CYP2C18 - CYP2C18

CYP2C18
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2CIK, 2H6P
Идентификаторы
Псевдонимы	CYP2C18, CPCI, CYP2C, CYP2C17, P450-6B / 29C, P450IIC17, член подсемейства C семейства 2 цитохрома P450 18
Внешние идентификаторы	OMIM: 601131 MGI: 1919332 ГомолоГен: 133567 Генные карты: CYP2C18
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q23.33 Начинать 94,683,729 бп[1] Конец 94,736,190 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 C3 Начинать 39,007,019 бп[2] Конец 39,042,693 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • оксидоредуктазная активность, действующая на парных доноров, с включением или восстановлением молекулярного кислорода • активность ароматазы • связывание ионов железа • оксидоредуктазная активность • монооксигеназная активность • гемовое связывание • связывание кислорода • активность эпоксигеназы арахидоновой кислоты • связывание ионов металлов • активность стероид-гидроксилазы • оксидоредуктазная активность, действующая на парных доноров, с включением или восстановлением молекулярного кислорода, восстановленным флавином или флавопротеином в качестве одного донора и включением одного атома кислорода Сотовый компонент • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана органеллы • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • мембрана • эндоплазматический ретикулум • цитоплазма Биологический процесс • путь эпоксигеназы P450 • ксенобиотический метаболический процесс • окислительно-восстановительный процесс • метаболический процесс органических кислот • экзогенный лекарственный катаболический процесс Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1562	72082
Ансамбль	ENSG00000108242	ENSMUSG00000025002
UniProt	P33260	Q9D816
RefSeq (мРНК)	NM_001128925 NM_000772	NM_028089
RefSeq (белок)	NP_000763 NP_001122397	NP_082365
Расположение (UCSC)	Chr 10: 94,68 - 94,74 Мб	Chr 19: 39.01 - 39.04 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цитохром P450 2C18 это белок что у людей кодируется CYP2C18 ген.^[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует член суперсемейства ферментов цитохрома P450. Белки цитохрома P450 представляют собой монооксигеназы, которые катализируют многие реакции, участвующие в метаболизме лекарств и синтезе холестерина, стероидов и других липидов. Этот белок локализуется в эндоплазматическом ретикулуме, но его специфический субстрат еще не определен. Ген расположен в кластере генов цитохрома P450 на хромосоме 10q24. Когда-то считалось, что существует дополнительный ген, CYP2C17; однако CYP4217 теперь считается артефактом, основанным на химере CYP2C18 и CYP2C19.^[7]

CYP2C18 также обладает эпоксигеназа активность: он может атаковать различные длинноцепочечные полиненасыщенные жирные кислоты на их двойных (т.е. алкен ) облигации для формирования эпоксид продукты, которые действуют как сигнальные агенты. Он метаболизирует: 1) арахидоновая кислота различным эпоксиэйкозатриеновые кислоты (также называемые EET); 2) линолевая кислота до 9,10-эпоксиоктадекаеновых кислот (также называемых верноловая кислота, линолевая кислота 9: 10-оксид или лейкотоксин) и 12,13-эпокси-октадекаеновая кислота (также называемая коронаровая кислота, 12,13-оксид линолевой кислоты или изолейкотоксин); 3) докозагексаеновая кислота различным эпоксидокозапентаеновые кислоты (также называемые EDP); и 4) эйкозапентаеновая кислота к различным эпоксиэйкозатетраеновым кислотам (также называемым EEQ).^[8][9][10]

В то время как CYP2C19, CYP2C8, CYP2C9, CYP2J2, и возможно CYP2S1 являются основными продуцентами EET и, весьма вероятно, EEQ, EDP и эпоксидов линолевой кислоты, CYP2C18 может вносить вклад в производство этих метаболитов в определенных тканях.^[9][11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108242 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025002 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Furuya H, Meyer UA, Gelboin HV, Gonzalez FJ (сентябрь 1991 г.). «Идентификация, клонирование и количественное определение мРНК человеческого CYP2C18 с помощью полимеразной цепной реакции». Молекулярная фармакология. 40 (3): 375–82. PMID  1896026.
6. Ромкес М., Фалетто МБ, Блейсделл Дж. А., Рози Дж. Л., Гольдштейн Дж. А. (апрель 1991 г.). «Клонирование и экспрессия комплементарных ДНК для множества членов подсемейства цитохрома P450IIC человека». Биохимия. 30 (13): 3247–55. Дои:10.1021 / bi00227a012. PMID  2009263.
7. «Ген Entrez: цитохром P450 CYP2C18, семейство 2, подсемейство C, полипептид 18».
8. Флеминг I (октябрь 2014 г.). «Фармакология оси цитохром Р450 эпоксигеназа / растворимая эпоксидгидролаза в сосудистой сети и сердечно-сосудистых заболеваниях». Фармакологические обзоры. 66 (4): 1106–40. Дои:10.1124 / пр.113.007781. PMID  25244930.
9. Вагнер К., Вито С., Инчеоглу Б., Hammock BD (октябрь 2014 г.). «Роль длинноцепочечных жирных кислот и их эпоксидных метаболитов в ноцицептивной передаче сигналов». Простагландины и другие липидные медиаторы. 113-115: 2–12. Дои:10.1016 / j.prostaglandins.2014.09.001. ЧВК  4254344. PMID  25240260.
10. Fischer R, Konkel A, Mehling H, Blossey K, Gapelyuk A, Wessel N, von Schacky C, Dechend R, Muller DN, Rothe M, Luft FC, Weylandt K, Schunck WH (март 2014 г.). «Диетические жирные кислоты омега-3 модулируют профиль эйкозаноидов у человека, прежде всего, через путь CYP-эпоксигеназы». Журнал липидных исследований. 55 (6): 1150–1164. Дои:10.1194 / мл. M047357. ЧВК  4031946. PMID  24634501.
11. Спектор А.А., Ким Х.Й. (апрель 2015 г.). «Цитохром P450 эпоксигеназный путь метаболизма полиненасыщенных жирных кислот». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов. 1851 (4): 356–65. Дои:10.1016 / j.bbalip.2014.07.020. ЧВК  4314516. PMID  25093613.

внешняя ссылка

• Человек CYP2C18 расположение генома и CYP2C18 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Гольдштейн Дж. А., де Мораис С. М. (декабрь 1994 г.). «Биохимия и молекулярная биология подсемейства CYP2C человека». Фармакогенетика. 4 (6): 285–99. Дои:10.1097/00008571-199412000-00001. PMID  7704034.
• Смит Дж., Стаббинс М.Дж., Харрис Л.В., Вольф CR (декабрь 1998 г.). «Молекулярная генетика суперсемейства цитохрома Р450 монооксигеназы человека». Ксенобиотика. 28 (12): 1129–65. Дои:10.1080/004982598238868. PMID  9890157.
• Гед С., Бон П. (июнь 1992 г.). «Анализ экспрессии человеческого гена CYP2C18, опосредованный частичной последовательностью и полимеразной цепной реакцией». Фармакогенетика. 2 (3): 109–15. Дои:10.1097/00008571-199206000-00002. PMID  1306110.
• Ромкес М., Фалетто М.Б., Блейсделл Дж. А., Рози Дж. Л., Гольдштейн Дж. А. (февраль 1993 г.). «Клонирование и экспрессия комплементарных ДНК для множества членов подсемейства человеческого цитохрома PH50IIC». Биохимия. 32 (5): 1390. Дои:10.1021 / bi00056a025. PMID  8095407.
• Гольдштейн Дж. А., Фалетто М. Б., Ромкес-Спаркс М., Салливан Т., Китареван С., Рауси Дж. Л., Ласкер Дж. М., Ганайем Б. И. (февраль 1994 г.). «Доказательства того, что CYP2C19 является основной (S) -мефенитоин-4'-гидроксилазой у людей». Биохимия. 33 (7): 1743–52. Дои:10.1021 / bi00173a017. PMID  8110777.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• de Morais SM, Schweikl H, Blaisdell J, Goldstein JA (июль 1993 г.). «Структура гена и вышестоящие регуляторные области CYP2C9 и CYP2C18 человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 194 (1): 194–201. Дои:10.1006 / bbrc.1993.1803. PMID  8333835.
• Ричардсон Т.Х., Гриффин К.Дж., Юнг Ф., Рози Дж.Л., Джонсон Э.Ф. (февраль 1997 г.). «Целевые антипептидные антитела к цитохрому P450 2C18 на основе картирования эпитопа ингибирующего моноклонального антитела к P450 2C51». Архивы биохимии и биофизики. 338 (2): 157–64. Дои:10.1006 / abbi.1996.9817. PMID  9028867.
• Зафиропулос П.Г. (июнь 1997 г.). «Пропуск экзона и образование кольцевой РНК в транскриптах гена цитохрома P-450 2C18 человека в эпидермисе и гена андрогенсвязывающего белка крысы в ​​семенниках». Молекулярная и клеточная биология. 17 (6): 2985–93. Дои:10.1128 / mcb.17.6.2985. ЧВК  232150. PMID  9154796.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Macé K, Bowman ED, Vautravers P, Shields PG, Harris CC, Pfeifer AM (май 1998 г.). «Характеристика экспрессии ферментов, метаболизирующих ксенобиотики, в слизистой оболочке бронхов человека и периферических тканях легких». Европейский журнал рака. 34 (6): 914–20. Дои:10.1016 / S0959-8049 (98) 00034-3. PMID  9797707.
• Клозе Т.С., Блейсделл Дж. А., Гольдштейн Дж. А. (1999). «Генная структура CYP2C8 и внепеченочное распределение человеческих CYP2C». Журнал биохимической и молекулярной токсикологии. 13 (6): 289–95. Дои:10.1002 / (SICI) 1099-0461 (1999) 13: 6 <289 :: AID-JBT1> 3.0.CO; 2-N. PMID  10487415.
• Finta C, Zaphiropoulos PG (февраль 2000 г.). «Локус CYP2C человека: прототип для сплайсинга межгенных и экзонных повторов». Геномика. 63 (3): 433–8. Дои:10.1006 / geno.1999.6063. PMID  10704292.
• Thum T, Borlak J (март 2000 г.). «Экспрессия генов в различных областях сердца». Ланцет. 355 (9208): 979–83. Дои:10.1016 / S0140-6736 (00) 99016-0. PMID  10768437. S2CID  23176414.
• Марилл Дж, Крестей Т., Ланотт М, Шабо Г.Г. (декабрь 2000 г.). «Идентификация цитохрома P450 человека, участвующего в образовании основных метаболитов транс-ретиноевой кислоты». Молекулярная фармакология. 58 (6): 1341–8. Дои:10.1124 / моль 58.6.1341. PMID  11093772.
• Чжу-Гэ Дж, Юй Юн, Цянь ЮЛ, Ли Х (октябрь 2002 г.). «Создание трансгенной клеточной линии, стабильно экспрессирующей цитохром P450 2C18 человека, и идентификация клона CYP2C18 с отсутствующим экзоном 5». Всемирный журнал гастроэнтерологии. 8 (5): 888–92. Дои:10.3748 / wjg.v8.i5.888. ЧВК  4656581. PMID  12378636.