ALPL - ALPL

ALPL
Идентификаторы
Псевдонимы	ALPL, AP-TNAP, APTNAP, HOPS, TNAP, TNSALP, щелочная фосфатаза, печень / кость / почки, TNALP, щелочная фосфатаза, биоминерализация
Внешние идентификаторы	OMIM: 171760 MGI: 87983 ГомолоГен: 37314 Генные карты: ALPL
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п36.12 Начинать 21,509,397 бп[1] Конец 21,578,410 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 D3 | 4 70,02 см Начинать 137,741,733 бп[2] Конец 137,796,384 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • гидролазная активность • активность щелочной фосфатазы • каталитическая активность • пирофосфатазная активность • фосфатазная активность Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • закрепленный компонент мембраны • мембрана • межклеточная мембраносвязанная органелла • внеклеточная экзосома • внеклеточная область • внеклеточный • клеточная мембрана • внеклеточный матрикс Биологический процесс • ответ на липополисахарид • дифференцировка остеобластов • развитие биоминеральной ткани • цементная минерализация • клеточный ответ на органическое циклическое соединение • развитие скелетной системы • метаболизм • дефосфорилирование • ответ на витамин D • ответ на антибиотик • процесс развития, связанный с воспроизводством • ответ на глюкокортикоиды • эндохондральная оссификация • Липидирование C-концевого белка Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	249	11647
Ансамбль	ENSG00000162551	ENSMUSG00000028766
UniProt	P05186	P09242
RefSeq (мРНК)	NM_000478 NM_001127501 NM_001177520 NM_001369803 NM_001369804 NM_001369805	NM_001287172 NM_001287176 NM_007431
RefSeq (белок)	NP_000469 NP_001120973 NP_001170991 NP_001356732 NP_001356733 NP_001356734	NP_001274101 NP_031457
Расположение (UCSC)	Chr 1: 21.51 - 21.58 Мб	Chr 4: 137,74 - 137,8 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Щелочная фосфатаза тканеспецифическая изофермент является фермент что у людей кодируется ALPL ген.^[5][6]

Функция

Есть как минимум четыре различных, но связанных щелочные фосфатазы: кишечные, плацентарные, плацентарные и печень / кости / почки (тканеспецифические). Первые три расположены вместе на хромосоме 2, тогда как тканеспецифическая форма расположена на хромосоме 1. Продукт этого гена представляет собой мембранно-связанный гликозилированный фермент, который не экспрессируется в какой-либо конкретной ткани и поэтому называется тканеспецифическая форма фермента. Точная физиологическая функция щелочных фосфатаз неизвестна. Предполагаемая функция этой формы фермента - минерализация матрикса. Однако у мышей, у которых отсутствует функциональная форма этого фермента, наблюдается нормальное развитие скелета.^[7]

Клиническое значение

Этот фермент был напрямую связан с заболеванием, известным как гипофосфатазия, заболевание, которое характеризуется гиперкальциемией и включает дефекты скелета. Однако характер этого расстройства может варьироваться в зависимости от конкретной мутации, поскольку от этого зависит возраст начала и тяжесть симптомов.

Степень тяжести симптомов варьируется от преждевременной потери временных зубов без костных аномалий до мертворождения.^[8] в зависимости от того, какая аминокислота^[9][10] изменен в гене ALPL. Мутации в гене ALPL приводят к различной низкой активности фермента тканеспецифической щелочной фосфатазы (TNSALP), что приводит к гипофосфатазии (HPP).^[11] Существуют различные клинические формы HPP, которые могут быть унаследованы по аутосомно-рецессивному признаку или аутосомно-доминантному признаку,^[8] первые вызывают более тяжелые формы болезни. Щелочная фосфатаза способствует минерализации кальция и фосфора костями и зубами.^[11] Мутация гена ALPL приводит к недостаточному количеству фермента TNSALP и способствует накоплению химических веществ, таких как неорганический пирофосфат^[11] косвенно вызывать повышение уровня кальция в организме и отсутствие кальцификации костей.

Мутация E174K, при которой глицин превращается в аминокислоту аланин в 571-м положении соответствующей полипептидной цепи, является результатом наследственной мутации, которая произошла у кавказцев и показывает легкую форму HPP.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000162551 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028766 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Weiss MJ, Henthorn PS, Lafferty MA, Slaughter C, Raducha M, Harris H (октябрь 1986). «Выделение и характеристика кДНК, кодирующей щелочную фосфатазу типа печени / костей / почек человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 83 (19): 7182–6. Дои:10.1073 / пнас.83.19.7182. ЧВК  386679. PMID  3532105.
6. Swallow DM, Povey S, Parkar M, Andrews PW, Harris H, Pym B, Goodfellow P (июль 1986). «Картирование гена, кодирующего изофермент щелочной фосфатазы в печени / костях / почках человека, на хромосому 1». Анналы генетики человека. 50 (Pt 3): 229–35. Дои:10.1111 / j.1469-1809.1986.tb01043.x. PMID  3446011.
7. «Ген Entrez: щелочная фосфатаза ALPL, печень / кость / почки».
8. Hérasse M, Spentchian M, Taillandier A, Mornet E (октябрь 2002 г.). «Доказательства эффекта основателя мутации E174K в гене тканеспецифической щелочной фосфатазы (TNSALP) у пациентов с гипофосфатазией». Европейский журнал генетики человека. 10 (10): 666–8. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5200857. PMID  12357339.
9. Насу М., Ито М., Исида Й, Нума Н, Комару К., Номура С., Ода К. (декабрь 2006 г.). «Аберрантный межцепочечный дисульфидный мостик тканеспецифической щелочной фосфатазы с заменой Arg433 → Cys, связанной с тяжелой гипофосфатазией». Журнал FEBS. 273 (24): 5612–24. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022032. PMID  17212778.
10. Исида Ю., Комару К., Ито М., Амая Ю., Коно С., Ода К. (июль 2003 г.). «Тканевая неспецифическая щелочная фосфатаза с мутацией Asp (289) → Val не может достичь поверхности клетки и подвергается протеасомной деградации». Журнал биохимии. 134 (1): 63–70. Дои:10.1093 / jb / mvg114. PMID  12944372.
11. Федде К.Н., Блэр Л., Сильверстайн Дж., Коберн С.П., Райан Л.М., Вайнштейн Р.С., Уэймайр К., Нарисава С., Миллан Дж. Л., МакГрегор Г. Р., Уайт М. П. (декабрь 1999 г.). «Мыши с нокаутом щелочной фосфатазы повторяют метаболические и скелетные дефекты детской гипофосфатазии». Журнал исследований костей и минералов. 14 (12): 2015–26. Дои:10.1359 / jbmr.1999.14.12.2015. ЧВК  3049802. PMID  10620060.

дальнейшее чтение

• Морнет Э (2000). «Гипофосфатазия: мутации в гене тканеспецифической щелочной фосфатазы». Человеческая мутация. 15 (4): 309–15. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (200004) 15: 4 <309 :: AID-HUMU2> 3.0.CO; 2-C. PMID  10737975.
• Khandwala HM, Mumm S, Уайт MP (2007). «Низкая активность щелочной фосфатазы в сыворотке и патологический перелом: клинический случай и краткий обзор гипофосфатазии, диагностированной во взрослом возрасте». Эндокринная практика. 12 (6): 676–81. Дои:10.4158 / ep.12.6.676. PMID  17229666.
• Най К.Е., Райли Г.А., Пинчинг А.Дж. (июль 1992 г.). «Дефект, наблюдаемый в пути гидролиза фосфатидилинозитола в ВИЧ-инфицированных лимфоцитах и ​​лимфобластоидных клетках, обусловлен ингибированием инозитол-1,4,5-трифосфат-1,3,4,5-тетракисфосфат-5-фосфомоноэстеразы». Клиническая и экспериментальная иммунология. 89 (1): 89–93. Дои:10.1111 / j.1365-2249.1992.tb06883.x. ЧВК  1554388. PMID  1321014.
• Хенторн П.С., Радуча М., Федде К.Н., Лафферти М.А., Уайт М.П. (октябрь 1992 г.). «Различные миссенс-мутации в локусе тканеспецифического гена щелочной фосфатазы при аутосомно-рецессивно наследуемых формах легкой и тяжелой гипофосфатазии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 89 (20): 9924–8. Дои:10.1073 / пнас.89.20.9924. ЧВК  50246. PMID  1409720.
• Нишихара Й, Хаяси Й, Адачи Т., Кояма И., Стигбранд Т., Хирано К. (декабрь 1992 г.). «Химическая природа щелочной фосфатазы кишечного типа в почках человека». Клиническая химия. 38 (12): 2539–42. PMID  1458595.
• Федде К.Н., Уайт депутат (ноябрь 1990 г.). «Щелочная фосфатаза (тканеспецифический изофермент) представляет собой фосфоэтаноламин и пиридоксаль-5'-фосфатэктофосфатазу: исследование нормальных и гипофосфатазных фибробластов». Американский журнал генетики человека. 47 (5): 767–75. ЧВК  1683690. PMID  2220817.
• Киши Ф, Мацуура С., Кадзи Т. (март 1989 г.). «Нуклеотидная последовательность кДНК щелочной фосфатазы печени человека». Исследования нуклеиновых кислот. 17 (5): 2129. Дои:10.1093 / nar / 17.5.2129. ЧВК  317555. PMID  2928120.
• Weiss MJ, Ray K, Henthorn PS, Lamb B, Kadesch T., Harris H (август 1988). «Структура гена щелочной фосфатазы печени / костей / почек человека». Журнал биологической химии. 263 (24): 12002–10. PMID  3165380.
• Weiss MJ, Cole DE, Ray K, Whyte MP, Lafferty MA, Mulivor RA, Harris H (октябрь 1988 г.). «Миссенс-мутация в гене щелочной фосфатазы в печени / костях / почках человека, вызывающая летальную форму гипофосфатазии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 85 (20): 7666–9. Дои:10.1073 / pnas.85.20.7666. ЧВК  282253. PMID  3174660.
• Смит М., Вайс М.Дж., Гриффин К.А., Мюррей Дж. К., Буетоу К. Х., Эмануэль Б. С., Хенторн П. С., Харрис Н. (февраль 1988 г.). "Региональное назначение гена щелочной фосфатазы печени / костей / почек человека хромосоме 1p36.1-p34". Геномика. 2 (2): 139–43. Дои:10.1016 / 0888-7543 (88) 90095-X. PMID  3410475.
• Гараттини Е., Хуа Дж. К., Пан Ю. С., Удэнфренд С. (март 1986 г.). «Щелочная фосфатаза печени человека, очистка и частичное секвенирование: гомология с изоферментом плаценты». Архивы биохимии и биофизики. 245 (2): 331–7. Дои:10.1016/0003-9861(86)90223-7. PMID  3954357.
• Гольдштейн DJ, Бласко Л., Харрис Х (июль 1980 г.). «Плацентарная щелочная фосфатаза в незлокачественной шейке матки человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 77 (7): 4226–8. Дои:10.1073 / pnas.77.7.4226. ЧВК  349804. PMID  6933471.
• Сато Н., Такахаши Ю., Асано С. (февраль 1994 г.). «Предпочтительное использование лидерной последовательности костного типа для транскриптов гена щелочной фосфатазы типа печени / костей / почек в нейтрофильных гранулоцитах». Кровь. 83 (4): 1093–101. PMID  7509208.
• Оримо Х., Хаяси З., Ватанабэ А., Хираяма Т., Хираяма Т., Шимада Т. (сентябрь 1994 г.). «Новые миссенс-мутации и мутации сдвига рамки считывания тканеспецифического гена щелочной фосфатазы у японского пациента с гипофосфатазией». Молекулярная генетика человека. 3 (9): 1683–4. Дои:10.1093 / hmg / 3.9.1683. PMID  7833929.
• Гринберг CR, Тейлор CL, Хаворт JC, Seargeant LE, Philipps S, Triggs-Raine B, Chodirker BN (июль 1993 г.). «Гомоаллельная мутация Gly317 -> Asp в ALPL вызывает перинатальную (летальную) форму гипофосфатазии у канадских меннонитов». Геномика. 17 (1): 215–7. Дои:10.1006 / geno.1993.1305. PMID  8406453.
• Озоно К., Ямагата М., Мичигами Т., Накадзима С., Сакаи Н., Цай Г., Сатомура К., Ясуи Н., Окада С., Накаяма М. (декабрь 1996 г.). «Идентификация новых миссенс-мутаций (Phe310Leu и Gly439Arg) у новорожденных с гипофосфатазией». Журнал клинической эндокринологии и метаболизма. 81 (12): 4458–61. Дои:10.1210 / jc.81.12.4458. PMID  8954059.
• Оримо Х., Госэки-Соне М., Сато С., Шимада Т. (июнь 1997 г.). «Обнаружение делеции 1154-1156 мутации гипофосфатазии с использованием амплификации экзона TNSALP». Геномика. 42 (2): 364–6. Дои:10.1006 / geno.1997.4733. PMID  9192863.
• Сугимото Н., Ивамото С., Хосино Ю., Кадзи Е. (1998). «Новая миссенс-мутация тканеспецифического гена щелочной фосфатазы, обнаруженная у пациента с гипофосфатазией». Журнал генетики человека. 43 (3): 160–4. Дои:10.1007 / с100380050061. PMID  9747027.

внешняя ссылка

• GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о гипофосфатазии
• Человек ALPL расположение генома и ALPL страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.