Гаплогруппа E (мтДНК) - Haplogroup E (mtDNA)

Эта статья о гаплогруппе мтДНК человека. Для гаплогруппы Y-ДНК человека см. Гаплогруппа E-M96.
Гаплогруппа E
Возможное время происхождения35,000[1] до 8000[2] YBP
Возможное место происхожденияВосток Сундаленд[1] или же Фуцзянь морской берег[2]
ПредокM9
ПотомкиE1, E2
Определение мутаций3027, 3705, 7598, 13626, 16390[3]

В митохондриальная генетика человека, гаплогруппа E это гаплогруппа митохондриальной ДНК человека (мтДНК) типично для Малайский архипелаг. Это подгруппа гаплогруппа M9.

Источник

Было сделано два противоположных предложения относительно места и времени происхождения гаплогруппы E. Согласно одной из точек зрения, клады сформировались более 30 000 лет назад, примерно во времена Последний ледниковый максимум, на северо-восточном побережье Сундаленд (около современного Борнео В этой модели гаплогруппа была рассеяна в результате повышения уровня моря во время Поздний ледниковый период период.[1][4]

В 2014 году митохондриальная ДНК скелета возрастом 8000 лет была обнаружена на Остров Лян, один из Острова Мацу у побережья юго-восточного Китая, было обнаружено, что он принадлежит к гаплогруппе E, с двумя из четырех мутаций, характерных для подгруппы E1. На основании этого Ко и его коллеги утверждают, что гаплогруппа E возникла 8000-11000 лет назад недалеко от севера. Фуцзянь побережье, отправился на Тайвань с поселенцами эпохи неолита 6000 лет назад, а оттуда распространился в Приморскую Юго-Восточную Азию с Австронезийский язык разгон.[2]Соарес и др. Предостерегают от чрезмерного акцента на одной выборке и утверждают, что молекулярные часы подразумевает, что более ранняя дата (и более южное происхождение) остается более вероятной.[5]

Распределение

Гаплогруппа E встречается повсюду Приморская Юго-Восточная Азия.[4]Он почти отсутствует на материковой части Восточной Азии, где распространена его сестринская группа M9a (также найденная в Японии).[4][6]В частности, он встречается среди носителей Австронезийские языки, и он редко встречается даже в Юго-Восточной Азии среди членов других языковых семей. Обнаружен в популяциях Тайвань, то Филиппины, Индонезия, Малайзия (включая Сабах из Борнео, но не Оранг Асли полуострова Малайзия), прибрежная Папуа - Новая Гвинея, и особенно в Чаморро из Марианские острова.[4][7][8][9][10][11]

Из четырех основных субкладов E1b и E2a находятся в основном в Приморской Юго-Восточной Азии, в то время как только E1a и E2b также встречаются на Тайване.[12]E2b имеет низкое разнообразие на Тайване, что позволяет предположить, что он появился там около 5000 лет назад.[12]Наиболее распространенный субклад E, E1a1a, имеет наибольшее разнообразие на Тайване, за ним следуют Филиппины и Сулавеси. Более того, другие ветви E1a1 в значительной степени ограничены Тайванем.[13]

Частоты мтДНК гаплогруппы E
численность населенияЧастотаСчитатьИсточникПодтипы
Чаморро (85 Гуам, 14 Сайпан, & 6 Рота )0.924105Вилар и др., 2013 г.E2a = 68, E1a2 = 29
Восточно-индонезийский (Сулавеси, в т.ч. 89 Манадо, 64 Тораджа, 46 Уджунг Паданг, & 38 Палу )0.266237Хилл и др. 2007E1a = 42, E1b = 9, E2 = 7, E1 (xE1a, E1b) = 5
Филиппинский (Минданао )0.21470Таббада и др., 2010 г., п. 24E1a1a = 10, E2 (xE2b) = 4, E1b = 1
Филиппинский (Visayas )0.214112Таббада и др., 2010 г., п. 24E1a1a = 18, E2 (xE2b) = 5, E1 (xE1a1a, E1a2, E1b) = 1
Восточно-индонезийский (Амбон )0.16343Хилл и др. 2007E1 (xE1a, E1b) = 3, E1a = 2, E2 = 2
Восточно-индонезийский (Waingapu, Сумба )0.16050Хилл и др. 2007E1b = 6, E1a = 1, E2 = 1
Индонезийский (Бангка )0.14734Хилл и др., 2006 г.E = 5
Борнео (89 Банджармасин & 68 Кота-Кинабалу )0.146157Хилл и др. 2007E1a = 14, E2 = 5, E1b = 3, E1 (xE1a, E1b) = 1
Филиппинский0.12564Таббада и др., 2010 г., п. 24E1a1a = 5, E2 (xE2b) = 2, E1a2 = 1
Филиппинский (Лусон )0.124177Таббада и др., 2010 г., п. 24E1a1a = 14, E1b = 5, E2 (xE2b) = 2, E2b = 1
Тайвань (абориген)0.120640Peng et al 2011E = 77
Восточно-индонезийский (Алор )0.11145Хилл и др. 2007E1a = 3, E1b = 2
Восточно-индонезийский (Матарам, Ломбок )0.09144Хилл и др. 2007E1b = 3, E1a = 1
Индонезийский (Паданг, Суматра )0.08324Хилл и др., 2006 г.E = 2
Индонезийский (Медан, Суматра )0.07142Хилл и др., 2006 г.E = 3
Индонезийский (Пеканбару, Медан, Бангка, Палембанг, & Паданг )0.067180Хилл и др. 2007E1a = 6, E1b = 4, E1 (xE1a, E1b) = 1, E2 = 1
Индонезийский (Бали )0.06182Хилл и др. 2007E1a = 3, E1b = 1, E1 (xE1a, E1b) = 1
Филиппинский (Палаван )0.05020Скоулз и др., 2011 г.E1a = 1
Индонезийский (Палембанг, Суматра )0.03628Хилл и др., 2006 г.E = 1
Tujia (Уезд Яньхэ, Гуйчжоу )0.03429Ли и др., 2007 г.E = 1
Гелао (Округ Даочжэнь, Гуйчжоу)0.03231Ли и др., 2007 г.E = 1
Индонезийский (Ява, в т.ч. 36 из Тенгер )0.02246Хилл и др. 2007E1b = 1
Индонезийский (Пеканбару, Суматра )0.01952Хилл и др., 2006 г.E = 1
Чам (Bình Thuận, Вьетнам )0.012168Peng et al 2010E1a1a = 1, E2a = 1
Каролинский (Сайпан )0.00017Вилар и др., 2013 г.-
Йи (Hezhang County, Гуйчжоу )0.00020Ли и др., 2007 г.-
Донг (Уезд Тяньчжу, Гуйчжоу )0.00028Ли и др., 2007 г.-
Батек (Малайзия )0.00029Хилл и др., 2006 г.-
Cun (Хайнань )0.00030Peng et al 2011-
Батак (Палаван )0.00031Скоулз и др., 2011 г.-
Lingao (Хайнань )0.00031Peng et al 2011-
Мендрик (Малайзия )0.00032Хилл и др., 2006 г.-
Темуан (Малайзия )0.00033Хилл и др., 2006 г.-
Данга (Хайнань )0.00040Peng et al 2011-
Джахай (Малайзия )0.00051Хилл и др., 2006 г.-
Сенои (Малайзия )0.00052Хилл и др., 2006 г.-
Семелаи (Малайзия )0.00061Хилл и др., 2006 г.-
Гелао (Округ Даочжэнь, Гуйчжоу)0.000102Лю и др. 2011-
Ли (Хайнань )0.000346Peng et al 2011-

Субклады

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы E основано на статье Манниса ван Овена и Манфреда Кайзера. Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека[3] и последующие опубликованные исследования.

  • E
    • E1
      • E1a
        • E1a1
          • E1a1a
            • E1a1a1
        • E1a2
      • E1b
        • E1b1
    • E2
      • E2a
      • E2b
        • E2b1
        • E2b2

Смотрите также

Филогенетическое дерево гаплогруппы митохондриальной ДНК человека (мтДНК)

 Митохондриальная Ева (L )  
L0L1–6 
L1L2 L3  L4L5L6
MN 
CZDEграммQ ОАSр яWИксY
CZBFR0 pre-JT п U
HVJTK
ЧАСVJТ

Рекомендации

  1. ^ а б c Соарес и др., 2008 г., п. 1215.
  2. ^ а б c Ко и др., 2014.
  3. ^ а б Ван Овен и Кайзер 2008.
  4. ^ а б c d Хилл и др. 2007.
  5. ^ Соарес и др., 2016.
  6. ^ Trejaut et al 2005.
  7. ^ Таббада и др., 2010 г. С. 24, 28.
  8. ^ Peng et al 2010.
  9. ^ Хилл и др., 2006 г..
  10. ^ Вилар и др., 2013 г..
  11. ^ Peng et al 2011.
  12. ^ а б Соарес и др., 2008 г., п. 1213.
  13. ^ Таббада и др., 2010 г., п. 29.

внешняя ссылка