ACADVL - ACADVL

ACADVL
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2UXW, 3B96
Идентификаторы
Псевдонимы	ACADVL, ацил-КоА дегидрогеназа, очень длинная цепь, ACAD6, LCACD, VLCAD, ацил-КоА дегидрогеназа, очень длинная цепь
Внешние идентификаторы	OMIM: 609575 MGI: 895149 ГомолоГен: 5 Генные карты: ACADVL
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17p13.1 Начинать 7,217,125 бп[1] Конец 7,225,266 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 B3 | 11 42,96 см Начинать 70,010,183 бп[2] Конец 70,015,411 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • оксидоредуктазная активность, действующая на группу доноров CH-CH • активность ацил-КоА дегидрогеназы • оксидоредуктазная активность • связывание флавинаденин динуклеотидов • активность длинноцепочечной ацил-КоА дегидрогеназы • связывание жирных ацил-КоА • активность ацил-КоА дегидрогеназы с очень длинной цепью Сотовый компонент • мембрана • митохондриальный матрикс • ядрышко • митохондрия • митохондриальная внутренняя мембрана • митохондриальный нуклеоид • ядро клетки • цитозоль • митохондриальные мембраны Биологический процесс • дифференцировка эпителиальных клеток • отрицательная регуляция процесса биосинтеза жирных кислот • липидный обмен • отрицательное регулирование окисления жирных кислот • получение энергии путем окисления органических соединений • метаболический процесс жирных кислот • регулирование процесса обмена холестерина • IRE1-опосредованный ответ развернутого белка • бета-окисление жирных кислот • температурный гомеостаз • окислительно-восстановительный процесс • катаболический процесс жирных кислот • реакция на холод • бета-окисление жирных кислот с использованием ацил-КоА дегидрогеназы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	37	11370
Ансамбль	ENSG00000072778	ENSMUSG00000018574
UniProt	P49748	P50544
RefSeq (мРНК)	NM_000018 NM_001033859 NM_001270447 NM_001270448	NM_017366
RefSeq (белок)	NP_000009 NP_001029031 NP_001257376 NP_001257377	NP_059062
Расположение (UCSC)	Chr 17: 7.22 - 7.23 Мб	Chr 11: 70.01 - 70.02 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ацил-КоА-дегидрогеназа с очень длинной цепью, митохондриальная (VLCAD) - это фермент, который у человека кодируется ACADVL ген.

Мутации в ACADVL связаны с дефицит дегидрогеназы ацил-кофермента А с очень длинной цепью. В белок кодируемый этим геном, нацелен на внутренняя митохондриальная мембрана, где он катализирует первую стадию пути бета-окисления митохондриальных жирных кислот. Этот ацил-коэнзим А дегидрогеназа специфичен для длинноцепочечных и очень длинноцепочечных жирных кислот. Дефицит этого генного продукта снижает бета-окисление жирных кислот миокарда и связан с кардиомиопатия. Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы.^[5]

Структура

Ген ACADVL содержит 20 экзоны,^[6] и имеет длину около 5,4 КБ.^[7] VLCAD имеет интересную структуру генов у людей, поскольку он расположен в структуре «голова к голове» с DLG4 ген на Хромосома 17, и что транскрибируемые области этих генов перекрываются. Было показано, что лечение DEHP приводит к активации минимальным промотором.^[8] Хотя DLG4 и VLCAD имеют общие регуляторные элементы, каждый из них имеет отдельные и отличные тканеспецифичные элементы, которые обеспечивают их функцию. У мышей эти два гена расположены «голова к голове», но не перекрываются.^[7]

Функция

Фермент VLCAD катализирует большую часть бета-окисления жирных кислот, образуя транс-двойную связь C2-C3 в жирной кислоте. VLCAD специфичен для жирных кислот с очень длинной цепью, обычно C16-acylCoA и более длинных.^[9] У мышей с дефицитом VLCAD гиперацетилирование белка в печени практически отсутствует; это означает, что белок VLCAD также необходим для ацетилирование белков в этой биологической системе.^[10]

Клиническое значение

ACADVL связан с дефицит дегидрогеназы ацил-кофермента А с очень длинной цепью (VLCADD), который имеет множество симптомов и обычно представляет собой один из трех фенотипы. Первый - тяжелый, с ранним началом и высокой смертностью; наиболее частым симптомом является эта форма кардиомиопатия. Вторая форма - это поздняя детская форма с более легкими симптомами, которые чаще всего проявляются в виде гипокетотической гипогликемии. Окончательная форма проявляется в зрелом возрасте и представляет собой изолированное поражение скелетных мышц, рабдомиолиз, и миоглобинурия, который запускается упражнениями или голоданием.^[11] Заболевание обычно диагностируется при первом выполнении тандемная масс-спектрометрия на образце крови пациента в период стресса, а затем проводят молекулярно-генетическое тестирование на наличие гена ACADVL. Дефицит лечится систематически, но при определенных условиях, таких как голодание, раздражение миокарда, обезвоживание, и следует избегать диет с высоким содержанием жиров, чтобы предотвратить вторичные осложнения.^[12]

Взаимодействия

ACADVL имеет 75 двоичных белок-белковые взаимодействия в том числе 73 сопряженных взаимодействия. ACADVL, похоже, взаимодействует с RPSA и GPHN.^[13]

Смотрите также

• Ацил-КоА-дегидрогеназа

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000072778 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018574 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «ацил-КоА дегидрогеназа, очень длинная цепь».
6. Штраус А.В., Пауэлл К.К., Хейл Д.Е., Андерсон М.М., Ахуджа А., Брэкетт Дж. К., Sims HF (ноябрь 1995 г.). «Молекулярная основа дефицита ацил-КоА дегидрогеназы митохондрий человека с очень длинной цепью, вызывающего кардиомиопатию и внезапную смерть в детстве». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (23): 10496–500. Дои:10.1073 / пнас.92.23.10496. ЧВК  40638. PMID  7479827.
7. Чжоу С., Блумберг Б. (февраль 2003 г.). «Перекрывающаяся генная структура человеческого VLCAD и DLG4». Ген. 305 (2): 161–6. Дои:10.1016 / s0378-1119 (02) 01235-0. PMID  12609736.
8. Чжан Л.Ф., Дин Дж.Х., Ян Б.З., Хе ГК, Роу С. (декабрь 2003 г.). «Характеристика области двунаправленного промотора между человеческими генами, кодирующими VLCAD и PSD-95». Геномика. 82 (6): 660–8. Дои:10.1016 / s0888-7543 (03) 00211-8. PMID  14611808.
9. Аояма Т., Сури М., Ушикубо С., Камиджо Т., Ямагути С., Келли Р.И., Рхед В.Дж., Утаке К., Танака К., Хашимото Т. (июнь 1995 г.). «Очистка человеческой дегидрогеназы ацил-кофермента А с очень длинной цепью и характеристика ее дефицита у семи пациентов». Журнал клинических исследований. 95 (6): 2465–73. Дои:10.1172 / JCI117947. ЧВК  295925. PMID  7769092.
10. Пуговкина О., Те Бринке Х., Офман Р., ван Крухтен А.Г., Кулик В., Вандерс Р.Дж., Хаутен С.М., де Бур В.К. (июль 2014 г.). «Ацетилирование митохондриального белка вызывается ацетил-КоА в результате окисления жирных кислот». Молекулярная генетика человека. 23 (13): 3513–22. Дои:10.1093 / hmg / ddu059. PMID  24516071.
11. Андресен Б.С., Олпин С., Поортуис Б.Дж., Шольте Х.Р., Виани-Сабан К., Вандерс Р., Ийлст Л., Моррис А., Пурфарзам М., Бартлетт К., Баумгартнер Е. Бросс П., Болунд Л., Грегерсен Н. (февраль 1999 г.). «Четкая корреляция генотипа с фенотипом заболевания при дефиците ацил-КоА дегидрогеназы с очень длинной цепью». Американский журнал генетики человека. 64 (2): 479–94. Дои:10.1086/302261. ЧВК  1377757. PMID  9973285.
12. Лесли, Н. Д .; Валенсия, К. А .; Штраус, А. В .; Zhang, K .; Adam, M. P .; Ardinger, H.H .; Pagon, R.A .; Wallace, S.E .; Bean LJH; Стивенс, К .; Амемия, А. (1993). «Дефицит ацил-кофермента дегидрогеназы с очень длинной цепью». PMID  20301763.
13. «75 бинарных взаимодействий найдено по поисковому запросу ACADVL». База данных по молекулярным взаимодействиям IntAct. EMBL-EBI. Получено 2018-08-24.

дальнейшее чтение

• Коста К.Г., Дорланд Л., де Алмейда ИТ, Якобс К., Дюран М., Poll-The BT (июнь 1998 г.). «Влияние голодания, нагрузки длинноцепочечных триглицеридов и нагрузки карнитина на уровни длинноцепочечного ацилкарнитина в плазме при дефиците митохондриальной очень длинноцепочечной ацил-КоА дегидрогеназы». Журнал наследственных метаболических заболеваний. 21 (4): 391–9. Дои:10.1023 / А: 1005354624735. PMID  9700596. S2CID  2198523.

внешняя ссылка

• GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о дефиците дегидрогеназы ацил-кофермента А с очень длинной цепью
• Человек ACADVL расположение генома и ACADVL страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.