Семейство гликозидгидролаз 15 - Glycoside hydrolase family 15 - Wikipedia
| Семейство гликозилгидролаз 15 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_15 | ||||||||
| Pfam | PF00723 | ||||||||
| Pfam клан | CL0059 | ||||||||
| SCOP2 | 1глм / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| CAZy | GH15 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии семейство гликозидгидролаз 15 это семья из гликозидгидролазы.
Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать то гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7] y [_] 9
Семейство гликозидгидролаз 15 CAZY GH_15 содержит ферменты с несколькими известными активностями; глюкоамилаза (EC 3.2.1.3 ); альфа-глюкозидаза (EC 3.2.1.20 ); глюкодекстраназа (EC 3.2.1.70 ).
Глюкоамилаза (GA) катализирует высвобождение D-глюкоза из невосстанавливающих концов крахмала и других олиго- или полисахаридов. Исследования грибковый GA указала на 3 тесно сгруппированных кислотных остатка, которые играют роль в каталитическом механизме.[8] Эта область также является консервативной в недавно секвенированном бактериальном GA.[9]
Трехмерная структура псевдо-тетрасахарид акарбоз в комплексе с глюкоамилазой II (471) из Aspergillus awamori var. X100 определился на 2.4А разрешающая способность.[10] Белок относится в основном к альфа-классу и содержит 19 спирали и 9 пряди.
Рекомендации
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК 41477. PMID 7624375.
- ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2) (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Проблема с базой данных): D490-5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК 3965031. PMID 24270786.
- ^ «Семейство гликозид гидролаз 15». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. HDL:21.11116 / 0000-0003-B7EB-6. PMID 29040563.
- ^ Сиркс М.Р., Форд С., Рейли П.Дж., Свенссон Б. (январь 1990 г.). «Каталитический механизм грибковой глюкоамилазы, как определено мутагенезом Asp176, Glu179 и Glu180 в ферменте из Aspergillus awamori». Белковая инженерия. 3 (3): 193–8. Дои:10.1093 / белок / 3.3.193. PMID 1970434.
- ^ Охниши Х., Китамура Х., Минова Т., Сакаи Х., Охта Т. (июль 1992 г.). «Молекулярное клонирование гена глюкоамилазы из термофильного Clostridium и кинетика клонированного фермента». Европейский журнал биохимии. 207 (2): 413–8. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1992.tb17064.x. PMID 1633799.
- ^ Алешин А.Е., Фирсов Л.М., Хонзатко Р.Б. (июнь 1994 г.). «Усовершенствованная структура комплекса акарбозы с глюкоамилазой из Aspergillus awamori var. X100 с разрешением 2,4-А». Журнал биологической химии. 269 (22): 15631–9. PMID 8195212.
