МикроРНК Мир-96 - Mir-96 microRNA

микроРНК mir-96
Вторичная структура РНК и сохранение последовательности для miR-96.jpg
Идентификаторы
Символмир-96
Альт. СимволыМИР96
РфамRF00669
miRBaseMI0000098
Семейство miRBaseMIPF0000072
Прочие данные
РНК типГен; miRNA
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКSO: 0001244
PDB структурыPDBe

предшественник микроРНК miR-96 это маленький некодирующая РНК что регулирует экспрессия гена. микроРНК транскрибируются как ~ 80 нуклеотид прекурсоры и впоследствии обработанные Дайсер фермент, чтобы дать ~ 23 нуклеотидных продукта. В этом случае зрелая последовательность происходит от 5'-плеча предшественника.[1]Считается, что зрелые продукты играют регуляторную роль благодаря комплементарности мРНК.

Считается, что miR-96 сохраняется в Нефрозоа, т.е. Deuterostomes и Протостомы.[2]

Вариации внутри области зародыша зрелой miR-96 были связаны с аутосомно-доминантный, прогрессирующая потеря слуха у людей и мышей. В гомозиготный мутантные мыши были глубоко глухими, не проявляя кохлеарный ответы. Гетерозиготный мыши и люди постепенно теряют способность слышать.[3][4][5]Пять генов из 132 предсказанных мишеней были экспериментально подтверждены как мишени для miR-96: Aqp5, Celsr2, Myrip, Odf2 и Ryk.[4]

Микрочип анализ 4-дневных мышей дикого типа и мутантных мышей показал, что в 3 ′ UTR Что касается активированных генов, наблюдалось значительное обогащение гептамеров, комплементарных miR-96, подразумевая, что miR-96 обычно влияет на широкий спектр генов-мишеней, и что мутация приводит к потере нормальных мишеней. Среди генов с пониженной регуляцией наблюдается значительное обогащение гептамерами, комплементарными мутантному miR-96, поэтому мутант miR-96 получил новые мишени.[4] Среди генов с пониженной регуляцией особого интереса было пять; Ocm, Pitpnm1, Престин, Ptprq и Gfi1 все они сильно и специфически экспрессируются в волосковых клетках. Мыши, мутантные по последним трем, демонстрируют глухоту и дегенерацию волосковых клеток.[6][7][8]

Множественное выравнивание последовательностей молекул-предшественников miR-96. Высококонсервативные нуклеотиды окрашены в красный цвет, менее консервативные нуклеотиды - в оранжевый, а неконсервативные нуклеотиды - в синий или белый цвет. Столбцы, соответствующие зрелой и затравочной последовательностям, указаны над выравниванием. Каноническая последовательность человека и две последовательности варианта человека, которые участвуют в потере слуха (13G> A и 14C> A), находятся в первом, втором и третьем рядах соответственно.

Рекомендации

  1. ^ Mourelatos Z, Dostie J, Paushkin S, Sharma A, Charroux B, Abel L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (2002). «miRNPs: новый класс рибонуклеопротеидов, содержащий множество микроРНК». Genes Dev. 16 (6): 720–728. Дои:10.1101 / gad.974702. ЧВК  155365. PMID  11914277.
  2. ^ Уилер Б.М., Хаймберг А.М., Мой В.Н., Сперлинг Е.А., Голштин Т.В., Хебер С., Петерсон К.Дж. (2009). «Глубокая эволюция микроРНК многоклеточных животных». Evol Dev. 11 (1): 50–68. Дои:10.1111 / j.1525-142X.2008.00302.x. PMID  19196333.
  3. ^ Mencía A, Modamio-Høybjør S, Redshaw N, Morín M, Mayo-Merino F, Olavarrieta L, Aguirre LA, del Castillo I, Steel KP, Dalmay T, Moreno F, Moreno-Pelayo MA (2009). «Мутации в области зародыша miR-96 человека ответственны за несиндромную прогрессирующую потерю слуха». Нат Жене. 41 (5): 609–613. Дои:10,1038 / нг.355. PMID  19363479.
  4. ^ а б c Льюис М.А., Квинт Э., Глейзер А.М., Фукс Х., Де Анжелис М.Х., Лэнгфорд К., ван Донген С., Абреу-Гуджер С., Пийпари М., Редшоу Н., Далмей Т., Морено-Пелайо М.А., Энрайт А.Дж., Сталь КП (2009) . «ENU-индуцированная мутация miR-96, связанная с прогрессирующей потерей слуха у мышей». Нат Жене. 41 (5): 614–618. Дои:10,1038 / нг.369. ЧВК  2705913. PMID  19363478.
  5. ^ Соукуп Г.А. (2009). «Немного, но громко: малые РНК оказывают сильное влияние на развитие ушей». Brain Res. 1277: 104–114. Дои:10.1016 / j.brainres.2009.02.027. ЧВК  2700218. PMID  19245798.
  6. ^ Либерман М.С., Гао Дж., Хэ Д.З., Ву Х, Цзя С., Цзо Дж. (2002). «Престин необходим для электромобильности наружной волосковой клетки и для усилителя улитки». Природа. 419 (6904): 300–304. Дои:10.1038 / природа01059. PMID  12239568.
  7. ^ Гудиер Р.Дж., Леган П.К., Райт М.Б., Маркотти В., Оганесян А., Коутс С.А., Бут С.Дж., Крос С.Дж., Зайферт Р.А., Боуэн-Поуп Д.Ф., Ричардсон Г.П. (2003). «Рецептор-подобная инозитоллипидфосфатаза необходима для созревания развивающихся пучков волос улитки». J Neurosci. 23 (27): 9208–9219. Дои:10.1523 / jneurosci.23-27-09208.2003. PMID  14534255.
  8. ^ Уоллис Д., Хамблен М., Чжоу Ю., Венкен К.Дж., Шумахер А., Граймс Х.Л., Зогби HY, Оркин Ш., Беллен Х. Дж. (2003). «Фактор транскрипции цинкового пальца Gfi1, участвующий в лимфомагенезе, необходим для дифференцировки и выживания волосковых клеток внутреннего уха». Разработка. 130 (1): 221–232. Дои:10.1242 / dev.00190. PMID  12441305.

Сообщения СМИ

дальнейшее чтение

внешняя ссылка