DDIT4 - DDIT4

DDIT4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3LQ9
Идентификаторы
Псевдонимы	DDIT4, Dig2, REDD-1, REDD1, транскрипт, индуцируемый повреждением ДНК 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 607729 MGI: 1921997 ГомолоГен: 10400 Генные карты: DDIT4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q22.1 Начните 72,273,924 бп[1] Конец 72,276,036 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 B4 Начните 59,949,669 бп[2] Конец 59,951,834 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • 14-3-3 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • митохондрия • внутриклеточный • цитозоль Биологический процесс • ответ на гипоксию • отрицательная регуляция фосфорилирования пептидил-треонина • отрицательная регуляция гликолитического процесса • путь передачи сигналов рецептора нейротрофина TRK • отрицательная регуляция передачи внутриклеточного сигнала • положительная регуляция гибели нейронов • развитие мозга • внутренний апоптотический сигнальный путь в ответ на повреждение ДНК медиатором класса p53 • апоптотический процесс • метаболический процесс активных форм кислорода • клеточная пролиферация • дифференциация нейронов • отрицательная регуляция фосфорилирования пептидил-серина • миграция нейронов • отрицательная регуляция передачи сигнала • отрицательная регуляция передачи сигналов TOR • клеточный ответ на стимул дексаметазона • защитный ответ на вирус • разборка макромолекулярного комплекса • регулирование сигнализации TOR Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	54541	74747
Ансамбль	ENSG00000168209	ENSMUSG00000020108
UniProt	Q9NX09	Q9D3F7
RefSeq (мРНК)	NM_019058	NM_029083
RefSeq (белок)	NP_061931	NP_083359
Расположение (UCSC)	Chr 10: 72.27 - 72.28 Мб	Chr 10: 59.95 - 59.95 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Транскрипт 4, индуцируемый повреждением ДНК (DDIT4) белок, также известный как белок регулируется в развитии и ответе на повреждение ДНК 1 (REDD1) это белок что у людей кодируется DDIT4 ген.^[5][6]

Функция

DDIT4 действует как негативный регулятор mTOR,^[7] серин / треонинкиназа, которая регулирует различные клеточные функции, такие как рост, пролиферация и аутофагия.^[8] В частности, повышенная регуляция HIF-1 в ответ на гипоксия активирует DDIT4,^[5] приводящий к активации Tsc1 / 2 через 14–3–3 челнока ^[9] и последующее подавление mTOR через Реб.^[10] Было показано, что помимо гипоксии экспрессия DDIT4 активируется повреждением ДНК.^[11] и энергетический стресс.^[12]

Клиническое значение

Клинический интерес к DDIT4 основан прежде всего на его влиянии на mTOR, которое связано со старением.^[13] и связаны с такими заболеваниями, как туберозный склероз, лимфангиолейомиоматоз,^[14] сахарный диабет,^[13] и рак. В частности, сверхактивация mTOR при многих типах рака^[8] привел к развитию ингибиторы mTOR для лечение рака. DDIT4 начал привлекать внимание в этом отношении через лекарство от диабета. Метформин который, как было показано, снижает риск рака и увеличивает экспрессию DDIT4.^[15]

Смотрите также

• HIF1A
• Белок туберозного склероза
• MTOR
• 14-3-3 белок
• DDIT4L / REDD2

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000168209 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020108 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Шошани Т., Фаерман А., Метт И., Зелин Е., Тенне Т., Городин С., Мошель Ю., Эльбаз С., Буданов А., Чаджут А., Калински Х., Камер И., Розен А., Мор О, Кешет Е., Лешковиц Д., Эйнат П. , Скалитер Р., Файнштейн Э. (апрель 2002 г.). «Идентификация нового гена, индуцируемого гипоксией фактора 1, RTP801, участвующего в апоптозе». Молекулярная и клеточная биология. 22 (7): 2283–93. Дои:10.1128 / MCB.22.7.2283-2293.2002. ЧВК  133671. PMID  11884613.
6. «Ген Entrez: транскрипт 4, индуцируемый повреждением ДНК DDIT4».
7. Софер А., Лей К., Йоханнесен К.М., Эллисен Л.В. (июль 2005 г.). «Регулирование mTOR и роста клеток в ответ на энергетический стресс с помощью REDD1». Молекулярная и клеточная биология. 25 (14): 5834–45. Дои:10.1128 / MCB.25.14.5834-5845.2005. ЧВК  1168803. PMID  15988001.
8. Сато Т., Накашима А., Го Л., Коффман К., Таманой Ф. (май 2010 г.). «Изменения отдельных аминокислот, которые вызывают конститутивную активацию mTOR, обнаружены при раке человека». Онкоген. 29 (18): 2746–52. Дои:10.1038 / onc.2010.28. ЧВК  2953941. PMID  20190810.
9. Депутат ДеЯнга, Хорак П., Софер А., Сгрой Д., Эллисен Л.В. (январь 2008 г.). «Гипоксия регулирует передачу сигналов TSC1 / 2-mTOR и подавление опухоли посредством REDD1-опосредованного перемещения 14-3-3». Гены и развитие. 22 (2): 239–51. Дои:10.1101 / gad.1617608. ЧВК  2192757. PMID  18198340.
10. Иноки К., Ли И, Сюй Т., Гуань К.Л. (август 2003 г.). «Rheb GTPase является прямой мишенью для активности TSC2 GAP и регулирует передачу сигналов mTOR». Гены и развитие. 17 (15): 1829–34. Дои:10.1101 / gad.1110003. ЧВК  196227. PMID  12869586.
11. Эллисен Л.В., Рамсайер К.Д., Йоханнесен К.М., Ян А., Беппу Х., Минда К., Олинер Дж. Д., МакКеон Ф., Хабер Д.А. (ноябрь 2002 г.). «REDD1, онтогенетически регулируемая транскрипционная мишень p63 и p53, связывает p63 с регуляцией активных форм кислорода». Молекулярная клетка. 10 (5): 995–1005. Дои:10.1016 / S1097-2765 (02) 00706-2. PMID  12453409.
12. МакГи Н.К., Джефферсон Л.С., Кимбалл С.Р. (май 2009 г.). «Повышенный уровень кортикостерона, связанный с голоданием, усиливает экспрессию в скелетных мышцах крыс репрессора mTORC1, REDD1». Журнал питания. 139 (5): 828–834. Дои:10.3945 / jn.108.099846. ЧВК  2714387. PMID  19297425.
13. Зонджу Р., Эфеян А., Сабатини Д.М. (январь 2011 г.). «mTOR: от интеграции сигналов роста к раку, диабету и старению». Обзоры природы Молекулярная клеточная биология. 12 (1): 21–35. Дои:10.1038 / nrm3025. ЧВК  3390257. PMID  21157483.
14. Сарбасов Д.Д., Али С.М., Сабатини Д.М. (декабрь 2005 г.). «Растущие роли пути mTOR». Текущее мнение в области клеточной биологии. 17 (6): 596–603. Дои:10.1016 / j.ceb.2005.09.009. PMID  16226444.
15. Бен Сахра I, Регаззетти С., Роберт Дж., Лоран К., Ле Маршан-Брюстель И., Обергер П., Танти Дж. Ф., Джорджетти-Перальди С., Бост Ф (июль 2011 г.). «Метформин, независимо от AMPK, индуцирует ингибирование mTOR и остановку клеточного цикла посредством REDD1». Исследования рака. 71 (13): 4366–72. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-10-1769. PMID  21540236.

дальнейшее чтение

• Эллисен Л.В. (ноябрь 2005 г.). «Контроль роста в условиях стресса: регуляция mTOR посредством пути REDD1-TSC». Клеточный цикл. 4 (11): 1500–02. Дои:10.4161 / cc.4.11.2139. PMID  16258273.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO отчеты. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Ким Дж. Р., Ли С. Р., Чанг Х. Дж., Ким С., Пэк Ш., Ким Дж. Х., Ким И. С. (октябрь 2003 г.). «Идентификация генов, чувствительных к амилоидному бета-пептиду, с помощью технологии микрочипов кДНК: участие RTP801 в токсичности амилоидного бета-пептида». Экспериментальная и молекулярная медицина. 35 (5): 403–11. Дои:10.1038 / emm.2003.53. PMID  14646594.
• Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С., Лей С., Мурадж Дж., Фиск Дж. Дж., Ли И, Сюй Ц., Фанг Р., Гуглер К., Рао М. С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л. В. (июнь 2004 г.). «Характеристика транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Природа Биотехнологии. 22 (6): 707–16. Дои:10.1038 / nbt971. PMID  15146197. S2CID  27764390.
• Ли М., Бикрам М., О С., Бык Д.А., Ким С.В. (май 2004 г.). «Sp1-зависимая регуляция промотора RTP801 и ее применение в индуцируемой гипоксией плазмиде VEGF при ишемической болезни». Фармацевтические исследования. 21 (5): 736–41. Дои:10.1023 / B: PHAM.0000026421.09367.b3. PMID  15180327. S2CID  21039750.
• Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Шварцер Р., Тондера Д., Арнольд В., Гизе К., Клиппель А., Кауфманн Дж. (Февраль 2005 г.). «REDD1 интегрирует опосредованную гипоксией передачу сигналов выживания после фосфатидилинозитол-3-киназы». Онкоген. 24 (7): 1138–49. Дои:10.1038 / sj.onc.1208236. PMID  15592522.
• Коррадетти М.Н., Иноки К., Гуан К.Л. (март 2005 г.). «Стресс-индуцированные белки RTP801 и RTP801L являются негативными регуляторами мишени рапамицинового пути у млекопитающих». Журнал биологической химии. 280 (11): 9769–72. Дои:10.1074 / jbc.C400557200. PMID  15632201.
• Софер А., Лей К., Йоханнесен К.М., Эллисен Л.В. (июль 2005 г.). «Регулирование mTOR и роста клеток в ответ на энергетический стресс с помощью REDD1». Молекулярная и клеточная биология. 25 (14): 5834–45. Дои:10.1128 / MCB.25.14.5834-5845.2005. ЧВК  1168803. PMID  15988001.
• О Дж.Х., Ян Джо, Хан И, Ким М.Р., Бён С.С., Чон Й.Дж., Ким Дж.М., Сон К.С., Но С.М., Ким С., Ю HS, Ким Ю.С., Ким Н.С. (декабрь 2005 г.). «Транскриптомный анализ рака желудка человека». Геном млекопитающих. 16 (12): 942–54. Дои:10.1007 / s00335-005-0075-2. PMID  16341674. S2CID  69278.
• Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. (январь 2006 г.) «База данных LIFEdb в 2006 году». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Дж., Руал Дж. Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Е., Барабаши А.Л., Видал М., Зогби Х.Ю. «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Ячейка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Малагелада К., Рю Э.Дж., Бисвас С.К., Джексон-Льюис В., Грин Л.А. (сентябрь 2006 г.). «Уровень RTP801 повышен в нейронах черного вещества мозга Паркинсона и опосредует смерть в клеточных моделях болезни Паркинсона с помощью механизма, включающего в себя мишень для инактивации рапамицина у млекопитающих». Журнал неврологии. 26 (39): 9996–10005. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.3292-06.2006. ЧВК  6674487. PMID  17005863.
• Джин Хо, Ан С., Ли ХК, Ву Ш, Со СК, Чхве ТБ и др. (Июль 2007 г.). «Гипоксическое состояние и индуцированная высокой плотностью клеток экспрессия Redd1 регулируется активацией индуцируемого гипоксией фактора-1альфа и Sp1 через сигнальный путь фосфатидилинозитол-3-киназы / Akt». Сотовая связь. 19 (7): 1393–403. Дои:10.1016 / j.cellsig.2006.12.014. PMID  17307335.