TNFAIP3 - TNFAIP3

TNFAIP3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2EQF, 2EQG, 2VFJ, 3 КБ, 3OJ3, 3OJ4, 3VUW, 3VUX, 3VUY, 3ZJD, 3ZJE, 3ZJF, 3ZJG, 4ZRH, 4ZS5
Идентификаторы
Псевдонимы	TNFAIP3, A20, OTUD7C, TNFA1P2, AISBL, TNF альфа-индуцированный белок 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 191163 MGI: 1196377 ГомолоГен: 4582 Генные карты: TNFAIP3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q23.3 Начните 137,867,214 бп[1] Конец 137,883,312 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 A3 | 10 8,08 см Начните 19,000,910 бп[2] Конец 19,015,657 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • активность пептидазы цистеинового типа • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • активность убиквитин-протеинтрансферазы • связывание протеазы • самоассоциация белков • пептидазная активность • активность лигазы • связывание киназы • Связанное с K63 связывание с белком, зависимым от модификации полиубиквитина • связывание убиквитина • GO: 0001948 связывание с белками • каталитическая активность • тиол-зависимая убиквитин-специфическая протеазная активность • гидролазная активность • идентичное связывание с белками • Lys63-специфическая активность деубиквитиназы • трансферазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • лизосома • внеклеточная экзосома • ядро клетки • внутриклеточная мембраносвязанная органелла Биологический процесс • регуляция образования зародышевого центра • положительная регуляция пролиферации гепатоцитов • отрицательная регуляция процесса апоптоза эндотелиальных клеток • отрицательная регуляция выработки интерлейкина-1 бета • отрицательная регуляция пролиферации гладкомышечных клеток • регуляция заживления сосудистых ран • В-1 гомеостаз В-клеток • деубиквитинирование белка K48 • положительная регуляция белкового катаболического процесса • отрицательная регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • регулирование защитного ответа на вирус со стороны хозяина • деубиквитинирование белка, участвующее в убиквитин-зависимом катаболическом процессе белка • отрицательная регуляция сигнального пути toll-подобного рецептора 2 • отрицательная регуляция нуклеотид-связывающего домена олигомеризации, содержащего 2 сигнальных пути • регуляция сигнального пути, опосредованного фактором некроза опухоли • отрицательная регуляция продукции интерлейкина-6 • отрицательная регуляция активации В-клеток • отрицательная регуляция сигнального пути толл-подобного рецептора 5 • индукция толерантности к липополисахариду • ответ на мурамилдипептид • отрицательная регуляция хронической воспалительной реакции • отрицательная регуляция гибели клеток • отрицательная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • протеолиз • установление локализации белка в вакуоли • деубиквитинирование белков • отрицательная регуляция убиквитинирования белков • убиквитинирование, связанное с белком K48 • деубиквитинирование, связанное с белком K63 • отрицательная регуляция сигнального пути CD40 • отрицательная регуляция внешнего апоптотического сигнального пути через рецепторы домена смерти • олигомеризация белков • деубиквитинирование, связанное с белком K11 • регуляция воспалительного ответа • отрицательная регуляция нуклеотид-связывающего домена олигомеризации, содержащего 1 сигнальный путь • отрицательная регуляция врожденного иммунного ответа • отрицательная регуляция пролиферации остеокластов • отрицательная регуляция выработки фактора некроза опухоли • отрицательная регуляция выработки интерферона I типа • метаболизм • воспалительная реакция • ответ на молекулу бактериального происхождения • отрицательная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • отрицательная регуляция продукции интерлейкина-2 • отрицательная регуляция воспалительного ответа • отрицательная регуляция сигнального пути toll-подобного рецептора 3 • нуклеотид-связывающий домен олигомеризации, содержащий сигнальный путь • клеточный ответ на липополисахарид • отрицательная регуляция сигнального пути толл-подобного рецептора 4 • отрицательная регуляция резорбции костной ткани • клеточный ответ на перекись водорода • апоптотический процесс • убиквитинирование белков • организация цитоскелета • миграция клеток • положительная регуляция сигнального пути Wnt • деубиквитинирование, связанное с белком К29 • положительная регуляция катаболического процесса клеточного белка • деубиквитинирование, связанное с белком К33 Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	7128	21929
Ансамбль	ENSG00000118503	ENSMUSG00000019850
UniProt	P21580	Q60769
RefSeq (мРНК)	NM_001270507 NM_001270508 NM_006290	NM_001166402 NM_009397
RefSeq (белок)	NP_001257436 NP_001257437 NP_006281	NP_001159874 NP_033423
Расположение (UCSC)	Chr 6: 137,87 - 137,88 Мб	Chr 10:19 - 19.02 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор некроза опухоли, альфа-индуцированный белок 3 или A20 это белок что у людей кодируется TNFAIP3 ген.^[5][6]

Этот ген был идентифицирован как ген, экспрессия которого быстро индуцируется фактором некроза опухоли (TNF). Белок, кодируемый этим геном, представляет собой белок цинковых пальцев и деубиквитинирующий фермент, и было показано, что он подавляет NF-каппа B активация, а также TNF-опосредованная апоптоз. Белок A20 - древний, а белок гомолог можно найти еще в книдария (кораллы, медуза, анемоны ) с сохраненным белковый домен сочинение. ^[7] Использование нокаутных мышиных моделей TNFAIP3 и его репрессора транскрипции (т.е. КЧИП3 ), TNFAIP3, как было показано, имеет решающее значение для ограничения воспаления за счет прекращения индуцированных эндотоксином и TNF ответов NF-каппа B.^[8][9] Вкратце, было показано, что функция деубиквитиназы TNFAIP3 удаляет убиквитиновые цепи из VE-кадгерин для предотвращения потери VE-кадгерина в эндотелиальном прилипает к стыкам. ^[8]

Взаимодействия

TNFAIP3 был показан взаимодействовать с участием TNIP1,^[10] TRAF1,^[11][12] TRAF2,^[11] ИКБКГ,^[13] TAX1BP1,^[14] YWHAB,^[15] YWHAZ,^[15][16] TRAF6^[12][17] и YWHAH.^[15][16]

Связь с ревматоидным артритом

Локус TNFAIP3 участвует в качестве положительно ассоциированного фактора в ревматоидный артрит (РА). RS5029937 (T) и RS6920220 (A) SNP увеличивают риск РА от 20 до 40% соответственно.^[18] Третий SNP, rs10499194 (T), встречается реже при ревматоидном артрите, но эта отрицательная связь может не иметь статистической значимости.

Прочие болезни

Сообщалось также о связи с младенческим началом неизлечимого воспалительного заболевания кишечника.^[19]

Смотрите также

• Гаплонедостаточность A20

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000118503 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019850 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Opipari AW Jr; Богуски М.С.; Диксит В.М. (октябрь 1990 г.). «КДНК А20, индуцированная фактором некроза опухоли альфа, кодирует новый тип белка цинкового пальца». J Biol Chem. 265 (25): 14705–8. PMID  2118515.
6. «Ген Entrez: фактор некроза опухоли TNFAIP3, альфа-индуцированный белок 3».
7. Стаал Дж., Дриеж Й., Хэгман М., Борги А., Хюльпио П., Ливенс Л. и др. (2018). «Древнее происхождение CARD-Coiled Coil / Bcl10 / MALT1-подобного сигнального комплекса паракаспаза указывает на неизвестные критические функции». Границы иммунологии. 9: 1136. Дои:10.3389 / fimmu.2018.01136. ЧВК  5978004. PMID  29881386.
8. Soni D, Wang DM, Regmi SC, Mittal M, Vogel SM, Schlüter D, Tiruppathi C (май 2018 г.). «Деубиквитиназная функция A20 поддерживает и восстанавливает эндотелиальный барьер после повреждения сосудов легких». Открытие смерти клетки. 4 (60). Дои:10.1038 / s41420-018-0056-3. ЧВК  5955943. PMID  29796309.
9. Тируппати С., Сони Д., Ван Д.М. и др. (Март 2014 г.). «Фактор транскрипции DREAM подавляет A20 и опосредует воспаление». Нат Иммунол. 15 (3): 239–247. Дои:10.1038 / ni.2823. ЧВК  4005385. PMID  24487321.
10. Хайнинк, К; Де Валк Д; Vanden Berghe W; Ван Крикинг В; Contreras R; Fiers W; Haegeman G; Бейерт Р. (июнь 1999 г.). «Белок цинкового пальца A20 ингибирует TNF-индуцированную экспрессию NF-kappaB-зависимого гена путем вмешательства в сигнал трансактивации, опосредованный RIP или TRAF2, и напрямую связывается с новым ингибирующим NF-kappaB белком ABIN». J. Cell Biol. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 145 (7): 1471–82. Дои:10.1083 / jcb.145.7.1471. ISSN  0021-9525. ЧВК  2133159. PMID  10385526.
11. Песня, H Y; Rothe M; Геддел Д. В. (июнь 1996 г.). «Белок цинкового пальца A20, индуцируемый фактором некроза опухоли, взаимодействует с TRAF1 / TRAF2 и ингибирует активацию NF-kappaB». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 93 (13): 6721–5. Bibcode:1996PNAS ... 93.6721S. Дои:10.1073 / пнас.93.13.6721. ISSN  0027-8424. ЧВК  39093. PMID  8692885.
12. Хайнинк, К; Бейерт Р. (январь 1999 г.). «Цитокин-индуцируемый белок цинкового пальца А20 ингибирует индуцированную IL-1 активацию NF-kappaB на уровне TRAF6». FEBS Lett. НИДЕРЛАНДЫ. 442 (2–3): 147–50. Дои:10.1016 / S0014-5793 (98) 01645-7. ISSN  0014-5793. PMID  9928991. S2CID  19072203.
13. Zhang, S Q; Коваленко А; Cantarella G; Уоллах Д. (март 2000 г.). «Рекрутирование сигнаносомы IKK на рецептор TNF p55: RIP и A20 связываются с NEMO (IKKgamma) при стимуляции рецептора». Иммунитет. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 12 (3): 301–11. Дои:10.1016 / S1074-7613 (00) 80183-1. ISSN  1074-7613. PMID  10755617.
14. Де Валк, Д. Jin D Y; Heyninck K; Ван де Краен М; Contreras R; Fiers W; Jeang K T; Beyaert R (июль 1999 г.). «Белок цинкового пальца А20 взаимодействует с новым антиапоптотическим белком, который расщепляется специфическими каспазами». Онкоген. АНГЛИЯ. 18 (29): 4182–90. Дои:10.1038 / sj.onc.1202787. ISSN  0950-9232. PMID  10435631.
15. Винченц, К; Диксит В. М. (август 1996 г.). «Белки 14-3-3 связываются с А20 специфическим для изоформы образом и действуют как шапероны и как адаптерные молекулы». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 271 (33): 20029–34. Дои:10.1074 / jbc.271.33.20029. ISSN  0021-9258. PMID  8702721.
16. Де Валк, Д. Heyninck K; Ван Крикинг В; Vandenabeele P; Fiers W; Бейерт Р. (сентябрь 1997 г.). «A20 ингибирует активацию NF-kappaB независимо от связывания с белками 14-3-3». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 238 (2): 590–4. Дои:10.1006 / bbrc.1997.7343. ISSN  0006-291X. PMID  9299557.
17. Evans, P.C; Тейлор Э. Р.; Coadwell J; Heyninck K; Beyaert R; Килшоу П. Дж. (Август 2001 г.). «Выделение и характеристика двух новых A20-подобных белков». Biochem. J. Англия. 357 (Пт 3): 617–23. Дои:10.1042/0264-6021:3570617. ISSN  0264-6021. ЧВК  1221992. PMID  11463333.
18. Шталь Э.А., Райчаудхури С., Реммерс Э.Ф. и др. (Июнь 2010 г.). «Полногеномный метаанализ исследования ассоциации выявил семь новых локусов риска ревматоидного артрита». Nat. Genet. 42 (6): 508–14. Дои:10,1038 / нг.582. ЧВК  4243840. PMID  20453842.
19. Zheng C, Huang Y, Ye Z, Wang Y, Tang Z, Lu J, Wu J, Zhou Y, Wang L, Huang Z, Yang H, Xue A (2018) Неизлечимое воспалительное заболевание кишечника с младенческим началом из-за новых гетерозиготных мутаций в TNFAIP3 (A20). Воспаление кишечника. Dis doi: 10.1093 / ibd / izy165.

дальнейшее чтение

• Диксит В.М., Грин С., Сарма В. и др. (1990). «Индукция фактора некроза опухоли альфа новых генных продуктов в эндотелиальных клетках человека, включая хемотаксин, специфичный для макрофагов». J. Biol. Chem. 265 (5): 2973–8. PMID  2406243.
• Купер Дж. Т., Строка Д. М., Бростян С. и др. (1996). «A20 блокирует активацию эндотелиальных клеток посредством NF-kappaB-зависимого механизма». J. Biol. Chem. 271 (30): 18068–73. Дои:10.1074 / jbc.271.30.18068. PMID  8663499.
• Мэн З., Чжао Т., Чжоу К. и др. (2017). «A20 уменьшает воспалительные поражения, вызванные внутримозговым кровоизлиянием, регулируя полиубиквитинирование TRAF6». J. Immunol. 198 (2): 820–31. Дои:10.4049 / jimmunol.1600334. ЧВК  5220121. PMID  27986908.
• Песня HY, Rothe M, Goeddel DV (1996). «Белок цинкового пальца A20, индуцируемый фактором некроза опухоли, взаимодействует с TRAF1 / TRAF2 и ингибирует активацию NF-kappaB». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (13): 6721–5. Bibcode:1996PNAS ... 93.6721S. Дои:10.1073 / пнас.93.13.6721. ЧВК  39093. PMID  8692885.
• Винченц К., Диксит В.М. (1996). «Белки 14-3-3 связываются с А20 специфическим для изоформы образом и действуют как шапероны и как адаптерные молекулы». J. Biol. Chem. 271 (33): 20029–34. Дои:10.1074 / jbc.271.33.20029. PMID  8702721.
• Де Валк Д., Хейнинк К., Ван Крикинг В. и др. (1996). «А20, ингибитор гибели клеток, самоассоцируется с помощью домена цинкового пальца». FEBS Lett. 384 (1): 61–4. Дои:10.1016/0014-5793(96)00283-9. PMID  8797804. S2CID  29040964.
• Де Валк Д., Хейнинк К., Ван Крикинг В. и др. (1997). «A20 ингибирует активацию NF-kappaB независимо от связывания с белками 14-3-3». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 238 (2): 590–4. Дои:10.1006 / bbrc.1997.7343. PMID  9299557.
• Элиопулос А.Г., Блейк С.М., Флоттманн Дж. Э. и др. (1999). «Латентный мембранный белок 1, кодируемый вирусом Эпштейна-Барра, активирует путь JNK через свой крайний С-конец через механизм, включающий TRADD и TRAF2». Дж. Вирол. 73 (2): 1023–35. Дои:10.1128 / JVI.73.2.1023-1035.1999. ЧВК  103922. PMID  9882303.
• Heyninck K, Beyaert R (1999). «Цитокин-индуцируемый белок цинкового пальца A20 ингибирует индуцированную IL-1 активацию NF-kappaB на уровне TRAF6». FEBS Lett. 442 (2–3): 147–50. Дои:10.1016 / S0014-5793 (98) 01645-7. PMID  9928991. S2CID  19072203.
• Хайнинк К., Де Валк Д., Ванден Берге В. и др. (1999). «Белок цинкового пальца А20 ингибирует TNF-индуцированную экспрессию NF-kappaB-зависимого гена путем вмешательства в сигнал трансактивации, опосредованный RIP или TRAF2, и напрямую связывается с новым ингибирующим NF-kappaB белком ABIN». J. Cell Biol. 145 (7): 1471–82. Дои:10.1083 / jcb.145.7.1471. HDL:1854 / LU-113881. ЧВК  2133159. PMID  10385526.
• Де Валк Д., Джин Д. Ю., Хейнинк К. и др. (1999). «Белок цинкового пальца А20 взаимодействует с новым антиапоптотическим белком, который расщепляется специфическими каспазами». Онкоген. 18 (29): 4182–90. Дои:10.1038 / sj.onc.1202787. PMID  10435631.
• Чжан С.К., Коваленко А., Кантарелла Г., Уоллах Д. (2000). «Рекрутирование сигнаносомы IKK на рецептор TNF p55: RIP и A20 связываются с NEMO (IKKgamma) при стимуляции рецептора». Иммунитет. 12 (3): 301–11. Дои:10.1016 / S1074-7613 (00) 80183-1. PMID  10755617.
• Ли Э. Г., Бун Д. Л., Чай С. и др. (2000). «Неспособность регулировать TNF-индуцированный NF-kappaB и ответы клеточной гибели у мышей с дефицитом A20». Наука. 289 (5488): 2350–4. Bibcode:2000Sci ... 289.2350L. Дои:10.1126 / science.289.5488.2350. ЧВК  3582399. PMID  11009421.
• Клинкенберг М., Ван Хаффель С., Хейнинк К., Бейерт Р. (2001). «Функциональная избыточность цинковых пальцев A20 для ингибирования активации NF-kappaB и белок-белковых взаимодействий». FEBS Lett. 498 (1): 93–7. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 02504-2. PMID  11389905. S2CID  32414520.
• Ван Хаффель С., Делай Ф., Хейнинк К. и др. (2001). «Идентификация нового A20-связывающего ингибитора активации ядерного фактора каппа B, названного ABIN-2». J. Biol. Chem. 276 (32): 30216–23. Дои:10.1074 / jbc.M100048200. PMID  11390377.
• Эванс П.К., Тейлор Э.Р., Коадвелл Дж. И др. (2001). «Выделение и характеристика двух новых A20-подобных белков». Biochem. J. 357 (Пт 3): 617–23. Дои:10.1042/0264-6021:3570617. ЧВК  1221992. PMID  11463333.
• Балтатакис I, Алькантара О, Болдт Д.Х. (2001). «Экспрессия различных генов пути NF-kappaB в дендритных клетках (DC) или макрофагах, оцененная с помощью профилирования экспрессии генов». J. Cell. Биохим. 83 (2): 281–90. Дои:10.1002 / jcb.1231. PMID  11573245. S2CID  12756967.
• Зетун Ф.С., Мурти А.Р., Шао З. и др. (2002). «A20 ингибирует активацию NF-каппа B ниже нескольких киназ Map3 и взаимодействует с сигнаносомой I каппа B». Цитокин. 15 (6): 282–98. Дои:10.1006 / cyto.2001.0921. PMID  11594795.
• Ву В.С., Сюй ZX, Чанг К.С. (2002). «Белок промиелоцитарного лейкоза подавляет транскрипцию, опосредованную А20». J. Biol. Chem. 277 (35): 31734–9. Дои:10.1074 / jbc.M201648200. PMID  12080044.
• Soni D, Wang DM, Regmi SC, Mittal M, Vogel SM, Schlüter D, Tiruppathi C (май 2018 г.). «Деубиквитиназная функция A20 поддерживает и восстанавливает эндотелиальный барьер после повреждения сосудов легких». Открытие смерти клетки. 4 (60). Дои:10.1038 / s41420-018-0056-3. ЧВК  5955943. PMID  29796309.
• Он К.Л., Тинг А.Т. (2002). «A20 ингибирует апоптоз, индуцированный фактором некроза опухоли (TNF) альфа, нарушая рекрутирование TRADD и RIP в комплекс рецептора TNF 1 в Т-клетках Jurkat». Мол. Cell. Биол. 22 (17): 6034–45. Дои:10.1128 / MCB.22.17.6034-6045.2002. ЧВК  133997. PMID  12167698.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P21580 (Белок 3, индуцированный фактором некроза опухоли альфа) на PDBe-KB.