Остреококк Таури - Ostreococcus tauri

Остреококк Таури
Просвечивающая электронная микрофотография О. таури клетка
Научная классификация редактировать
Тип:Хлорофита
Учебный класс:Mamiellophyceae
Заказ:Mamiellales
Семья:Батикокковые
Род:Остреококк
Разновидность:
О. таури
Биномиальное имя
Остреококк Таури
C. Courties и M.-J. Кретьенно-Дине (1995)

Остреококк Таури это одноклеточный разновидность из морской зеленая водоросль около 0,8 микрометры (мкм) в диаметре, наименьшие свободноживущие (несимбиотический ) эукариот пока не описал. Имеет очень простой ультраструктура, и компактный геном.

Как общий член мирового океана пикопланктон популяций, этот организм играет важную роль в цикл углерода во многих областях. Недавно, О. таури был предметом исследований с использованием сравнительная геномика и функциональная геномика,[1][2][3][4] поскольку он представляет интерес для исследователей из-за своего компактного генома и зеленого происхождения.

История

Остреококк Таури был обнаружен в 1994 г. в Лагуна Тау, Франция, в годовом исследовании популяции пикопланктона лагуны с использованием проточной цитометрии. О. таури было обнаружено, что это основной компонент популяции пикопланктона в лагуне, и изображения клеток, произведенные просвечивающая электронная микроскопия выявили самые маленькие из описанных свободноживущих эукариотических клеток.[5] О. таури сразу был помещен в класс Prasinophyceae исходя из наличия характерных хлорофилл пигменты и Chlorophyceae -связанные с каротиноиды,[5] и эта классификация была подтверждена дальнейшей работой.[6][7]

Анатомия

Клетки примерно сферические (кокковидный ), составляя в среднем около 1 мкм в длину и 0,7 мкм в ширину. Ультраструктура клетки очень проста, в ней отсутствует клеточная стенка и состоящий из ядро, один митохондрия, один хлоропласт, и один аппарат Гольджи.[5] В клетках также отсутствуют жгутики.

Первоначально описанный как содержащий 14 хромосом,[7] теперь известно, что ядро ​​содержит 20 хромосом[нужна цитата ], всего около 33 фг ДНК.[5]

Экология

Остреококк Таури является доминирующим видом водорослей по количеству клеток в лагуне Тау на юге Франции. Считается, что условия, которые приводят к такому преобладанию, заключаются, во-первых, в том, что лагуна используется для интенсивного выращивания моллюсков, а во-вторых, в том, что уровни меди в лагуне высоки. Первое соображение выбирает меньшие ячейки (пикопланктон ); более крупные эукариотические виды водорослей и многие хищники мелких водорослей преимущественно потребляются моллюсками, которые питатели-фильтры. Второе соображение выбирает против цианобактерии, так как О. таури считается, что лучше справляется с «неблагоприятными условиями». Считается, что избыток меди в лагуне происходит из-за сельскохозяйственных химикатов, используемых окружающими виноградники.[8]

Использование в качестве модельного организма

Еще в 1998 г. О. таури был определен как "хороший кандидат на биологические модели такие как исследования деления клеток и / или секвенирования генома ".[7]

Геномика

В 2006 г. О. таури геном был секвенирован Derelle и другие..[1] Геном размером 12,56 Mb, организованный в 20 хромосом, показал чрезвычайную плотность генов и мало интрон -содержащие гены. Две хромосомы с внешними характеристиками (содержание G + C, интрон структуры), а именно хромосома 2 и хромосома 19. Секвенирование других видов Mamiellales порядки показали наличие похожих удаленных хромосом у других видов (О. lucimarinus,[2] Микромонас пустышка [9] & Б. прасинос[10]).

Рекомендации

  1. ^ а б Дерелль, Э., Ферраз, К., Ромбаутс, С., Рузе, П., Уорден, А. З., Роббенс, С.,… Моро, Х. (2006). Анализ генома самого маленького свободноживущего эукариота Ostreococcus tauri выявил множество уникальных особенностей. Слушания Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки, 103 (31), 11647–52. http://doi.org/10.1073/pnas.0604795103
  2. ^ а б Паленик, Б., Гримвуд, Дж., Аэртс, А., Рузе, П., Саламов, А., Патнэм, Н.,… Григорьев, И. В. (2007). Крошечный эукариот Ostreococcus дает геномное понимание парадокса видообразования планктона. Слушания Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки, 104 (18), 7705–10. http://doi.org/10.1073/pnas.0611046104
  3. ^ Блан-Матье, Р., Верхелст, Б., Дерелль, Э., Ромбо, С., Буге, Ф.-Й., Карре, И.,… Пигано, Г. (2014). Улучшенный геном модельной морской водоросли Ostreococcus tauri раскрывается путем оценки сборок Illumina de novo. BMC Genomics, 15 (1), 1103. http://doi.org/10.1186/1471-2164-15-1103
  4. ^ Крумхольц, Э. В., Янг, Х., Вайзенхорн, П., Генри, К. С., и Либурель, И. Г. Л. (2012). Полногеномная реконструкция метаболической сети picoalga Ostreococcus. Журнал экспериментальной ботаники, 63 (6), 2353–2362. http://doi.org/10.1093/jxb/err407
  5. ^ а б c d Courties, C. и другие. (1994). Самый маленький эукариотический организм. Природа 370: 255.
  6. ^ Courties, C. и другие. (1995). Новый морской пикоэукариот - Остреококк Таури Gen et Sp-NOV (Chlorophyta, Prasinophyceae). Phycologia 34 (4): 285-292
  7. ^ а б c Courties, C. и другие. (1998). «Филогенетический анализ и размер генома Остреококк Таури (Chlorophyta, Prasinophyceae) " J. Phycol. 34 (5): 844-849.
  8. ^ Вакер, А. и другие. (1996). Запас и динамика пикофитопланктона в лагуне Тау (северо-западное побережье Средиземного моря). Лимнология и океанография 41 (8): 1821-1828
  9. ^ Уорден, А.З., Ли, Дж.-Х., Мок, Т., Рузе, П., Симмонс, М.П., ​​Аэртс, А.Л.,… Григорьев, И.В. (2009). Зеленая эволюция и динамические адаптации, выявленные геномами морских пикоэукариот Micromonas. Наука, 324 (5924), 268–272. http://doi.org/10.1126/science.1167222
  10. ^ Моро, Х., Верхелст, Б., Кулу, А., Дерелл, Э., Ромбо, С., Гримсли, Н.,… Вандепоэле, К. (2012). Функции генов и структура генома у Bathycoccus prasinos отражают клеточную специализацию, лежащую в основе зеленой линии. Геномная биология, 13 (8), R74. http://doi.org/10.1186/gb-2012-13-8-r74