Митохондриальный код дрожжей - Yeast mitochondrial code
В митохондриальный код дрожжей (таблица перевода 3) это генетический код используется митохондриальный геном дрожжей, в частности Saccharomyces cerevisiae, Candida glabrata, Hansenula saturnus, и Kluyveromyces thermotolerans.[1]
Код
AA = FFLLSSSSYY ** CCWWTTTTPPPPHHQQRRRRIIMMTTTTNNKKSSRRVVVVVAAAADDEEGGGGНачинается = --- M --------------- M --------------- M ------------- --M ------------Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGGBase2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGBase3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG
Базы: аденин (А), цитозин (С), гуанин (G) и тимин (T) или урацил (U).
Аминокислоты: Аланин (Ала, А), Аргинин (Arg, R), Аспарагин (Asn, N), Аспарагиновая кислота (Asp, D), Цистеин (Cys, C), Глютаминовая кислота (Glu, E), Глутамин (Gln, Q), Глицин (Gly, G), Гистидин (Его, H), Изолейцин (Иль, я), Лейцин (Leu, L), Лизин (Лис, К), Метионин (Met, M), Фенилаланин (Phe, F), Пролин (Pro, P), Серин (Сер, S), Треонин (Thr, T), Триптофан (Трп, Вт), Тирозин (Tyr, Y), Валин (Вал, В).
Отличия от стандартного кода
| Кодоны ДНК | Кодоны РНК | Этот код (3) | Стандартный код (1) | |
|---|---|---|---|---|
| ATA | AUA | Встреча (M) | Иль (I) | |
| CTT | CUU | Thr (T) | Лей (L) | |
| CTC | CUC | Thr (Т) | Лея (L) | |
| CTA | CUA | Thr (Т) | Лея (L) | |
| CTG | CUG | Thr (Т) | Лея (L) | |
| TGA | UGA | Trp (Вт) | СТОП = Тер (*) | |
| CGA | CGA | Отсутствующий | Arg (Р) | |
| CGC | CGC | Отсутствующий | Arg (Р) |
- Остальные кодоны CGN редки в Saccharomyces cerevisiae [2] и отсутствует в Candida glabrata.
- Кодон AUA часто встречается в гене var1 кодирование одного митохондриального рибосомальный белок, но редко встречается в генах, кодирующих ферменты.
- Присвоения кодов AUA (Met или Ile) и CUU (возможно, Leu, а не Thr) не определены в Hansenula saturnus.
- Присвоение кодировки Thr к CUN не определено в Kluyveromyces thermotolerans.
Смотрите также
Рекомендации
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.[3]
- ^ Clark-Walker, G.D .; Вейллер, Г. Ф. (1994). "Структура малой митохондриальной ДНК Kluyveromyces thermotolerans вероятно, отражает порядок генов предков у грибов ". Журнал молекулярной эволюции. 38 (6): 593–601. Дои:10.1007 / bf00175879. PMID 8083884.
- ^ Сьюзан Г. Бонитц, Роберта Берлани, Глория Коруцци, Мэй Ли, Джузеппе Мачино, Франсиско Г. Нобрега, Марина П. Нобрега, Арбара Э. Таленфельд и Александр Цаголофф (июнь 1980 г.). «Правила распознавания кодонов в митохондриях дрожжей» (PDF). Proc. Natl. Акад. Sci. Соединенные Штаты Америки. 77 (6): 3167–3170. Дои:10.1073 / pnas.77.6.3167. ЧВК 349575. PMID 6997870.CS1 maint: несколько имен: список авторов (ссылка на сайт)
- ^ Эльзановский А, Остелл Дж, Лейпе Д., Сусов В. "Генетические коды". Браузер таксономии. Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США. Получено 30 апреля 2015.