Emerin - Emerin

EMD
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1JEI, 2ODC, 2ODG
Идентификаторы
Псевдонимы	EMD, EDMD, LEMD5, STA, Emerin
Внешние идентификаторы	OMIM: 300384 MGI: 108117 ГомолоГен: 91 Генные карты: EMD
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq28 Начните 154,379,273 бп[1] Конец 154,381,523 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X A7,3 | X 37,92 см Начните 74,254,687 бп[2] Конец 74,261,548 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание бета-тубулина • связывание актина • связывание кадгерина Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • не мембрана • мембрана • внутренняя ядерная мембрана • эндоплазматический ретикулум • микротрубочки • внешняя ядерная мембрана • ядро клетки • нуклеоплазма • цитоплазма • ядерная оболочка • центросома полюса веретена • кортикальный эндоплазматический ретикулум • шпиндель Биологический процесс • сокращение мышц • регуляция канонического пути передачи сигналов Wnt • клеточный ответ на стимул фактора роста • развитие мышечных органов • положительное регулирование экспорта белка из ядра • разборка митотической ядерной оболочки • дифференциация клеток скелетных мышц • повторная сборка митотической ядерной оболочки • отрицательная регуляция пролиферации фибробластов • отрицательная регуляция канонического сигнального пути Wnt Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2010	13726
Ансамбль	ENSG00000102119	ENSMUSG00000001964
UniProt	P50402	O08579
RefSeq (мРНК)	NM_000117	NM_007927
RefSeq (белок)	NP_000108	NP_031953
Расположение (UCSC)	Chr X: 154,38 - 154,38 Мб	Chr X: 74,25 - 74,26 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Emerin белок, который у человека кодируется EMD ген, также известный как STA ген. Эмерин вместе с LEMD3, является доменом LEM, содержащим интеграл белок из внутренний ядерный мембрана у позвоночных. Emerin сильно выражен в сердечный и скелетная мышца. В сердечная мышца, Emerin локализуется на прилипает к стыкам в пределах вставные диски где он, по-видимому, действует в механотрансдукции клеточного штамма и в бета-катенин сигнализация. Мутации в причинах возникновения Х-сцепленный рецессивный Мышечная дистрофия Эмери – Дрейфуса, нарушения сердечной проводимости и дилатационная кардиомиопатия.

Он назван в честь Алан Эмери.^[5]

Структура

Эмерин представляет собой 29,0 кДа (наблюдаемая молекулярная масса 34 кДа). белок состоит из 254 аминокислоты.^[6] Эмерин серин -богатые белок с N-концевой 20-аминокислота гидрофобная область, окруженная заряженными остатками; гидрофобная область может быть важной для закрепления белок к мембране, причем заряженные концевые хвосты являются цитозольными.^[7] В сердечный, скелетный, и гладкая мышца, Emerin локализуется во внутреннем ядерная мембрана;^[8][9] экспрессия эмерина наиболее высока в скелетный и сердечная мышца.^[7] В сердечная мышца в частности, Emerin также находится в прилипает к стыкам в пределах вставные диски.^[10][11][12]

Функция

Эмерин серин -богатый белок ядерной мембраны и член ядерная пластинка -ассоциированное семейство белков. Он обеспечивает закрепление мембраны на цитоскелет. Мышечная дистрофия Эмери – Дрейфуса является Х-сцепленным наследственным дегенеративным миопатия в результате мутации в EMD (также известный как STA) ген.^[13] Эмерин, по-видимому, участвует в механотрансдукции, как и у мышей с дефицитом эмерина. фибробласты не удалось преобразовать нормальные ответы экспрессии механочувствительных генов на стимулы напряжения.^[14] В сердечная мышца, Emerin также находится в комплексе с бета-катенин в прилипает к стыкам из вставные диски, и кардиомиоциты из сердец, лишенных эмерина, показал бета-катенин перераспределение, а также возмущенные вставной диск архитектура и форма миоцитов. Это взаимодействие, по-видимому, регулируется киназа гликогенсинтазы 3 бета.^[15]

Клиническое значение

Мутации в причинах возникновения Х-сцепленный рецессивный Мышечная дистрофия Эмери – Дрейфуса, который характеризуется ранними контрактурами ахилловых сухожилий, локтей и пост-шейных мышц; мышечная слабость проксимально в верхних конечностях и дистально в нижних конечностях; наряду с дефектами сердечной проводимости, которые варьируются от синусовая брадикардия, PR продление завершить блокада сердца.^[16] У этих пациентов иммуноокрашивание эмерина теряется в различных тканях, включая мышцы, кожу. фибробласты, и лейкоциты однако диагностические протоколы включают анализ мутаций, а не окрашивание белков.^[16] Почти во всех случаях мутации приводят к полной делеции или неопределяемому уровню Emerin. белок. Примерно в 20% случаев имеются Х-хромосомы с инверсией в области Xq28.^[17]

Более того, недавние исследования показали, что отсутствие функционального эмерина может снизить инфекционность ВИЧ-1. Таким образом, предполагается, что пациенты, страдающие мышечной дистрофией Эмери-Дрейфуса, могут иметь иммунитет к ВИЧ-1 или проявлять нерегулярный характер инфекции.^[18]

Взаимодействия

Эмерин был показан взаимодействовать с:

• ACTA1,^[19]
• ACTG2,^[19]
• BANF1,^[20][21]
• BCLAF1,^[22]
• CTNNB1,^[11][23]
• GMCL1,^[21]
• LMNA,^{[19][24][25][26]}
• PSME1,^[24]
• SYNE1,^[27][28][29]
• SYNE2,^[27][29][30]
• TMEM43,^[31] и
• YTHDC1.^[24]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000102119 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001964 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Питер Харпер; Лоис Рейнольдс; Тилли Тэнси, ред. (2010), Клиническая генетика в Великобритании: истоки и развитие, Добро пожаловать, свидетели современной медицины, История современной исследовательской группы биомедицины, стр. 118–119, ISBN  978-0-85484-127-1, Викиданные  Q29581774
6. «Белковая последовательность EMD человека (Uniprot ID: P50402)». Атлас кардиоорганических белков (COPaKB). Архивировано из оригинал 4 марта 2016 г.. Получено 16 сентября 2015.
7. Bione S, Maestrini E, Rivella S, Mancini M, Regis S, Romeo G, Toniolo D (декабрь 1994 г.). «Идентификация нового X-сцепленного гена, ответственного за мышечную дистрофию Эмери-Дрейфуса». Природа Генетика. 8 (4): 323–7. Дои:10.1038 / ng1294-323. PMID  7894480.
8. Нагано А., Кога Р., Огава М., Курано Ю., Кавада Дж., Окада Р., Хаяси Ю. К., Цукахара Т., Арахата К. (март 1996 г.). «Дефицит эмерина на ядерной мембране у пациентов с мышечной дистрофией Эмери-Дрейфуса». Природа Генетика. 12 (3): 254–9. Дои:10.1038 / ng0396-254. PMID  8589715.
9. Manilal S, Nguyen TM, Sewry CA, Morris GE (июнь 1996 г.). «Белок мышечной дистрофии Эмери-Дрейфуса, эмерин, является белком ядерной мембраны». Молекулярная генетика человека. 5 (6): 801–8. Дои:10,1093 / чмг / 5,6.801. PMID  8776595.
10. Картеньи Л., ди Барлетта М.Р., Баррези Р., Скварцони С., Сабателли П., Маральди Н., Мора М., Ди Блази К., Корнелио Ф, Мерлини Л., Вилла А, Кобианки Ф, Тониоло Д. (декабрь 1997 г.). «Сердечная локализация эмерина: новое понимание мышечной дистрофии Эмери-Дрейфуса». Молекулярная генетика человека. 6 (13): 2257–64. Дои:10.1093 / hmg / 6.13.2257. PMID  9361031.
11. Уилер М.А., Уорли А., Робертс Р.Г., Элер Е., Эллис Дж. А. (март 2010 г.). «Идентификация комплекса эмерин-бета-катенин в сердце, важного для архитектуры интеркалированного диска и локализации бета-катенина». Клеточные и молекулярные науки о жизни. 67 (5): 781–96. Дои:10.1007 / s00018-009-0219-8. PMID  19997769.
12. Manilal S, Sewry CA, Pereboev A, Man N, Gobbi P, Hawkes S, Love DR, Morris GE (февраль 1999 г.). «Распределение эмерина и ламинов в сердце и последствия для мышечной дистрофии Эмери-Дрейфуса». Молекулярная генетика человека. 8 (2): 353–9. Дои:10,1093 / чмг / 8.2.353. PMID  9949197.
13. «Ген Entrez: EMD Emerin (мышечная дистрофия Эмери-Дрейфуса)».
14. Ламмердинг, Дж; Сяо, Дж; Шульце, ПК; Козлов, С; Стюарт, К.Л .; Ли, RT (29 августа 2005 г.). «Аномальная форма ядра и нарушение механотрансдукции в эмерерин-дефицитных клетках». Журнал клеточной биологии. 170 (5): 781–91. Дои:10.1083 / jcb.200502148. ЧВК  2171355. PMID  16115958.
15. Уиллер, Массачусетс; Уорли, А; Робертс, Р.Г.; Ehler, E; Эллис, Дж. А. (март 2010 г.). «Идентификация комплекса эмерин-бета-катенин в сердце, важного для архитектуры интеркалированного диска и локализации бета-катенина». Клеточные и молекулярные науки о жизни. 67 (5): 781–96. Дои:10.1007 / s00018-009-0219-8. PMID  19997769.
16. Эмери А.Е. (июнь 2000 г.). «Мышечная дистрофия Эмери – Дрейфуса - 40-летняя ретроспектива». Нервно-мышечные расстройства. 10 (4–5): 228–32. Дои:10.1016 / s0960-8966 (00) 00105-х. PMID  10838246.
17. Small K, Warren ST (январь 1998 г.). «Emerin делеции, встречающиеся на обоих инверсионных фонах Xq28». Молекулярная генетика человека. 7 (1): 135–9. Дои:10.1093 / hmg / 7.1.135. PMID  9384614.
18. Ли М., Крейги Р. (июнь 2006 г.). «Вирусология: ВИЧ становится ядерным». Природа. 441 (7093): 581–2. Bibcode:2006Натура.441..581L. Дои:10.1038 / 441581a. PMID  16738646.
19. Латтанци Г., Ценни В., Мармироли С., Капанни С., Маттиоли Е., Мерлини Л., Скварцони С., Маральди Н. М. (апрель 2003 г.). «Ассоциация эмерина с ядерным и цитоплазматическим актином регулируется при дифференцировке миобластов». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 303 (3): 764–70. Дои:10.1016 / s0006-291x (03) 00415-7. PMID  12670476.
20. Берк Дж. М., Саймон Д. Н., Дженкинс-Хук С. Р., Вестербек Дж. В., Грённинг-Ван Л. М., Карлсон С. Р., Уилсон К. Л. (сентябрь 2014 г.). «Молекулярные основы взаимодействий эмерин-эмерин и эмерин-BAF». Журнал клеточной науки. 127 (Pt 18): 3956–69. Дои:10.1242 / jcs.148247. ЧВК  4163644. PMID  25052089.
21. Холаска Дж. М., Ли К. К., Ковальски А. К., Уилсон К. Л. (февраль 2003 г.). «Бесклеточный репрессор транскрипции (GCL) и барьер для фактора аутоинтеграции (BAF) конкурируют за связывание с Emerin in vitro». Журнал биологической химии. 278 (9): 6969–75. Дои:10.1074 / jbc.M208811200. PMID  12493765.
22. Haraguchi T, Holaska JM, Yamane M, Koujin T., Hashiguchi N, Mori C., Wilson KL, Hiraoka Y (март 2004 г.). «Связывание Emerin с Btf, вызывающим смерть транскрипционным репрессором, нарушается миссенс-мутацией, которая вызывает мышечную дистрофию Emery-Dreifuss». Европейский журнал биохимии / FEBS. 271 (5): 1035–45. Дои:10.1111 / j.1432-1033.2004.04007.x. PMID  15009215.
23. Маркевич Э., Тилгнер К., Баркер Н., ван де Ветеринг М., Клеверс Х., Доробек М., Хаусманова-Петрусевич I, Рамакерс ФК, Броерс Дж. Л., Бланкестейн В. М., Салпингиду Дж., Уилсон Р. Г., Эллис Дж. А., Хатчисон С. Дж. (Июль 2006 г.). «Белок внутренней ядерной мембраны эмерин регулирует активность бета-катенина, ограничивая его накопление в ядре». Журнал EMBO. 25 (14): 3275–85. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601230. ЧВК  1523183. PMID  16858403.
24. Wilkinson FL, Holaska JM, Zhang Z, Sharma A, Manilal S, Holt I, Stamm S, Wilson KL, Morris GE (июнь 2003 г.). «Emerin взаимодействует in vitro с фактором, связанным со сплайсингом, YT521-B». Европейский журнал биохимии / FEBS. 270 (11): 2459–66. Дои:10.1046 / j.1432-1033.2003.03617.x. PMID  12755701.
25. Сакаки М., Коике Х., Такахаши Н., Сасагава Н., Томиока С., Арахата К., Ишиура С. (февраль 2001 г.). «Взаимодействие эмерина с ядерными ламинами». Журнал биохимии. 129 (2): 321–7. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a002860. PMID  11173535.
26. Клементс Л., Манилал С., Лав Д.Р., Моррис Г.Е. (январь 2000 г.). «Прямое взаимодействие между эмерином и ламином А». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 267 (3): 709–14. Дои:10.1006 / bbrc.1999.2023. PMID  10673356.
27. Zhang Q, Skepper JN, Yang F, Davies JD, Hegyi L, Roberts RG, Weissberg PL, Ellis JA, Shanahan CM (декабрь 2001 г.). «Nesprins: новое семейство белков, содержащих повторы спектрина, которые локализуются на ядерной мембране во многих тканях». Журнал клеточной науки. 114 (Pt 24): 4485–98. PMID  11792814.
28. Mislow JM, Holaska JM, Kim MS, Lee KK, Segura-Totten M, Wilson KL, McNally EM (август 2002 г.). «Nesprin-1alpha самоассоциируется и непосредственно связывается с эмерином и ламином A in vitro». Письма FEBS. 525 (1–3): 135–40. Дои:10.1016 / s0014-5793 (02) 03105-8. PMID  12163176.
29. Уилер М.А., Дэвис Дж. Д., Чжан К., Эмерсон Л. Дж., Хант Дж., Шанахан К. М., Эллис Дж. А. (август 2007 г.). «Определенные функциональные домены в несприн-1альфа и несприн-2бета связываются непосредственно с эмерином, и оба взаимодействия нарушаются при X-связанной мышечной дистрофии Эмери-Дрейфуса». Экспериментальные исследования клеток. 313 (13): 2845–57. Дои:10.1016 / j.yexcr.2007.03.025. PMID  17462627.
30. Zhang Q, Ragnauth CD, Skepper JN, Worth NF, Warren DT, Roberts RG, Weissberg PL, Ellis JA, Shanahan CM (февраль 2005 г.). «Nesprin-2 - это мульти-изомерный белок, который связывает ламин и эмерин в ядерной оболочке и образует субклеточную сеть в скелетных мышцах». Журнал клеточной науки. 118 (Pt 4): 673–87. Дои:10.1242 / jcs.01642. PMID  15671068.
31. Bengtsson L, Otto H (февраль 2008 г.). «LUMA взаимодействует с эмерином и влияет на его распределение на внутренней ядерной мембране». Журнал клеточной науки. 121 (Pt 4): 536–48. Дои:10.1242 / jcs.019281. PMID  18230648.

дальнейшее чтение

• Гант TM, Уилсон К.Л. (1998). «Ядерная сборка». Анну. Rev. Cell Dev. Биол. 13: 669–95. Дои:10.1146 / annurev.cellbio.13.1.669. PMID  9442884.
• Хелблинг-Леклерк А., Бонне Г., Шварц К. (2002). «Мышечная дистрофия Эмери – Дрейфуса». Евро. J. Hum. Genet. 10 (3): 157–61. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5200744. PMID  11973618.
• Холаска Дж. М., Уилсон К. Л. (2006). «Множественные роли для Emerin: последствия для мышечной дистрофии Эмери-Дрейфуса». Анатомическая запись, часть A: открытия в молекулярной, клеточной и эволюционной биологии. 288 (7): 676–80. Дои:10.1002 / ar.a.20334. ЧВК  2559942. PMID  16761279.
• Бионе С, Таманини Ф, Маэстрини Э, Трибиоли С, Поустка А, Торри Г, Ривелла С, Тониоло Д. (1994). "Транскрипционная организация области 450 т.п.н. Х-хромосомы человека в Xq28". Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 90 (23): 10977–81. Дои:10.1073 / пнас.90.23.10977. ЧВК  47904. PMID  8248200.
• Бион С., Смолл К., Аксманович В. М., Д'Урсо М., Чиккодикола А., Мерлини Л., Моранди Л., Кресс В., Йейтс Дж. Р., Уоррен С. Т. (1996). «Идентификация новых мутаций в гене мышечной дистрофии Эмери-Дрейфуса и доказательства генетической гетерогенности заболевания». Гм. Мол. Genet. 4 (10): 1859–63. Дои:10.1093 / hmg / 4.10.1859. PMID  8595407.
• Ямада Т., Кобаяши Т. (1996). «Новая мутация Emerin у японского пациента с мышечной дистрофией Эмери-Дрейфуса». Гм. Genet. 97 (5): 693–4. Дои:10.1007 / BF02281886. PMID  8655156.
• Chen EY, Zollo M, Mazzarella R, Ciccodicola A, Chen CN, Zuo L, Heiner C, Burough F, Repetto M, Schlessinger D, D'Urso M (1997). «Анализ дальнейших последовательностей в Xq28: тринадцать известных и шесть генов-кандидатов в 219,4 т.п.н. ДНК с высоким содержанием GC между локусами RCP / GCP и G6PD». Гм. Мол. Genet. 5 (5): 659–68. Дои:10,1093 / hmg / 5.5.659. PMID  8733135.
• Эллис Дж. А., Кракстон М, Йейтс Дж. Р., Кендрик-Джонс Дж. (1998). «Аберрантное внутриклеточное нацеливание и зависимое от клеточного цикла фосфорилирование эмерина вносят вклад в фенотип мышечной дистрофии Эмери-Дрейфуса». J. Cell Sci. 111 (6): 781–92. PMID  9472006.
• Squarzoni S, Sabatelli P, Ognibene A, Toniolo D, Cartegni L, Cobianchi F, Petrini S, Merlini L, Maraldi NM (1998). «Иммуноцитохимическое обнаружение эмерина в ядерном матриксе». Neuromuscul. Disord. 8 (5): 338–44. Дои:10.1016 / S0960-8966 (98) 00031-5. PMID  9673989.
• Эллис Дж. А., Йетс Дж. Р., Кендрик-Джонс Дж., Браун Калифорния (1999). «Изменения в P183 эмерина ослабляют его белок-белковые взаимодействия, что приводит к X-связанной мышечной дистрофии Эмери-Дрейфуса». Гм. Genet. 104 (3): 262–8. Дои:10.1007 / s004390050946. PMID  10323252.
• Squarzoni S, Sabatelli P, Capanni C, Petrini S, Ognibene A, Toniolo D, Cobianchi F, Zauli G, Bassini A, Baracca A, Guarnieri C, Merlini L, Maraldi NM (2001). «Наличие эмерина в тромбоцитах». Acta Neuropathol. 100 (3): 291–8. Дои:10.1007 / s004019900169. PMID  10965799.
• Мартинс С.Б., Эйде Т., Стин Р.Л., Янсен Т., Сколхегг Б.С., Коллас П. (2001). «HA95 - это белок хроматина и ядерного матрикса, регулирующий динамику ядерной оболочки». J. Cell Sci. 113 (21): 3703–13. PMID  11034899.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Лагури К., Жилкин Б., Вольф Н., Роми-Лебрен Р., Курчай К., Каллебаут I, Ворман Г.Дж., Зинн-Джастин С. «Структурная характеристика мотива LEM, общего для трех белков внутренней ядерной мембраны человека». Структура. 9 (6): 503–11. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00611-6. PMID  11435115.

внешняя ссылка

• GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о мышечной дистрофии Эмери – Дрейфуса
• EMD + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)