UTX (ген) - UTX (gene) - Wikipedia

KDM6A
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3AVR, 3AVS
Идентификаторы
Псевдонимы	KDM6A, KABUK2, UTX, bA386N14.2, лизин-деметилаза 6A
Внешние идентификаторы	OMIM: 300128 MGI: 1095419 ГомолоГен: 7586 Генные карты: KDM6A
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xp11.3 Начинать 44,873,177 бп[1] Конец 45,112,602 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X A1.2-A1.3 | X 13,45 см Начинать 18,162,575 бп[2] Конец 18,279,936 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность диоксигеназы • связывание ионов металлов • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • идентичное связывание с белками • оксидоредуктазная активность • связывание хроматина с ДНК • активность гистон-деметилазы (специфическая для H3-K27) • гистоновая деметилаза активность • связывание хроматина • последовательное связывание ДНК Сотовый компонент • нуклеоплазма • Комплекс MLL3 / 4 • гистон-метилтрансферазный комплекс • ядро клетки Биологический процесс • процесс дыхательной системы • деметилирование гистона H3-K27 • рост многоклеточного организма • развитие эмбриональных органов • спецификация ростральной / каудальной оси сомита • морфогенез сердца • внутриутробное эмбриональное развитие • развитие сердца • метилирование гистона H3-K4 • закрытие нервной трубки • положительная регуляция экспрессии генов • морфогенез хорды • развитие нервной трубки • дифференцировка мезодермальных клеток • канонический путь передачи сигналов Wnt • регуляция экспрессии генов • окислительно-восстановительный процесс • ремоделирование хроматина • организация хроматина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7403	22289
Ансамбль	ENSG00000147050	ENSMUSG00000037369
UniProt	O15550	O70546
RefSeq (мРНК)	NM_001291415 NM_001291416 NM_001291417 NM_001291418 NM_001291421 NM_021140	NM_009483 NM_001310444
RefSeq (белок)	NP_001278344 NP_001278345 NP_001278346 NP_001278347 NP_001278350 NP_066963	NP_001297373 NP_033509
Расположение (UCSC)	Chr X: 44,87 - 45,11 Мб	Chr X: 18.16 - 18.28 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Лизин-специфическая деметилаза 6А также известный как Повсеместно транскрибируемый тетратрикопептидный повтор, Х-хромосома (UTX), это белок который у человека кодируется KDM6A ген.^[5][6][7] Он принадлежит к 2-оксоглутарат (2OG) -зависимая диоксигеназа надсемейство.

Функция

UTX был связан с деметилирование остатков лизина на гистон, в частности H3K27, что приводит к дерепрессии гена, потенциальному средству регуляции клеточного метаболизма.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000147050 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037369 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Ген: лизиндеметилаза 6А KDM6A».
6. Лан Б.Т., Пейдж, округ Колумбия (октябрь 1997 г.). «Функциональная когерентность Y-хромосомы человека». Наука. 278 (5338): 675–80. Дои:10.1126 / наука.278.5338.675. PMID  9381176.
7. Гринфилд А., Каррел Л., Пенниси Д., Филипп С., Квадери Н., Сиггерс П., Штайнер К., Там П. П., Монако А. П., Уиллард Х. Ф., Купман П. (апрель 1998 г.). «Ген UTX избегает инактивации X у мышей и людей». Гм. Мол. Genet. 7 (4): 737–42. Дои:10,1093 / чмг / 7,4,737. PMID  9499428.
8. Ли М.Г., Вилла Р., Тройер П., Норман Дж., Ян К.П., Рейнберг Д., Ди Кроче Л., Шихаттар Р. (октябрь 2007 г.). «Деметилирование H3K27 регулирует рекрутирование поликомб и убиквитинирование H2A». Наука. 318 (5849): 447–50. Дои:10.1126 / science.1149042. PMID  17761849.

дальнейшее чтение

• Лан Б.Т., Пейдж, округ Колумбия (1997). «Функциональная когерентность Y-хромосомы человека». Наука. 278 (5338): 675–80. Дои:10.1126 / наука.278.5338.675. PMID  9381176.
• Гринфилд А., Каррел Л., Пенниси Д. и др. (1998). «Ген UTX избегает инактивации X у мышей и людей». Гм. Мол. Genet. 7 (4): 737–42. Дои:10,1093 / чмг / 7,4,737. PMID  9499428.
• Грбавец Д., Ло Р., Лю Й. и др. (1999). «Граучо / трансдуцин-подобный энхансер расщепленных членов семейства (TLE) взаимодействуют с дрожжевым корепрессором транскрипции SSN6 и белками, связанными с SSN6 млекопитающих: последствия для эволюционного сохранения механизмов репрессии транскрипции». Biochem. J. 337 (Pt 1) (Pt 1): 13–7. Дои:10.1042/0264-6021:3370013. ЧВК  1219929. PMID  9854018.
• Фореста С., Ферлин А., Моро Е. (2000). «Анализ делеции и экспрессии генов AZFa в Y-хромосоме человека показал важную роль DBY в мужском бесплодии». Гм. Мол. Genet. 9 (8): 1161–9. Дои:10.1093 / hmg / 9.8.1161. PMID  10767340.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Агат Р.Дж., Чхве М., Арнольд А.П. (2004). «Половые различия в структуре и экспрессии генов половых хромосом CHD1Z и CHD1W у зебровых зябликов». Мол. Биол. Evol. 21 (2): 384–96. Дои:10.1093 / молбев / мш027. PMID  14660691.
• Колланд Ф., Жак Х, Троплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А. и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши». Мол. Клетка. Протеомика. 3 (11): 1093–101. Дои:10.1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID  15345747.
• Джеррард Д.Т., Филатов Д.А. (2005). «Положительный и отрицательный отбор по Y-хромосомам млекопитающих». Мол. Биол. Evol. 22 (6): 1423–32. Дои:10.1093 / molbev / msi128. PMID  15758204.
• Чо Ю.В., Хонг Т., Хонг С. и др. (2007). "PTIP ассоциирует с MLL3- и MLL4-содержащим комплексом гистон H3 лизин 4 метилтрансферазой". J. Biol. Chem. 282 (28): 20395–406. Дои:10.1074 / jbc.M701574200. ЧВК  2729684. PMID  17500065.
• Аггер К., Клоос П.А., Кристенсен Дж. И др. (2007). «UTX и JMJD3 представляют собой деметилазы гистона H3K27, участвующие в регуляции и развитии гена HOX». Природа. 449 (7163): 731–4. Дои:10.1038 / природа06145. PMID  17713478.
• Ли М.Г., Вилла Р., Тройер П. и др. (2007). «Деметилирование H3K27 регулирует рекрутирование поликомб и убиквитинирование H2A». Наука. 318 (5849): 447–50. Дои:10.1126 / science.1149042. PMID  17761849.
• Lan F, Bayliss PE, Rinn JL, et al. (2007). «Гистон H3 лизин 27 деметилаза регулирует заднее развитие животных». Природа. 449 (7163): 689–94. Дои:10.1038 / природа06192. PMID  17851529.
• Хонг С., Чо Ю.В., Ю. Л. Р. и др. (2008). «Идентификация UTX и JMJD3, содержащих домен JmjC, как деметилазы лизина 27 гистона H3». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 104 (47): 18439–44. Дои:10.1073 / pnas.0707292104. ЧВК  2141795. PMID  18003914.