ASAH1 - ASAH1

ASAH1
Идентификаторы
Псевдонимы	ASAH1, AC, ACDase, ASAH, PHP, PHP32, SMAPME, N-ацилсфингозинамидогидролаза (кислая церамидаза) 1, N-ацилсфингозинамидогидролаза 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 613468 MGI: 1277124 ГомолоГен: 10504 Генные карты: ASAH1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8p22 Начните 18,055,992 бп[1] Конец 18,084,998 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 | 8 A4 Начните 41,340,197 бп[2] Конец 41,374,773 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность ацилсфингозиндеацилазы • каталитическая активность • гидролазная активность • гидролазная активность, действующая на углерод-азотные (но не пептидные) связи • активность церамидазы • гидролазная активность, действующая на связи углерод-азот (но не пептид) в линейных амидах Сотовый компонент • лизосома • просвет лизосомы • внеклеточная экзосома • внеклеточная область • внеклеточный • просвет третичной гранулы • Просвет гранул, богатых фиколином-1 • ранняя эндосома • эндоплазматический ретикулум • ядро клетки • цитоплазма Биологический процесс • метаболический процесс гликосфинголипидов • процесс метаболизма керамидов • липидный обмен • дегрануляция нейтрофилов • процесс биосинтеза сфингозина • процесс биосинтеза керамидов • катаболический процесс керамидов • дифференцировка кератиноцитов • регуляция процесса биосинтеза стероидов • регуляция запрограммированной некротической гибели клеток • клеточный ответ на фактор некроза опухоли • сфинголипидный метаболический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	427	11886
Ансамбль	ENSG00000104763	ENSMUSG00000031591
UniProt	Q13510	Q9WV54
RefSeq (мРНК)	NM_001127505 NM_004315 NM_177924 NM_001363743	NM_019734
RefSeq (белок)	NP_001120977 NP_004306 NP_808592 NP_001350672	NP_062708
Расположение (UCSC)	Chr 8: 18.06 - 18.08 Мб	Chr 8: 41.34 - 41.37 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

В ASAH1 ген кодирует в людях кислота керамидаза фермент.^[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует гетеродимерный белок, состоящий из негликозилированной альфа-субъединицы и гликозилированный бета-субъединица, которая расщепляется до зрелого фермента посттрансляционно. Кодируемый белок катализирует синтез и деградацию керамид в сфингозин и жирные кислоты. Мутации в этом гене были связаны с лизосомное нарушение накопления известный как Болезнь Фарбера и, недавно, с редким нейродегенеративным заболеванием, известным как спинальная мышечная атрофия с прогрессирующей миоклонической эпилепсией.^[8] Для этого гена были идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[7] В меланоцитарные клетки Экспрессия гена ASAH1 может регулироваться MITF.^[9]

В качестве лекарственной мишени для глиобластомы

Экспрессия ASAH1 активируется после облучения, что позволяет предположить, что он играет роль в обеспечении радиорезистентности к глиобластома и в развитии рецидивирующей глиобластомы.^[10] Подавление активности ASAH1 с Carmofur, препарат, одобренный для клинического лечения колоректальный рак в некоторых странах приводит к значительной гибели клеток и в результате был предложен в качестве лекарственной мишени для лечения глиобластомы.^[11] Также предполагалось, что это новое лекарство, направленное против опухолей головного мозга у детей.^[12]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000104763 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031591 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Кох Дж., Гертнер С., Ли С.М., Квинтерн Л.Е., Бернардо К., Левран О., Шнабель Д., Десник Р.Дж., Шухман Е.Х., Сандхофф К. (декабрь 1996 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика полноразмерной комплементарной ДНК, кодирующей кислотную церамидазу человека. Идентификация первого молекулярного поражения, вызывающего болезнь Фарбера». Журнал биологической химии. 271 (51): 33110–5. Дои:10.1074 / jbc.271.51.33110. PMID  8955159.
6. Ли СМ, ​​Пак Дж. Х., Хе Х, Леви Б., Чен Ф, Араи К., Адлер Д. А., Disteche CM, Кох Дж., Сандхофф К., Шухман Э. Х. (декабрь 1999 г.). «Ген кислой церамидазы человека (ASAH): структура, хромосомное положение, анализ мутаций и экспрессия». Геномика. 62 (2): 223–31. Дои:10.1006 / geno.1999.5940. PMID  10610716.
7. «Энтрез Ген: N-ацилсфингозинамидогидролаза ASAH1 (кислая церамидаза) 1».
8. Zhou J, Tawk M, Tiziano FD, Veillet J, Bayes M, Nolent F, Garcia V, Servidei S, Bertini E, Castro-Giner F, Renda Y, Carpentier S, Andrieu-Abadie N, Gut I, Levade T, Topaloglu Х, Мелки Дж (июль 2012 г.). «Спинальная мышечная атрофия, связанная с прогрессирующей миоклонической эпилепсией, вызвана мутациями в ASAH1». Американский журнал генетики человека. 91 (1): 5–14. Дои:10.1016 / j.ajhg.2012.05.001. ЧВК  3397266. PMID  22703880.
9. Хук К.С., Шлегель Н.С., Эйххофф О.М., Видмер Д.С., Преториус К., Эйнарссон С.О., Валгейрсдоттир С., Бергстейнсдоттир К., Щепски А., Даммер Р., Штайнгримссон Е. (декабрь 2008 г.). «Новые мишени MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов». Исследования пигментных клеток и меланомы. 21 (6): 665–76. Дои:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID  19067971. S2CID  24698373.
10. Доан Н.Б., Нгуен Х.С., Аль-Гизавий М.М., Мюллер В.М., Саббадини Р.А., Рэнд С.Д., Коннелли Дж.М., Читамбар С.Р., Шмайнда К.М., Мирза С.П. (октябрь 2017 г.). «Кислая церамидаза придает радиорезистентность клеткам глиобластомы». Отчеты онкологии. 38 (4): 1932–40. Дои:10.3892 / или 2017.5855. ЧВК  5652937. PMID  28765947.
11. Доан Н.Б., Альхаджала Х., Аль-Гизавий М.М., Мюллер В.М., Рэнд С.Д., Коннелли Дж.М., Кокран Э.Дж., Читамбар С.Р., Кларк П., Куо Дж., Шмайнда К.М., Мирза С.П. «Кислая церамидаза и ее ингибиторы: лекарственная мишень de novo и новый класс препаратов для уничтожения стволовых клеток рака глиобластомы с высокой эффективностью». Oncotarget. 8 (68): 112662–74. Дои:10.18632 / oncotarget.22637. ЧВК  5762539. PMID  29348854.
12. Доан Н.Б., Нгуен Х.С., Монтур А., Аль-Гизавий М.М., Мюллер В.М., Курпад С., Рэнд С.Д., Коннелли Д.М., Читамбар С.Р., Шмайнда К.М., Мирза С.П. (апрель 2017 г.). «Кислая церамидаза - новая лекарственная мишень для лечения опухолей головного мозга у детей». Oncotarget. 8 (15): 24753–61. Дои:10.18632 / oncotarget.15800. ЧВК  5421885. PMID  28445970.

внешние ссылки

• Человек ASAH1 расположение генома и ASAH1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Перри Д.К., Ханнун Ю.А. (декабрь 1998 г.). «Роль церамида в передаче сигналов в клетке». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов. 1436 (1–2): 233–43. Дои:10.1016 / S0005-2760 (98) 00145-3. PMID  9838138.
• Бернардо К., Гурвиц Р., Зенк Т., Десник Р.Дж., Ферлинц К., Шухман Э.Х., Сандхофф К. (май 1995 г.). «Очистка, характеристика и биосинтез кислой церамидазы человека». Журнал биологической химии. 270 (19): 11098–102. Дои:10.1074 / jbc.270.19.11098. PMID  7744740.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Силан Р.С., Цянь С., Йокомидзо А., Боствик Д.Г., Смит Д.И., Лю В. (октябрь 2000 г.). «Кислая церамидаза человека сверхэкспрессируется, но не мутирует при раке простаты». Гены, хромосомы и рак. 29 (2): 137–46. Дои:10.1002 / 1098-2264 (2000) 9999: 9999 <:: AID-GCC1018> 3.0.CO; 2-E. PMID  10959093.
• Стрелов А., Бернардо К., Адам-Клагес С., Линке Т., Сандхофф К., Крёнке М., Адам Д. (сентябрь 2000 г.). «Сверхэкспрессия кислой церамидазы защищает от гибели клеток, вызванной фактором некроза опухоли». Журнал экспериментальной медицины. 192 (5): 601–12. Дои:10.1084 / jem.192.5.601. ЧВК  2193270. PMID  10974027.
• Бэр Дж., Линке Т., Ферлинц К., Нойман У., Шухман Э. Х., Сандхофф К. (март 2001 г.). «Молекулярный анализ дефицита кислой церамидазы у пациентов с болезнью Фарбера». Человеческая мутация. 17 (3): 199–209. Дои:10.1002 / humu.5. PMID  11241842. S2CID  39656479.
• Ферлинц К., Копал Г., Бернардо К., Линке Т., Бар Дж., Брейден Б., Нойман Ю., Ланг Ф., Шухман Э. Х., Сандхофф К. (сентябрь 2001 г.). «Кислая церамидаза человека: процессинг, гликозилирование и нацеливание на лизосомы». Журнал биологической химии. 276 (38): 35352–60. Дои:10.1074 / jbc.M103066200. PMID  11451951.
• Мурамацу Т., Сакаи Н., Янагихара И., Ямада М., Нишигаки Т., Кокубу К., Цукамото Х., Ито М., Инуи К. (ноябрь 2002 г.). «Мутационный анализ гена кислой церамидазы у японских пациентов с болезнью Фарбера». Журнал наследственных метаболических заболеваний. 25 (7): 585–92. Дои:10.1023 / А: 1022047408477. PMID  12638942. S2CID  26208268.
• Чжан Х., Ли XJ, Мартин Д.Б., Эберсолд Р. (июнь 2003 г.). «Идентификация и количественное определение N-связанных гликопротеинов с использованием химии гидразидов, метки стабильных изотопов и масс-спектрометрии». Природа Биотехнологии. 21 (6): 660–6. Дои:10.1038 / nbt827. PMID  12754519. S2CID  581283.
• Okino N, He X, Gatt S, Sandhoff K, Ito M, Schuchman EH (август 2003 г.). «Обратная активность кислой церамидазы человека». Журнал биологической химии. 278 (32): 29948–53. Дои:10.1074 / jbc.M303310200. PMID  12764132.
• Хе Икс, Окино Н., Дхами Р., Даган А., Гатт С., Шульце Х., Сандхофф К., Шухман Э. Х. (август 2003 г.). «Очистка и характеристика рекомбинантной кислой церамидазы человека. Каталитические реакции и взаимодействия с кислой сфингомиелиназой». Журнал биологической химии. 278 (35): 32978–86. Дои:10.1074 / jbc.M301936200. PMID  12815059.
• Хара С., Накашима С., Киёно Т., Савада М., Йошимура С., Ивама Т., Банно И., Шинода Дж., Сакаи Н. (август 2004 г.). «Р53-независимое образование церамидов в клетках глиомы человека во время апоптоза, индуцированного гамма-излучением». Гибель клеток и дифференциация. 11 (8): 853–61. Дои:10.1038 / sj.cdd.4401428. PMID  15088070.
• Левандровски Ю., Мебиус Дж., Вальтер Ю., Сикманн А. (февраль 2006 г.). «Выяснение сайтов N-гликозилирования на белках тромбоцитов человека: гликопротеомный подход». Молекулярная и клеточная протеомика. 5 (2): 226–33. Дои:10.1074 / mcp.M500324-MCP200. PMID  16263699.