., Моро-Обри А., Гаруссо Дж. Л., Жотеро Ф., Батай Р. (март 2000 г.). «Гены злокачественной зародышевой линии MAGE-1, MAGE-3 и PRAME обычно экспрессируются клетками миеломы человека». Европейский журнал иммунологии. 30 (3): 803–9. Дои:10.1002 / 1521-4141 (200003) 30: 3 <803 :: AID-IMMU803> 3.0.CO; 2-P. PMID  10741395.
• Matsushita M, Ikeda H, Kizaki M, Okamoto S, Ogasawara M, Ikeda Y, Kawakami Y (март 2001 г.). «Количественный мониторинг гена PRAME для выявления минимальной остаточной болезни при лейкемии». Британский журнал гематологии. 112 (4): 916–26. Дои:10.1046 / j.1365-2141.2001.02670.x. PMID  11298586. S2CID  22217905.
• Steinbach D, Hermann J, Viehmann S, Zintl F, Gruhn B (март 2002 г.). «Клинические последствия экспрессии гена PRAME при остром миелоидном лейкозе у детей». Генетика и цитогенетика рака. 133 (2): 118–23. Дои:10.1016 / S0165-4608 (01) 00570-2. PMID  11943337.
• Штайнбах Д., Фиманн С., Цинтл Ф., Грун Б. (октябрь 2002 г.). «Экспрессия гена PRAME при остром лимфобластном лейкозе у детей». Генетика и цитогенетика рака. 138 (1): 89–91. Дои:10.1016 / S0165-4608 (02) 00582-4. PMID  12419593.
• Ленер Б., Семпл Д.И., Браун С.Е., Советник Д., Кэмпбелл Р.Д., Сандерсон К.М. (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной двугибридной дрожжевой системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика. 83 (1): 153–67. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID  14667819.
• Обертюр А, Герой Б, Шпиц Р., Бертольд Ф., Фишер М. (июль 2004 г.). «Связанный с опухолью антиген PRAME повсеместно экспрессируется в нейробластоме высокой стадии и связан с плохим исходом». Клинические исследования рака. 10 (13): 4307–13. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-03-0813. PMID  15240516.
• Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс Калифорния, Депутат Дэвиса, Гринхэм Дж. А., Коул К. Г., Говард М. Е., Агуадо Б., Малля М., Мокраб И., Хакл Е. Д., Биар Д. М., Данхэм I. (2005). «Основанный на аннотации генома подход к клонированию ORFeome человека». Геномная биология. 5 (10): R84. Дои:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. ЧВК  545604. PMID  15461802.