Формат NeXML - NeXML format
Инструменты XML для формата NeXus, используемые при рассеянии нейтронов, рентгеновских лучей и мюонов, см.
Nexus (формат данных).
NeXML стандарт обмена для представления филоинформатических данных.[1] Он был вдохновлен широко используемым Формат файла Nexus но использует XML для создания более надежного формата для богатых филогенетических данных. Преимущества включают проверку синтаксиса, семантическую аннотацию и веб-сервисы. Формат широко поддерживается и имеет библиотеки на многих популярных языках программирования для биоинформатика.
внешняя ссылка
Рекомендации
- ^ Вос, Рутгер А .; Balhoff, Джеймс П .; Caravas, Jason A .; Держатель, Марка Т .; Лапп, Хилмар; Мэддисон, Уэйн П .; Мидфорд, Питер Э .; Приям, Анураг; Сукумаран, Джит (01.07.2012). «NeXML: богатое, расширяемое и проверяемое представление сравнительных данных и метаданных». Систематическая биология. 61 (4): 675–689. Дои:10.1093 / sysbio / sys025. ISSN 1063-5157. ЧВК 3376374. PMID 22357728.
|
---|
Базы данных | - Базы данных последовательностей: GenBank, Европейский архив нуклеотидов и Банк данных ДНК Японии
- Вторичные базы данных: UniProt, база данных белковых последовательностей, сгруппированных вместе Swiss-Prot, TrEMBL и Информационный ресурс о белках
- Другие базы данных: Банк данных белков, Ансамбль и ИнтерПро
- Специализированные геномные базы данных: СМЕЛЫЙ, База данных генома Saccharomyces, FlyBase, VectorBase, WormBase, База данных генома крысы, PHI-база, Информационный ресурс об арабидопсисе и Информационная сеть по рыбкам данио
|
---|
Программного обеспечения | |
---|
Другой | |
---|
Учреждения | |
---|
Организации | |
---|
Встречи | |
---|
Форматы файлов | |
---|
похожие темы | |
---|
|