PRMT1 - PRMT1 - Wikipedia

PRMT1
Идентификаторы
Псевдонимы	PRMT1, ANM1, HCP1, HRMT1L2, IR1B4, протеин-аргининметилтрансфераза 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602950 MGI: 107846 ГомолоГен: 21477 Генные карты: PRMT1
Номер ЕС	2.1.1.321
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.33 Начинать 49,675,786 бп[1] Конец 49,689,029 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 B3 | 7 29,07 см Начинать 44,975,989 бп[2] Конец 44,986,568 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность метилтрансферазы • гистон-метилтрансферазная активность • трансферазная активность • гистон-метилтрансферазная активность (специфическая для H4-R3) • связывание метил-CpG • Связывание митоген-активированной протеинкиназы p38 • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • связывание ферментов • Активность N-метилтрансферазы • протеин-аргинин омега-N асимметричная метилтрансферазная активность • Связывание РНК • активность протеинметилтрансферазы • протеин-аргинин-N-метилтрансферазная активность • гистон-аргинин-N-метилтрансферазная активность • белок-аргинин-омега-N монометилтрансфераза • Связывание S-аденозил-L-метионина Сотовый компонент • цитоплазма • нуклеоплазма • метилосома • ядро клетки • цитозоль Биологический процесс • положительная регуляция каскада p38MAPK • положительная регуляция процесса биосинтеза гемоглобина • метилирование гистона H4-R3 • положительная регуляция дифференцировки эритроцитов • отрицательная регуляция дифференцировки мегакариоцитов • сигнальный путь рецептора клеточной поверхности • метилирование • метилирование пептидил-аргинина • метилирование гистонов • развитие проекции нейрона • пептидил-аргинин N-метилирование • метилирование пептидиларгинина до асимметричного диметиларгинина • Ответ на повреждение ДНК, передача сигнала медиатором класса p53, приводящая к остановке клеточного цикла • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • метилирование белков • положительное регулирование пролиферации клеток • регуляция дифференцировки мегакариоцитов • внутриутробное эмбриональное развитие • метилирование гистона аргинина • гомоолигомеризация белков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3276	15469
Ансамбль	ENSG00000126457	ENSMUSG00000109324
UniProt	Q99873	Q9JIF0
RefSeq (мРНК)	NM_001207042 NM_001536 NM_198318 NM_198319	NM_001252476 NM_001252477 NM_019830
RefSeq (белок)	NP_001193971 NP_001527 NP_938074	NP_001239405 NP_001239406 NP_062804
Расположение (UCSC)	Chr 19: 49.68 - 49.69 Мб	Chr 7: 44.98 - 44.99 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок аргинин-N-метилтрансфераза 1 является фермент что у людей кодируется PRMT1 ген.^[5] Ген HRMT1L2 кодирует белок аргинин метилтрансфераза который функционирует как гистон-метилтрансфераза специфический для гистон H4.^[6]

Функция

Ген PRMT1 кодирует белок аргинин метилтрансфераза который функционирует как гистон-метилтрансфераза специфический для гистон H4 в эукариотических клетках.^[6] В частности, изменение гистона H4 у эукариот дает ему способность ремоделировать хроматин, действуя как пост-трансляционный модификатор.^[7]

Посредством регуляции экспрессии генов аргининметилтрансферазы контролируют клеточный цикл и гибель эукариотических клеток.^[7]

Путь реакции

В то время как все ферменты PRMT катализируют метилирование остатков аргинина в белках, PRMT1 уникален тем, что катализирует образование асимметрично диметилированного аргинина, в отличие от PRMT2, который катализирует образование симметрично диметилированного аргинина.^[8] Индивидуальный PRMT использует S-аденозил-L-метионин (SAM) в качестве донора метила и катализирует перенос метильной группы на ω-азот остатка аргинина.^[8]

Клиническое значение

У людей эти ферменты регулируют экспрессию генов и, следовательно, участвуют в патогенезе многих заболеваний человека.^[9] Используя ингибиторы фермента аргининметилтрансферазы 1, исследования смогли продемонстрировать потенциал фермента в качестве раннего катализатора различных видов рака.^[9][8][10]

Взаимодействия

PRMT1 был показан взаимодействовать с:

• BTG1,^[11][12]
• BTG2,^[11][12]
• DHX9,^[13]
• FUS,^[14][15][16]
• HNRNPR,^[15][16]
• ГНРПК,^[15][17]
• IFNAR1,^[18]
• ILF3,^[14][19]
• KHDRBS1,^[17] и
• SUPT5H.^[20]

Модельные организмы

Prmt1 нокаутный фенотип мыши

Характеристика	Фенотип
Гомозигота жизнеспособность	Аномальный
Рецессивный смертельное исследование	Аномальный
Масса тела	Нормальный
Беспокойство	Нормальный
Неврологический осмотр	Нормальный
Сила захвата	Нормальный
Горячая тарелка	Нормальный
Дисморфология	Нормальный
Косвенная калориметрия	Нормальный
Тест толерантности к глюкозе	Нормальный
Слуховой ответ ствола мозга	Нормальный
DEXA	Нормальный
Рентгенография	Нормальный
Температура тела	Нормальный
Морфология глаза	Нормальный
Клиническая химия	Аномальный[21]
Плазма иммуноглобулины	Нормальный
Гематология	Нормальный
Лимфоциты периферической крови	Нормальный
Микроядерный тест	Нормальный
Вес сердца	Нормальный
Гистопатология кожи	Нормальный
Гистопатология мозга	Нормальный
Все тесты и анализы от[22][23]

Модельные организмы были использованы для изучения функции и структуры PRMT1.

Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Prmt1^{tm1a (EUCOMM) Wtsi[24][25]} был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse Программа - проект мутагенеза с высокой пропускной способностью, направленный на создание и распространение животных моделей болезней среди заинтересованных ученых.^[26][27][28]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.^[22][29] Было проведено 23 испытания на мутант мышей и три значительных отклонения от нормы.^[22] Нет гомозиготный мутант эмбрионы были идентифицированы во время беременности, и поэтому ни один из них не выжил до отлучение от груди. Остальные испытания проводились на гетерозиготный мутантные взрослые мыши и самки показали повышенную циркуляцию креатинин уровни.^[22]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000126457 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000109324 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Скотт Х.С., Антонаракис С.Е., Лалиоти, доктор медицины, Россье С., Сильвер, Пенсильвания, Генри М.Ф. (июнь 1998 г.). «Идентификация и характеристика двух предполагаемых человеческих метилтрансфераз аргинина (HRMT1L1 и HRMT1L2)». Геномика. 48 (3): 330–40. Дои:10.1006 / geno.1997.5190. PMID  9545638.
6. «Ген Entrez: протеин аргининметилтрансфераза 1 PRMT1».
7. Цянь К., Чжэнь Г (01.01.2016). «Глава 8 - Современные разработки ингибиторов протеин-аргининметилтрансферазы». В Медине-Франко JL (ред.). Эпи-информатика. Бостон: Academic Press. С. 231–256. Дои:10.1016 / b978-0-12-802808-7.00008-3. ISBN  978-0-12-802808-7.
8. Обианйо О., Осборн Т.С., Томпсон ПР (сентябрь 2008 г.). «Кинетический механизм протеина аргининметилтрансферазы 1». Биохимия. 47 (39): 10420–7. Дои:10.1021 / bi800904m. ЧВК  2933744. PMID  18771293.
9. Цзэн Х., Сюй В. (01.01.2015). «Глава 16 - Ферментативные анализы ферментов гистон-метилтрансферазы». В Чжэн Ю.Г. (ред.). Эпигенетические технологические приложения. Бостон: Academic Press. С. 333–361. Дои:10.1016 / b978-0-12-801080-8.00016-8. ISBN  978-0-12-801080-8.
10. Карбон Ф., Монтекукко Ф., Сюй С., Банах М., Джамиалахмади Т., Сахебкар А. (август 2020 г.). «Эпигенетика при атеросклерозе: ключевые особенности и терапевтическое значение». Мнение экспертов о терапевтических целях. 24 (8): 719–721. Дои:10.1080/14728222.2020.1764535. PMID  32354276.
11. Лин WJ, Гэри JD, Ян MC, Кларк S, Herschman HR (июнь 1996). «Ранний ранний белок TIS21 млекопитающих и ассоциированный с лейкемией белок BTG1 взаимодействуют с протеин-аргинин-N-метилтрансферазой». J. Biol. Chem. 271 (25): 15034–44. Дои:10.1074 / jbc.271.25.15034. PMID  8663146.
12. Бертэ С., Геэннё Ф., Револь В., Самарут С., Лукашевич А., Дехай С., Дюмонте С., Маго Дж. П., Руо Дж. П. (январь 2002 г.). «Взаимодействие PRMT1 с белками BTG / TOB в передаче сигналов в клетке: молекулярный анализ и функциональные аспекты». Гены Клетки. 7 (1): 29–39. Дои:10.1046 / j.1356-9597.2001.00497.x. PMID  11856371. S2CID  15016952.
13. Смит В.А., Шуртер Б.Т., Вонг-Стаал Ф., Дэвид М. (май 2004 г.). «Метилирование аргинина РНК-геликазы А определяет ее внутриклеточную локализацию». J. Biol. Chem. 279 (22): 22795–8. Дои:10.1074 / jbc.C300512200. PMID  15084609.
14. Ли Дж., Бедфорд MT (март 2002 г.). «PABP1, идентифицированный как субстрат аргининметилтрансферазы с использованием массивов белков высокой плотности». EMBO Rep. 3 (3): 268–73. Дои:10.1093 / embo-reports / kvf052. ЧВК  1084016. PMID  11850402.
15. Вада К., Иноуэ К., Хагивара М. (август 2002 г.). «Идентификация метилированных белков с помощью протеина аргинин N-метилтрансферазы 1, PRMT1, с новой стратегией клонирования экспрессии». Биохим. Биофиз. Acta. 1591 (1–3): 1–10. Дои:10.1016 / s0167-4889 (02) 00202-1. PMID  12183049.
16. Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (сентябрь 2005 г.). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070. S2CID  8235923.
17. Côté J, Boisvert FM, Boulanger MC, Bedford MT, Richard S (январь 2003 г.). «РНК-связывающий белок Sam68 является субстратом in vivo для белка аргинин-N-метилтрансферазы 1». Мол. Биол. Клетка. 14 (1): 274–87. Дои:10.1091 / mbc.E02-08-0484. ЧВК  140244. PMID  12529443.
18. Абрамович С., Якобсон Б., Чебат Дж., Ревель М. (январь 1997 г.). «Протеин-аргининметилтрансфераза связывается с интрацитоплазматическим доменом цепи IFNAR1 в рецепторе интерферона I типа». EMBO J. 16 (2): 260–6. Дои:10.1093 / emboj / 16.2.260. ЧВК  1169633. PMID  9029147.
19. Тан Дж, Као П.Н., Хершман HR (июнь 2000 г.). «Протеин-аргининметилтрансфераза I, преобладающая протеин-аргининметилтрансфераза в клетках, взаимодействует и регулируется фактором связывания интерлейкина-усилителя 3». J. Biol. Chem. 275 (26): 19866–76. Дои:10.1074 / jbc.M000023200. PMID  10749851.
20. Квак Ю.Т., Го Дж., Праджапати С., Парк К.Дж., Сурабхи Р.М., Миллер Б., Гериг П., Гейнор Р.Б. (апрель 2003 г.). «Метилирование SPT5 регулирует его взаимодействие с РНК-полимеразой II и свойства удлинения транскрипции». Мол. Клетка. 11 (4): 1055–66. Дои:10.1016 / с1097-2765 (03) 00101-1. PMID  12718890.
21. «Данные клинической химии для Prmt1». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
22. Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
23. Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
24. «Международный консорциум нокаут-мышей».
25. "Информатика генома мыши".
26. Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт АФ, Брэдли А (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
27. Долгин Э (2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
28. Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (2007). «Мышь на все случаи жизни». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
29. ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.

дальнейшее чтение

• Ким С., Пак Г. Х., Пайк В. К. (1999). «Последние достижения в метилировании белков: ферментативное метилирование белков, связывающих нуклеиновые кислоты». Аминокислоты. 15 (4): 291–306. Дои:10.1007 / BF01320895. PMID  9891755. S2CID  28412209.
• Болдуин GS, Карнеги PR (1971). «Специфическое ферментативное метилирование аргинина в экспериментальном белке аллергического энцефаломиелита из человеческого миелина». Наука. 171 (3971): 579–81. Дои:10.1126 / science.171.3971.579. PMID  4924231. S2CID  36959912.
• Раджпурохит Р., Ли СО, Пак Джо, Пайк В.К., Ким С. (1994). «Ферментативное метилирование рекомбинантного гетерогенного ядерного белка RNP A1. Двойная субстратная специфичность для S-аденозилметионина: гистон-аргинин N-метилтрансфераза». J. Biol. Chem. 269 (2): 1075–82. PMID  8288564.
• Лин WJ, Гэри JD, Ян М.С., Кларк S, Herschman HR (1996). «Ранний ранний белок TIS21 млекопитающих и ассоциированный с лейкемией белок BTG1 взаимодействуют с протеин-аргинин-N-метилтрансферазой». J. Biol. Chem. 271 (25): 15034–44. Дои:10.1074 / jbc.271.25.15034. PMID  8663146.
• Никава Дж, Накано Х, Охи Н. (1996). «Структурная и функциональная консервация генов HCP1 человека и дрожжей, которые могут подавлять дефект роста мутанта Saccharomyces cerevisiae ire15». Ген. 171 (1): 107–11. Дои:10.1016 / 0378-1119 (96) 00073-X. PMID  8675017.
• Абрамович С, Якобсон Б, Чебат Дж, Ревель М (1997). «Протеин-аргининметилтрансфераза связывается с интрацитоплазматическим доменом цепи IFNAR1 в рецепторе интерферона I типа». EMBO J. 16 (2): 260–6. Дои:10.1093 / emboj / 16.2.260. ЧВК  1169633. PMID  9029147.
• Кляйн С., Кэрролл Дж. А., Чен И., Генри М. Ф., Генри П. А., Ортоновски И. Е., Пинтуччи Г., Бивис Р. К., Берджесс WH, Рифкин Д. Б. (2000). «Биохимический анализ метилирования аргинина высокомолекулярного фактора роста фибробластов-2». J. Biol. Chem. 275 (5): 3150–7. Дои:10.1074 / jbc.275.5.3150. PMID  10652299.
• Тан Дж, Као П.Н., Хершман Х.Р. (2000). «Протеин-аргининметилтрансфераза I, преобладающая протеин-аргининметилтрансфераза в клетках, взаимодействует и регулируется фактором связывания интерлейкина-усилителя 3». J. Biol. Chem. 275 (26): 19866–76. Дои:10.1074 / jbc.M000023200. PMID  10749851.
• Николс Р.К., Ван XW, Тан Дж., Гамильтон Б.Дж., High FA, Herschman HR, Rigby WF (2000). «Домен RGG в hnRNP A2 влияет на субклеточную локализацию». Exp. Cell Res. 256 (2): 522–32. Дои:10.1006 / excr.2000.4827. PMID  10772824.
• Чжан X, Чжоу Л., Ченг X (2000). «Кристаллическая структура консервативного ядра протеина аргининметилтрансферазы PRMT3». EMBO J. 19 (14): 3509–19. Дои:10.1093 / emboj / 19.14.3509. ЧВК  313989. PMID  10899106.
• Ко СС, Чен Д., Ли Ю. Х., Сталлкап MR (2001). «Синергетическое усиление функции ядерных рецепторов коактиваторами p160 и двумя коактиваторами с активностью протеинметилтрансферазы». J. Biol. Chem. 276 (2): 1089–98. Дои:10.1074 / jbc.M004228200. PMID  11050077.
• Скорилас А., Блэк М. Х., Тальери М., Диамандис Е. П. (2001). «Геномная организация, физическое картирование и анализ экспрессии человеческого гена аргининметилтрансферазы 1». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 278 (2): 349–59. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3807. PMID  11097842.
• Ро Дж, Чой С., Сон Ю.Р., Чо В.К., Ким Ш., Им Д.С. (2001). «Prmt5, который образует отдельные гомоолигомеры, является членом семейства протеин-аргининметилтрансфераз». J. Biol. Chem. 276 (14): 11393–401. Дои:10.1074 / jbc.M008660200. PMID  11152681.
• Моуэн К.А., Тан Дж., Чжу В., Шуртер Б.Т., Шуай К., Хершман Х.Р., Дэвид М. (2001). «Метилирование аргинином STAT1 модулирует транскрипцию, индуцированную IFN-альфа / бета». Клетка. 104 (5): 731–41. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00269-0. PMID  11257227. S2CID  17584895.
• Ван Х, Хуанг ЦК, Ся Л., Фенг Кью, Эрдджумент-Бромаж Х, Страл Б.Д., Бриггс С.Д., Эллис С.Д., Вонг Дж., Темпст П., Чжан Ю. (2001). «Метилирование гистона H4 по аргинину 3, способствующее активации транскрипции ядерным гормональным рецептором». Наука. 293 (5531): 853–7. Дои:10.1126 / science.1060781. PMID  11387442. S2CID  33566292.
• Страл Б.Д., Бриггс С.Д., Брейм С.Дж., Колдуэлл Дж.А., Кох С.С., Ма Х., Кук Р.Г., Шабановиц Дж., Хант Д.Ф., Сталлкап М.Р., Аллис CD (2001). «Метилирование гистона H4 по аргинину 3 происходит in vivo и опосредовано коактиватором ядерного рецептора PRMT1». Curr. Биол. 11 (12): 996–1000. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00294-9. PMID  11448779. S2CID  17783289.
• Ро Дж, Чхве С., Сонг Ю.Р., Чхве Дж., Им Д.С. (2001). «Остаток аргинина-1493 в мотиве IV QRRGRTGR1493G геликазного домена NS3 вируса гепатита С необходим для метилирования белка NS3 белком-аргинин-метилтрансферазой 1». Дж. Вирол. 75 (17): 8031–44. Дои:10.1128 / JVI.75.17.8031-8044.2001. ЧВК  115047. PMID  11483748.
• Ли Дж, Бедфорд MT (2002). «PABP1, идентифицированный как субстрат аргининметилтрансферазы с использованием массивов белков высокой плотности». EMBO Rep. 3 (3): 268–73. Дои:10.1093 / embo-reports / kvf052. ЧВК  1084016. PMID  11850402.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q99873 (Белок аргинин-N-метилтрансфераза 1) на PDBe-KB.