METAP1 - METAP1

METAP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2B3H, 2B3K, 2B3L, 2Г6П, 2GZ5, 2NQ6, 2NQ7, 4FLI, 4FLJ, 4ФЛК, 4FLL, 4HXX, 4IKR, 4ИКС, 4IKT, 4IKU, 4IU6, 4U1B, 4U69, 4U6C, 4U6E, 4U6J, 4U6W, 4U6Z, 4U70, 4U71, 4U73, 4U75, 4U76
Идентификаторы
Псевдонимы	METAP1, MAP1A, MetAP1A, метиониламинопептидаза 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 610151 MGI: 1922874 ГомолоГен: 6488 Генные карты: METAP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q23 Начинать 98,995,620 бп[1] Конец 99,062,813 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 G3 Начинать 138,458,956 бп[2] Конец 138,489,515 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • пептидазная активность • аминопептидазная активность • металлоэкзопептидазная активность • гидролазная активность • связывание ионов металлов Сотовый компонент • цитозоль • цитоплазма Биологический процесс • модификация пептидилметионина • Скопление тромбоцитов • N-концевая модификация аминокислот белка • регулирование перевода • протеолиз • регуляция сигнального пути, опосредованного родопсином Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23173	75624
Ансамбль	ENSG00000164024	ENSMUSG00000005813
UniProt	P53582	Q8BP48
RefSeq (мРНК)	NM_015143	NM_175224
RefSeq (белок)	NP_055958	NP_780433
Расположение (UCSC)	Chr 4: 99 - 99,06 Мб	Chr 3: 138.46 - 138.49 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Метионинаминопептидаза 1 является фермент что у людей кодируется METAP1 ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000164024 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000005813 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нагасе Т., Миядзима Н., Танака А., Сазука Т., Секи Н., Сато С., Табата С., Исикава К., Каварабаяси И., Котани Н. и др. (Июль 1995 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. III. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0081-KIAA0120), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 2 (1): 37–43. Дои:10.1093 / dnares / 2.1.37. PMID  7788527.
6. Даммит Б., Фей Й, Чанг Й. (июль 2002 г.). «Функциональная экспрессия человеческой метионинаминопептидазы типа 1 в Saccharomyces cerevisiae». Протеиновый салат. 9 (4): 295–303. Дои:10.2174/0929866023408607. PMID  12144506.
7. «Ген Entrez: метиониламинопептидаза 1 METAP1».

дальнейшее чтение

• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Сереро А., Джильоне С., Сардини А. и др. (2004). «Необычные особенности пептид-деформилазы в митохондриальном N-концевом пути удаления метионина». J. Biol. Chem. 278 (52): 52953–63. Дои:10.1074 / jbc.M309770200. PMID  14532271.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К. и др. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005Натура 433 ... 77А. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Аддлагатта А., Ху Х, Лю Дж. О., Мэтьюз Б. В. (2006). «Структурная основа функциональных различий между метионинаминопептидазами человека типа I и типа II». Биохимия. 44 (45): 14741–9. Дои:10.1021 / bi051691k. PMID  16274222.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Сельвакумар П., Лакшмикуттьямма А., Диммок Дж. Р., Шарма Р. К. (2006). «Метионинаминопептидаза 2 и рак». Биохим. Биофиз. Acta. 1765 (2): 148–54. Дои:10.1016 / j.bbcan.2005.11.001. PMID  16386852.
• Ху Х, Аддлагатта А., Лу Дж. И др. (2007). «Выяснение функции метионинаминопептидазы человека 1 типа во время прогрессирования клеточного цикла». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (48): 18148–53. Дои:10.1073 / pnas.0608389103. ЧВК  1838721. PMID  17114291.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для метионинаминопептидазы человека 1