ERCC5 - ERCC5

ERCC5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5EKF, 5ЭКГ
Идентификаторы
Псевдонимы	ERCC5, COFS3, ERCM2, UVDR, XPG, XPGC, ERCC5-201, эксцизионная репарация, кросс-комплементация, группа 5, эксцизионная репарация 5, эндонуклеаза
Внешние идентификаторы	OMIM: 133530 MGI: 103582 ГомолоГен: 133551 Генные карты: ERCC5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 13 (человек)[1] Группа 13q33.1 Начните 102,807,146 бп[1] Конец 102,876,001 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 C1.1 | 1 23,55 см Начните 44,147,744 бп[2] Конец 44,181,260 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • активность гомодимеризации белков • гидролазная активность, действующая на сложноэфирные связи • связывание с N-концом белка • связывание пузырьков с ДНК • связывание ионов металлов • связывание одноцепочечной ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • каталитическая активность • нуклеазная активность • эндонуклеазная активность • связывание двухцепочечной ДНК • эндодезоксирибонуклеазная активность • гидролазная активность • Связывание ядра РНК-полимеразы II • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса Сотовый компонент • ДНК-направленная РНК-полимераза II, холофермент • холо TFIIH комплекс • Комплекс фактора репликации ДНК А • ядро клетки • нуклеоплазма • комплекс нуклеотидно-эксцизионной репарации Биологический процесс • отрицательная регуляция апоптотического процесса • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • УФ защита • транскрипционно-связанная эксцизионная репарация нуклеотидов • эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК • ответ на УФ • ответ на УФ-С • эксцизионная репарация нуклеотидов • нуклеотидно-эксцизионная репарация, стабилизация предразрезного комплекса • Ремонт ДНК • нуклеотидно-эксцизионная репарация, сборка комплекса до разреза • эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК, 5'-очаг поражения • нуклеотидно-эксцизионная репарация, разрез ДНК, поражение 3'-к Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	2073	22592
Ансамбль	ENSG00000134899	ENSMUSG00000026048
UniProt	P28715	P35689
RefSeq (мРНК)	NM_000123	NM_011729
RefSeq (белок)	NP_000114	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 13: 102,81 - 102,88 Мб	Chr 1: 44.15 - 44.18 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок репарации ДНК, дополняющий клетки XP-G это белок что у людей кодируется ERCC5 ген.^[5][6]

Функция

Эксцизионная репарация, дополняющая дефицит репарации у грызунов, группа комплементации 5 (xeroderma pigmentosum, группа комплементации G) участвует в эксцизионной репарации повреждений ДНК, вызванных УФ-излучением. Мутации вызывают синдром Кокейна, который характеризуется серьезными дефектами роста, умственной отсталостью и кахексией. Описано множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы, но биологическая достоверность всех вариантов не определена.^[6]

Мутации в ERCC5 причина артрогрипоз.^[7]

XPG - это структура, специфичная эндонуклеаза что надрезает ДНК на 3 ’стороне поврежденного нуклеотида во время эксцизионная репарация нуклеотидов.

Синдромы

Мутационные дефекты в Ercc5(Xpg) ген может вызвать либо предрасположенное к раку состояние пигментная ксеродермия (XP) отдельно или в сочетании с тяжелым нарушением психического развития Синдром Кокейна (CS) или детский летальный церебро-окуло-фациально-скелетный синдром.^[8]

Модель мыши

An Ercc5(Xpg) мутантная модель мыши представила признаки преждевременного старения, включая кахексия и остеопороз с выраженными дегенеративными фенотипами как в печени, так и в головном мозге.^[8] У этих мутантных мышей развился мультисистемный дегенеративный фенотип преждевременного старения, который, по-видимому, усиливает связь между Повреждение ДНК и старение.^[8] (увидеть Теория повреждений ДНК старения ).

Ограничение питания, который продлевает продолжительность жизни мышей дикого типа, а также существенно увеличивает продолжительность жизни Ercc5(Xpg) мутантные мыши.^[9] Ограничение рациона мутантных мышей, замедляя старение, также, по-видимому, замедляет накопление повреждений ДНК в масштабе всего генома и сохраняет транскрипционный выход, что способствует повышению жизнеспособности клеток.

Взаимодействия

ERCC5 был показан взаимодействовать с участием ERCC2.^[10]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000134899 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026048 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Самек С., Джонс Т.А., Корлет Дж., Шерли Д., Шеер Д., Вуд Р.Д., Кларксон С.Г. (май 1994 г.). «Человеческий ген группы G комплементации xeroderma pigmentosum (XPG) отображается на 13q33 посредством флуоресцентной гибридизации in situ». Геномика. 21 (1): 283–5. Дои:10.1006 / geno.1994.1261. PMID  8088806.
6. «Ген Entrez: эксцизионная репарация ERCC5, дополняющая дефицит репарации у грызунов, группа комплементации 5 (пигментная ксеродерма, группа комплементации G (синдром Кокейна))».
7. Друри С., Бустред С., Текман М., Станеску Х., Клета Р., Ленч Н., Читти Л.С., Скотт Р.Х. (июль 2014 г.). «Новая гомозиготная усекающая мутация ERCC5 в семье с пренатальным артрогрипозом - еще одно доказательство корреляции генотип-фенотип». Американский журнал медицинской генетики. Часть А. 164A (7): 1777–83. Дои:10.1002 / ajmg.a.36506. PMID  24700531.
8. Barnhoorn S, Uittenboogaard LM, Jaarsma D, Vermeij WP, Tresini M, Weymaere M, Menoni H, Brandt RM, de Waard MC, Botter SM, Sarker AH, Jaspers NG, van der Horst GT, Cooper PK, Hoeijmakers JH, van der Pluijm I (октябрь 2014 г.). «Клеточно-автономные прогероидные изменения в условных моделях мышей для восстановления дефицита эндонуклеазы XPG». PLoS Genetics. 10 (10): e1004686. Дои:10.1371 / journal.pgen.1004686. ЧВК  4191938. PMID  25299392.
9. Вермей В.П., Долле М.Э., Рейлинг Э., Джарсма Д., Паян-Гомес К., Бомбардиери С.Р., Ву Х., Рокс А.Дж., Боттер С.М., ван дер Эрден Б.К., Юсеф С.А., Койпер Р.В., Нагараджа Б. Барнхорн С., Имхольц С., Пеннингс Дж. Л., де Брюин А., Гьенис А., Потхоф Дж., Вийг Дж., Ван Стиг Х., Хоймейкерс Дж. Х. (сентябрь 2016 г.). «Ограниченная диета задерживает ускоренное старение и геномный стресс у мышей с дефицитом репарации ДНК». Природа. 537 (7620): 427–431. Bibcode:2016Натура.537..427В. Дои:10.1038 / природа19329. ЧВК  5161687. PMID  27556946.
10. Айер Н., Рейган М.С., Ву К.Дж., Канагараджа Б., Фридберг ЕС (февраль 1996 г.). «Взаимодействия с участием комплекса транскрипции / эксцизионной репарации РНК-полимеразы II человека TFIIH, белка эксцизионной репарации нуклеотидов XPG и белка группы B синдрома Кокейна (CSB)». Биохимия. 35 (7): 2157–67. Дои:10.1021 / bi9524124. PMID  8652557.

внешние ссылки

• GeneReviews / NIH / NCBI / UW запись о Xeroderma Pigmentosum

дальнейшее чтение

• Миура М (март 1999 г.). «Обнаружение связанной с хроматином PCNA в клетках млекопитающих и его использование для изучения эксцизионной репарации ДНК». Журнал радиационных исследований. 40 (1): 1–12. Bibcode:1999JRadR..40 .... 1M. Дои:10,1269 / младший 40,1. PMID  10408173.
• Кливер Дж. Э., Томпсон Л. Х., Ричардсон А. С., Штаты JC (1999). «Краткое изложение мутаций в чувствительных к УФ-излучению расстройствах: пигментная ксеродермия, синдром Кокейна и трихотиодистрофия». Человеческая мутация. 14 (1): 9–22. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1999) 14: 1 <9 :: AID-HUMU2> 3.0.CO; 2-6. PMID  10447254.
• Такахаши Э., Шиоми Н., Шиоми Т. (ноябрь 1992 г.). «Точная локализация гена эксцизионной репарации, ERCC5, на хромосоме человека 13q32.3-q33.1 путем прямого R-бэндинга флуоресценции in situ гибридизации». Японский журнал исследований рака. 83 (11): 1117–9. Дои:10.1111 / j.1349-7006.1992.tb02731.x. ЧВК  5918714. PMID  1483924.
• Маджетт Дж. С., Макиннес Массачусетс (декабрь 1990 г.). «Выделение функционального гена эксцизионной репарации ERCC5 человека путем межкосмидной рекомбинации». Геномика. 8 (4): 623–33. Дои:10.1016 / 0888-7543 (90) 90248-С. PMID  2276736.
• Сиоми Т., Харада Ю., Сайто Т., Сиоми Н., Окуно Ю., Ямаидзуми М. (март 1994 г.). «Ген ERCC5, гомологичный дрожжевому RAD2, участвует в группе G xeroderma pigmentosum». Мутационные исследования. 314 (2): 167–75. Дои:10.1016/0921-8777(94)90080-9. PMID  7510366.
• Леманн А.Р., Бутсма Д., Кларксон С.Г., Кливер Дж. Э., Макалпайн П.Дж., Танака К., Томпсон Л.Х., Вуд Р.Д. (июль 1994 г.). «Номенклатура генов репарации ДНК человека». Мутационные исследования. 315 (1): 41–2. Дои:10.1016/0921-8777(94)90026-4. PMID  7517009.
• Клауд К.Г., Шен Б., Стрнист Г.Ф., Парк М.С. (июль 1995 г.). «Белок XPG обладает структурно-специфической эндонуклеазной активностью». Мутационные исследования. 347 (2): 55–60. Дои:10.1016/0165-7992(95)90070-5. PMID  7651464.
• Мацунага Т., Мю Д., Парк СН, Рирдон Дж. Т., Санкар А. (сентябрь 1995 г.). «Нуклеаза эксцизии репарации ДНК человека. Анализ роли субъединиц, участвующих в двойных разрезах, с использованием антител против XPG и ERCC1». Журнал биологической химии. 270 (35): 20862–9. Дои:10.1074 / jbc.270.35.20862. PMID  7657672.
• Носпикель Т., Кларксон С.Г. (июнь 1994 г.). «Мутации, которые отключают ген репарации ДНК XPG у пациента группы G xeroderma pigmentosum» (PDF). Молекулярная генетика человека. 3 (6): 963–7. Дои:10,1093 / hmg / 3,6,963. PMID  7951246.
• Хабракен Й, Сунг П., Пракаш Л., Пракаш С. (август 1994 г.). «Ген группы G Xeroderma pigmentosum человека кодирует эндонуклеазу ДНК». Исследования нуклеиновых кислот. 22 (16): 3312–6. Дои:10.1093 / nar / 22.16.3312. ЧВК  523723. PMID  8078765.
• О'Донован А., Дэвис А.А., Моггс Дж. Г., Вест СК, Вуд Р. Д. (сентябрь 1994 г.). «Эндонуклеаза XPG делает 3'-разрез при эксцизионной репарации нуклеотидов ДНК человека». Природа. 371 (6496): 432–5. Bibcode:1994Натура.371..432O. Дои:10.1038 / 371432a0. PMID  8090225.
• О'Донован А., Шерли Д., Кларксон С. Г., Вуд Р. Д. (июнь 1994 г.). «Выделение активного рекомбинантного белка XPG, эндонуклеазы репарации ДНК человека». Журнал биологической химии. 269 (23): 15965–8. PMID  8206890.
• Макиннес М.А., Диксон Дж. А., Эрнандес Р. Р., Лермонт Д., Лин Г. Ю., Маджетт Дж. С., Парк М. С., Шауэр С., Рейнольдс Р. Дж., Стрнист Г. Ф. (октябрь 1993 г.). «Комплементация кДНК-космиды человека ERCC5 для эксцизионной репарации и двудольные аминокислотные домены, консервативные с помощью белков RAD Saccharomyces cerevisiae и Schizosaccharomyces pombe». Молекулярная и клеточная биология. 13 (10): 6393–402. Дои:10.1128 / MCB.13.10.6393. ЧВК  364698. PMID  8413238.
• Шерли Д., Носпикель Т., Корле Дж., Укла С., Байроч А., Кларксон С.Г. (май 1993 г.). «Комплементация дефекта репарации ДНК в клетках группы G xeroderma pigmentosum кДНК человека, родственной дрожжевому RAD2». Природа. 363 (6425): 182–5. Bibcode:1993Натура.363..182С. Дои:10.1038 / 363182a0. PMID  8483504.
• О'Донован А., Вуд Р. Д. (май 1993 г.). «Идентичные дефекты репарации ДНК в группе G xeroderma pigmentosum и группе 5 ERCC грызунов». Природа. 363 (6425): 185–8. Bibcode:1993Натура.363..185O. Дои:10.1038 / 363185a0. PMID  8483505.
• Айер Н., Рейган М.С., Ву К.Дж., Канагараджа Б., Фридберг ЕС (февраль 1996 г.). «Взаимодействия с участием комплекса транскрипции / эксцизионной репарации РНК-полимеразы II человека TFIIH, белка эксцизионной репарации нуклеотидов XPG и белка группы B синдрома Кокейна (CSB)». Биохимия. 35 (7): 2157–67. Дои:10.1021 / bi9524124. PMID  8652557.
• Park MS, Knauf JA, Pendergrass SH, Coulon CH, Strniste GF, Marrone BL, MacInnes MA (август 1996). «Вызванное ультрафиолетом перемещение белка репарации ДНК человека Xeroderma pigmentosum типа G в ядре». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (16): 8368–73. Bibcode:1996PNAS ... 93.8368P. Дои:10.1073 / пнас.93.16.8368. ЧВК  38677. PMID  8710877.