Сигнальная пептидная пептидаза - Signal peptide peptidase

Пептидаза_A22B
Идентификаторы
СимволПептидаза_A22B
PfamPF04258
Pfam кланCL0130
ИнтерПроIPR007369
МЕРОПЫA22
Пептидаза_A24
Идентификаторы
СимволПептидаза_A24
PfamPF01478
Pfam кланCL0130
ИнтерПроIPR000045
МЕРОПЫA24
OPM суперсемейство244
Белок OPM3s0x

В молекулярной биологии Сигнальная пептидная пептидаза (SPP) - это тип белка, который специфически расщепляет части других белков. Это внутримембранный аспартил протеаза с сохраненным активным сайтом мотивы 'YD' и 'GxGD' рядом трансмембранные домены (TMD). Его последовательности высоко консервативны у разных видов позвоночных. SPP раскалывает остаток сигнальные пептиды оставленный в мембране под действием сигнальная пептидаза[1] а также играет ключевую роль в невосприимчивый наблюдение и созревание определенных вирусные белки.[2]

Биологическая функция

Физиологически SPP обрабатывает сигнальные пептиды классических MHC класс I препротеины. Затем представлен фрагмент расщепления из девяти аминокислот. HLA-E рецепторов и модулирует активность естественные клетки-киллеры.[3]

SPP также играет патофизиологическую роль; он расщепляет структурный белок нуклеокапсида (также известный как основной белок) Гепатит С вирус и, таким образом, влияет на скорость размножения вируса.[4]

У мышей неамерный пептид, происходящий из белка SPP, служит второстепенным антигеном гистосовместимости. HM13 что играет роль в отторжение трансплантата[5][6]

Гомологичные протеазы SPPL2A и SPPL2B способствовать внутримембранному расщеплению TNFα в активированном дендритные клетки и может сыграть иммуномодулирующий роль.[7][8] Для SPPL2c и SPPL3 субстраты неизвестны.

SPP не требуют кофакторы как продемонстрировано выражение в бактерии и очистка протеолитически активной формы. С-концевой участок определяет функциональный домен, который сам по себе достаточен для протеолитический Мероприятия.[9]

Лидерная пептидаза IV типа

Другое семейство сигнальных аспарагиновых эндопептидаз было обнаружено у бактерий. Бактерии производить много белка предшественники которые проходят посттрансляционный метилирование и протеолиз до секреция как активные белки. Лидерные пептидазы препилина типа IV являются ферменты которые опосредуют этот тип посттрансляционная модификация. Пилин типа IV - это белок, обнаруженный на поверхности Псевдомонады Aeruginosa, Neisseria gonorrhoeae и другие грамотрицательные возбудители. Пилин подразделения прикрепить заражающий организм на поверхность хозяина эпителиальные клетки. Они синтезируются в виде субъединиц препилина, которые отличаются от зрелого пилина тем, что содержат 6-8 остаток лидерный пептид, состоящий из заряженных аминокислоты. Зрелые пилины типа IV также содержат метилированный N-концевой фенилаланин остаток.

Бифункциональный фермент препилинпептидаза (PilD) из Синегнойная палочка является ключевым детерминантом в обоих типах IV пилус биогенез и внеклеточный секреция белка, выступающая в роли лидерной пептидазы и метил трансфераза (МТаза). Он отвечает за эндопептидные расщепление уникального лидера пептиды которые характеризуют предшественники пилина IV типа, а также белки с гомологичный лидерные последовательности которые являются важными компонентами общего пути секреции, обнаруженного у различных грамотрицательных патогены. После удаления лидерных пептидов тот же фермент отвечает за второй посттрансляционная модификация который характеризует пилины типа IV и их гомологи, а именно N-метилирование вновь экспонированного N-конца аминокислота остаток.[10]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Вайхофен А, Биннс К., Лемберг М.К., Эшман К., Мартольо Б. (2002). «Идентификация сигнальной пептидной пептидазы, аспарагиновой протеазы пресенилинового типа». Наука. 296 (5576): 2215–8. Дои:10.1126 / science.1070925. PMID  12077416.
  2. ^ Martoglio B, Golde TE (октябрь 2003 г.). «Интрамембранно-расщепляющие аспарагиновые протеазы и заболевание: пресенилины, сигнальные пептидные пептидазы и их гомологи». Гм. Мол. Genet. 12 Спецификация № 2: R201-6. Дои:10.1093 / hmg / ddg303. PMID  12966028.
  3. ^ Лемберг МК, Блэнд Ф.А., Вайхофен А, Брауд В.М., Мартольо Б (2001). «Интрамембранный протеолиз сигнальных пептидов: важный этап в создании эпитопов HLA-E». J. Immunol. 167 (11): 6441–6. Дои:10.4049 / jimmunol.167.11.6441. PMID  11714810.
  4. ^ Окамото К., Мори Ю., Комода Ю., Окамото Т., Окочи М., Такеда М., Сузуки Т., Морииси К., Мацуура Ю. (2008). «Интрамембранный процессинг сигнальной пептидной пептидазой регулирует мембранную локализацию корового белка вируса гепатита С и распространение вируса». Дж. Вирол. 82 (17): 8349–61. Дои:10.1128 / JVI.00306-08. ЧВК  2519675. PMID  18562515.
  5. ^ Snell GD, Cudkowicz G, Bunker HP (июнь 1967 г.). «Гены гистосовместимости мышей. VII. H-13, новый локус гистосовместимости в пятой группе сцепления». Трансплантация. 5 (3): 492–503. Дои:10.1097/00007890-196705000-00011. PMID  5340356.
  6. ^ «Ген Энтреса: гистосовместимость H13 (незначительная) 13».
  7. ^ Фридманн Э., Хаубен Э., Майландт К. и др. (2006). «SPPL2a и SPPL2b способствуют внутримембранному протеолизу TNFα в активированных дендритных клетках, чтобы запустить продукцию IL-12». Nat. Cell Biol. 8 (8): 843–8. Дои:10.1038 / ncb1440. PMID  16829952.
  8. ^ Флюрер Р., Граммер Г., Израиль Л. и др. (2006). «Гамма-секретазоподобное внутримембранное расщепление TNFalpha с помощью аспартил протеазы GxGD SPPL2b». Nat. Cell Biol. 8 (8): 894–6. Дои:10,1038 / ncb1450. PMID  16829951.
  9. ^ Нараянан С., Сато Т., Вулф М.С. (июль 2007 г.). «С-концевой участок сигнальной пептидной пептидазы определяет функциональный домен для внутримембранного катализа аспарагиновой протеазой». J. Biol. Chem. 282 (28): 20172–9. Дои:10.1074 / jbc.M701536200. PMID  17517891.
  10. ^ Лори С., Стром М.С. (июнь 1997 г.). «Взаимосвязь между структурой и функцией препилинпептидазы типа IV Pseudomonas aeruginosa - обзор». Ген. 192 (1): 117–21. Дои:10.1016 / S0378-1119 (96) 00830-X. PMID  9224881.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка