Аполипопротеин С1 - Apolipoprotein C1
| ApoC-I | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 структурные исследования ингибитора белков плазмы крови павианов (papio sp.) холестерилэфиртрансферазы. | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ApoC-I | ||||||||
| Pfam | PF04691 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR006781 | ||||||||
| SCOP2 | 1ale / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
Аполипопротеин C-I является белковым компонентом липопротеины что у людей кодируется APOC1 ген.[3][4]
Функция
Белок, кодируемый этим геном, является членом аполипопротеин С семья. Этот ген экспрессируется в основном в печени и активируется при моноциты дифференцировать в макрофаги. Альтернативно сплайсированные варианты транскриптов были найдены для этого гена, но биологическая ценность некоторых вариантов не была определена.[5]
Аполипопротеин С1 имеет длину 57 аминокислоты обычно обнаруживается в плазме и отвечает за активацию этерифицированного холестерина лецитина, играющего важную роль в обмене этерифицированным холестерином между липопротеинами и удалении холестерина из тканей. Его основная функция - подавление CETP, возможно, изменив электрический заряд из HDL молекулы.
Во время голодания (как и другие аполипопротеин C), он находится в основном в HDL, а после еды он обнаруживается на поверхности других липопротеинов. Когда белки, богатые триглицеридами, такими как хиломикроны и VLDL, расщепляются, этот апопротеин снова переносится на HDL. Это один из самых положительно заряженных белки в теле человека.
Псевдоген
А псевдоген этого гена расположен на 4 т.п.н. ниже гена апоС-I в той же ориентации на хромосоме 19, где оба находятся в кластере генов аполипопротеина. Этот псевдоген, который, как сообщается, также присутствовал у денисовцев и неандертальцев, возник в результате двух отдельных событий. После расхождения обезьян Нового Света от человеческой линии ген apoC-I был продублирован. Было показано, что обезьяны Старого Света и другие человекообразные обезьяны имеют два активных гена. Один из дубликатов кодирует основной белок, обозначенный как апоС-IB, который является ортологом человеческого аполипопротеина С-I. Другой кодирует кислый белок, apoC-IA, который ортологичен виртуальному белку, кодируемому псевдогеном. Событие псевдогенизации произошло где-то между расхождением бонобо и шимпанзе от человеческого происхождения и приходом денисовцев и неандертальцев. Псевдоген возникает из-за изменения одного нуклеотида в кодоне предпоследней аминокислоты, то есть глутамина, в сигнальной последовательности, что приводит к стоп-кодону.[6][7][8]
Интерактивная карта проезда
Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи. [§ 1]
- ^ Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: "Statin_Pathway_WP430".
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000130208 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Тата Ф., Генри I, Маркхэм А.Ф., Уоллис С.К., Вейл Д., Гжешик К.Х. и др. (1985). «Выделение и характеристика клона кДНК для человеческого аполипопротеина CI и отнесение гена к хромосоме 19». Генетика человека. 69 (4): 345–9. Дои:10.1007 / BF00291654. PMID 2985493. S2CID 32767041.
- ^ Смит М., ван дер Кой-Мейс Э., Франц Р. Р., Хавекес Л., Класен Э. К. (январь 1988 г.). «Кластер гена аполипопротеина на хромосоме 19. Определенная локализация гена APOC2 и полиморфного сайта Hpa I, связанного с гиперлипопротеинемией III типа». Генетика человека. 78 (1): 90–3. Дои:10.1007 / BF00291243. PMID 2892779. S2CID 22711986.
- ^ «Энтрез Ген: аполипопротеин C-I APOC1».
- ^ Puppione DL, Ryan CM, Bassilian S, Souda P, Xiao X, Ryder OA, Whitelegge JP (март 2010 г.). «Обнаружение двух различных форм апоС-I у человекообразных обезьян». Сравнительная биохимия и физиология. Часть D, Геномика и протеомика. 5 (1): 73–9. Дои:10.1016 / j.cbd.2009.12.003. ЧВК 2830554. PMID 20209111.
- ^ Puppione D, Whitelegge JP (октябрь 2013 г.). «Протеогеномный обзор изменений апоС-I приматов в процессе эволюции». Границы биологии. 8 (5): 533–548. Дои:10.1007 / s11515-013-1278-7. ЧВК 5528196. PMID 28757862.
- ^ Puppione DL (сентябрь 2014 г.). «У высших приматов, но не у обезьян Нового Света, есть повторяющийся набор энхансеров, фланкирующих их гены апоС-I». Сравнительная биохимия и физиология. Часть D, Геномика и протеомика. 11: 45–8. Дои:10.1016 / j.cbd.2014.08.001. PMID 25160599.
дальнейшее чтение
- Шульман Р.С., Герберт П.Н., Верли К., Фредриксон Д.С. (январь 1975 г.). «Полная аминокислотная последовательность C-I (apoLp-Ser), аполипопротеина из липопротеинов очень низкой плотности человека». Журнал биологической химии. 250 (1): 182–90. PMID 166984.
- Лауэр С.Дж., Уокер Д., Эльшурбаджи Н.А., Рирдон, Калифорния, Леви-Уилсон Б., Тейлор Дж. М. (май 1988 г.). «Две копии гена аполипопротеина C-I человека тесно связаны с геном аполипопротеина E». Журнал биологической химии. 263 (15): 7277–86. PMID 2835369.
- Смит М., ван дер Коой-Мейс Э., Вудт Л.П., Хавекес Л.М., Франц Р.Р. (май 1988 г.). «Точная локализация сайта рестрикции HpaI, связанного с семейной дисбеталипопротеинемией, в промоторной области гена APOC1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 152 (3): 1282–8. Дои:10.1016 / S0006-291X (88) 80424-8. PMID 2897845.
- Дэвисон П.Дж., Нортон П., Уоллис С.К., Гилл Л., Кук М., Уильямсон Р., Хамфрис С.Е. (май 1986 г.). «Есть две последовательности гена аполипопротеина CI человека (апо CI) на хромосоме 19, одна из которых находится в 4 т.п.н. от гена апо E». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 136 (3): 876–84. Дои:10.1016 / 0006-291X (86) 90414-6. PMID 3013172.
- Myklebost O, Rogne S (август 1986). «Ген аполипопротеина CI человека расположен на расстоянии 4,3 килобаз от гена аполипопротеина E на 19 хромосоме». Генетика человека. 73 (4): 286–9. Дои:10.1007 / BF00279087. PMID 3017837. S2CID 11662593.
- Джексон Р.Л., Воробей Д.Т., Бейкер Н.Н., Моррисетт Д.Д., Тонтон О.Д., Готто А.М. (август 1974 г.). «Первичная структура аполопопротеина-серина». Журнал биологической химии. 249 (16): 5308–13. PMID 4369340.
- Knott TJ, Робертсон ME, Пристли LM, Urdea M, Wallis S, Scott J (май 1984). «Характеристика мРНК, кодирующих предшественник человеческого аполипопротеина CI». Исследования нуклеиновых кислот. 12 (9): 3909–15. Дои:10.1093 / nar / 12.9.3909. ЧВК 318798. PMID 6328444.
- Сервилло Л., Брюэр Х. Б., Осборн Дж. К. (февраль 1981 г.). «Оценка смешанного взаимодействия между аполипопротеинами A-II и C-I в равновесном оседании». Биофизическая химия. 13 (1): 29–38. Дои:10.1016/0301-4622(81)80022-1. PMID 6789904.
- Карри, доктор медицины, МакКонати, В. Дж., Фесмир, Д. Д., Алаупович, П. (апрель 1981 г.). «Количественное определение аполипопротеинов C-I и C-II в плазме человека с помощью отдельных электроиммуноанализов». Клиническая химия. 27 (4): 543–8. Дои:10.1093 / Clinchem / 27.4.543. PMID 7471419.
- Розек А., Бучко Г.В., Кашли Р.Дж. (июнь 1995 г.). «Конформация двух пептидов, соответствующих остаткам 7-24 и 35-53 аполипопротеина C-I человека, в присутствии додецилсульфата натрия по данным КД и ЯМР-спектроскопии». Биохимия. 34 (22): 7401–8. Дои:10.1021 / bi00022a013. PMID 7779782.
- Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Траск Б., Фертитта А., Кристенсен М., Янгблом Дж., Бергманн А., Коупленд А. и др. (Январь 1993 г.). «Флуоресцентное гибридизационное картирование хромосомы 19 человека: расположение цитогенетических полос 540 космид и 70 генов или ДНК-маркеров». Геномика. 15 (1): 133–45. Дои:10.1006 / geno.1993.1021. PMID 8432525.
- Камино К., Ёсива А., Нишиваки Ю., Нагано К., Ямамото Х., Кобаяси Т. и др. (1996). «Исследование генетической ассоциации между старческой деменцией типа Альцгеймера и кластером генов APOE / C1 / C2». Геронтология. 42 Дополнение 1: 12–9. Дои:10.1159/000213820. PMID 8804993.
- Розек А., Бучко Г.В., Канда П., Кашли Р.Дж. (сентябрь 1997 г.). «Конформационные исследования N-концевого липид-ассоциированного домена аполипопротеина C-I человека с помощью спектроскопии ЯМР CD и 1H». Белковая наука. 6 (9): 1858–68. Дои:10.1002 / pro.5560060906. ЧВК 2143781. PMID 9300485.
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Галушка М.К., Фан Дж. Б., Бентли К., Хси Л., Шен Н., Ведер А. и др. (Июль 1999 г.). «Паттерны однонуклеотидных полиморфизмов в генах-кандидатах на гомеостаз кровяного давления». Природа Генетика. 22 (3): 239–47. Дои:10.1038/10297. PMID 10391210. S2CID 4636523.
- Freitas EM, Zhang WJ, Lalonde JP, Tay GK, Gaudieri S, Ashworth LK и др. (1999). «Секвенирование 42 т.п.н. кластера генов APO E-C2 выявило новый ген: PEREC1». Последовательность ДНК. 9 (2): 89–100. Дои:10.3109/10425179809086433. PMID 10520737.
- Готье Т., Массон Д., де Баррос Дж. П., Атиас А., Гамберт П., Онис Д. и др. (Декабрь 2000 г.). «Человеческий аполипопротеин C-I отвечает за способность липопротеинов высокой плотности плазмы подавлять активность белка, переносящего сложный эфир холестерина». Журнал биологической химии. 275 (48): 37504–9. Дои:10.1074 / jbc.M007210200. PMID 10978346.
- Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК 310948. PMID 11076863.
внешняя ссылка
- Человек APOC1 расположение генома и APOC1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
- PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческого аполипопротеина C-I
PDB галерея | |
|---|---|
|
 | Эта статья о ген на хромосома человека 19 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |