Семейство предшественников микроРНК Мир-398 - Mir-398 microRNA precursor family

мир-398
Идентификаторы
Символ	мир-398
Рфам	RF00695
Семейство miRBase	MIPF0000107
Прочие данные
РНК тип	микроРНК
Домен (ы)	Эукариоты;
PDB структуры	PDBe

В молекулярной биологии mir-398 микроРНК короткий РНК молекула. МикроРНК функция регуляции уровней экспрессии других генов с помощью нескольких механизмов.

Смотрите также

• МикроРНК

Рекомендации

дальнейшее чтение

• Мендоса-Сото А.Б., Санчес Ф., Эрнандес Г. (2012). «МикроРНК как регуляторы реакции токсичности растений на металлы». Границы растениеводства. 3: 105. Дои:10.3389 / fpls.2012.00105. ЧВК  3356851. PMID  22661980.
• Берклью CE, Эшлок Дж., Уинфри В.Б., Чжан Б. (2012). Ву К. (ред.). «Влияние наночастиц оксида алюминия на рост, развитие и экспрессию микроРНК табака (Nicotiana tabacum)». PLOS ONE. 7 (5): e34783. Дои:10.1371 / journal.pone.0034783. ЧВК  3350507. PMID  22606225.
• Чжан Дж., Чжан С., Хан С., Ву Т., Ли Х, Ли В., Ци Л. (август 2012 г.). «Полногеномная идентификация микроРНК в лиственнице и стадийно-специфическая модуляция 11 консервативных микроРНК и их мишеней во время соматического эмбриогенеза». Planta. 236 (2): 647–57. Дои:10.1007 / s00425-012-1643-9. PMID  22526500. S2CID  6776890.
• Юнг Дж. Х., Со П. Дж., Ан Дж. Х., Пак К. М. (май 2012 г.). «РНК-связывающий белок арабидопсиса FCA регулирует процессинг микроРНК172 при термосенсорном цветении». Журнал биологической химии. 287 (19): 16007–16. Дои:10.1074 / jbc.M111.337485. ЧВК  3346135. PMID  22431732.
• Рен Л., Тан Г. (май 2012 г.). «Идентификация микроРНК, чувствительных к сахарозе, выявляет регулируемые сахарозой накопления меди SPL7-зависимым и независимым образом у Arabidopsis thaliana». Растениеводство. 187: 59–68. Дои:10.1016 / j.plantsci.2012.01.014. PMID  22404833.
• Сункар Р., Ли Ю.Ф., Джагадисваран Г. (апрель 2012 г.). «Функции микроРНК в ответах растений на стресс». Тенденции в растениеводстве. 17 (4): 196–203. Дои:10.1016 / j.tplants.2012.01.010. PMID  22365280.
• Гулерия П., Ядав С.К. (декабрь 2011 г.). «Идентификация miR414 и анализ экспрессии консервативных miRNA из Stevia rebaudiana». Геномика, протеомика и биоинформатика. 9 (6): 211–7. Дои:10.1016 / S1672-0229 (11) 60024-7. ЧВК  5054151. PMID  22289477.
• Чжао М., Тай Х, Сунь С, Чжан Ф, Сюй И, Ли ВХ (2012). Пфеффер С. (ред.). «Клонирование и характеристика miRNA кукурузы, участвующих в ответах на дефицит азота». PLOS ONE. 7 (1): e29669. Дои:10.1371 / journal.pone.0029669. ЧВК  3250470. PMID  22235323.
• Монавар Фешани А., Мохаммади С., Фрейзер Т.П., Аббаси А., Абдини Р., Карими Фарсад Л., Эхья Ф., Салекде Г. Х., Марди М. (февраль 2012 г.). «Идентификация и проверка miRNA Asteraceae с помощью анализа метки экспрессированной последовательности». Ген. 493 (2): 253–9. Дои:10.1016 / j.gene.2011.11.024. PMID  22146318.
• Сюй З., Чжун С., Ли Х, Ли В., Ротштейн С.Дж., Чжан С., Би И, Се Ц. (2011). Мустафа А. (ред.). «Полногеномная идентификация микроРНК в ответ на низкую доступность нитратов в листьях и корнях кукурузы». PLOS ONE. 6 (11): e28009. Дои:10.1371 / journal.pone.0028009. ЧВК  3223196. PMID  22132192.
• Лу С., Ян Ц., Чанг В.Л. (ноябрь 2011 г.). «Сохранение и разнообразие микроРНК-ассоциированных сетей регуляции меди в Populus trichocarpa». Журнал интегративной биологии растений. 53 (11): 879–91. Дои:10.1111 / j.1744-7909.2011.01080.x. PMID  22013976.
• Attallah CV, Welchen E, Martin AP, Spinelli SV, Bonnard G, Palatnik JF, Gonzalez DH (август 2011 г.). «Растения содержат два белка SCO, которые по-разному участвуют в функции цитохром с оксидазы и меди и окислительно-восстановительном гомеостазе». Журнал экспериментальной ботаники. 62 (12): 4281–94. Дои:10.1093 / jxb / err138. PMID  21543521.
• Чжу Ц., Дин И, Лю Х. (сентябрь 2011 г.). «MiR398 и реакция растений на стресс». Physiologia Plantarum. 143 (1): 1–9. Дои:10.1111 / j.1399-3054.2011.01477.x. PMID  21496029.
• Kantar M, Lucas SJ, Budak H (март 2011 г.). «Паттерны экспрессии miRNA Triticum dicoccoides в ответ на шоковую засуху». Planta. 233 (3): 471–84. Дои:10.1007 / s00425-010-1309-4. PMID  21069383. S2CID  27289636.
• Буше Н. (июнь 2010 г.). «Новое понимание функций miR398 в Arabidopsis». Сигнализация и поведение растений. 5 (6): 684–6. Дои:10.4161 / psb.5.6.11573. ЧВК  3001559. PMID  20400846.
• Миура Э, Като Ю., Сакамото В. (май 2010 г.). «Сравнительный анализ транскриптома зеленых / белых пестрых секторов у Arabidopsis yellow variegated2: ответы на окислительные и другие стрессы в белых секторах». Журнал экспериментальной ботаники. 61 (9): 2433–45. Дои:10.1093 / jxb / erq075. ЧВК  2877895. PMID  20400527.
• Цзя X, Менду V, Тан Г (2010). «Платформа массива для идентификации стресс-чувствительных микроРНК в растениях». Стрессоустойчивость растений. Методы молекулярной биологии. 639. С. 253–69. Дои:10.1007/978-1-60761-702-0_15. ISBN  978-1-60761-701-3. PMID  20387051.
• Ли Ю.Ф., Чжэн Ю., Аддо-Куайе С., Чжан Л., Сайни А., Джагадисваран Г., Акстелл М.Дж., Чжан В., Сункар Р. (июнь 2010 г.). «Транскриптомная идентификация мишеней микроРНК в рисе». Журнал растений. 62 (5): 742–59. Дои:10.1111 / j.1365-313X.2010.04187.x. PMID  20202174.
• Дин Ю.Ф., Ван Г.Й., Фу Ю.П., Чжу С. (февраль 2010 г.). «[Роль miR398 в ответах растений на стресс]». И Чуань = Наследие. 32 (2): 129–34. Дои:10.3724 / sp.j.1005.2010.00129. PMID  20176556.
• Боклер Л., Ю. А., Буше Н. (май 2010 г.). «Направленное микроРНК расщепление и репрессия трансляции шаперона меди для мРНК супероксиддисмутазы в Arabidopsis» (PDF). Журнал растений. 62 (3): 454–62. Дои:10.1111 / j.1365-313X.2010.04162.x. PMID  20128885.
• Ли Х., Ю С.Дж., Ли Дж.Х., Ким В., Ю С.К., Фицджеральд Х., Кэррингтон Дж. К., Ан Дж. Х. (май 2010 г.). «Генетическая основа регуляции времени цветения с помощью микроРНК, чувствительных к температуре окружающей среды, у Arabidopsis». Исследования нуклеиновых кислот. 38 (9): 3081–93. Дои:10.1093 / нар / gkp1240. ЧВК  2875011. PMID  20110261.
• Гу М., Сюй К., Чен А., Чжу И, Тан Г., Сюй Г. (февраль 2010 г.). «Анализ экспрессии предполагает потенциальную роль микроРНК в передаче сигналов фосфатной и арбускулярной микоризы в Solanum lycopersicum». Physiologia Plantarum. 138 (2): 226–37. Дои:10.1111 / j.1399-3054.2009.01320.x. PMID  20015123.
• Trindade I, Capitão C, Dalmay T., Fevereiro MP, Santos DM (февраль 2010 г.). «miR398 и miR408 активируются в ответ на дефицит воды у Medicago truncatula». Planta. 231 (3): 705–16. Дои:10.1007 / s00425-009-1078-0. PMID  20012085. S2CID  12943657.
• Се Л.К., Лин С.И., Ши А.С., Чен Дж.В., Лин В.Й., Ценг С.Ю., Ли В.Х., Чиу Т.Дж. (декабрь 2009 г.). «Выявление опосредованных малыми РНК ответов на дефицит фосфата у Arabidopsis путем глубокого секвенирования». Физиология растений. 151 (4): 2120–32. Дои:10.1104 / стр.109.147280. ЧВК  2785986. PMID  19854858.
• Jia X, Wang WX, Ren L, Chen QJ, Mendu V, Willcut B, Dinkins R, Tang X, Tang G (сентябрь 2009 г.). «Дифференциальная и динамическая регуляция miR398 в ответ на АБК и солевой стресс у Populus tremula и Arabidopsis thaliana». Молекулярная биология растений. 71 (1–2): 51–9. Дои:10.1007 / s11103-009-9508-8. PMID  19533381. S2CID  21096126.
• Дин Ю.Ф., Чжу С. (август 2009 г.). «Роль микроРНК в гомеостазе меди и кадмия». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 386 (1): 6–10. Дои:10.1016 / j.bbrc.2009.05.137. PMID  19501049.
• Сире С., Морено А.Б., Гарсия-Чапа М., Лопес-Мойя Дж.Дж., Сан-Сегундо Б. (март 2009 г.). «Суточные колебания в накоплении микроРНК Arabidopsis, miR167, miR168, miR171 и miR398». Письма FEBS. 583 (6): 1039–44. Дои:10.1016 / j.febslet.2009.02.024. HDL:10261/101742. PMID  19236868. S2CID  25968907.
• Джагадисваран Г., Шайни А., Сункар Р. (март 2009 г.). «Биотический и абиотический стресс подавляют экспрессию miR398 у Arabidopsis». Planta. 229 (4): 1009–14. Дои:10.1007 / s00425-009-0889-3. PMID  19148671. S2CID  31993796.
• Ямасаки Х., Хаяси М., Фукадзава М., Кобаяси Ю., Шиканай Т. (январь 2009 г.). «Промотор SQUAMOSA, связывающий белок-подобный 7, является центральным регулятором гомеостаза меди у Arabidopsis». Растительная клетка. 21 (1): 347–61. Дои:10.1105 / tpc.108.060137. ЧВК  2648088. PMID  19122104.
• Хевези Т., Хоу П., Майер Т.Р., Баум Т.Дж. (декабрь 2008 г.). «Малые РНК Arabidopsis и их мишени при паразитизме цистовых нематод». Молекулярные взаимодействия растений и микробов. 21 (12): 1622–34. Дои:10.1094 / MPMI-21-12-1622. PMID  18986258.
• Абдель-Гани С.Е., Пилон М. (июнь 2008 г.). «Опосредованное микроРНК системное подавление экспрессии белка меди в ответ на низкую доступность меди в Arabidopsis». Журнал биологической химии. 283 (23): 15932–45. Дои:10.1074 / jbc.M801406200. ЧВК  3259626. PMID  18408011.
• Дугас Д.В., Бартель Б. (июль 2008 г.). «Сахарозная индукция Arabidopsis miR398 репрессирует две супероксиддисмутазы Cu / Zn». Молекулярная биология растений. 67 (4): 403–17. Дои:10.1007 / s11103-008-9329-1. PMID  18392778. S2CID  22984450.
• Ямасаки Х., Пилон М., Шиканай Т. (апрель 2008 г.). «Как растения реагируют на дефицит меди?». Сигнализация и поведение растений. 3 (4): 231–2. Дои:10.4161 / psb.3.4.5094. ЧВК  2634185. PMID  19704637.
• Buhtz A, Springer F, Chappell L, Baulcombe DC, Kehr J (март 2008 г.). «Идентификация и характеристика малых РНК из флоэмы Brassica napus». Журнал растений. 53 (5): 739–49. Дои:10.1111 / j.1365-313X.2007.03368.x. PMID  18005229.
• Ямасаки Х., Абдель-Гани С.Е., Коху С.М., Кобаяши Ю., Шиканаи Т., Пилон М. (июнь 2007 г.). «Регулирование гомеостаза меди с помощью микро-РНК у Arabidopsis». Журнал биологической химии. 282 (22): 16369–78. Дои:10.1074 / jbc.M700138200. PMID  17405879.
• Сункар Р., Капур А., Чжу Дж. К. (август 2006 г.). «Посттранскрипционная индукция двух генов супероксиддисмутазы Cu / Zn у Arabidopsis опосредована подавлением miR398 и важна для устойчивости к окислительному стрессу». Растительная клетка. 18 (8): 2051–65. Дои:10.1105 / tpc.106.041673. ЧВК  1533975. PMID  16861386.

внешняя ссылка

• Страница семейства предшественников микроРНК mir-398 в Рфам