Промотор смерти, ассоциированной с Bcl-2 - Bcl-2-associated death promoter

ПЛОХО
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1G5J
Идентификаторы
Псевдонимы	ПЛОХО, BBC2, BCL2L8, BCL2-ассоциированный агонист гибели клеток
Внешние идентификаторы	OMIM: 603167 MGI: 1096330 ГомолоГен: 3189 Генные карты: ПЛОХО
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q13.1 Начинать 64,269,830 бп[1] Конец 64,284,704 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 А Начинать 6,941,861 бп[2] Конец 6,951,899 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов Молекулярная функция • 14-3-3 связывание с белками • связывание протеинфосфатазы • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков • активность активатора эндопептидазы цистеинового типа, участвующего в апоптотическом процессе • связывание фосфолипидов • связывание протеинкиназы • связывание липидов • связывание протеинфосфатазы 2B • связывание протеинкиназы B Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • мембрана • митохондриальная наружная мембрана • митохондрия Биологический процесс • положительная регуляция дифференцировки Т-клеток • клеточный ответ на гипоксию • регуляция апоптотического процесса • ответ на аминокислоту • ответ на эстрадиол • ответ на гипоксию • положительная регуляция развития клеток поджелудочной железы типа B • реакция на органическое циклическое соединение • внешний апоптотический сигнальный путь • положительное регулирование аутофагии • гомеостаз глюкозы • цитокин-опосредованный сигнальный путь • ответ на тестостерон • положительная регуляция пролиферации эпителиальных клеток • положительное регулирование дифференцировки В-клеток • ответ на прогестерон • положительная регуляция апоптотического процесса вирусом • комплексная сборка пор • клеточный ответ на никотин • ответ на глюкокортикоиды • положительная регуляция гибели нейронов • ответ на глюкозу • регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • реакция на органическое вещество • ответ на ион кальция • положительная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • Метаболический процесс АТФ • клеточный ответ на механический раздражитель • активация активности эндопептидазы цистеинового типа • регуляция проницаемости митохондриальной мембраны • положительная регуляция вставки белка в митохондриальную мембрану, участвующую в сигнальном пути апоптоза • положительная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути • положительная регуляция активности глюкокиназы • сперматогенез • катаболический процесс глюкозы • внутренний апоптотический сигнальный путь в ответ на повреждение ДНК • положительное регулирование протеолиза • развитие коры головного мозга • внешний апоптотический сигнальный путь в отсутствие лиганда • клеточный ответ на липид • положительное регулирование высвобождения цитохрома с из митохондрий • ответ на гормон • положительная регуляция митохондриального мембранного потенциала • положительная регуляция секреции инсулина, участвующая в клеточном ответе на стимул глюкозы • подавление вирусом апоптотического процесса хозяина • реакция на этанол • Метаболический процесс АДФ • активация активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • клеточная пролиферация • пролиферация клеток поджелудочной железы типа B • клеточный ответ на хромат • внешний апоптотический сигнальный путь через рецепторы домена смерти • ответ на наркотик • реакция на перекись водорода • реакция на олеиновую кислоту • высвобождение цитохрома с из митохондрий • положительное регулирование секреции инсулина • апоптотический процесс • внутренний апоптотический сигнальный путь • апоптотический сигнальный путь • вставка белка в митохондриальную мембрану, участвующую в сигнальном пути апоптоза • положительная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути в ответ на осмотический стресс • положительная регуляция апоптотического процесса • положительная регуляция процесса апоптоза гранулезных клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	572	12015
Ансамбль	ENSG00000002330	ENSMUSG00000024959
UniProt	Q92934	Q61337
RefSeq (мРНК)	NM_032989 NM_004322	NM_007522 NM_001285453
RefSeq (белок)	NP_004313 NP_116784	NP_001272382 NP_031548
Расположение (UCSC)	Chr 11: 64,27 - 64,28 Мб	Chr 19: 6.94 - 6.95 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Проапоптотический белок Bcl-2, БАД
комплекс bcl-xl с пептидом от плохого
Идентификаторы
Символ	Bcl-2_BAD
Pfam	PF10514
ИнтерПро	IPR018868
Доступные белковые структуры: Pfam   структуры / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum резюме структуры

В BCL2-ассоциированный агонист клеточной смерти^[5] (ПЛОХО) белок это проапоптотический член Bcl-2 семейство генов, которое участвует в инициации апоптоз. BAD является членом Семья только для BH3,^[6] подсемейство Семейство bcl-2. Он не содержит C-терминал трансмембранный домен для внешнего митохондриальная мембрана и ядерная оболочка таргетинг, в отличие от большинства других членов Семейство bcl-2.^[7] После активации он может сформировать гетеродимер с антиапоптотическими белками и не позволяют им останавливать апоптоз.

Механизм действия

Bax /Бак как полагают, инициируют апоптоз, формируя поры на внешней мембране митохондрий, которые позволяют цитохром с чтобы выйти в цитоплазму и активировать проапоптотический каспазный каскад. Антиапоптотический Bcl-2 и Bcl-xL белки ингибируют высвобождение цитохрома с через поры митохондрий, а также ингибируют активацию каскада цитоплазматических каспаз цитохромом с.^[8]

Дефосфорилированный BAD образует гетеродимер с Bcl-2 и Bcl-xL, инактивируя их и тем самым позволяя Bax /Бак -запускаемый апоптоз. Когда БАД фосфорилируется Akt / протеинкиназа B (запускается PIP₃), он образует БАД- (14-3-3 ) белковый гетеродимер. Это оставляет Bcl-2 свободно препятствовать Bax -запускаемый апоптоз.^[9] Таким образом, фосфорилирование BAD является антиапоптотическим, а дефосфорилирование BAD (например, Ca²⁺-стимулированный Кальциневрин ) является проапоптотическим. Последний может быть вовлечен в нервные заболевания, такие как шизофрения.^[10]

Взаимодействия

Обзор путей передачи сигналов, связанных с апоптоз.

Bcl-2-ассоциированный промотор смерти показал взаимодействовать с:

• BCL2L1,^{[11][12][13][14][15][16][17][18][19][20][21]}
• BCL2A1,^[11][22]
• BCL2L2,^{[11][15][22][23]}
• Bcl-2,^[11][17]
• MCL1^[11][22]
• S100A10,^[24]
• YWHAQ,^[11][24] и
• YWHAZ.^[25]

Смотрите также

• Запрограммированная гибель клеток

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000002330 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024959 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/572#gene-expression
6. Адачи М., Имаи К. (2002). «Проапоптотический белок BH3-only BAD трансдуцирует сигналы клеточной смерти независимо от его взаимодействия с Bcl-2». Разница в гибели клеток. 9 (11): 1240–7. Дои:10.1038 / sj.cdd.4401097. PMID  12404123.
7. Сюй С.Ю., Кайпиа А., Чжу Л., Сюэ А.Дж. (1997). «Вмешательство в индуцированный BAD (Bcl-xL / Bcl-2 промотор смерти) апоптоз в клетках млекопитающих с помощью изоформ 14-3-3 и P11». Мол. Эндокринол. 11 (12): 1858–67. Дои:10.1210 / я.11.12.1858. PMID  9369453.
8. Helmreich, E.J.M. (2001) Биохимия клеточной сигнализации, стр. 238-43.
9. E.J.M. (2001) Биохимия передачи сигналов клеток, стр. 242
10. Фостер, Т. и другие. (2001) J. Neurosci. 21, 4066-4073, «Кальциневрин связывает дисрегуляцию Ca ++ со старением мозга» (
11. Чен Л., Уиллис С.Н., Вэй А., Смит Б.Дж., Флетчер Д.И., Хайндс М.Г., Колман П.М., Дэй К.Л., Адамс Дж.М., Хуанг, округ Колумбия (февраль 2005 г.). «Дифференциальное нацеливание белков Bcl-2 для выживания с помощью их лигандов, содержащих только BH3, обеспечивает комплементарную апоптотическую функцию». Мол. Клетка. 17 (3): 393–403. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.12.030. PMID  15694340.
12. Цзинь Цзинь, М Синь, Дэн Х (апрель 2005 г.). «Выживающая функция протеинкиназы C {йота} как новой плохой киназы, активируемой нитрозамином 4- (метилнитрозамино) -1- (3-пиридил) -1-бутаноном». J. Biol. Chem. 280 (16): 16045–52. Дои:10.1074 / jbc.M413488200. PMID  15705582.
13. Штробель Т., Тай Ю.Т., Корсмейер С., Каннистра С.А. (ноябрь 1998 г.). «БАД частично отменяет устойчивость к паклитакселу в раковых клетках яичников человека». Онкоген. 17 (19): 2419–27. Дои:10.1038 / sj.onc.1202180. PMID  9824152.
14. Чжан Х., Ниммер П., Розенберг С.Х., Нг С.К., Джозеф М. (август 2002 г.). «Разработка высокопроизводительного анализа поляризации флуоресценции для Bcl-x (L)». Анальный. Биохим. 307 (1): 70–5. Дои:10.1016 / S0003-2697 (02) 00028-3. PMID  12137781.
15. Ayllón V, Cayla X, García A, Fleischer A, Rebollo A (июль 2002 г.). «Антиапоптотические молекулы Bcl-xL и Bcl-w нацелены на протеин-фосфатазу 1альфа до плохого». Евро. J. Immunol. 32 (7): 1847–55. Дои:10.1002 / 1521-4141 (200207) 32: 7 <1847 :: AID-IMMU1847> 3.0.CO; 2-7. PMID  12115603.
16. Komatsu K, Miyashita T, Hang H, Hopkins KM, Zheng W., Cuddeback S, Yamada M, Lieberman HB, Wang HG (январь 2000 г.). «Человеческий гомолог S. pombe Rad9 взаимодействует с BCL-2 / BCL-xL и способствует апоптозу». Nat. Cell Biol. 2 (1): 1–6. Дои:10.1038/71316. PMID  10620799. S2CID  52847351.
17. Ян Э., Чжа Дж., Джокель Дж., Бойсе Л. Х., Томпсон С. Б., Корсмейер С. Дж. (Январь 1995 г.). «Bad, гетеродимерный партнер для Bcl-XL и Bcl-2, вытесняет Bax и способствует гибели клеток». Клетка. 80 (2): 285–91. Дои:10.1016/0092-8674(95)90411-5. PMID  7834748. S2CID  10343291.
18. Петрос А.М., Неттесхайм Д.Г., Ван Й., Олейничак Е.Т., Медоуз Р.П., Мак Дж., Свифт К., Матаёши Э.Д., Чжан Х., Томпсон С.Б., Фесик С.В. (декабрь 2000 г.). «Обоснование образования комплекса Bcl-xL / плохой пептид на основе структурных, мутагенезных и биофизических исследований». Белковая наука. 9 (12): 2528–34. Дои:10.1110 / пс 9.12.2528. ЧВК  2144516. PMID  11206074.
19. Чаттопадхьяй А., Чанг К. В., Ян Э. (июль 2001 г.). «Гетеродимеризация BAD / BCL- [X (L)] приводит к обходу ареста G0 / G1». Онкоген. 20 (33): 4507–18. Дои:10.1038 / sj.onc.1204584. PMID  11494146.
20. Ивахаси Х., Эгути Й., Ясухара Н., Ханафуса Т., Мацудзава И., Цудзимото И. (ноябрь 1997 г.). «Синергическая антиапоптотическая активность между Bcl-2 и SMN, вовлеченная в спинальную мышечную атрофию». Природа. 390 (6658): 413–7. Bibcode:1997Натура.390..413I. Дои:10.1038/37144. PMID  9389483. S2CID  1936633.
21. Komatsu K, Wharton W, Hang H, Wu C., Singh S, Lieberman HB, Pledger WJ, Wang HG (ноябрь 2000 г.). «PCNA взаимодействует с hHus1 / hRad9 в ответ на повреждение ДНК и ингибирование репликации». Онкоген. 19 (46): 5291–7. Дои:10.1038 / sj.onc.1203901. PMID  11077446.
22. Бэ Дж, Сюй С.И., Лео С.П., Зелл К., Сюэ А.Дж. (октябрь 2001 г.). «Недостаточно фосфорилированный BAD взаимодействует с различными антиапоптотическими белками семейства Bcl-2 для регулирования апоптоза». Апоптоз. 6 (5): 319–30. Дои:10.1023 / А: 1011319901057. PMID  11483855. S2CID  23119757.
23. Холмгрин С.П., Хуанг, округ Колумбия, Адамс Дж. М., Кори С. (июнь 1999 г.). «Выживающая активность гомологов Bcl-2 Bcl-w и A1 лишь частично коррелирует с их способностью связывать проапоптотические члены семейства». Разница в гибели клеток. 6 (6): 525–32. Дои:10.1038 / sj.cdd.4400519. PMID  10381646.
24. Сюй С.Ю., Кайпиа А., Чжу Л., Сюэ А.Дж. (ноябрь 1997 г.). «Вмешательство в индуцированный BAD (Bcl-xL / Bcl-2 промотор смерти) апоптоз в клетках млекопитающих с помощью изоформ 14-3-3 и P11». Мол. Эндокринол. 11 (12): 1858–67. Дои:10.1210 / я.11.12.1858. PMID  9369453.
25. Ян Х, Мастерс СК, Ван Х, Фу Х (июнь 2001 г.). «Проапоптотический белок Bad связывает амфипатическую бороздку 14-3-3zeta». Биохим. Биофиз. Acta. 1547 (2): 313–9. Дои:10.1016 / S0167-4838 (01) 00202-3. PMID  11410287.

дальнейшее чтение

• Толструп М., Остергард Л., Лаурсен А.Л., Педерсен С.Ф., Дуч М. (2004). «Ускользание от иммунного надзора за ВИЧ / ВИП: внимание на Неф». Curr. ВИЧ Res. 2 (2): 141–51. Дои:10.2174/1570162043484924. PMID  15078178.
• Цзян П., Ду В, Ву М. (2007). «p53 and Bad: далекие незнакомцы становятся близкими друзьями». Cell Res. 17 (4): 283–5. Дои:10.1038 / кр.2007.19. PMID  17404594.
• Ян Э., Чжа Дж., Джокель Дж., Бойсе Л. Х., Томпсон С. Б., Корсмейер С. Дж. (1995). «Bad, гетеродимерный партнер для Bcl-XL и Bcl-2, вытесняет Bax и способствует гибели клеток». Клетка. 80 (2): 285–91. Дои:10.1016/0092-8674(95)90411-5. PMID  7834748. S2CID  10343291.
• Чжа Дж., Харада Х., Ян Э., Джокель Дж., Корсмейер С.Дж. (1996). «Фосфорилирование серина агониста смерти BAD в ответ на фактор выживания приводит к связыванию с 14-3-3, а не с BCL-X (L)». Клетка. 87 (4): 619–28. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81382-3. PMID  8929531. S2CID  860908.
• Ван Х. Г., Рапп У. Р., Рид Дж. С. (1996). «Bcl-2 нацеливает протеинкиназу Raf-1 на митохондрии». Клетка. 87 (4): 629–38. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81383-5. PMID  8929532. S2CID  16559750.
• Инохара Н., Динг Л., Чен С., Нуньес Г. (1997). «Харакири, новый регулятор гибели клеток, кодирует белок, который активирует апоптоз и селективно взаимодействует с белками, способствующими выживанию, Bcl-2 и Bcl-X (L)». EMBO J. 16 (7): 1686–94. Дои:10.1093 / emboj / 16.7.1686. ЧВК  1169772. PMID  9130713.
• Жа Дж., Харада Х., Осипов К., Джокель Дж., Ваксман Дж., Корсмейер С.Дж. (1997). «Домен BH3 BAD необходим для гетеродимеризации с BCL-XL и проапоптотической активности». J. Biol. Chem. 272 (39): 24101–4. Дои:10.1074 / jbc.272.39.24101. PMID  9305851.
• Сюй С.Ю., Кайпиа А., Чжу Л., Сюэ А.Дж. (1997). «Вмешательство в индуцированный BAD (Bcl-xL / Bcl-2 промотор смерти) апоптоз в клетках млекопитающих с помощью изоформ 14-3-3 и P11». Мол. Эндокринол. 11 (12): 1858–67. Дои:10.1210 / я.11.12.1858. PMID  9369453.
• дель Песо Л., Гонсалес-Гарсия М., Пейдж С., Эррера Р., Нуньес Г. (1997). «Интерлейкин-3-индуцированное фосфорилирование BAD через протеинкиназу Akt». Наука. 278 (5338): 687–9. Bibcode:1997Sci ... 278..687D. Дои:10.1126 / science.278.5338.687. PMID  9381178.
• Оттили С., Диаз Дж. Л., Хорн В., Чанг Дж., Ван Й., Уилсон Дж., Чанг С., Уикс С., Фриц Л. С., Олтерсдорф Т. (1997). «Димеризационные свойства человеческого BAD. Идентификация домена BH-3 и анализ его связывания с мутантными белками BCL-2 и BCL-XL». J. Biol. Chem. 272 (49): 30866–72. Дои:10.1074 / jbc.272.49.30866. PMID  9388232.
• Хуанг, округ Колумбия, Адамс Дж. М., Кори С. (1998). «Консервативный N-концевой домен BH4 гомологов Bcl-2 необходим для ингибирования апоптоза и взаимодействия с CED-4». EMBO J. 17 (4): 1029–39. Дои:10.1093 / emboj / 17.4.1029. ЧВК  1170452. PMID  9463381.
• Блюм-Йенсен П., Янкнехт Р., Хантер Т. (1998). «Рецептор набора способствует выживанию клеток посредством активации PI 3-киназы и последующего Akt-опосредованного фосфорилирования Bad на Ser136». Curr. Биол. 8 (13): 779–82. Дои:10.1016 / S0960-9822 (98) 70302-1. PMID  9651683. S2CID  15596347.
• Штробель Т., Тай Ю.Т., Корсмейер С., Каннистра С.А. (1998). «БАД частично отменяет устойчивость к паклитакселу в раковых клетках яичников человека». Онкоген. 17 (19): 2419–27. Дои:10.1038 / sj.onc.1202180. PMID  9824152.
• Сонг Q, Куанг Y, Диксит В.М., Винченц К. (1999). «Boo, новый негативный регулятор клеточной смерти, взаимодействует с Apaf-1». EMBO J. 18 (1): 167–78. Дои:10.1093 / emboj / 18.1.167. ЧВК  1171112. PMID  9878060.
• Ясуда М., Хан Дж. В., Дионн Калифорния, Бойд Дж. М., Чиннадурай Дж. (1999). «BNIP3alpha: человеческий гомолог митохондриального проапоптотического белка BNIP3». Рак Res. 59 (3): 533–7. PMID  9973195.
• Ван Х.Г., Патан Н., Этель И.М., Краевски С., Ямагути Й., Шибасаки Ф., Маккеон Ф., Бобо Т., Франке Т.Ф., Рид Дж.С. (1999). «Ca2 + -индуцированный апоптоз через дефосфорилирование BAD кальциневрином». Наука. 284 (5412): 339–43. Bibcode:1999Наука ... 284..339Вт. Дои:10.1126 / science.284.5412.339. PMID  10195903.
• Холмгрин С.П., Хуанг, округ Колумбия, Адамс Дж. М., Кори С. (1999). «Выживающая активность гомологов Bcl-2 Bcl-w и A1 лишь частично коррелирует с их способностью связывать проапоптотические члены семейства». Разница в гибели клеток. 6 (6): 525–32. Дои:10.1038 / sj.cdd.4400519. PMID  10381646.
• Острерова Н., Петручелли Л., Фаррер М., Мехта Н., Чой П., Харди Дж., Волозин Б (1999). «Альфа-синуклеин имеет физическую и функциональную гомологию с белками 14-3-3». J. Neurosci. 19 (14): 5782–91. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.19-14-05782.1999. ЧВК  6783081. PMID  10407019.
• Шайд МП, Шуберт К.М., Дуронио V (1999). «Регулирование плохого фосфорилирования и ассоциации с Bcl-x (L) киназой MAPK / Erk». J. Biol. Chem. 274 (43): 31108–13. Дои:10.1074 / jbc.274.43.31108. PMID  10521512.
• Бонни А., Брюнет А., Вест А. Е., Датта С. Р., Такасу М. А., Гринберг М. Е. (1999). «Выживанию клеток способствует сигнальный путь Ras-MAPK с помощью транскрипционно-зависимых и независимых механизмов». Наука. 286 (5443): 1358–62. Дои:10.1126 / science.286.5443.1358. PMID  10558990.

внешняя ссылка

• bcl-связанный + смерть + белок в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• Человек ПЛОХО расположение генома и ПЛОХО страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.